Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400081438
CDS Infomation

pacid=37455948 polypeptide=PGSC0003DMP400055115 locus=PGSC0003DMG400031837 ID=PGSC0003DMT400081438.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAGATATCAACCAGAAAGCTCATATCTTTAACGCACCCTTCTCTCAATCTTTGGCAT
CCAACTGTCGATTGTTTCACTTGGAATACTCTCATCAGAGCCTATGTTCAACGAACTCAT
CAACCTTCAAGCCCCATCCATACCCCACTCTCCATCTTCCTCCGAATGCGCTTCCATGGC
GTCCATATTGATTACTACACCTTCCCTTTTCTCCTCCAGTCAGTCCATTCTCCACCACAC
CTCCAATTGGGACGATCCATTCACTCACAGGTTCTTGTTTTTGGTTTTTCATCCGACCCG
TTTGTCCAAACTTCGTTGATCAGTATGTACACTGCTTGTGGCGATGTGGGGTCTGCACGA
GATGTGTTTGATGAAATGTCTCAACCGGATTTGCCTGCGTGGAATTCTATTGTTAATGCG
AACGTGAAAGCGGGTTTGCTTAGTGTTGCGCGTGAACTGTTTGTTAAAATGCCAAGCAGA
AATGTTGTATCTTGGAGTAGTATGTTGGATGGTTATGTGAGGTGGGGTAAGTGTGAAGAA
GCATTGGAGTTGTTTAATGAGATGATAAAAGAAAATGAGGTTATGCCTAATGAGTATACC
ATGGCTATTTTGCTTGCGGCGTGTGAGCAGTTGGGTTCACTTGAACATGGGAAATGGGCT
CATGCTTGTGTTTACAAACTCGGGATGGAGATTAATGTTGTTCTTGGGACTTCGTTGATT
GAAATGTACGCTAAATGTGGGAGTATAGTCCGGGCAAGATTAGTTTTTGAAAATTTGGGT
CCAAAGAAGGATGTAATGGCTTGGAGTGCCATGATCTCAGGTCTTGCTATGCATGGACAC
TGGGAAGATTGTCTCTGTTTGTTTTCAAATATGGTTGACAGCGGAGTAATGCCTGATGAT
ATCACGTTCTTAGGTGTTCTTTCTGCTTGTGTACATGGAGGATTGGTGAGCCAAGGGAAG
GAAATGTTTGAGAGGATGAGTAAAGAGTTTGGTATTTCGCCTTCAGTTCAGCATTATGGT
TGTATGATTGACCTTTATGGCAAGGCTGGTTTGATTGATGAAGCGTGGAATCTTCTGAAT
ACAATGCCTATGGAGCCAGATGTGCTTATTTGGGGAGCTCTTCTTAGTGGAGCCAGGATA
TGTGGAGATATTGAAACATGTGAGATTGCACTCAACAAAATAATAGAGCAAGATCCCACA
AATAGTGCAGCTTATGTTCTTCTCTCCAATGTCTACGCTAAGATGGGTCGGTGGAAAGAT
GCTAGGGACATCAGAAACGTTATGGAGACAAATAAGGTACAGAAAGTTCCTGGGCGTAGT
TCCATAGAGGTCAATTCAAATATCCAGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400055115
PEP Infomation

pacid=37455948 transcript=PGSC0003DMT400081438 locus=PGSC0003DMG400031837 ID=PGSC0003DMT400081438.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MKISTRKLISLTHPSLNLWHPTVDCFTWNTLIRAYVQRTHQPSSPIHTPLSIFLRMRFHG
VHIDYYTFPFLLQSVHSPPHLQLGRSIHSQVLVFGFSSDPFVQTSLISMYTACGDVGSAR
DVFDEMSQPDLPAWNSIVNANVKAGLLSVARELFVKMPSRNVVSWSSMLDGYVRWGKCEE
ALELFNEMIKENEVMPNEYTMAILLAACEQLGSLEHGKWAHACVYKLGMEINVVLGTSLI
EMYAKCGSIVRARLVFENLGPKKDVMAWSAMISGLAMHGHWEDCLCLFSNMVDSGVMPDD
ITFLGVLSACVHGGLVSQGKEMFERMSKEFGISPSVQHYGCMIDLYGKAGLIDEAWNLLN
TMPMEPDVLIWGALLSGARICGDIETCEIALNKIIEQDPTNSAAYVLLSNVYAKMGRWKD
ARDIRNVMETNKVQKVPGRSSIEVNSNIQ*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400081438
Transcript Infomation

pacid=37455948 locus=PGSC0003DMG400031837 ID=PGSC0003DMT400081438.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAGATATCAACCAGAAAGCTCATATCTTTAACGCACCCTTCTCTCAATCTTTGGCAT
CCAACTGTCGATTGTTTCACTTGGAATACTCTCATCAGAGCCTATGTTCAACGAACTCAT
CAACCTTCAAGCCCCATCCATACCCCACTCTCCATCTTCCTCCGAATGCGCTTCCATGGC
GTCCATATTGATTACTACACCTTCCCTTTTCTCCTCCAGTCAGTCCATTCTCCACCACAC
CTCCAATTGGGACGATCCATTCACTCACAGGTTCTTGTTTTTGGTTTTTCATCCGACCCG
TTTGTCCAAACTTCGTTGATCAGTATGTACACTGCTTGTGGCGATGTGGGGTCTGCACGA
GATGTGTTTGATGAAATGTCTCAACCGGATTTGCCTGCGTGGAATTCTATTGTTAATGCG
AACGTGAAAGCGGGTTTGCTTAGTGTTGCGCGTGAACTGTTTGTTAAAATGCCAAGCAGA
AATGTTGTATCTTGGAGTAGTATGTTGGATGGTTATGTGAGGTGGGGTAAGTGTGAAGAA
GCATTGGAGTTGTTTAATGAGATGATAAAAGAAAATGAGGTTATGCCTAATGAGTATACC
ATGGCTATTTTGCTTGCGGCGTGTGAGCAGTTGGGTTCACTTGAACATGGGAAATGGGCT
CATGCTTGTGTTTACAAACTCGGGATGGAGATTAATGTTGTTCTTGGGACTTCGTTGATT
GAAATGTACGCTAAATGTGGGAGTATAGTCCGGGCAAGATTAGTTTTTGAAAATTTGGGT
CCAAAGAAGGATGTAATGGCTTGGAGTGCCATGATCTCAGGTCTTGCTATGCATGGACAC
TGGGAAGATTGTCTCTGTTTGTTTTCAAATATGGTTGACAGCGGAGTAATGCCTGATGAT
ATCACGTTCTTAGGTGTTCTTTCTGCTTGTGTACATGGAGGATTGGTGAGCCAAGGGAAG
GAAATGTTTGAGAGGATGAGTAAAGAGTTTGGTATTTCGCCTTCAGTTCAGCATTATGGT
TGTATGATTGACCTTTATGGCAAGGCTGGTTTGATTGATGAAGCGTGGAATCTTCTGAAT
ACAATGCCTATGGAGCCAGATGTGCTTATTTGGGGAGCTCTTCTTAGTGGAGCCAGGATA
TGTGGAGATATTGAAACATGTGAGATTGCACTCAACAAAATAATAGAGCAAGATCCCACA
AATAGTGCAGCTTATGTTCTTCTCTCCAATGTCTACGCTAAGATGGGTCGGTGGAAAGAT
GCTAGGGACATCAGAAACGTTATGGAGACAAATAAGGTACAGAAAGTTCCTGGGCGTAGT
TCCATAGAGGTCAATTCAAATATCCAGTAG