Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400081472
CDS Infomation	pacid=37438687 polypeptide=PGSC0003DMP400055144 locus=PGSC0003DMG400031867 ID=PGSC0003DMT400081472.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGCAGATAACCAGCACCCAACTGTTTATCAGAAGGTAGCTAGCCAGATGCATCTGAGC TCCAGTCTTTCACAGGATGTCCATGCTCGCTACGGGGGCATTCAAAGGCCTGCTCTCTCC CAGAGACGTTTTCCGTATGGCAATTACTCTAATGCCGGACTACAAACATGTCAAGCCACA CAGGATCTCTCATTGATTGCCGCAAATGCTTCACCAGTGTTTGTGCAAGCTCCACAAGAG AAAGGACTTGCAGCGTTTGCCACTGACTTCCTCATGGGTGGTGTTTCTGCTGCTGTGTCA AAGACTGCTGCTGCCCCTATTGAGCGTGTGAAGCTTTTGATCCAAAACCAAGATGAGATG ATTAAGGCTGGTAGACTCTCAGAACCATACAAGGGAATTGGAGAGTGTTTTAGTAGGACA ATTAAGGATGAAGGATTTGCTGCCTTGTGGAGAGGAAACACCGCTAATGTCATTCGTTAC TTCCCCACTCAGGCATTGAACTTTGCATTTAAGGACTACTTCAAGAGGCTCTTCAACTTC AAGAAGGACCGCGATGGCTACTGGAAGTGGTTTGCAGGTAACTTGGCATCTGGTGGTGGT GCTGGTGCTTCCTCTTTGCTCTTTGTTTACTCCCTTGACTATGCTCGTACTCGTCTTGCA AATGATGCCAAGGCTGCAAAGAAGGGAGGTGGTGGCAGACAATTTGATGGGTTGGTTGAT GTCTACAGAAAGACACTTAAATCTGATGGAGTTGCTGGCTTGTACCGTGGGTTTAACATT TCATGTGTTGGTATCATTGTGTACCGTGGTTTGTACTTCGGAATGTATGATTCATTGAAG CCAGTGCTGTTGACTGGAAAAATGGAGGATAGTTTCTTTGCTAGCTTTGCTCTTGGATGG CTTATCACCAATGGTGCTGGTCTTGCATCGTACCCTATTGACACAGTTAGGAGAAGAATG ATGATGACATCTGGTGAGGCAGTGAAGTACAAGAGCTCGTTCGATGCATTCAACCAAATC CTTAAGAATGAGGGTCCCAAATCTTTGTTTAAAGGTGCTGGTGCCAACGTCCTCCGTGCC GTTGCTGGTGCTGGTGTGTTGGCTGGTTATGACAAGCTTCAGGTGATCGTCTTTGGAAAG AAATATGGCTCCGGTGGTGGCTAA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400055144
PEP Infomation	pacid=37438687 transcript=PGSC0003DMT400081472 locus=PGSC0003DMG400031867 ID=PGSC0003DMT400081472.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MADNQHPTVYQKVASQMHLSSSLSQDVHARYGGIQRPALSQRRFPYGNYSNAGLQTCQAT QDLSLIAANASPVFVQAPQEKGLAAFATDFLMGGVSAAVSKTAAAPIERVKLLIQNQDEM IKAGRLSEPYKGIGECFSRTIKDEGFAALWRGNTANVIRYFPTQALNFAFKDYFKRLFNF KKDRDGYWKWFAGNLASGGGAGASSLLFVYSLDYARTRLANDAKAAKKGGGGRQFDGLVD VYRKTLKSDGVAGLYRGFNISCVGIIVYRGLYFGMYDSLKPVLLTGKMEDSFFASFALGW LITNGAGLASYPIDTVRRRMMMTSGEAVKYKSSFDAFNQILKNEGPKSLFKGAGANVLRA VAGAGVLAGYDKLQVIVFGKKYGSGGG*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400081472
Transcript Infomation	pacid=37438687 locus=PGSC0003DMG400031867 ID=PGSC0003DMT400081472.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGCAGATAACCAGCACCCAACTGTTTATCAGAAGGTAGCTAGCCAGATGCATCTGAGC TCCAGTCTTTCACAGGATGTCCATGCTCGCTACGGGGGCATTCAAAGGCCTGCTCTCTCC CAGAGACGTTTTCCGTATGGCAATTACTCTAATGCCGGACTACAAACATGTCAAGCCACA CAGGATCTCTCATTGATTGCCGCAAATGCTTCACCAGTGTTTGTGCAAGCTCCACAAGAG AAAGGACTTGCAGCGTTTGCCACTGACTTCCTCATGGGTGGTGTTTCTGCTGCTGTGTCA AAGACTGCTGCTGCCCCTATTGAGCGTGTGAAGCTTTTGATCCAAAACCAAGATGAGATG ATTAAGGCTGGTAGACTCTCAGAACCATACAAGGGAATTGGAGAGTGTTTTAGTAGGACA ATTAAGGATGAAGGATTTGCTGCCTTGTGGAGAGGAAACACCGCTAATGTCATTCGTTAC TTCCCCACTCAGGCATTGAACTTTGCATTTAAGGACTACTTCAAGAGGCTCTTCAACTTC AAGAAGGACCGCGATGGCTACTGGAAGTGGTTTGCAGGTAACTTGGCATCTGGTGGTGGT GCTGGTGCTTCCTCTTTGCTCTTTGTTTACTCCCTTGACTATGCTCGTACTCGTCTTGCA AATGATGCCAAGGCTGCAAAGAAGGGAGGTGGTGGCAGACAATTTGATGGGTTGGTTGAT GTCTACAGAAAGACACTTAAATCTGATGGAGTTGCTGGCTTGTACCGTGGGTTTAACATT TCATGTGTTGGTATCATTGTGTACCGTGGTTTGTACTTCGGAATGTATGATTCATTGAAG CCAGTGCTGTTGACTGGAAAAATGGAGGATAGTTTCTTTGCTAGCTTTGCTCTTGGATGG CTTATCACCAATGGTGCTGGTCTTGCATCGTACCCTATTGACACAGTTAGGAGAAGAATG ATGATGACATCTGGTGAGGCAGTGAAGTACAAGAGCTCGTTCGATGCATTCAACCAAATC CTTAAGAATGAGGGTCCCAAATCTTTGTTTAAAGGTGCTGGTGCCAACGTCCTCCGTGCC GTTGCTGGTGCTGGTGTGTTGGCTGGTTATGACAAGCTTCAGGTGATCGTCTTTGGAAAG AAATATGGCTCCGGTGGTGGCTAA