Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400086252
CDS Infomation	pacid=37427074 polypeptide=PGSC0003DMP400057927 locus=PGSC0003DMG400035823 ID=PGSC0003DMT400086252.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGGGTTCAACAAAGATGAAGCAAGTTCATCTTCTCATGTTTTGAGTATCCCAAGAGAA GATACACCACTTCTTGGCAAGATTCAACATCTTTCTTCTCCTTCCAAGACTTTTGCTAAT GTTTTCATAGCCATAGTTGGAGCTGGAGTTCTTGGTCTTCCTTACACCTTTAAGAGAACT GGATGGGTTATGGGTTCTATCATGCTCTTCTCAGTTGCCTTTCTTACTTACTACTGTATG ATGCTTTTGGTCTATTCAAGGCGTAAGGTTGAATCCCACATCAAAGCTGCAAAAATTTCA TCTTTTGGTGATTTGGGGTTTGCTGTGTGTGGACCTGTTGGTAGATTGTCTGTTGATCTT ATGATTATTCTATCTCAAGCTGGTTTTTGTGTTAGTTACTTGATTTTTGTGGCTAATACT TTAGCATATTTGTTCAGCTATTCAATTGCAAAACCAGATCCCAAAATCTTGGGATTTTCA CCCAAAGCAATGTATATATGGGGCTGTTTCCCATTTCAGTTGGGGTTGAATTCAGTTCCC ACACTGACCCTTTTAGCCCCTTTGAGTATTTTTGCTGATATTGTTGAATTAGGAGCTATG GGTGTAGTGATGGTTGAGGATGTGATGATTTACCTCCAGAACAGGCCTGTTCTTGAAATG TTTGGTGGGTTCAATGTGTTTTTCTATGGACTTGGTGTGGCTGTGTATGCTTTTGAAGGG ATTGGTATGGTTTTGCCTTTGGAATCAGAGACAAGAGACAAGGACAAGTTTGGGAAAATC TTGGGATTGGCAATGGGCTTCATATCTTTGTTGTTTGGTGCTTTTGGAGTATTGGGCTAC TTTGCATTTGGGGAAGACACTAAAGATATAATCACTACTAATCTTGGGCAGGGATTGCTC AGCACCTTTGTTCAACTTGGCCTTTGCATAAACCTGTTTTTCACTTTCCCCCTTATGATG AATCCAGTCTATGAAGTAATGGAAAGGAGATTCTGGGAAGGCAGGTACTGTGTGTGGTTG AGATGGCTTATGGTTTTAGCAGTGACTTTTGTTGCATTGGCGGTGCCCAATTTTGCTGAT TTCTTGTCACTTGTTGGGAGCAGTGTGTGCATTGTTTTGGGGTTTGTGTTGCCTTCTTTG TTTCACTTAATTGTGTTCAAAGATGAATTGAGATGGCATGGTTTCGTTTTTGATGCTGCA TTGATTGTCATGGGCACAATTTTTGCTGTCTATGGAACCTATTCTTCCCTGATGGAGATA TTAGCAAAAAAAGCTTAG

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400057927
PEP Infomation	pacid=37427074 transcript=PGSC0003DMT400086252 locus=PGSC0003DMG400035823 ID=PGSC0003DMT400086252.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MGFNKDEASSSSHVLSIPREDTPLLGKIQHLSSPSKTFANVFIAIVGAGVLGLPYTFKRT GWVMGSIMLFSVAFLTYYCMMLLVYSRRKVESHIKAAKISSFGDLGFAVCGPVGRLSVDL MIILSQAGFCVSYLIFVANTLAYLFSYSIAKPDPKILGFSPKAMYIWGCFPFQLGLNSVP TLTLLAPLSIFADIVELGAMGVVMVEDVMIYLQNRPVLEMFGGFNVFFYGLGVAVYAFEG IGMVLPLESETRDKDKFGKILGLAMGFISLLFGAFGVLGYFAFGEDTKDIITTNLGQGLL STFVQLGLCINLFFTFPLMMNPVYEVMERRFWEGRYCVWLRWLMVLAVTFVALAVPNFAD FLSLVGSSVCIVLGFVLPSLFHLIVFKDELRWHGFVFDAALIVMGTIFAVYGTYSSLMEI LAKKA*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400086252
Transcript Infomation	pacid=37427074 locus=PGSC0003DMG400035823 ID=PGSC0003DMT400086252.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGGGTTCAACAAAGATGAAGCAAGTTCATCTTCTCATGTTTTGAGTATCCCAAGAGAA GATACACCACTTCTTGGCAAGATTCAACATCTTTCTTCTCCTTCCAAGACTTTTGCTAAT GTTTTCATAGCCATAGTTGGAGCTGGAGTTCTTGGTCTTCCTTACACCTTTAAGAGAACT GGATGGGTTATGGGTTCTATCATGCTCTTCTCAGTTGCCTTTCTTACTTACTACTGTATG ATGCTTTTGGTCTATTCAAGGCGTAAGGTTGAATCCCACATCAAAGCTGCAAAAATTTCA TCTTTTGGTGATTTGGGGTTTGCTGTGTGTGGACCTGTTGGTAGATTGTCTGTTGATCTT ATGATTATTCTATCTCAAGCTGGTTTTTGTGTTAGTTACTTGATTTTTGTGGCTAATACT TTAGCATATTTGTTCAGCTATTCAATTGCAAAACCAGATCCCAAAATCTTGGGATTTTCA CCCAAAGCAATGTATATATGGGGCTGTTTCCCATTTCAGTTGGGGTTGAATTCAGTTCCC ACACTGACCCTTTTAGCCCCTTTGAGTATTTTTGCTGATATTGTTGAATTAGGAGCTATG GGTGTAGTGATGGTTGAGGATGTGATGATTTACCTCCAGAACAGGCCTGTTCTTGAAATG TTTGGTGGGTTCAATGTGTTTTTCTATGGACTTGGTGTGGCTGTGTATGCTTTTGAAGGG ATTGGTATGGTTTTGCCTTTGGAATCAGAGACAAGAGACAAGGACAAGTTTGGGAAAATC TTGGGATTGGCAATGGGCTTCATATCTTTGTTGTTTGGTGCTTTTGGAGTATTGGGCTAC TTTGCATTTGGGGAAGACACTAAAGATATAATCACTACTAATCTTGGGCAGGGATTGCTC AGCACCTTTGTTCAACTTGGCCTTTGCATAAACCTGTTTTTCACTTTCCCCCTTATGATG AATCCAGTCTATGAAGTAATGGAAAGGAGATTCTGGGAAGGCAGGTACTGTGTGTGGTTG AGATGGCTTATGGTTTTAGCAGTGACTTTTGTTGCATTGGCGGTGCCCAATTTTGCTGAT TTCTTGTCACTTGTTGGGAGCAGTGTGTGCATTGTTTTGGGGTTTGTGTTGCCTTCTTTG TTTCACTTAATTGTGTTCAAAGATGAATTGAGATGGCATGGTTTCGTTTTTGATGCTGCA TTGATTGTCATGGGCACAATTTTTGCTGTCTATGGAACCTATTCTTCCCTGATGGAGATA TTAGCAAAAAAAGCTTAG