Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400079890
CDS Infomation

pacid=37437971 polypeptide=PGSC0003DMP400054194 locus=PGSC0003DMG400031114 ID=PGSC0003DMT400079890.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAACTCGAAGTTCGGAAGAATTGAAGCTGCTCGCCATGTGTTCGATAGTATGCCTGAG
AGAAATTCGGCGTCTTGGAATAATATGGTGTCTGGGTATGTCAAGATGGGTCTTTACTGG
GATGCTGTAGTTCTTTTTGTTGAAATGTGGGGTTGTGGAGTTCAACCAAATGGGTACTTT
ATAGCAAGTTTGTTGACTGCATTAAGTAAATTGGAAAATATGGTTTTGGAAGGATTTCAA
ATTCATGGATTGGTTTTGAAATATGGTTTGTTGAATGATGTTTTTGTGGGGACTTCGTTT
CTCCATTTTTATGGTGTATATGGACTACCTTGTAGTGCTAAAACATTGTTTGAGGAAATG
CTGGAAAGAAATGTTGTTACTTGGACTTCTTTGATGGTTGCATATTCAGATAATGGTTAC
CCGGATGTGGTAATAAATTTATACCAAAGAATGAGGCATGAGGAGGTGTCTGGTAATCAA
AACACACTTACTGCTGTTATTAGTTCTTGCATAGCTCTTGATGATGATTTTTTGGGTCAT
CAAGTGCTAGGTCAGGTTGTAAAGTCTGGATTCCAGGACAATGTTTCCGTATCAAATTCT
CTTATTTCGATGTTTGGAAGTTTTGGTTTCGTTGAGGATGCCTCTTATATCTTTGAGGGA
ATGAACGACCGTGACACTATATCGTGGAATTCAATTATTTCTGCACTAGCATATAACGAG
TTATCCGAAAAGGTGTTCAGCTCGTTTTCTGAAATGCGACATGATCACGACGATGTCAAT
TCAACAACACTTTCTTCATTGTTGTCTGTTTGTGGAACTATAGATTGTCTAAACTTAGGG
AGAGGTGTTCATGGTTTGTCGTTGAAATTGGGATGGGATTCTAATATTTGTGTGTCAAAT
ACTCTTCTCTCAATGTATTTGGAGGCTTCAAGGGACAAAGATGCCGAAAGTTTGTTCTTG
GCAATGCCAGCAAAAGATTTGATTTCATGGAACTCCATGATGGCTGGTTATGTTTTAGCA
GGCAAGTACTTCAAGGTTTTGGAAGTGTTGGCTCAACTGCTTCACTTGCAAAGAACAGTT
AATTATGTGACCTTTGCTAGTGCTTTGGCTGCTTGTTCAGATGGTCAATTGCTTGATGAA
GGCAAAACTATTCATGCTCTTGTAATTGCTCATGGGCTCCATGACAATTTAATAGTTGGC
AATGCCTTAGTCACTATGTACGGAAAGTGTGGTATGATGTGGGAGGCTAAAATGGTATTT
CAAAAAATGCCTGACAGGGAATTAGTCACTTGGAATGCATTAATTGGTGGCTATGCAGAT
AAAAAGGACACACTTGAGGCAGTGAGAACTTTTAAGTTAATGAGAGAGGAAGAAAATTCT
CCAAATTACATTACTTTGATCAATGTTCTTGGTTCTTGCTCAACTGAAACTGATCTTCTG
AAGTATGGCATGCCATTGCACGGACATATAATTCTGACTGGTTTTGAGACAAATGAATAC
ATTAGGAACTCTCTCATAACAATGTATGCTGACTGTGGTGATGTCAATTCGAGTAGTCTT
ATCTTTAATGCGCTACTAATTAAGACATCAGTGACCTGGAATGCTATGCTTGCAGCTAAT
GCTTGTCTTGGTCTCTGGGAGGAAGCGTTGAAACTTCTCCTGCAGATGCAAAGGGAAAAA
CTGGAGTTTGATCAATTCAGCCTCTCTGCTGCACTTTCAGCTGCAGCAAACTTGGCATCC
TTGGAAGAGGGACAACAGATTCACTGTTTAGCTACTAAACTTGGATTTGATTCCAATTCT
TTTGTTGGAAACGCTACGATGGATATGTATGGGAAATGTGGTGAAATGAACAATGTGCTG
AAAATATTCCCTGAACCAAACCTGCGTCCAAGATTGTCTTGGAATGTATTAATATCTGTT
TTTGCCAGACATGGATTTTTCCAAAAAGCTAGGGATACTTTTCACGATATGGTTAAGCAA
GGTTCAAAACTAGACCATGTCACTTTTGTGTCTCTTCTATCAGCCTGTAGCCACGGTGGT
CTAGTAGATGAAGGTCTTAGATATTTTGCTGCTATGACTTCTGAATTTGGAGTCCCGGCT
GGCATTGAGCACTGTGTTTGTGTAGTAGACCTTCTTGGAAGATCTGGAAGGCTCCCTGAA
GCAATAGCTTTTATTAAAGAAATGCCTGTGCCACCAAACGACTTTGTTTGGAGAAGCTTG
TTGGCAGCATGCAGGATGCACAGGAATACAGAACTAGGAAAAGTAGCAGCTGAAAATCTT
CTAACATCTAACCCATCGGATGATTCAGCTTATGTTCTTTATTCAAATATCTGTGCAACT
TCTGGGAGGTGGCAGGACGTTCAGAATGTGAGAGCTGAAATGGAATCACATAAAGTGAAA
AAGCAGCTTGCTTGCAGTTGGGTCAAGTTAAAGAACCAAATTTGCACCTTTGGGATCGGA
GACTTGTCTCACCCAGAGTCGGTGCAAATATACAGGAAGTTGACAGAACTGAGAAAAAAG
ATTCAGGAGGCCGGTTATATTGCTGATACAAGCTTTGCATTGCATGACACAGATGAAGAA
CAGAAGGAGCACAATTTATGGATGCACAGTGAAAGACTTGCACTGGCATATGGTTTGATT
AGTACTCCTGAAGGTTCAACTCTTCGAATATTTAAGAACCTTAGAGTCTGCGGTGATTGC
CATTCAGTTTTCAAGTTGGTAAGCAACATTATTAGTAGGGAAATCATATTGAGGGATCCT
TATCGGTTTCACCACTTTAGTAGTGGCCAATGTTCTTGTGGTGATTACTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400054194
PEP Infomation

pacid=37437971 transcript=PGSC0003DMT400079890 locus=PGSC0003DMG400031114 ID=PGSC0003DMT400079890.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MNSKFGRIEAARHVFDSMPERNSASWNNMVSGYVKMGLYWDAVVLFVEMWGCGVQPNGYF
IASLLTALSKLENMVLEGFQIHGLVLKYGLLNDVFVGTSFLHFYGVYGLPCSAKTLFEEM
LERNVVTWTSLMVAYSDNGYPDVVINLYQRMRHEEVSGNQNTLTAVISSCIALDDDFLGH
QVLGQVVKSGFQDNVSVSNSLISMFGSFGFVEDASYIFEGMNDRDTISWNSIISALAYNE
LSEKVFSSFSEMRHDHDDVNSTTLSSLLSVCGTIDCLNLGRGVHGLSLKLGWDSNICVSN
TLLSMYLEASRDKDAESLFLAMPAKDLISWNSMMAGYVLAGKYFKVLEVLAQLLHLQRTV
NYVTFASALAACSDGQLLDEGKTIHALVIAHGLHDNLIVGNALVTMYGKCGMMWEAKMVF
QKMPDRELVTWNALIGGYADKKDTLEAVRTFKLMREEENSPNYITLINVLGSCSTETDLL
KYGMPLHGHIILTGFETNEYIRNSLITMYADCGDVNSSSLIFNALLIKTSVTWNAMLAAN
ACLGLWEEALKLLLQMQREKLEFDQFSLSAALSAAANLASLEEGQQIHCLATKLGFDSNS
FVGNATMDMYGKCGEMNNVLKIFPEPNLRPRLSWNVLISVFARHGFFQKARDTFHDMVKQ
GSKLDHVTFVSLLSACSHGGLVDEGLRYFAAMTSEFGVPAGIEHCVCVVDLLGRSGRLPE
AIAFIKEMPVPPNDFVWRSLLAACRMHRNTELGKVAAENLLTSNPSDDSAYVLYSNICAT
SGRWQDVQNVRAEMESHKVKKQLACSWVKLKNQICTFGIGDLSHPESVQIYRKLTELRKK
IQEAGYIADTSFALHDTDEEQKEHNLWMHSERLALAYGLISTPEGSTLRIFKNLRVCGDC
HSVFKLVSNIISREIILRDPYRFHHFSSGQCSCGDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400079890
Transcript Infomation

pacid=37437971 locus=PGSC0003DMG400031114 ID=PGSC0003DMT400079890.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAACTCGAAGTTCGGAAGAATTGAAGCTGCTCGCCATGTGTTCGATAGTATGCCTGAG
AGAAATTCGGCGTCTTGGAATAATATGGTGTCTGGGTATGTCAAGATGGGTCTTTACTGG
GATGCTGTAGTTCTTTTTGTTGAAATGTGGGGTTGTGGAGTTCAACCAAATGGGTACTTT
ATAGCAAGTTTGTTGACTGCATTAAGTAAATTGGAAAATATGGTTTTGGAAGGATTTCAA
ATTCATGGATTGGTTTTGAAATATGGTTTGTTGAATGATGTTTTTGTGGGGACTTCGTTT
CTCCATTTTTATGGTGTATATGGACTACCTTGTAGTGCTAAAACATTGTTTGAGGAAATG
CTGGAAAGAAATGTTGTTACTTGGACTTCTTTGATGGTTGCATATTCAGATAATGGTTAC
CCGGATGTGGTAATAAATTTATACCAAAGAATGAGGCATGAGGAGGTGTCTGGTAATCAA
AACACACTTACTGCTGTTATTAGTTCTTGCATAGCTCTTGATGATGATTTTTTGGGTCAT
CAAGTGCTAGGTCAGGTTGTAAAGTCTGGATTCCAGGACAATGTTTCCGTATCAAATTCT
CTTATTTCGATGTTTGGAAGTTTTGGTTTCGTTGAGGATGCCTCTTATATCTTTGAGGGA
ATGAACGACCGTGACACTATATCGTGGAATTCAATTATTTCTGCACTAGCATATAACGAG
TTATCCGAAAAGGTGTTCAGCTCGTTTTCTGAAATGCGACATGATCACGACGATGTCAAT
TCAACAACACTTTCTTCATTGTTGTCTGTTTGTGGAACTATAGATTGTCTAAACTTAGGG
AGAGGTGTTCATGGTTTGTCGTTGAAATTGGGATGGGATTCTAATATTTGTGTGTCAAAT
ACTCTTCTCTCAATGTATTTGGAGGCTTCAAGGGACAAAGATGCCGAAAGTTTGTTCTTG
GCAATGCCAGCAAAAGATTTGATTTCATGGAACTCCATGATGGCTGGTTATGTTTTAGCA
GGCAAGTACTTCAAGGTTTTGGAAGTGTTGGCTCAACTGCTTCACTTGCAAAGAACAGTT
AATTATGTGACCTTTGCTAGTGCTTTGGCTGCTTGTTCAGATGGTCAATTGCTTGATGAA
GGCAAAACTATTCATGCTCTTGTAATTGCTCATGGGCTCCATGACAATTTAATAGTTGGC
AATGCCTTAGTCACTATGTACGGAAAGTGTGGTATGATGTGGGAGGCTAAAATGGTATTT
CAAAAAATGCCTGACAGGGAATTAGTCACTTGGAATGCATTAATTGGTGGCTATGCAGAT
AAAAAGGACACACTTGAGGCAGTGAGAACTTTTAAGTTAATGAGAGAGGAAGAAAATTCT
CCAAATTACATTACTTTGATCAATGTTCTTGGTTCTTGCTCAACTGAAACTGATCTTCTG
AAGTATGGCATGCCATTGCACGGACATATAATTCTGACTGGTTTTGAGACAAATGAATAC
ATTAGGAACTCTCTCATAACAATGTATGCTGACTGTGGTGATGTCAATTCGAGTAGTCTT
ATCTTTAATGCGCTACTAATTAAGACATCAGTGACCTGGAATGCTATGCTTGCAGCTAAT
GCTTGTCTTGGTCTCTGGGAGGAAGCGTTGAAACTTCTCCTGCAGATGCAAAGGGAAAAA
CTGGAGTTTGATCAATTCAGCCTCTCTGCTGCACTTTCAGCTGCAGCAAACTTGGCATCC
TTGGAAGAGGGACAACAGATTCACTGTTTAGCTACTAAACTTGGATTTGATTCCAATTCT
TTTGTTGGAAACGCTACGATGGATATGTATGGGAAATGTGGTGAAATGAACAATGTGCTG
AAAATATTCCCTGAACCAAACCTGCGTCCAAGATTGTCTTGGAATGTATTAATATCTGTT
TTTGCCAGACATGGATTTTTCCAAAAAGCTAGGGATACTTTTCACGATATGGTTAAGCAA
GGTTCAAAACTAGACCATGTCACTTTTGTGTCTCTTCTATCAGCCTGTAGCCACGGTGGT
CTAGTAGATGAAGGTCTTAGATATTTTGCTGCTATGACTTCTGAATTTGGAGTCCCGGCT
GGCATTGAGCACTGTGTTTGTGTAGTAGACCTTCTTGGAAGATCTGGAAGGCTCCCTGAA
GCAATAGCTTTTATTAAAGAAATGCCTGTGCCACCAAACGACTTTGTTTGGAGAAGCTTG
TTGGCAGCATGCAGGATGCACAGGAATACAGAACTAGGAAAAGTAGCAGCTGAAAATCTT
CTAACATCTAACCCATCGGATGATTCAGCTTATGTTCTTTATTCAAATATCTGTGCAACT
TCTGGGAGGTGGCAGGACGTTCAGAATGTGAGAGCTGAAATGGAATCACATAAAGTGAAA
AAGCAGCTTGCTTGCAGTTGGGTCAAGTTAAAGAACCAAATTTGCACCTTTGGGATCGGA
GACTTGTCTCACCCAGAGTCGGTGCAAATATACAGGAAGTTGACAGAACTGAGAAAAAAG
ATTCAGGAGGCCGGTTATATTGCTGATACAAGCTTTGCATTGCATGACACAGATGAAGAA
CAGAAGGAGCACAATTTATGGATGCACAGTGAAAGACTTGCACTGGCATATGGTTTGATT
AGTACTCCTGAAGGTTCAACTCTTCGAATATTTAAGAACCTTAGAGTCTGCGGTGATTGC
CATTCAGTTTTCAAGTTGGTAAGCAACATTATTAGTAGGGAAATCATATTGAGGGATCCT
TATCGGTTTCACCACTTTAGTAGTGGCCAATGTTCTTGTGGTGATTACTGGTGA