Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400082483
CDS Infomation

pacid=37474059 polypeptide=PGSC0003DMP400055629 locus=PGSC0003DMG400032564 ID=PGSC0003DMT400082483.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTTGAATGTTACAGTATCTTCAAATCCCGCTACTCTAACACAAAAATTCATCACCTTT
CTTGAAAAATGCAAATCAATTTCAGAGTTCAAGAAACTCCATGCTTTGTTAATAACCTGT
GGCATTTCCAAGGAAACTCAATTCAGTTCAAGAATCCTCTGTTTCACAGCATTATCTGAT
TCCTCCAATATAGACTATGCTCATCGTGTTTTTCTACAAATTAAAAACCCAACAATCTTT
GATTACAATGCTCTTATAAGGGGTTATTCTAACAGCAAAAACCCATGTAAATCTTTGTCT
TTATTTGTTGAAATGTTGCAAAATGAGGTTTTTCCGAACTATTTTACGTACCCTTTTGTT
GTTAAGTGTTTAGCTAAGTTGTGTGAGGTTAGAATTGGTAGGAGTGTTCATGGAGGGGTT
TTGAAAAATGGGTTTGATGTGGATTTGTATGTTTCGAATTCGTTGATTCATATGTATGGT
TCTTGTGGTGATGTTTTGTGTGCGAGGAAGGTGTTTGATGAAATGCCTGTGAAGAATTTG
GTGTCGTGGAATTCGATGTTGGATGGGTATGGGAAATGTGGGGATGTTGTTTTGATGAGG
GAGGTGTTTGATTCGATGATTGAGAGGGATGTTGTGTCGTGGAGCTCTTTGATTGATGGG
TATGTTAAGGATGGAGAATATGCTGAGGCGTTGGCGATGTTTGAGAAAATGAGAGTGGAA
GGGCCAAAAGCGAATGAGGTGACCATGGTGAGTGTTTTGGGTGCTTGTGCTCACTTGGGT
GCGCTTGAGCAAGGGAGGGTAATGCATGAGTACGTGGTTGAGAATAAGTTGCCTATGACT
TTAGTGTTGAGGACGTCGCTTGTTGATATGTATGCTAAGTGTGGTGCAGTAGAGGAGGCA
TTAGTTGTGTTTCGAGAGGCTTTAGGGAGAAAAACCGATGTCTTGATTTGGAATGCCATG
ATTGGAGGTTTGGCAACACATGGCCTGGTTACTGAGTCTTTGGAGTTGTACAAGGAAATG
TGCATTTTAAAGGTGAGACCAGATGAGATTACGTACTTGTGTCTTTTATGCGCTTGTGCT
CATGGAGGATTAGTTAAGGAGGCTTGGTGTTTCTTTGATTCTCTTGGTAAAGATGGAACG
ACAGCAAAGTGTGAGCATTATGCCTGCATGATGGATGTACTAGCACGTGCAGGTCGTTTA
ACAGAAGCCTACAGGTTTCTATGTGAAATGCCTATGGAACCGACTGCTTCCATGTTAGGT
GCACTACTTAGTGGCTGCATCAACCATGGAAGGTTGGATCTTGCAGAAATAGTAGGGAAA
AAGCTTATCGACTTGGAGCCATTTCATGATGGTAGATATGTTGGGTTATCTAATGTATAT
GCACTTAAAAAGCGTTGGGATGAAGCAAAAGCCATGAGAGAAGCTATGGATACTCGGGGA
GTGAAGAAATTGCCTGGTTTCAGTGTTGTGGAGATCTTTGGGGCTCTTCACAGATTCATA
GCACATGATAAAGCACACCCTGAATCGGATCAAATCTACACGATTCTAGATTTTGTTTTG
TGGCAAATGAAGCTTGGTAGAGATTGTGAAGAGCAAGAACAATTGTTATGTGATATCAAT
GTAGGAATTGGTAATGGAGATGATAGCAGTGCCTTGCAGATGAATGATTTTTCGCTATAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400055629
PEP Infomation

pacid=37474059 transcript=PGSC0003DMT400082483 locus=PGSC0003DMG400032564 ID=PGSC0003DMT400082483.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MLNVTVSSNPATLTQKFITFLEKCKSISEFKKLHALLITCGISKETQFSSRILCFTALSD
SSNIDYAHRVFLQIKNPTIFDYNALIRGYSNSKNPCKSLSLFVEMLQNEVFPNYFTYPFV
VKCLAKLCEVRIGRSVHGGVLKNGFDVDLYVSNSLIHMYGSCGDVLCARKVFDEMPVKNL
VSWNSMLDGYGKCGDVVLMREVFDSMIERDVVSWSSLIDGYVKDGEYAEALAMFEKMRVE
GPKANEVTMVSVLGACAHLGALEQGRVMHEYVVENKLPMTLVLRTSLVDMYAKCGAVEEA
LVVFREALGRKTDVLIWNAMIGGLATHGLVTESLELYKEMCILKVRPDEITYLCLLCACA
HGGLVKEAWCFFDSLGKDGTTAKCEHYACMMDVLARAGRLTEAYRFLCEMPMEPTASMLG
ALLSGCINHGRLDLAEIVGKKLIDLEPFHDGRYVGLSNVYALKKRWDEAKAMREAMDTRG
VKKLPGFSVVEIFGALHRFIAHDKAHPESDQIYTILDFVLWQMKLGRDCEEQEQLLCDIN
VGIGNGDDSSALQMNDFSL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400082483
Transcript Infomation

pacid=37474059 locus=PGSC0003DMG400032564 ID=PGSC0003DMT400082483.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTTGAATGTTACAGTATCTTCAAATCCCGCTACTCTAACACAAAAATTCATCACCTTT
CTTGAAAAATGCAAATCAATTTCAGAGTTCAAGAAACTCCATGCTTTGTTAATAACCTGT
GGCATTTCCAAGGAAACTCAATTCAGTTCAAGAATCCTCTGTTTCACAGCATTATCTGAT
TCCTCCAATATAGACTATGCTCATCGTGTTTTTCTACAAATTAAAAACCCAACAATCTTT
GATTACAATGCTCTTATAAGGGGTTATTCTAACAGCAAAAACCCATGTAAATCTTTGTCT
TTATTTGTTGAAATGTTGCAAAATGAGGTTTTTCCGAACTATTTTACGTACCCTTTTGTT
GTTAAGTGTTTAGCTAAGTTGTGTGAGGTTAGAATTGGTAGGAGTGTTCATGGAGGGGTT
TTGAAAAATGGGTTTGATGTGGATTTGTATGTTTCGAATTCGTTGATTCATATGTATGGT
TCTTGTGGTGATGTTTTGTGTGCGAGGAAGGTGTTTGATGAAATGCCTGTGAAGAATTTG
GTGTCGTGGAATTCGATGTTGGATGGGTATGGGAAATGTGGGGATGTTGTTTTGATGAGG
GAGGTGTTTGATTCGATGATTGAGAGGGATGTTGTGTCGTGGAGCTCTTTGATTGATGGG
TATGTTAAGGATGGAGAATATGCTGAGGCGTTGGCGATGTTTGAGAAAATGAGAGTGGAA
GGGCCAAAAGCGAATGAGGTGACCATGGTGAGTGTTTTGGGTGCTTGTGCTCACTTGGGT
GCGCTTGAGCAAGGGAGGGTAATGCATGAGTACGTGGTTGAGAATAAGTTGCCTATGACT
TTAGTGTTGAGGACGTCGCTTGTTGATATGTATGCTAAGTGTGGTGCAGTAGAGGAGGCA
TTAGTTGTGTTTCGAGAGGCTTTAGGGAGAAAAACCGATGTCTTGATTTGGAATGCCATG
ATTGGAGGTTTGGCAACACATGGCCTGGTTACTGAGTCTTTGGAGTTGTACAAGGAAATG
TGCATTTTAAAGGTGAGACCAGATGAGATTACGTACTTGTGTCTTTTATGCGCTTGTGCT
CATGGAGGATTAGTTAAGGAGGCTTGGTGTTTCTTTGATTCTCTTGGTAAAGATGGAACG
ACAGCAAAGTGTGAGCATTATGCCTGCATGATGGATGTACTAGCACGTGCAGGTCGTTTA
ACAGAAGCCTACAGGTTTCTATGTGAAATGCCTATGGAACCGACTGCTTCCATGTTAGGT
GCACTACTTAGTGGCTGCATCAACCATGGAAGGTTGGATCTTGCAGAAATAGTAGGGAAA
AAGCTTATCGACTTGGAGCCATTTCATGATGGTAGATATGTTGGGTTATCTAATGTATAT
GCACTTAAAAAGCGTTGGGATGAAGCAAAAGCCATGAGAGAAGCTATGGATACTCGGGGA
GTGAAGAAATTGCCTGGTTTCAGTGTTGTGGAGATCTTTGGGGCTCTTCACAGATTCATA
GCACATGATAAAGCACACCCTGAATCGGATCAAATCTACACGATTCTAGATTTTGTTTTG
TGGCAAATGAAGCTTGGTAGAGATTGTGAAGAGCAAGAACAATTGTTATGTGATATCAAT
GTAGGAATTGGTAATGGAGATGATAGCAGTGCCTTGCAGATGAATGATTTTTCGCTATAA