Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400083250
CDS Infomation

pacid=37452691 polypeptide=PGSC0003DMP400055927 locus=PGSC0003DMG400033141 ID=PGSC0003DMT400083250.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCACCGCTTATTCTTTGTTCAATGTCGGAATTACTGTTACACTCACGCAATTGCATCA
AATTCTCAGATTTCACATTTTGCTCGTTTGGGCCAAGTTCAGAATGCCCGAAGGGTGTTC
GACGAAATGCCCAACAAAAATGTGACTTCTTGGAACTCTATAATCACTGGGTATTTCCAA
AATCACCAACCCAATGAAGGCCAGTGTCTGTTTGATCAAATGCCTGAGAGAAACATAGTT
TCATGGAATGGGTTAATCTCAGGTTATGTAAAGAATAGGATGGTGAAGGAAGCAAGGAAA
GTGTTTGACAAAATGCCCCAACGAAATGTCATTTCTTGGACTGCTATGGTCAGAGGGTAT
GTTGAGGAGGGGTTTGTTGAAGAGGCGGAAACCCTGTTTTGGCAAATGCCTGGAAAGAAT
GTTGTGTCATGGACTGTGATGATAGGTGGGTTGATTCAAGAAAGGAGAGTTGATGAGGCT
AGAAGGCTTTATGACATGATGCCAGTAAAGGATGTAGTTGTGAGGACAAATATGATATGT
GGATATTGTCAGGAAGGTAGGCTGGATGAGGCACGCGACCTCTTTGATCACATGCCGAAA
AAGAATGTGGTGTCTTGGACAGCCATGGTATCAGGATATGCCCAAAATGGTAAACTGGAT
ATTGCTAGAAAACTTTTTGAAGTCATGCCTGAGAAGAATGAGATCTCATGGACTGCAATT
ATAATAAGCTATGTGCAATATGGTAGATTTGAAGAGGCGTGGAAGCTTTTCGAAGTGATG
CCTGTTAGAACTACTCCTGCTTGTAATGCCATAATTCTTGGAATAGGACAGAATGGGGAG
GTTGCTAAGGCGCGGATGGTGTTTGATCTTTTGAAGGAGAAGGATGATGCAACATGGAGT
GCAATGATCAAGGTTTATGAAAGGAAAGGATATGAGTTAGAGGCACTGGATTTGTTTCAT
CGAATGCAAGTAGATGGATTTCGGCCAAATTTCCCTTCGTTGATAAGCATACTTTCAATT
TGTGCTAGTCTTGCAAGTCTTAATTATGGTACAGAGATACATGCACAGTTAATTAGAACC
AACTGTGATGATGACGTGTATGTCTCTTCTGTATTAATTACGATGTACATCAAATGTGGT
GATTTCGTCAAGGCCAAATTAATATTTGACAGATTTTCTCCAAAAGATGTGGTCATGTGG
AATTCTATCATAACAGGTTATGCTCAACATGGATTAGGAGATGAAGCTCTAGAAGTGTTC
AGAGAAATGTGTTCTTTAGGTATTACCCCAGACGAGGTTACCTTTGTTGGAGTTTTATCT
GCATGTAGCTACACTGGGAAAGTGAAAGAAGGGCAAGATATCTTTGAGTCCATGAATTCA
AAATATCAGATGGAGCCAGGAACTGCACATTATGCTTGCATGGTTGACATGCTTGGTCGA
GCTGGTCGATTGAATGAGGCGATGGATATGATCAACAAAATGACTGTAGAAGCAGATGCA
ATTATTTGGGGTTCTTTAATGGGTGCATGTAGGATGCATATGAACCTAGATTTGGCAGAA
GTTGCTGCAAAGAAACTTTTACAGCTTGAACCCCAAAATTCAGGGCCCTATGTCCTACTT
TCTAATATTTATGCATCCAAAGGTATGTGGGCTGATGTTGCTTCACTTAGGAAGTCGATG
CTGTCTAGGGAAGTGGTTAAATCACCTGGTTGTAGTTGGCTTGAGGCAGACAAAGAAGTG
CATATGTTCACTGGTGGACAGAGCATGCCCCATCCCGAGCATGAATCAATTCTCAAAATA
TTAGAAAAGTTGAGTCCTATGTTAAGAGAAGCTGGTTATATTCCTGATGGAAGCTTTGCT
TTGCATGATGTGGAGGAAGAAGAGAAGTTGCATAGCTTGAATTATCACAGTGAGAAACTA
GCTGTGGCCTATGGACTTCTTAAATTGCCTGAAGGAATGCCTATACGAGTAATGAAAAAT
CTTCGAGTTTGTGGTGACTGTCATTCTGCTATTAAGTTAATCGCTAAAGTCACAGGACGA
GAGATAATTCTGAGAGATGCCAACAGATTTCACCATTTTAAGGATGGGGTATGTTCTTGC
AAGGATTTTTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400055927
PEP Infomation

pacid=37452691 transcript=PGSC0003DMT400083250 locus=PGSC0003DMG400033141 ID=PGSC0003DMT400083250.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MHRLFFVQCRNYCYTHAIASNSQISHFARLGQVQNARRVFDEMPNKNVTSWNSIITGYFQ
NHQPNEGQCLFDQMPERNIVSWNGLISGYVKNRMVKEARKVFDKMPQRNVISWTAMVRGY
VEEGFVEEAETLFWQMPGKNVVSWTVMIGGLIQERRVDEARRLYDMMPVKDVVVRTNMIC
GYCQEGRLDEARDLFDHMPKKNVVSWTAMVSGYAQNGKLDIARKLFEVMPEKNEISWTAI
IISYVQYGRFEEAWKLFEVMPVRTTPACNAIILGIGQNGEVAKARMVFDLLKEKDDATWS
AMIKVYERKGYELEALDLFHRMQVDGFRPNFPSLISILSICASLASLNYGTEIHAQLIRT
NCDDDVYVSSVLITMYIKCGDFVKAKLIFDRFSPKDVVMWNSIITGYAQHGLGDEALEVF
REMCSLGITPDEVTFVGVLSACSYTGKVKEGQDIFESMNSKYQMEPGTAHYACMVDMLGR
AGRLNEAMDMINKMTVEADAIIWGSLMGACRMHMNLDLAEVAAKKLLQLEPQNSGPYVLL
SNIYASKGMWADVASLRKSMLSREVVKSPGCSWLEADKEVHMFTGGQSMPHPEHESILKI
LEKLSPMLREAGYIPDGSFALHDVEEEEKLHSLNYHSEKLAVAYGLLKLPEGMPIRVMKN
LRVCGDCHSAIKLIAKVTGREIILRDANRFHHFKDGVCSCKDFW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400083250
Transcript Infomation

pacid=37452691 locus=PGSC0003DMG400033141 ID=PGSC0003DMT400083250.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCACCGCTTATTCTTTGTTCAATGTCGGAATTACTGTTACACTCACGCAATTGCATCA
AATTCTCAGATTTCACATTTTGCTCGTTTGGGCCAAGTTCAGAATGCCCGAAGGGTGTTC
GACGAAATGCCCAACAAAAATGTGACTTCTTGGAACTCTATAATCACTGGGTATTTCCAA
AATCACCAACCCAATGAAGGCCAGTGTCTGTTTGATCAAATGCCTGAGAGAAACATAGTT
TCATGGAATGGGTTAATCTCAGGTTATGTAAAGAATAGGATGGTGAAGGAAGCAAGGAAA
GTGTTTGACAAAATGCCCCAACGAAATGTCATTTCTTGGACTGCTATGGTCAGAGGGTAT
GTTGAGGAGGGGTTTGTTGAAGAGGCGGAAACCCTGTTTTGGCAAATGCCTGGAAAGAAT
GTTGTGTCATGGACTGTGATGATAGGTGGGTTGATTCAAGAAAGGAGAGTTGATGAGGCT
AGAAGGCTTTATGACATGATGCCAGTAAAGGATGTAGTTGTGAGGACAAATATGATATGT
GGATATTGTCAGGAAGGTAGGCTGGATGAGGCACGCGACCTCTTTGATCACATGCCGAAA
AAGAATGTGGTGTCTTGGACAGCCATGGTATCAGGATATGCCCAAAATGGTAAACTGGAT
ATTGCTAGAAAACTTTTTGAAGTCATGCCTGAGAAGAATGAGATCTCATGGACTGCAATT
ATAATAAGCTATGTGCAATATGGTAGATTTGAAGAGGCGTGGAAGCTTTTCGAAGTGATG
CCTGTTAGAACTACTCCTGCTTGTAATGCCATAATTCTTGGAATAGGACAGAATGGGGAG
GTTGCTAAGGCGCGGATGGTGTTTGATCTTTTGAAGGAGAAGGATGATGCAACATGGAGT
GCAATGATCAAGGTTTATGAAAGGAAAGGATATGAGTTAGAGGCACTGGATTTGTTTCAT
CGAATGCAAGTAGATGGATTTCGGCCAAATTTCCCTTCGTTGATAAGCATACTTTCAATT
TGTGCTAGTCTTGCAAGTCTTAATTATGGTACAGAGATACATGCACAGTTAATTAGAACC
AACTGTGATGATGACGTGTATGTCTCTTCTGTATTAATTACGATGTACATCAAATGTGGT
GATTTCGTCAAGGCCAAATTAATATTTGACAGATTTTCTCCAAAAGATGTGGTCATGTGG
AATTCTATCATAACAGGTTATGCTCAACATGGATTAGGAGATGAAGCTCTAGAAGTGTTC
AGAGAAATGTGTTCTTTAGGTATTACCCCAGACGAGGTTACCTTTGTTGGAGTTTTATCT
GCATGTAGCTACACTGGGAAAGTGAAAGAAGGGCAAGATATCTTTGAGTCCATGAATTCA
AAATATCAGATGGAGCCAGGAACTGCACATTATGCTTGCATGGTTGACATGCTTGGTCGA
GCTGGTCGATTGAATGAGGCGATGGATATGATCAACAAAATGACTGTAGAAGCAGATGCA
ATTATTTGGGGTTCTTTAATGGGTGCATGTAGGATGCATATGAACCTAGATTTGGCAGAA
GTTGCTGCAAAGAAACTTTTACAGCTTGAACCCCAAAATTCAGGGCCCTATGTCCTACTT
TCTAATATTTATGCATCCAAAGGTATGTGGGCTGATGTTGCTTCACTTAGGAAGTCGATG
CTGTCTAGGGAAGTGGTTAAATCACCTGGTTGTAGTTGGCTTGAGGCAGACAAAGAAGTG
CATATGTTCACTGGTGGACAGAGCATGCCCCATCCCGAGCATGAATCAATTCTCAAAATA
TTAGAAAAGTTGAGTCCTATGTTAAGAGAAGCTGGTTATATTCCTGATGGAAGCTTTGCT
TTGCATGATGTGGAGGAAGAAGAGAAGTTGCATAGCTTGAATTATCACAGTGAGAAACTA
GCTGTGGCCTATGGACTTCTTAAATTGCCTGAAGGAATGCCTATACGAGTAATGAAAAAT
CTTCGAGTTTGTGGTGACTGTCATTCTGCTATTAAGTTAATCGCTAAAGTCACAGGACGA
GAGATAATTCTGAGAGATGCCAACAGATTTCACCATTTTAAGGATGGGGTATGTTCTTGC
AAGGATTTTTGGTGA