Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400086425
CDS Infomation

pacid=37469662 polypeptide=PGSC0003DMP400058100 locus=PGSC0003DMG400035996 ID=PGSC0003DMT400086425.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTGAGGACTTCAGTCCTTTATCAGACTCCATTCCTGATACCCAAAGAATATCATGCA
AAAGCTCAAGAATTCAACTTTAGCTTGAAGGAACAAGAATGGATTTCTATGATCAAGAAA
TGCAACAGTATGAGGGAATTGAAGCAAGTTCATGGCCAAATCTTGAAGCTTGGATTCATT
TGTAGCTCTTTCTGTTCAGGCAATCTTTTATCCACTTGTGCACTTTCAGAATGGGGCAGC
ATGGACTATGCTTGTTTGATTTTCGATGAAATCGATGATCCACGTTCATTTGAATACAAT
ACTGTTATAAGAGGATATGTCAAAGATATGAACTTGGAAGAAGCTCTACTTTGGTATGTT
CATATGATTGAAGATGAGGTTGAACCAGATAATTTCTCATATCCTACACTTCTTAAAGTA
TGTGCTCGAATTCGGGCACTCAAAGAAGGAAAGCAGATTCATGGGCAGATTCTTAAGTTT
GGACATGAGGATGATGTGTTTGTGCAGAACAGCTTGATCAATATGTATGGGAAGTGTGGA
GAAGTTAGGCAATCTTGCATTGTCTTTGAGCAAATGGATCAAAGAACTATAGCTTCTTGG
AGTGCACTTATTGCAGCTAATGCTAATTTGGGACTATGGTCTGAGTGCCTCAAAGTTTTT
GGTGAAATGAACTCTGAGGGGTGTTGGAGGGCAGAGGAGAGTACATTGGTGAGTGTGATT
TCTGCTTGTACTCATTTGGATGCCCTTGATTTTGGGAAAGCCACACATGGATATCTTTTA
AGGAACATGACTGGTCTCAATGTTATAGTAGAGACATCCTTAATAGACATGTATGTTAAA
TGTGGATGTCTAGAGAAAGGGTTGTTTCTCTTTCAAAGAATGGCAAACAAGAACCAGATG
TCCTATAGTGCCATCATCTCAGGGTTGGCATTGCACGGGCGTGGAGAGGAAGCTCTAAGG
ATCTACCATGAAATGCTCAAAGAAAGAATAGAACCAGATGATGTTGTTTATGTTGGGGTT
TTGAGTGCTTGTAGTCATGCTGGATTGGTTGAAGAAGGGTTAAAATGTTTTGATAGGATG
AGACTGGAGCATCGGATAGAGCCAACAATTCAGCATTATGGGTGTATGGTTGATCTCTTG
GGACGAGCTGGGAGGCTTGAGGAAGCTTTGGAGCTCATCAAAGGCATGCCAATGGAGCCA
AACGACGTCTTATGGAGAAGTCTGCTAAGTTCTTGCAGAGTTCATCAGAATGTTGAGTTG
GGAGAAGTAGCAGCCAAGAATCTTTTCATGTTGAAATCAAGAAATGCTAGTGATTATGTG
ATGCTCTGCAATATATATGCACAAGCTAAAATGTGGGAAAAGATGGCTGTAATTCGGACA
AAAATGGTTAATGAAGGGATAATTCAAGTACCTGGTTCTTGCTTGGTTGAAGCAGACAGA
AAGCTCTACAAGTTTGTGTCACAAGATAGGTCACATACCTGCAGTGATGAGGTATATGAA
ATGATTCACCAAATGGAATGGCAACTGAAATTTGAAGGGTATTCACCAGATACATCATTG
GTATTGTTTGATGTAGATGAAGAAGAGAAGAGGCAAAGACTGAGCACTCATTGTCAAAAG
CTGGCAATTGCATTTGCACTTATAAAAACATCTCAAGGTTCTCCTATAAGAATAGTGAGA
AATGTCAGAATGTGTAGTGATTGTCACACATACACTAAACTTATTTCCATGATTTACGAA
AGAGATATCGTTGTTAGGGACAGAAATCAGTTCCACCATTTCAAAGATGGAACTTGCTCT
TGTAAAGATTACTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400058100
PEP Infomation

pacid=37469662 transcript=PGSC0003DMT400086425 locus=PGSC0003DMG400035996 ID=PGSC0003DMT400086425.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MVRTSVLYQTPFLIPKEYHAKAQEFNFSLKEQEWISMIKKCNSMRELKQVHGQILKLGFI
CSSFCSGNLLSTCALSEWGSMDYACLIFDEIDDPRSFEYNTVIRGYVKDMNLEEALLWYV
HMIEDEVEPDNFSYPTLLKVCARIRALKEGKQIHGQILKFGHEDDVFVQNSLINMYGKCG
EVRQSCIVFEQMDQRTIASWSALIAANANLGLWSECLKVFGEMNSEGCWRAEESTLVSVI
SACTHLDALDFGKATHGYLLRNMTGLNVIVETSLIDMYVKCGCLEKGLFLFQRMANKNQM
SYSAIISGLALHGRGEEALRIYHEMLKERIEPDDVVYVGVLSACSHAGLVEEGLKCFDRM
RLEHRIEPTIQHYGCMVDLLGRAGRLEEALELIKGMPMEPNDVLWRSLLSSCRVHQNVEL
GEVAAKNLFMLKSRNASDYVMLCNIYAQAKMWEKMAVIRTKMVNEGIIQVPGSCLVEADR
KLYKFVSQDRSHTCSDEVYEMIHQMEWQLKFEGYSPDTSLVLFDVDEEEKRQRLSTHCQK
LAIAFALIKTSQGSPIRIVRNVRMCSDCHTYTKLISMIYERDIVVRDRNQFHHFKDGTCS
CKDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400086425
Transcript Infomation

pacid=37469662 locus=PGSC0003DMG400035996 ID=PGSC0003DMT400086425.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTGAGGACTTCAGTCCTTTATCAGACTCCATTCCTGATACCCAAAGAATATCATGCA
AAAGCTCAAGAATTCAACTTTAGCTTGAAGGAACAAGAATGGATTTCTATGATCAAGAAA
TGCAACAGTATGAGGGAATTGAAGCAAGTTCATGGCCAAATCTTGAAGCTTGGATTCATT
TGTAGCTCTTTCTGTTCAGGCAATCTTTTATCCACTTGTGCACTTTCAGAATGGGGCAGC
ATGGACTATGCTTGTTTGATTTTCGATGAAATCGATGATCCACGTTCATTTGAATACAAT
ACTGTTATAAGAGGATATGTCAAAGATATGAACTTGGAAGAAGCTCTACTTTGGTATGTT
CATATGATTGAAGATGAGGTTGAACCAGATAATTTCTCATATCCTACACTTCTTAAAGTA
TGTGCTCGAATTCGGGCACTCAAAGAAGGAAAGCAGATTCATGGGCAGATTCTTAAGTTT
GGACATGAGGATGATGTGTTTGTGCAGAACAGCTTGATCAATATGTATGGGAAGTGTGGA
GAAGTTAGGCAATCTTGCATTGTCTTTGAGCAAATGGATCAAAGAACTATAGCTTCTTGG
AGTGCACTTATTGCAGCTAATGCTAATTTGGGACTATGGTCTGAGTGCCTCAAAGTTTTT
GGTGAAATGAACTCTGAGGGGTGTTGGAGGGCAGAGGAGAGTACATTGGTGAGTGTGATT
TCTGCTTGTACTCATTTGGATGCCCTTGATTTTGGGAAAGCCACACATGGATATCTTTTA
AGGAACATGACTGGTCTCAATGTTATAGTAGAGACATCCTTAATAGACATGTATGTTAAA
TGTGGATGTCTAGAGAAAGGGTTGTTTCTCTTTCAAAGAATGGCAAACAAGAACCAGATG
TCCTATAGTGCCATCATCTCAGGGTTGGCATTGCACGGGCGTGGAGAGGAAGCTCTAAGG
ATCTACCATGAAATGCTCAAAGAAAGAATAGAACCAGATGATGTTGTTTATGTTGGGGTT
TTGAGTGCTTGTAGTCATGCTGGATTGGTTGAAGAAGGGTTAAAATGTTTTGATAGGATG
AGACTGGAGCATCGGATAGAGCCAACAATTCAGCATTATGGGTGTATGGTTGATCTCTTG
GGACGAGCTGGGAGGCTTGAGGAAGCTTTGGAGCTCATCAAAGGCATGCCAATGGAGCCA
AACGACGTCTTATGGAGAAGTCTGCTAAGTTCTTGCAGAGTTCATCAGAATGTTGAGTTG
GGAGAAGTAGCAGCCAAGAATCTTTTCATGTTGAAATCAAGAAATGCTAGTGATTATGTG
ATGCTCTGCAATATATATGCACAAGCTAAAATGTGGGAAAAGATGGCTGTAATTCGGACA
AAAATGGTTAATGAAGGGATAATTCAAGTACCTGGTTCTTGCTTGGTTGAAGCAGACAGA
AAGCTCTACAAGTTTGTGTCACAAGATAGGTCACATACCTGCAGTGATGAGGTATATGAA
ATGATTCACCAAATGGAATGGCAACTGAAATTTGAAGGGTATTCACCAGATACATCATTG
GTATTGTTTGATGTAGATGAAGAAGAGAAGAGGCAAAGACTGAGCACTCATTGTCAAAAG
CTGGCAATTGCATTTGCACTTATAAAAACATCTCAAGGTTCTCCTATAAGAATAGTGAGA
AATGTCAGAATGTGTAGTGATTGTCACACATACACTAAACTTATTTCCATGATTTACGAA
AGAGATATCGTTGTTAGGGACAGAAATCAGTTCCACCATTTCAAAGATGGAACTTGCTCT
TGTAAAGATTACTGGTGA