Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400083071
CDS Infomation

pacid=37454333 polypeptide=PGSC0003DMP400055792 locus=PGSC0003DMG400033042 ID=PGSC0003DMT400083071.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCAGACTCTGTGACAGCTCCAGCGACTTACGGGACTCAAGCCGATGCTTTGCTAAGG
AAGAATTTGACATTTCAGAAACGAAATGTCAAGACAAATGTTCGCCTCATCTTAGTCCCT
ATTTTACTCGTTCTTTTAATAAGGTCCATTGAATTCTCGAGTACTGCGATGACGTACAAA
GACACTAAATGTGGCTGCCAATGTGTCGACAAAAATGGTACAGGGAAATGTGAAGAAGTA
TGTGGTCTGGAATACTCAAATCCGTTACAAGCACCAAGTTGTGAAGTTAAAGAACCATAT
GAATGGCATCCCGTTTTCCAGTTACCGGAATCTCAATTTAGTGCTGTAAAAACTGATGTT
ATTACATATCCAGACTTGCCTAATGAGTCATGCAGAGACTCTAATTCTTGTCCAGCTATT
ATACTTGTCACTGGAACTGATCAAACTTTTGGACAAAGTGTGAATGGGTACATGGTCAAA
AATGACTCAACCGTAGAGTCTACTTTCATCACCAACCAGATCATTGGTACAGAGATTCCA
GCTGATCGAACGGGTTTTCAAGACCCTGCTTTCAACTCACGAAAGGCTACATTCTATATT
ATTCAAGCTGGGTGTCCTGCGGATTACAAGGGTGAAGAGATCAATGATGATCACGCAACA
TATATGTTACAATGTCGTGAAGGTTTATCCTTGTGGCGTAATAGTCCCTCTGAGATCAAT
GATGAGCTGTTTAAAGGTTACATAAAGGGGAATACGGAGAAAAAGACAGGCGAGATAGCA
GCAGCATATGATTGGTTAAATACAAATGAAAATAGGTTCAATGTGAGTGTTTGGTATAAT
GGAACCTATAAGTATGAAGGTCAAAGTGAACAATTGGTACGGGTGCCTCCTTTGGTGAAC
CTGGCATCAAATGCCTTCCTTCAAAATTTGCTTGGACCTTCCTTCAATATTCTGTTTGAT
AATATCAAAGAAATGCCCAAGCACGGAAGTATGAGGATGTCGGAGATTTCTTCTCAGATG
GGACCAATTTTATTTTCATGGGTGATTTTACAGCTTTTCCCAGTTGCTTTTGTAGCTCTG
GTTTATGAAAAGCAGCAGAATCTACGAATCATGATGAAAATGCACGGACTTAAGGACGGC
CCCTATTGGACTATTACTTATGCTTATTTTCTTCTCATATCATCTCTCTACATGTTTGGC
TTTGTGGCGTTTGGCTCGCTCTTAGAATTAAGTATCTTTCTTCGTAATGCTTTCAGCATC
CAGTTTGTGTTCTACTTCATCTACATAAACTTGCAAATCGCATGTGCATTTCTGCTGGCT
GGATTTTTCAAAGATGTTAAGACAGCCACAGTCATGGGGTACTTGGTGGTGTTTGCAAGT
GGTCTCTTAGGATCATTCTTTTTCTCAAACTTTCTATCTGGTGCTTCAATATCAGAAGTG
TGGATTATATTGATGGAGCTATATCCTGGATTTGCTCTTTATCGTGGATTATTTGAGTTT
GGGGAATATAGCAAGAGTGGTCTTTATACGGGTGAAAGTGGTGGCATGAAATGGGCAAAT
TTGAGTGATCCTGGTAATGGGATGAAACAGGTTATGATTATAATGTTAGTGGAGTGGATA
GTAGTTCTCCTTGTTGCTTTTTACTTGGACCAGATCAATTCATCAGGGAAAAGTCCCCTA
TTTTTCTTGGAGAACTCGCGGAAGAAGCAGACGCTATCCACTATGAACTTATTAGAAAAG
AAGGATTCTGGAGTTTGTCTTGAAATGGAGAAAGAAGATGTTGCACAAGAGAGGGAAAAG
GTTGAACATATGGTAGCTGGATCGACATCAGGTTATCCCATCGTTGTTGACAACCTGAAA
AAGGTTTATCCAGGGATAGATGGAAACCCCGATAAATATGCAGTTAGAGGACTGTCACTT
GCTGTGCCTGAGGGAGAATGCCTTGGTATGCTTGGCCCCAATGGTGCTGGTAAAACATCA
TTTATTAGTATGATGATTGGGCTGACAAAGCCAAGCTCCGGTGCTGCATTTGTTGATGGC
CTGAATATAAATACAGAGATGGACAAAGTATACACCGTCATGGGTGTATGCCCTCAGCAT
GACCTGCTTTGGGATACATTAACAGGAAGGGAGCACCTACTTTTCTATGGAAGGCTTAAA
AATCTTAAAGGAGAAGTTTTACATCGAGCAGTTGAAGACTCTCTTAAGAGTCTCAACTTG
TTTAACGGAGGCGTTGCTGACAAGCAATCTGGGAGATATAGTGGTGGAATGAAGAGAAGG
CTAAGTGTTGCTATTTCACTCATTGGAAATCCCAAGGTTGTCTACCTGGATGAGCCGAGT
ACTGGACTTGATCCAGCTTCAAGAGATACCTTGTGGACTGTTGTGAAGAATGCACGGAAA
GGCAGAGCGATAATTCTCACTACCCATTCAATGGAAGAAGCGGATTATTTATGTGATCGC
TTAGGAATCTTCGTTGATGGAAGCTTGCAATGCATAGCAAATTCATCAGAGTTGAAGGCA
AGATATGGAGGGTCTTACGTGCTCGCGATAACTACATCAGCTGATAATGAGGTGGAAGTG
GAGAACATGGTGCGACAAATATGCCCAAATGCCAACAAAGTGTATCATTTATCGGGTACA
CAGAAGTTCGAGTTGCCAAAGCATGAATCGAAAATTGCAGATGTATTTCAACTAGTTGAG
AATGCAAAGAGTAGATTTCCAATTTATGCTTGGGGTATGGCTGATACAACTTTAGAAGAT
GTTTTTATCAAGGTTGCTTCTAGTGCTCAATCCTTTAATGAAGCATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400055792
PEP Infomation

pacid=37454333 transcript=PGSC0003DMT400083071 locus=PGSC0003DMG400033042 ID=PGSC0003DMT400083071.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MADSVTAPATYGTQADALLRKNLTFQKRNVKTNVRLILVPILLVLLIRSIEFSSTAMTYK
DTKCGCQCVDKNGTGKCEEVCGLEYSNPLQAPSCEVKEPYEWHPVFQLPESQFSAVKTDV
ITYPDLPNESCRDSNSCPAIILVTGTDQTFGQSVNGYMVKNDSTVESTFITNQIIGTEIP
ADRTGFQDPAFNSRKATFYIIQAGCPADYKGEEINDDHATYMLQCREGLSLWRNSPSEIN
DELFKGYIKGNTEKKTGEIAAAYDWLNTNENRFNVSVWYNGTYKYEGQSEQLVRVPPLVN
LASNAFLQNLLGPSFNILFDNIKEMPKHGSMRMSEISSQMGPILFSWVILQLFPVAFVAL
VYEKQQNLRIMMKMHGLKDGPYWTITYAYFLLISSLYMFGFVAFGSLLELSIFLRNAFSI
QFVFYFIYINLQIACAFLLAGFFKDVKTATVMGYLVVFASGLLGSFFFSNFLSGASISEV
WIILMELYPGFALYRGLFEFGEYSKSGLYTGESGGMKWANLSDPGNGMKQVMIIMLVEWI
VVLLVAFYLDQINSSGKSPLFFLENSRKKQTLSTMNLLEKKDSGVCLEMEKEDVAQEREK
VEHMVAGSTSGYPIVVDNLKKVYPGIDGNPDKYAVRGLSLAVPEGECLGMLGPNGAGKTS
FISMMIGLTKPSSGAAFVDGLNINTEMDKVYTVMGVCPQHDLLWDTLTGREHLLFYGRLK
NLKGEVLHRAVEDSLKSLNLFNGGVADKQSGRYSGGMKRRLSVAISLIGNPKVVYLDEPS
TGLDPASRDTLWTVVKNARKGRAIILTTHSMEEADYLCDRLGIFVDGSLQCIANSSELKA
RYGGSYVLAITTSADNEVEVENMVRQICPNANKVYHLSGTQKFELPKHESKIADVFQLVE
NAKSRFPIYAWGMADTTLEDVFIKVASSAQSFNEA*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400083071
Transcript Infomation

pacid=37454333 locus=PGSC0003DMG400033042 ID=PGSC0003DMT400083071.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCAGACTCTGTGACAGCTCCAGCGACTTACGGGACTCAAGCCGATGCTTTGCTAAGG
AAGAATTTGACATTTCAGAAACGAAATGTCAAGACAAATGTTCGCCTCATCTTAGTCCCT
ATTTTACTCGTTCTTTTAATAAGGTCCATTGAATTCTCGAGTACTGCGATGACGTACAAA
GACACTAAATGTGGCTGCCAATGTGTCGACAAAAATGGTACAGGGAAATGTGAAGAAGTA
TGTGGTCTGGAATACTCAAATCCGTTACAAGCACCAAGTTGTGAAGTTAAAGAACCATAT
GAATGGCATCCCGTTTTCCAGTTACCGGAATCTCAATTTAGTGCTGTAAAAACTGATGTT
ATTACATATCCAGACTTGCCTAATGAGTCATGCAGAGACTCTAATTCTTGTCCAGCTATT
ATACTTGTCACTGGAACTGATCAAACTTTTGGACAAAGTGTGAATGGGTACATGGTCAAA
AATGACTCAACCGTAGAGTCTACTTTCATCACCAACCAGATCATTGGTACAGAGATTCCA
GCTGATCGAACGGGTTTTCAAGACCCTGCTTTCAACTCACGAAAGGCTACATTCTATATT
ATTCAAGCTGGGTGTCCTGCGGATTACAAGGGTGAAGAGATCAATGATGATCACGCAACA
TATATGTTACAATGTCGTGAAGGTTTATCCTTGTGGCGTAATAGTCCCTCTGAGATCAAT
GATGAGCTGTTTAAAGGTTACATAAAGGGGAATACGGAGAAAAAGACAGGCGAGATAGCA
GCAGCATATGATTGGTTAAATACAAATGAAAATAGGTTCAATGTGAGTGTTTGGTATAAT
GGAACCTATAAGTATGAAGGTCAAAGTGAACAATTGGTACGGGTGCCTCCTTTGGTGAAC
CTGGCATCAAATGCCTTCCTTCAAAATTTGCTTGGACCTTCCTTCAATATTCTGTTTGAT
AATATCAAAGAAATGCCCAAGCACGGAAGTATGAGGATGTCGGAGATTTCTTCTCAGATG
GGACCAATTTTATTTTCATGGGTGATTTTACAGCTTTTCCCAGTTGCTTTTGTAGCTCTG
GTTTATGAAAAGCAGCAGAATCTACGAATCATGATGAAAATGCACGGACTTAAGGACGGC
CCCTATTGGACTATTACTTATGCTTATTTTCTTCTCATATCATCTCTCTACATGTTTGGC
TTTGTGGCGTTTGGCTCGCTCTTAGAATTAAGTATCTTTCTTCGTAATGCTTTCAGCATC
CAGTTTGTGTTCTACTTCATCTACATAAACTTGCAAATCGCATGTGCATTTCTGCTGGCT
GGATTTTTCAAAGATGTTAAGACAGCCACAGTCATGGGGTACTTGGTGGTGTTTGCAAGT
GGTCTCTTAGGATCATTCTTTTTCTCAAACTTTCTATCTGGTGCTTCAATATCAGAAGTG
TGGATTATATTGATGGAGCTATATCCTGGATTTGCTCTTTATCGTGGATTATTTGAGTTT
GGGGAATATAGCAAGAGTGGTCTTTATACGGGTGAAAGTGGTGGCATGAAATGGGCAAAT
TTGAGTGATCCTGGTAATGGGATGAAACAGGTTATGATTATAATGTTAGTGGAGTGGATA
GTAGTTCTCCTTGTTGCTTTTTACTTGGACCAGATCAATTCATCAGGGAAAAGTCCCCTA
TTTTTCTTGGAGAACTCGCGGAAGAAGCAGACGCTATCCACTATGAACTTATTAGAAAAG
AAGGATTCTGGAGTTTGTCTTGAAATGGAGAAAGAAGATGTTGCACAAGAGAGGGAAAAG
GTTGAACATATGGTAGCTGGATCGACATCAGGTTATCCCATCGTTGTTGACAACCTGAAA
AAGGTTTATCCAGGGATAGATGGAAACCCCGATAAATATGCAGTTAGAGGACTGTCACTT
GCTGTGCCTGAGGGAGAATGCCTTGGTATGCTTGGCCCCAATGGTGCTGGTAAAACATCA
TTTATTAGTATGATGATTGGGCTGACAAAGCCAAGCTCCGGTGCTGCATTTGTTGATGGC
CTGAATATAAATACAGAGATGGACAAAGTATACACCGTCATGGGTGTATGCCCTCAGCAT
GACCTGCTTTGGGATACATTAACAGGAAGGGAGCACCTACTTTTCTATGGAAGGCTTAAA
AATCTTAAAGGAGAAGTTTTACATCGAGCAGTTGAAGACTCTCTTAAGAGTCTCAACTTG
TTTAACGGAGGCGTTGCTGACAAGCAATCTGGGAGATATAGTGGTGGAATGAAGAGAAGG
CTAAGTGTTGCTATTTCACTCATTGGAAATCCCAAGGTTGTCTACCTGGATGAGCCGAGT
ACTGGACTTGATCCAGCTTCAAGAGATACCTTGTGGACTGTTGTGAAGAATGCACGGAAA
GGCAGAGCGATAATTCTCACTACCCATTCAATGGAAGAAGCGGATTATTTATGTGATCGC
TTAGGAATCTTCGTTGATGGAAGCTTGCAATGCATAGCAAATTCATCAGAGTTGAAGGCA
AGATATGGAGGGTCTTACGTGCTCGCGATAACTACATCAGCTGATAATGAGGTGGAAGTG
GAGAACATGGTGCGACAAATATGCCCAAATGCCAACAAAGTGTATCATTTATCGGGTACA
CAGAAGTTCGAGTTGCCAAAGCATGAATCGAAAATTGCAGATGTATTTCAACTAGTTGAG
AATGCAAAGAGTAGATTTCCAATTTATGCTTGGGGTATGGCTGATACAACTTTAGAAGAT
GTTTTTATCAAGGTTGCTTCTAGTGCTCAATCCTTTAATGAAGCATGA