Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400082337
CDS Infomation

pacid=37429704 polypeptide=PGSC0003DMP400055510 locus=PGSC0003DMG400032482 ID=PGSC0003DMT400082337.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTGACAGCTGGAATGGATACAGTGGCTATAACTGTTGAATGGGCTATGGCTGAATTA
GTCAAGAACACAAGGGTTCAACAAAAAGCCCAAGAAGAGTTGGACCGGGTTATCGGGTCG
GACCGGGTCATAACCGAATCCGATATGTCCAAACTCTCCTATCTACAAAGTGTAGTTAAA
GAATCACTAAGGTTACACCCTCCAACTCCACTAATGCTCCCTCACTTGGCTAGTGCTAAT
GTCAAAATTGGTGGTTACAACATTCCTAAGGGTACAATCGTACATGTTAATGTATGGGCA
CTTGGACGAGATCCTAAAGTATGGAAGGATCCTTTGCAATTTAGACCTGAAAGATTCATT
GAAGAGGATATTGACATGAAGGGGCATGATTTTCGACTTTTACCTTTTGGTGCTGGTAGA
CGTATTTGTCCTGGTACAAATCTAGCTATCAATATGGTTACTTCTATGTTAGCTCACTTG
TTACACCATTTTGAATGGTCTCCACCTATTGGAATTGAGCGCGATGACATTGACATGTTG
GAGAGTCCTGGAACTGTTACTTATATGCAAACACCTCTACAAGTTGTTCCTACTCCTAGA
TTGCCTCTACACTTATATGAACGCGGTCCTATCGTTATATAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400055510
PEP Infomation

pacid=37429704 transcript=PGSC0003DMT400082337 locus=PGSC0003DMG400032482 ID=PGSC0003DMT400082337.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MVTAGMDTVAITVEWAMAELVKNTRVQQKAQEELDRVIGSDRVITESDMSKLSYLQSVVK
ESLRLHPPTPLMLPHLASANVKIGGYNIPKGTIVHVNVWALGRDPKVWKDPLQFRPERFI
EEDIDMKGHDFRLLPFGAGRRICPGTNLAINMVTSMLAHLLHHFEWSPPIGIERDDIDML
ESPGTVTYMQTPLQVVPTPRLPLHLYERGPIVI*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400082337
Transcript Infomation

pacid=37429704 locus=PGSC0003DMG400032482 ID=PGSC0003DMT400082337.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTGACAGCTGGAATGGATACAGTGGCTATAACTGTTGAATGGGCTATGGCTGAATTA
GTCAAGAACACAAGGGTTCAACAAAAAGCCCAAGAAGAGTTGGACCGGGTTATCGGGTCG
GACCGGGTCATAACCGAATCCGATATGTCCAAACTCTCCTATCTACAAAGTGTAGTTAAA
GAATCACTAAGGTTACACCCTCCAACTCCACTAATGCTCCCTCACTTGGCTAGTGCTAAT
GTCAAAATTGGTGGTTACAACATTCCTAAGGGTACAATCGTACATGTTAATGTATGGGCA
CTTGGACGAGATCCTAAAGTATGGAAGGATCCTTTGCAATTTAGACCTGAAAGATTCATT
GAAGAGGATATTGACATGAAGGGGCATGATTTTCGACTTTTACCTTTTGGTGCTGGTAGA
CGTATTTGTCCTGGTACAAATCTAGCTATCAATATGGTTACTTCTATGTTAGCTCACTTG
TTACACCATTTTGAATGGTCTCCACCTATTGGAATTGAGCGCGATGACATTGACATGTTG
GAGAGTCCTGGAACTGTTACTTATATGCAAACACCTCTACAAGTTGTTCCTACTCCTAGA
TTGCCTCTACACTTATATGAACGCGGTCCTATCGTTATATAA