Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400079854
CDS Infomation

pacid=37431492 polypeptide=PGSC0003DMP400054167 locus=PGSC0003DMG400031100 ID=PGSC0003DMT400079854.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAGGAAGAAGCTATAAGCTCTTCCCATGATCCTCAATTGCCGCCCAAATCATCGTCT
CCTCCCCCTATCCCTACACCTGCTGCTAGTTCTGTAGGGGCATCATCTCCTGCCGTTCCA
ACAAATGCTGGGGGCACAGATTGGTTTGCACAAGCACAGGGTTCAAAAGCAGCTTCACTT
TCCCGTATTGGTTCACAGCCCATGTGGACTTCAGTGAGCAATAGTGCTGGTGGTTCAGCT
CTAGGATCATCACAACCTTCATGTAGACCATGGGAAAGGGGTGATCTATTGAGGCGTCTG
TCCACTTTCCAACCCACAAACTGGTTTGGGAAGCCTAAGGCTTCAAGTTCACTGGCTTGT
GCTAGAAGAGGCTGGGTGAATGTGGATGTTGATACAATCGAGTGTGAAGCTTGTGGTGCT
AATCTGAGATTCGTTTCTTCTGCAACGTGGACCTCTGATGAAGCTGATATCGCGGGGGAA
GAATTTGCTAAGAAACTTGATGAAGGGCACAAGGCCACTTGTCCTTGGAGAGGAAACAGC
TGTGCAGAAAGCTTGGTCCAGTTCCCTCCTACACCACCATCAGCCTTAATTGGTGGTTAT
AAGGATCGATGTGATGGATTGCTTCAGTTTCCTTCACTTCCAATTGTGGCTGCATCTGCA
ATTGAGCACATCAAGGCCTCTCGAAGTTCAGAAATTGATCGCCTTCTAGCTCAGTCGCAG
GCTTTTGGTGGGATGGAACCCATCTTTAGGTTAGAGATTATGTCAGGAACTGAAACCAAC
ATAGACGATGTCTTCCTTGTATACTCTCGTGCCAATAAGTTGATAAGCCTGTGTGGATGG
GAACCGAGATGGCTTCCAAATGTCCAAGACTGTGAAGAACATTCTGCTCAATCAGCTAGG
AGTGGGTACTCCATTGGTCCCACAAAATATCACACTTCTCTGCAAGATTTTGGCCATGGA
GAAAATGTATTGCCTTCTTCAAAGAAAAAAGTTCATAGTAAGAACGAAGCTGTGGGTCCC
AGGTCTAAAGGTGAATCTAGGTCACCTTTATTGGATTGTAGTTTGTGTGGAGCCACCGTG
AGAATCTGGGACTTCCTCACTGTTGTCCGTCCTGCTTGCTTTGCTCCAAATAGCAATGAT
ATCCCTGAAACAAGCAAGAAAATGGCATTGACACGTGGAGTAAGTGCTGCTAGTGGAATC
AGTGGGTGGGTTGCTGCTGATGGTGTGGAAAAGGAACAGACAGAGGACCTTGATGAGGCT
GCAACAAATGAAGTGGGAAGGTCTTTGTCAAATATAGGAGTAGATCTGAATCTCACAATG
GCTGGTGGATTATCCTCTTCACAGGTGAACATGGATGCAATGCCTGAACAATTCCAAGAT
GTCCATAAACGAAGATATCCAGTTACGGGGCAACCTTCGAGCAGTGAAGTTGGTGGTCAA
GCAGCTTCATATGAATCCCGAGGCCCTAGTTCTCGCAAACGAAACTTAGAGGAAGGTGGA
AGCACGGTTGACAGGCCACAATTGCCTGTACAACCAGCCGATAGTGTTGAAGGCACTGTG
ATAGACCGTGACGGAGATGAAGTAAATGATGGTAGTCAGTACTCAGCTGGCCCATCAAAG
CGTCCATGCCAGTCTGATGCCTTCGGGACCCACCATACTTCATATGGCAAGGATTCGTCA
GGTGCTGGTCCTAGCCTGTCACTTGGTTTTGAGATTGGTACAGGTGCTCCCAAAGATGAT
ACCTTTGGCCGAAGACACGAACAGCTAATTGGTGTGCCCTCTACTCGAGATTCAACACAT
GTTTCATCTGTTATTGCAATGGACACTGTTCACAGTACAGATGATTCAATGGAAAGTGTT
GAGAATCTCCCCGGAGACTTTGATGATGTTGATTTCCCTTCTACATCTATGTTAAGAAGT
GCAGACCCAGTGGAAACTTCGGAATTGAACTACAGTAACCAAGCACAACAGAGTACTTGT
CCAGCTGTGGTCAGAAGTGCTGGTGAAATGGGTGTTAGTAGCACAAATGATGAAGAAGTC
GTGAATGCTGATACTGCCACTGCCAATGTGAGGGATGGCCCTAGCTTTGGGATCAGTGGA
GGAAGTATTGGAATGGGTGCTAGTCATGAAGCTGAAATCCATGGGACAGATGCTTCAGTG
CACAGAGCAGATAGCGTCGCTGGTGAGGTAGAAGCAGTTGCTGAAATTACTGAAAATCAG
GGGCAAACTGGTGAATTTGCTGCAGATCCAGGGCTAATGGGTGACTATGTCCCTGAAGAA
GTGGACCGTGGAGATCCTAATGGTGATAGTCAAGATCTGACATCTCGTTCAGTGGAAAGG
GCTGATAGTGGCTCAAAAGTTGTTGGCTCCGCCAAAGCAGAATCCATTGAAAGTGGTGAA
AAGAATTGTCATGTGCAACCTATGCTCCCGAATAGTCCACACCCTTCTCTTTCTTGCAAT
GCTGTTGTATGTTCCGTCCATGAAGCATCCAAAGAAGAAGTTACCCAAAATAATGCACCA
GCTACTGATGATTGTGGATTTGTTGAGTCAGACTATATGCTTGCAAATGGGACAGGGCCT
CCTATTGGAGAAAGCAACTATGAAGAAGCTGTTGAATTTGATCCAATTAAGCATCATAAT
TTTTTCTGTCCTTGGGTTAATGGGAATGTTGCTGCTGCTGGCTGCAGTAATAGTGGCAGT
TCCTCTTCCAACACTGGTGCTATTGCTCTCTGTGGTTGGCAGCTAACATTAGATGCTTTG
GATTCTTTCCAGTCACTTGGACATGTTCCAGTCCAAACTGTTGAATCTGAATCAGCTGCA
TCTCTGTACAAGGATGATCATCGTGCACCAGGTAGGAAACTCTTGGCGCGTCACTCTTTT
AGCAAACATCATGGACATAACTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400054167
PEP Infomation

pacid=37431492 transcript=PGSC0003DMT400079854 locus=PGSC0003DMG400031100 ID=PGSC0003DMT400079854.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MKEEAISSSHDPQLPPKSSSPPPIPTPAASSVGASSPAVPTNAGGTDWFAQAQGSKAASL
SRIGSQPMWTSVSNSAGGSALGSSQPSCRPWERGDLLRRLSTFQPTNWFGKPKASSSLAC
ARRGWVNVDVDTIECEACGANLRFVSSATWTSDEADIAGEEFAKKLDEGHKATCPWRGNS
CAESLVQFPPTPPSALIGGYKDRCDGLLQFPSLPIVAASAIEHIKASRSSEIDRLLAQSQ
AFGGMEPIFRLEIMSGTETNIDDVFLVYSRANKLISLCGWEPRWLPNVQDCEEHSAQSAR
SGYSIGPTKYHTSLQDFGHGENVLPSSKKKVHSKNEAVGPRSKGESRSPLLDCSLCGATV
RIWDFLTVVRPACFAPNSNDIPETSKKMALTRGVSAASGISGWVAADGVEKEQTEDLDEA
ATNEVGRSLSNIGVDLNLTMAGGLSSSQVNMDAMPEQFQDVHKRRYPVTGQPSSSEVGGQ
AASYESRGPSSRKRNLEEGGSTVDRPQLPVQPADSVEGTVIDRDGDEVNDGSQYSAGPSK
RPCQSDAFGTHHTSYGKDSSGAGPSLSLGFEIGTGAPKDDTFGRRHEQLIGVPSTRDSTH
VSSVIAMDTVHSTDDSMESVENLPGDFDDVDFPSTSMLRSADPVETSELNYSNQAQQSTC
PAVVRSAGEMGVSSTNDEEVVNADTATANVRDGPSFGISGGSIGMGASHEAEIHGTDASV
HRADSVAGEVEAVAEITENQGQTGEFAADPGLMGDYVPEEVDRGDPNGDSQDLTSRSVER
ADSGSKVVGSAKAESIESGEKNCHVQPMLPNSPHPSLSCNAVVCSVHEASKEEVTQNNAP
ATDDCGFVESDYMLANGTGPPIGESNYEEAVEFDPIKHHNFFCPWVNGNVAAAGCSNSGS
SSSNTGAIALCGWQLTLDALDSFQSLGHVPVQTVESESAASLYKDDHRAPGRKLLARHSF
SKHHGHN*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400079854
Transcript Infomation

pacid=37431492 locus=PGSC0003DMG400031100 ID=PGSC0003DMT400079854.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAGGAAGAAGCTATAAGCTCTTCCCATGATCCTCAATTGCCGCCCAAATCATCGTCT
CCTCCCCCTATCCCTACACCTGCTGCTAGTTCTGTAGGGGCATCATCTCCTGCCGTTCCA
ACAAATGCTGGGGGCACAGATTGGTTTGCACAAGCACAGGGTTCAAAAGCAGCTTCACTT
TCCCGTATTGGTTCACAGCCCATGTGGACTTCAGTGAGCAATAGTGCTGGTGGTTCAGCT
CTAGGATCATCACAACCTTCATGTAGACCATGGGAAAGGGGTGATCTATTGAGGCGTCTG
TCCACTTTCCAACCCACAAACTGGTTTGGGAAGCCTAAGGCTTCAAGTTCACTGGCTTGT
GCTAGAAGAGGCTGGGTGAATGTGGATGTTGATACAATCGAGTGTGAAGCTTGTGGTGCT
AATCTGAGATTCGTTTCTTCTGCAACGTGGACCTCTGATGAAGCTGATATCGCGGGGGAA
GAATTTGCTAAGAAACTTGATGAAGGGCACAAGGCCACTTGTCCTTGGAGAGGAAACAGC
TGTGCAGAAAGCTTGGTCCAGTTCCCTCCTACACCACCATCAGCCTTAATTGGTGGTTAT
AAGGATCGATGTGATGGATTGCTTCAGTTTCCTTCACTTCCAATTGTGGCTGCATCTGCA
ATTGAGCACATCAAGGCCTCTCGAAGTTCAGAAATTGATCGCCTTCTAGCTCAGTCGCAG
GCTTTTGGTGGGATGGAACCCATCTTTAGGTTAGAGATTATGTCAGGAACTGAAACCAAC
ATAGACGATGTCTTCCTTGTATACTCTCGTGCCAATAAGTTGATAAGCCTGTGTGGATGG
GAACCGAGATGGCTTCCAAATGTCCAAGACTGTGAAGAACATTCTGCTCAATCAGCTAGG
AGTGGGTACTCCATTGGTCCCACAAAATATCACACTTCTCTGCAAGATTTTGGCCATGGA
GAAAATGTATTGCCTTCTTCAAAGAAAAAAGTTCATAGTAAGAACGAAGCTGTGGGTCCC
AGGTCTAAAGGTGAATCTAGGTCACCTTTATTGGATTGTAGTTTGTGTGGAGCCACCGTG
AGAATCTGGGACTTCCTCACTGTTGTCCGTCCTGCTTGCTTTGCTCCAAATAGCAATGAT
ATCCCTGAAACAAGCAAGAAAATGGCATTGACACGTGGAGTAAGTGCTGCTAGTGGAATC
AGTGGGTGGGTTGCTGCTGATGGTGTGGAAAAGGAACAGACAGAGGACCTTGATGAGGCT
GCAACAAATGAAGTGGGAAGGTCTTTGTCAAATATAGGAGTAGATCTGAATCTCACAATG
GCTGGTGGATTATCCTCTTCACAGGTGAACATGGATGCAATGCCTGAACAATTCCAAGAT
GTCCATAAACGAAGATATCCAGTTACGGGGCAACCTTCGAGCAGTGAAGTTGGTGGTCAA
GCAGCTTCATATGAATCCCGAGGCCCTAGTTCTCGCAAACGAAACTTAGAGGAAGGTGGA
AGCACGGTTGACAGGCCACAATTGCCTGTACAACCAGCCGATAGTGTTGAAGGCACTGTG
ATAGACCGTGACGGAGATGAAGTAAATGATGGTAGTCAGTACTCAGCTGGCCCATCAAAG
CGTCCATGCCAGTCTGATGCCTTCGGGACCCACCATACTTCATATGGCAAGGATTCGTCA
GGTGCTGGTCCTAGCCTGTCACTTGGTTTTGAGATTGGTACAGGTGCTCCCAAAGATGAT
ACCTTTGGCCGAAGACACGAACAGCTAATTGGTGTGCCCTCTACTCGAGATTCAACACAT
GTTTCATCTGTTATTGCAATGGACACTGTTCACAGTACAGATGATTCAATGGAAAGTGTT
GAGAATCTCCCCGGAGACTTTGATGATGTTGATTTCCCTTCTACATCTATGTTAAGAAGT
GCAGACCCAGTGGAAACTTCGGAATTGAACTACAGTAACCAAGCACAACAGAGTACTTGT
CCAGCTGTGGTCAGAAGTGCTGGTGAAATGGGTGTTAGTAGCACAAATGATGAAGAAGTC
GTGAATGCTGATACTGCCACTGCCAATGTGAGGGATGGCCCTAGCTTTGGGATCAGTGGA
GGAAGTATTGGAATGGGTGCTAGTCATGAAGCTGAAATCCATGGGACAGATGCTTCAGTG
CACAGAGCAGATAGCGTCGCTGGTGAGGTAGAAGCAGTTGCTGAAATTACTGAAAATCAG
GGGCAAACTGGTGAATTTGCTGCAGATCCAGGGCTAATGGGTGACTATGTCCCTGAAGAA
GTGGACCGTGGAGATCCTAATGGTGATAGTCAAGATCTGACATCTCGTTCAGTGGAAAGG
GCTGATAGTGGCTCAAAAGTTGTTGGCTCCGCCAAAGCAGAATCCATTGAAAGTGGTGAA
AAGAATTGTCATGTGCAACCTATGCTCCCGAATAGTCCACACCCTTCTCTTTCTTGCAAT
GCTGTTGTATGTTCCGTCCATGAAGCATCCAAAGAAGAAGTTACCCAAAATAATGCACCA
GCTACTGATGATTGTGGATTTGTTGAGTCAGACTATATGCTTGCAAATGGGACAGGGCCT
CCTATTGGAGAAAGCAACTATGAAGAAGCTGTTGAATTTGATCCAATTAAGCATCATAAT
TTTTTCTGTCCTTGGGTTAATGGGAATGTTGCTGCTGCTGGCTGCAGTAATAGTGGCAGT
TCCTCTTCCAACACTGGTGCTATTGCTCTCTGTGGTTGGCAGCTAACATTAGATGCTTTG
GATTCTTTCCAGTCACTTGGACATGTTCCAGTCCAAACTGTTGAATCTGAATCAGCTGCA
TCTCTGTACAAGGATGATCATCGTGCACCAGGTAGGAAACTCTTGGCGCGTCACTCTTTT
AGCAAACATCATGGACATAACTGA