Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400081241
CDS Infomation

pacid=37427095 polypeptide=PGSC0003DMP400054970 locus=PGSC0003DMG400031757 ID=PGSC0003DMT400081241.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGGAAGAGTTCGAAGAATGGTGCGCTCTTCAAGGACAAGGCGAAAAATCGCGTTGAT
GATCTGCAGGGTATGTTCATGAACCTGCAATCTGCAAGGAAAGAAAGTCGAACTTATGAT
GCTGGGGTGCTGGAAGAGCAGGTCCACCAGATGCTTCGTGAGTGGAAAGCTGAGCTCAAT
GAGCCTTCCCCTGCCTCTTCTTTGCAGGGAGGAAGCCGTATCTCATCAGACCTCTATAGG
CTGCTGCATGGTGAGGAGGAAGATGATGCTACCAGTGCATTAGCTGCTCCTAAGCCTGAG
CCTGATGCTCAAAAACAAGATGTTACTGGTTTCCAGGAGGGTTTCAATGCAACGCCGGTG
CTGCAGGATCAAGGTTACCAGTTGGTTGATGAATGCAAAAATACGCCTTTAGTCGTCAAC
AATGCAGGGATTAACAACCTAGGCGTTGCAACACAATTAGATTACCATTCTTTTGATCTG
CACCAAGACTTTGATCAGTTTGGATTTGATGCTTTAAATCTTTGTCTAGAGGATGATTTG
TCTCCTATTCAGATTAGCCCTCCACCCTCTGCTTTCCTGGGACCTAAATGTGCACTTTGG
GATTGTCCTCGACCTGCGATGGGGTCAGATTGGTGCCAGAAGTCTCATGACTACTGCAGT
GACTATCATGCTGCTCTTGCGCCTAATGAAGGCTATCTTGGAAGACCTCCAGTTGTTCGA
CCAATGGGTGTTGGCTTAAAGGATAGTTTACTTTTCCAAGCTCTAAGTGCTAAAGCACAC
GGGAAAGATGTTGGTGTTCCAGAATGTAAGGGTGCTGCCACTGCAAAGTCCCCCTGGAAT
GCACCAGAGCTCTTTGACCTTAAAGTTGTTGTGGGTGAAACAATCAGGGAATGGCTTTTC
TTTGATAAGCCTCGAAGAGCATTTGAAAGTGGAAACAGAAAGCAGAGGTCACTGCCAGAT
TATAACGGGCGGGGTTGGCATGAGTCTAGGAAGCAAGTGATAAATGATTATGGAGGGCTG
AAGAGATCCTACTATATGGATCCACAGCCAATGAAAAATCTGGAATGGCATTTGTATGAA
TATGAGATCAACAAGTATGATGCATGGGCCTTGTACAGATTGGAGCTTAAACTTGTTGAT
GGGAAGAAAAGTCCAAAAGGGAAAGTAACGAATGAGTCAGTTGCTGATTTGCAAAAGCAA
ATGGGAAGGCTCTCTGCTGAATTTCCTTTGGAGAACAAGCGCTCTGCTAAAGGCAGAGGA
AAGGCCAACTCAAAGGATGTTGGTACTAACGGGCCTCCTGCTCCAAATCAAACTGTTCCC
GCTATTGAAGGGTTTGATTATGTGGCCGGTGCACTTTTCCCTGATTATCTTGTTGATAAT
ACAGGTGGCTACTACATAACGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400054970
PEP Infomation

pacid=37427095 transcript=PGSC0003DMT400081241 locus=PGSC0003DMG400031757 ID=PGSC0003DMT400081241.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGKSSKNGALFKDKAKNRVDDLQGMFMNLQSARKESRTYDAGVLEEQVHQMLREWKAELN
EPSPASSLQGGSRISSDLYRLLHGEEEDDATSALAAPKPEPDAQKQDVTGFQEGFNATPV
LQDQGYQLVDECKNTPLVVNNAGINNLGVATQLDYHSFDLHQDFDQFGFDALNLCLEDDL
SPIQISPPPSAFLGPKCALWDCPRPAMGSDWCQKSHDYCSDYHAALAPNEGYLGRPPVVR
PMGVGLKDSLLFQALSAKAHGKDVGVPECKGAATAKSPWNAPELFDLKVVVGETIREWLF
FDKPRRAFESGNRKQRSLPDYNGRGWHESRKQVINDYGGLKRSYYMDPQPMKNLEWHLYE
YEINKYDAWALYRLELKLVDGKKSPKGKVTNESVADLQKQMGRLSAEFPLENKRSAKGRG
KANSKDVGTNGPPAPNQTVPAIEGFDYVAGALFPDYLVDNTGGYYIT*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400081241
Transcript Infomation

pacid=37427095 locus=PGSC0003DMG400031757 ID=PGSC0003DMT400081241.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGGAAGAGTTCGAAGAATGGTGCGCTCTTCAAGGACAAGGCGAAAAATCGCGTTGAT
GATCTGCAGGGTATGTTCATGAACCTGCAATCTGCAAGGAAAGAAAGTCGAACTTATGAT
GCTGGGGTGCTGGAAGAGCAGGTCCACCAGATGCTTCGTGAGTGGAAAGCTGAGCTCAAT
GAGCCTTCCCCTGCCTCTTCTTTGCAGGGAGGAAGCCGTATCTCATCAGACCTCTATAGG
CTGCTGCATGGTGAGGAGGAAGATGATGCTACCAGTGCATTAGCTGCTCCTAAGCCTGAG
CCTGATGCTCAAAAACAAGATGTTACTGGTTTCCAGGAGGGTTTCAATGCAACGCCGGTG
CTGCAGGATCAAGGTTACCAGTTGGTTGATGAATGCAAAAATACGCCTTTAGTCGTCAAC
AATGCAGGGATTAACAACCTAGGCGTTGCAACACAATTAGATTACCATTCTTTTGATCTG
CACCAAGACTTTGATCAGTTTGGATTTGATGCTTTAAATCTTTGTCTAGAGGATGATTTG
TCTCCTATTCAGATTAGCCCTCCACCCTCTGCTTTCCTGGGACCTAAATGTGCACTTTGG
GATTGTCCTCGACCTGCGATGGGGTCAGATTGGTGCCAGAAGTCTCATGACTACTGCAGT
GACTATCATGCTGCTCTTGCGCCTAATGAAGGCTATCTTGGAAGACCTCCAGTTGTTCGA
CCAATGGGTGTTGGCTTAAAGGATAGTTTACTTTTCCAAGCTCTAAGTGCTAAAGCACAC
GGGAAAGATGTTGGTGTTCCAGAATGTAAGGGTGCTGCCACTGCAAAGTCCCCCTGGAAT
GCACCAGAGCTCTTTGACCTTAAAGTTGTTGTGGGTGAAACAATCAGGGAATGGCTTTTC
TTTGATAAGCCTCGAAGAGCATTTGAAAGTGGAAACAGAAAGCAGAGGTCACTGCCAGAT
TATAACGGGCGGGGTTGGCATGAGTCTAGGAAGCAAGTGATAAATGATTATGGAGGGCTG
AAGAGATCCTACTATATGGATCCACAGCCAATGAAAAATCTGGAATGGCATTTGTATGAA
TATGAGATCAACAAGTATGATGCATGGGCCTTGTACAGATTGGAGCTTAAACTTGTTGAT
GGGAAGAAAAGTCCAAAAGGGAAAGTAACGAATGAGTCAGTTGCTGATTTGCAAAAGCAA
ATGGGAAGGCTCTCTGCTGAATTTCCTTTGGAGAACAAGCGCTCTGCTAAAGGCAGAGGA
AAGGCCAACTCAAAGGATGTTGGTACTAACGGGCCTCCTGCTCCAAATCAAACTGTTCCC
GCTATTGAAGGGTTTGATTATGTGGCCGGTGCACTTTTCCCTGATTATCTTGTTGATAAT
ACAGGTGGCTACTACATAACGTAG