Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400082437
CDS Infomation

pacid=37471578 polypeptide=PGSC0003DMP400055587 locus=PGSC0003DMG400032542 ID=PGSC0003DMT400082437.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTTATGGTCATGATGCATCAGCATCAGCATCATCACTCCACTGCTCCCTCAACTCAC
CCAATCAATCCTCCTCCACCTTCTTCAGCTTCCGTTCTTAGATCCCCCAACACATCTACT
TCAAATACCCAGCAATTTCCTTCAATTGGATCGCCTTCTGTGGAACATGGGTTGCCGTTA
GCACGGGTTAAGCTCTCCGATATTGTACCTTATGATGGAGCTCCGGTTGGACCTTATTTG
CGGGCTGTGGAAGCACTTTCAGGATCACTTATGCGGCATAACGCTGCGGTGATTGAGCTC
GGTGGTGAAGGTACTGCGGTGTTACGGTGTGGGTTGGAGTCGGTTAGGTACTTTTTTAAG
ACGAGGGCGGTTGCTCAGAATGGTGGCGGTGGCGCTGCTTTGGGCAAGAGTGGTCGTGGG
GTTTATATATACAGAGCTGGAAGGCCTTTGGAAGACATGGACTCTTCTCCCCCATGCATG
ACTGAAGTTTTCCGCTGCATGGGAAGGGCAGCTCGTGCTGCTTTATGTGCAATTGCAAGG
CATCTTCGATTGCGAAGCGATGTCTTCAATCACTTGCTTGATGATAATCCACTGCCCGTT
AATGAGGCCTCTTCATCTGTTGTTGTTGCAACCTTCTCCAATACCACCTCTCAAAATGGG
AAAGGAGCTATTGGAGGAGGGAAGCTAGTTACAAATGGTGAAGTAGAGAAGGGGCTGTTG
ACACTAGTTTCATCTGATGCTCCTGGTCTTCAGGTTTGTGATCCCAATGGTCGTTGGTAT
CTAGCAGATAGTGGCTTGACTCCTGGGGATTTACTATTGCTTACTGGGAAAGCTCTCAGC
CATGCTACTGCCGGTCTTCGTCCTGCAGCCGTATACCGGGGTTCAGCTGATAATTATGTG
GGCACTACTTGTGGTGGAAGGACATCACTTGCATTTAGGCTTATACCTCAGAGCAATGCA
ATACTGGATTGTTCTCCGATTACAGCTGCTGGTCATGTTATTCCTCATAGCTACGTGCCA
ATATCTGTAAGCCAGTTTATGGATGACCTTTCAGCCGAGGAAGACATGCTTTGTAGCAAT
ACTGATAATGCTTATGTCTCCCGAGACAATCTAAATAAGGAACCATCACTCAGAAGTGTT
CTTTCAGATCCCTTATCTGGCACATTCCTTGAAGATGCTATGTTTGTTTCATGCGGACAT
TCCTTTGGTGGTCTCATGCTGAAAAGGGTTATTGATATGGCAAGATGTACCCTCTGCAAT
GCTGAAATTGAGCGTGGTTCCTTAATTCCTAACCACGTGCTGAGAACTGCGGCTGCAGCA
GTGAAGCATGAGGATGACCGAAGACTTTTCCACAATGCAGCTCTTAGAAAGCGTCGAAAA
GAAGTGGGAGACATTAGGGAAAATGGTGAGCTTCCTTCTGAAAATGGACCCCATAAAGGT
GTTCAGTATCCATTCTCAGTGAATGAGAAAGTTCTTATTAGGGGAAATCGGAGGACACCA
GATAAATTTGTTGGAAAGGAAGCTGTAATCACATCACAGTGTCTTAATGGCTGGTATTTA
CTCAAGATTATGGACAGTGGTGAGAATGTTCGATTGCAGTACCGCTCTCTGCGTAAGTTC
CTTCCTACACAGGAAACAGAGGAGAGATGCCAGTCACAGACAGTTCAGAACAGTAGCTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400055587
PEP Infomation

pacid=37471578 transcript=PGSC0003DMT400082437 locus=PGSC0003DMG400032542 ID=PGSC0003DMT400082437.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MVMVMMHQHQHHHSTAPSTHPINPPPPSSASVLRSPNTSTSNTQQFPSIGSPSVEHGLPL
ARVKLSDIVPYDGAPVGPYLRAVEALSGSLMRHNAAVIELGGEGTAVLRCGLESVRYFFK
TRAVAQNGGGGAALGKSGRGVYIYRAGRPLEDMDSSPPCMTEVFRCMGRAARAALCAIAR
HLRLRSDVFNHLLDDNPLPVNEASSSVVVATFSNTTSQNGKGAIGGGKLVTNGEVEKGLL
TLVSSDAPGLQVCDPNGRWYLADSGLTPGDLLLLTGKALSHATAGLRPAAVYRGSADNYV
GTTCGGRTSLAFRLIPQSNAILDCSPITAAGHVIPHSYVPISVSQFMDDLSAEEDMLCSN
TDNAYVSRDNLNKEPSLRSVLSDPLSGTFLEDAMFVSCGHSFGGLMLKRVIDMARCTLCN
AEIERGSLIPNHVLRTAAAAVKHEDDRRLFHNAALRKRRKEVGDIRENGELPSENGPHKG
VQYPFSVNEKVLIRGNRRTPDKFVGKEAVITSQCLNGWYLLKIMDSGENVRLQYRSLRKF
LPTQETEERCQSQTVQNSS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400082437
Transcript Infomation

pacid=37471578 locus=PGSC0003DMG400032542 ID=PGSC0003DMT400082437.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTTATGGTCATGATGCATCAGCATCAGCATCATCACTCCACTGCTCCCTCAACTCAC
CCAATCAATCCTCCTCCACCTTCTTCAGCTTCCGTTCTTAGATCCCCCAACACATCTACT
TCAAATACCCAGCAATTTCCTTCAATTGGATCGCCTTCTGTGGAACATGGGTTGCCGTTA
GCACGGGTTAAGCTCTCCGATATTGTACCTTATGATGGAGCTCCGGTTGGACCTTATTTG
CGGGCTGTGGAAGCACTTTCAGGATCACTTATGCGGCATAACGCTGCGGTGATTGAGCTC
GGTGGTGAAGGTACTGCGGTGTTACGGTGTGGGTTGGAGTCGGTTAGGTACTTTTTTAAG
ACGAGGGCGGTTGCTCAGAATGGTGGCGGTGGCGCTGCTTTGGGCAAGAGTGGTCGTGGG
GTTTATATATACAGAGCTGGAAGGCCTTTGGAAGACATGGACTCTTCTCCCCCATGCATG
ACTGAAGTTTTCCGCTGCATGGGAAGGGCAGCTCGTGCTGCTTTATGTGCAATTGCAAGG
CATCTTCGATTGCGAAGCGATGTCTTCAATCACTTGCTTGATGATAATCCACTGCCCGTT
AATGAGGCCTCTTCATCTGTTGTTGTTGCAACCTTCTCCAATACCACCTCTCAAAATGGG
AAAGGAGCTATTGGAGGAGGGAAGCTAGTTACAAATGGTGAAGTAGAGAAGGGGCTGTTG
ACACTAGTTTCATCTGATGCTCCTGGTCTTCAGGTTTGTGATCCCAATGGTCGTTGGTAT
CTAGCAGATAGTGGCTTGACTCCTGGGGATTTACTATTGCTTACTGGGAAAGCTCTCAGC
CATGCTACTGCCGGTCTTCGTCCTGCAGCCGTATACCGGGGTTCAGCTGATAATTATGTG
GGCACTACTTGTGGTGGAAGGACATCACTTGCATTTAGGCTTATACCTCAGAGCAATGCA
ATACTGGATTGTTCTCCGATTACAGCTGCTGGTCATGTTATTCCTCATAGCTACGTGCCA
ATATCTGTAAGCCAGTTTATGGATGACCTTTCAGCCGAGGAAGACATGCTTTGTAGCAAT
ACTGATAATGCTTATGTCTCCCGAGACAATCTAAATAAGGAACCATCACTCAGAAGTGTT
CTTTCAGATCCCTTATCTGGCACATTCCTTGAAGATGCTATGTTTGTTTCATGCGGACAT
TCCTTTGGTGGTCTCATGCTGAAAAGGGTTATTGATATGGCAAGATGTACCCTCTGCAAT
GCTGAAATTGAGCGTGGTTCCTTAATTCCTAACCACGTGCTGAGAACTGCGGCTGCAGCA
GTGAAGCATGAGGATGACCGAAGACTTTTCCACAATGCAGCTCTTAGAAAGCGTCGAAAA
GAAGTGGGAGACATTAGGGAAAATGGTGAGCTTCCTTCTGAAAATGGACCCCATAAAGGT
GTTCAGTATCCATTCTCAGTGAATGAGAAAGTTCTTATTAGGGGAAATCGGAGGACACCA
GATAAATTTGTTGGAAAGGAAGCTGTAATCACATCACAGTGTCTTAATGGCTGGTATTTA
CTCAAGATTATGGACAGTGGTGAGAATGTTCGATTGCAGTACCGCTCTCTGCGTAAGTTC
CTTCCTACACAGGAAACAGAGGAGAGATGCCAGTCACAGACAGTTCAGAACAGTAGCTGA