Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400085913
CDS Infomation

pacid=37467971 polypeptide=PGSC0003DMP400057588 locus=PGSC0003DMG400035484 ID=PGSC0003DMT400085913.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTGCAAAATTCTCTACTGGTTTAGACATCCATTGCAGCATACCTTACACTTCAGAC
ACAAAGCTTCTTTATGGTTCATCTTCTTCTTCCACCAAATCATCAAGATTGTCCCTGAAA
AGATTCACTATTCTTTGCAATTCCACCTCAAAATCTCCAAAACCAAATCTTGATTTAGAT
TCTTCAAGAAAAAAGCCCTCTCTTTCTGAACAACTAAAGCCACTTTCCAACACCATTCTT
GATGACCCACCAAACCAAGCAAGAATTCTTTCTAAGCCAAAGTCAACTTGGGTAAACCCC
ACAAGGCCTAAACCTTCTGTTTTGTCTTTACAGAGGCAGAAAAGGTCTTCTTACTCTTAC
AATCCTCAAATTAGAGACCTTAAGAATTTTGCTAGGAGGTTAAGTGAGTCTCATTTCTCT
GATGATGCTTTCTTGGCTGTTCTTGAAGATATCCCACATCCACCCACTAGAGATAATGCT
TTGTTGGTGCTTAATAGTTTGAGGCCATGGCAAAAGACTATTTTTTTCTTCAATTGGATC
AAGACTAGGAATTTGTTTCCTCTTGAAACTATCTTTTATAATGTTGCTATGAAGTCTTTG
AGGTTTGGGAGGCAGTTTCAGCAGATTGAGGAATTAGCTTTTGAGATGATTGATAGTGGG
ATTGAGCTGGATAACATTACTTATTCTACTATTATTACTTGTGCTAAAAGGTGTAATCTT
TTTGATAAGGCAGTTGAGTGGTTTGAGAGGATGTATAAGACTGGTTTGATGCCTGATGAA
GTTACTTATTCTGCTGTTTTGGATGTGTATGCTCAGTTGGGGAAGGTTGAGGAGGTGATG
AGCTTGTATGAGAGAGGGAGGGCTAGTGGATGGACTCCAGACCCTGTTGCTTTTGCTGTG
TTGGCTAAAGTGTTTGGTGCAGCTGGGGATTATGATGGTATTAGGTTTGTGTTGCAAGAG
ATGAAGGCACTTGAAGTGCAGCCTAATTTGGTTGTGTATAATACATTGTTAGAGGCAATG
GGTAAGGCTGGGAAGCCTGGTTTGGCAAGGAGTCTGTTTGAGGAAATGGTGGATTCAGGG
CTTACCCCGGATGCGAAGACGTTAACAGCATTGATCAAGATTTATGGGAAGGCAAGGTGG
GCTAGAGATGCTTTGGATCTTTGGGAAAGAATGAAGTCTAATGGATGGCCTATGGACTTC
ATTTTGTACAATACATTGTTGAGTATGTGTGCAGATCTTGGGTTGGAGGAAGAGGCCGAG
ACGTTGTTTCATGATATGAGGAAGTCGGATAATTGTAGACTTGATAGCTGGAGCTATACA
GCAATGCTGAACATATATGGAAGCGTAGGAAATGCAGAGAAAGCTATGGCTTTGTTTGAG
GAAATGTCTAGAGTAGGTATCGAGCTTAACGTTATGGGATGCACTTGTTTGGTTCAGTGC
TTTGGTAGAGCACAGAGGATAGATGATTTGGTTAAGGTGTTTGAAATCTCAGTACAAAGA
GGAGTCAAGCCAGATGACAGACTTTGTGGATGCTTACTCTCAGTTGTGTCCTATTGCAAG
GGCGACGATGCAGATAAGGTCCTTGCTTGTCTACAACAAGCTAACCCAAGATTGGTAACC
TTTGTCAAGATGTTAGAAGATGAGAGCACTAGCTATGACATTGTGAAAGAAGAGTTCAGG
TCCATACTGACTAATACATCAGATGATGCTAGAAGGCCCTTCTGTAATTGTCTAATTGAT
ATATGCAGAAAGAGAAATCTCGCAGAGAGGGCTCACGAGCTTCTGTACTTGGGAACTGTA
TATGGACTATACCCAGGTTTACATACTAAGACACCAGAAGAATGGCGATTGAACGTACGA
GCACTATCTGTTGGTGCAGCTCAAACTGCATTTGAAGAATGGATGAGAACACTAGCTAAG
ATTGTGCAGAGTGAAGAGCCCTTGCCTGAAGTGTTATCAGCAAACACAGGAGCTGGTACT
CACAAGTTCTCACAGGGTTTGGCAAATGCCTTTGCTTCTCATGTGGAGAAGCTTGCTGCT
CCTTTCAAACAGAGTGAAGAGAAGGCCGGTTTCTTCATCGCGACTCGTGAAGATGTAGTG
TTATGGGTCCAATCAAAGGCAGCTGCAACTGCATAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400057588
PEP Infomation

pacid=37467971 transcript=PGSC0003DMT400085913 locus=PGSC0003DMG400035484 ID=PGSC0003DMT400085913.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAAKFSTGLDIHCSIPYTSDTKLLYGSSSSSTKSSRLSLKRFTILCNSTSKSPKPNLDLD
SSRKKPSLSEQLKPLSNTILDDPPNQARILSKPKSTWVNPTRPKPSVLSLQRQKRSSYSY
NPQIRDLKNFARRLSESHFSDDAFLAVLEDIPHPPTRDNALLVLNSLRPWQKTIFFFNWI
KTRNLFPLETIFYNVAMKSLRFGRQFQQIEELAFEMIDSGIELDNITYSTIITCAKRCNL
FDKAVEWFERMYKTGLMPDEVTYSAVLDVYAQLGKVEEVMSLYERGRASGWTPDPVAFAV
LAKVFGAAGDYDGIRFVLQEMKALEVQPNLVVYNTLLEAMGKAGKPGLARSLFEEMVDSG
LTPDAKTLTALIKIYGKARWARDALDLWERMKSNGWPMDFILYNTLLSMCADLGLEEEAE
TLFHDMRKSDNCRLDSWSYTAMLNIYGSVGNAEKAMALFEEMSRVGIELNVMGCTCLVQC
FGRAQRIDDLVKVFEISVQRGVKPDDRLCGCLLSVVSYCKGDDADKVLACLQQANPRLVT
FVKMLEDESTSYDIVKEEFRSILTNTSDDARRPFCNCLIDICRKRNLAERAHELLYLGTV
YGLYPGLHTKTPEEWRLNVRALSVGAAQTAFEEWMRTLAKIVQSEEPLPEVLSANTGAGT
HKFSQGLANAFASHVEKLAAPFKQSEEKAGFFIATREDVVLWVQSKAAATA*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400085913
Transcript Infomation

pacid=37467971 locus=PGSC0003DMG400035484 ID=PGSC0003DMT400085913.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTGCAAAATTCTCTACTGGTTTAGACATCCATTGCAGCATACCTTACACTTCAGAC
ACAAAGCTTCTTTATGGTTCATCTTCTTCTTCCACCAAATCATCAAGATTGTCCCTGAAA
AGATTCACTATTCTTTGCAATTCCACCTCAAAATCTCCAAAACCAAATCTTGATTTAGAT
TCTTCAAGAAAAAAGCCCTCTCTTTCTGAACAACTAAAGCCACTTTCCAACACCATTCTT
GATGACCCACCAAACCAAGCAAGAATTCTTTCTAAGCCAAAGTCAACTTGGGTAAACCCC
ACAAGGCCTAAACCTTCTGTTTTGTCTTTACAGAGGCAGAAAAGGTCTTCTTACTCTTAC
AATCCTCAAATTAGAGACCTTAAGAATTTTGCTAGGAGGTTAAGTGAGTCTCATTTCTCT
GATGATGCTTTCTTGGCTGTTCTTGAAGATATCCCACATCCACCCACTAGAGATAATGCT
TTGTTGGTGCTTAATAGTTTGAGGCCATGGCAAAAGACTATTTTTTTCTTCAATTGGATC
AAGACTAGGAATTTGTTTCCTCTTGAAACTATCTTTTATAATGTTGCTATGAAGTCTTTG
AGGTTTGGGAGGCAGTTTCAGCAGATTGAGGAATTAGCTTTTGAGATGATTGATAGTGGG
ATTGAGCTGGATAACATTACTTATTCTACTATTATTACTTGTGCTAAAAGGTGTAATCTT
TTTGATAAGGCAGTTGAGTGGTTTGAGAGGATGTATAAGACTGGTTTGATGCCTGATGAA
GTTACTTATTCTGCTGTTTTGGATGTGTATGCTCAGTTGGGGAAGGTTGAGGAGGTGATG
AGCTTGTATGAGAGAGGGAGGGCTAGTGGATGGACTCCAGACCCTGTTGCTTTTGCTGTG
TTGGCTAAAGTGTTTGGTGCAGCTGGGGATTATGATGGTATTAGGTTTGTGTTGCAAGAG
ATGAAGGCACTTGAAGTGCAGCCTAATTTGGTTGTGTATAATACATTGTTAGAGGCAATG
GGTAAGGCTGGGAAGCCTGGTTTGGCAAGGAGTCTGTTTGAGGAAATGGTGGATTCAGGG
CTTACCCCGGATGCGAAGACGTTAACAGCATTGATCAAGATTTATGGGAAGGCAAGGTGG
GCTAGAGATGCTTTGGATCTTTGGGAAAGAATGAAGTCTAATGGATGGCCTATGGACTTC
ATTTTGTACAATACATTGTTGAGTATGTGTGCAGATCTTGGGTTGGAGGAAGAGGCCGAG
ACGTTGTTTCATGATATGAGGAAGTCGGATAATTGTAGACTTGATAGCTGGAGCTATACA
GCAATGCTGAACATATATGGAAGCGTAGGAAATGCAGAGAAAGCTATGGCTTTGTTTGAG
GAAATGTCTAGAGTAGGTATCGAGCTTAACGTTATGGGATGCACTTGTTTGGTTCAGTGC
TTTGGTAGAGCACAGAGGATAGATGATTTGGTTAAGGTGTTTGAAATCTCAGTACAAAGA
GGAGTCAAGCCAGATGACAGACTTTGTGGATGCTTACTCTCAGTTGTGTCCTATTGCAAG
GGCGACGATGCAGATAAGGTCCTTGCTTGTCTACAACAAGCTAACCCAAGATTGGTAACC
TTTGTCAAGATGTTAGAAGATGAGAGCACTAGCTATGACATTGTGAAAGAAGAGTTCAGG
TCCATACTGACTAATACATCAGATGATGCTAGAAGGCCCTTCTGTAATTGTCTAATTGAT
ATATGCAGAAAGAGAAATCTCGCAGAGAGGGCTCACGAGCTTCTGTACTTGGGAACTGTA
TATGGACTATACCCAGGTTTACATACTAAGACACCAGAAGAATGGCGATTGAACGTACGA
GCACTATCTGTTGGTGCAGCTCAAACTGCATTTGAAGAATGGATGAGAACACTAGCTAAG
ATTGTGCAGAGTGAAGAGCCCTTGCCTGAAGTGTTATCAGCAAACACAGGAGCTGGTACT
CACAAGTTCTCACAGGGTTTGGCAAATGCCTTTGCTTCTCATGTGGAGAAGCTTGCTGCT
CCTTTCAAACAGAGTGAAGAGAAGGCCGGTTTCTTCATCGCGACTCGTGAAGATGTAGTG
TTATGGGTCCAATCAAAGGCAGCTGCAACTGCATAA