Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400083196
CDS Infomation

pacid=37441612 polypeptide=PGSC0003DMP400055886 locus=PGSC0003DMG400033112 ID=PGSC0003DMT400083196.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCCAAATCAGCAGCAACTTCAACAGTTGAAGACTTTGCAAGATCTGAAGCTGCCCCCA
CAGTTCAAGGACTTAAAACTTCCCCCAATGGGGAAAGACCAGAACCCAAAGGCTGTTAAG
TTTACCATGCCTGAGATGGATGATTTGACTGATGATGAATTTGATGAGGATGATTTGACT
GATTATGAGGATGATGAATTTGATGAGGATGAGTTGGATGATGAACTGGACGATATCCCG
TCGAAGATGAAGGCGATGATGGGCCCGGGTGCAGGGGCTAATTCTAGTGGTGCTCAGATG
AAGCTGCCAATGATGAGTGGTAATCCTGGAGCTCAGATGAAGCCGCCAATGATGGGTGGT
AATCCTGGAGCTCAGATGAAGCCGATGATGGGTGGTAATGGTGGAGGAGGTCAGATGCCT
AATATGATGATGATGAATGGTCTTATGAATGGGCAGCACCCTCAGCTTATGAAGGGTGGA
AATGGCGGTAACAATGGTGGCAATAATGGAGGTGGTGGTAATGGGAAAAAAGGTGGTGGT
AATGTCCCTGTTCAGATTAACATGGGCGGAAATAACGGTGGTAAGAAAGGCGGTGGTAAT
GGGGGAAATCCAAATCAAGGTGGAGGACCTGCTCAAAAGGGTGGCAAGAATGGTGGAGGG
CAGCCAAGTGGCGGTGGCGGCAATGGTGGTGGACAGAATAAGAATGGTAGTGGCGGTGGC
GGCGGTGGTGCTGGCAATATTCCTAACATGAATGGCAATGGGGCCAAAAAGGGAGGTGGA
GGAAATGATGGGATGCCTCAAGGCATGCCAAACAGGATGATGGCTATGAGTGGAGGTGGA
AACATGGGCCAGTTGGGAAACATGCCTAATCCAATGGGGCAGATGGGTCAAATGGGTGGT
CTTCCAGTGGGCCAAATGGGTGGTCTTCCAATGGGTCAAATGGGTAATCCAGTGGGTCAG
ATGAGCCATGTTTCGGCAGTCCAAGGCCTACCAGCAGGGGCAGCAATGGGGGGCGGTGGT
GGTGGTAATGCCGGTGGCTACTTCCAAGGTGCTGGTCCTGAAGTCATGGCTGGCAATCCT
TACTACCAGCAGCAACAAATGGCAGCTATGATGATGCAGCAACAACAGCAGCAGCAGCGT
GCCAATGGGAACGAAAGGTTTCAACCAATGATGTACGCTCGACCACCACCAGCTGTCAAT
TACATGCCACCACCAGCACCTTACAACCCGTATTACTACGGCCATCCACCACCTCCAAGT
GATAACTACAGCACCTTCTTCAGTGATGAAAACACCAACAGCTGCACTGTGATGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400055886
PEP Infomation

pacid=37441612 transcript=PGSC0003DMT400083196 locus=PGSC0003DMG400033112 ID=PGSC0003DMT400083196.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MPNQQQLQQLKTLQDLKLPPQFKDLKLPPMGKDQNPKAVKFTMPEMDDLTDDEFDEDDLT
DYEDDEFDEDELDDELDDIPSKMKAMMGPGAGANSSGAQMKLPMMSGNPGAQMKPPMMGG
NPGAQMKPMMGGNGGGGQMPNMMMMNGLMNGQHPQLMKGGNGGNNGGNNGGGGNGKKGGG
NVPVQINMGGNNGGKKGGGNGGNPNQGGGPAQKGGKNGGGQPSGGGGNGGGQNKNGSGGG
GGGAGNIPNMNGNGAKKGGGGNDGMPQGMPNRMMAMSGGGNMGQLGNMPNPMGQMGQMGG
LPVGQMGGLPMGQMGNPVGQMSHVSAVQGLPAGAAMGGGGGGNAGGYFQGAGPEVMAGNP
YYQQQQMAAMMMQQQQQQQRANGNERFQPMMYARPPPAVNYMPPPAPYNPYYYGHPPPPS
DNYSTFFSDENTNSCTVM*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400083196
Transcript Infomation

pacid=37441612 locus=PGSC0003DMG400033112 ID=PGSC0003DMT400083196.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCCAAATCAGCAGCAACTTCAACAGTTGAAGACTTTGCAAGATCTGAAGCTGCCCCCA
CAGTTCAAGGACTTAAAACTTCCCCCAATGGGGAAAGACCAGAACCCAAAGGCTGTTAAG
TTTACCATGCCTGAGATGGATGATTTGACTGATGATGAATTTGATGAGGATGATTTGACT
GATTATGAGGATGATGAATTTGATGAGGATGAGTTGGATGATGAACTGGACGATATCCCG
TCGAAGATGAAGGCGATGATGGGCCCGGGTGCAGGGGCTAATTCTAGTGGTGCTCAGATG
AAGCTGCCAATGATGAGTGGTAATCCTGGAGCTCAGATGAAGCCGCCAATGATGGGTGGT
AATCCTGGAGCTCAGATGAAGCCGATGATGGGTGGTAATGGTGGAGGAGGTCAGATGCCT
AATATGATGATGATGAATGGTCTTATGAATGGGCAGCACCCTCAGCTTATGAAGGGTGGA
AATGGCGGTAACAATGGTGGCAATAATGGAGGTGGTGGTAATGGGAAAAAAGGTGGTGGT
AATGTCCCTGTTCAGATTAACATGGGCGGAAATAACGGTGGTAAGAAAGGCGGTGGTAAT
GGGGGAAATCCAAATCAAGGTGGAGGACCTGCTCAAAAGGGTGGCAAGAATGGTGGAGGG
CAGCCAAGTGGCGGTGGCGGCAATGGTGGTGGACAGAATAAGAATGGTAGTGGCGGTGGC
GGCGGTGGTGCTGGCAATATTCCTAACATGAATGGCAATGGGGCCAAAAAGGGAGGTGGA
GGAAATGATGGGATGCCTCAAGGCATGCCAAACAGGATGATGGCTATGAGTGGAGGTGGA
AACATGGGCCAGTTGGGAAACATGCCTAATCCAATGGGGCAGATGGGTCAAATGGGTGGT
CTTCCAGTGGGCCAAATGGGTGGTCTTCCAATGGGTCAAATGGGTAATCCAGTGGGTCAG
ATGAGCCATGTTTCGGCAGTCCAAGGCCTACCAGCAGGGGCAGCAATGGGGGGCGGTGGT
GGTGGTAATGCCGGTGGCTACTTCCAAGGTGCTGGTCCTGAAGTCATGGCTGGCAATCCT
TACTACCAGCAGCAACAAATGGCAGCTATGATGATGCAGCAACAACAGCAGCAGCAGCGT
GCCAATGGGAACGAAAGGTTTCAACCAATGATGTACGCTCGACCACCACCAGCTGTCAAT
TACATGCCACCACCAGCACCTTACAACCCGTATTACTACGGCCATCCACCACCTCCAAGT
GATAACTACAGCACCTTCTTCAGTGATGAAAACACCAACAGCTGCACTGTGATGTGA