Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400079758
CDS Infomation

pacid=37459321 polypeptide=PGSC0003DMP400054098 locus=PGSC0003DMG400031057 ID=PGSC0003DMT400079758.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATCACCATTCCATACTTGACCGCCTTGACAACCTACTTCAGCTATGGATTGCTCTTC
GCATTCGGTCAATTCCGTGAGTTCTTCAGGAAGATCTTTGATTGGTGGCGTGGCAACAAT
CTTCAGGGATATGCTCCGATCTGCTTAGGACTTGAAGATTTCTATATCCGTCGGTTGTAT
CTTCGCATTCAGGATTGCTTTGGACGGCCAATATGTAGTCCTCCTGATGCTTGGTTTGAT
GTGGTGGAGCGTTTGTCCAATGATAATAACAAGACACTAAAGCGGACCACTAAAGTTTCA
AGGTGCCTAAACTTGGGTTCATATAATTACCTTGGTTTTGCTGCATCGGATGAATATTGT
ACACCTCGTGTCATTGAGTCTTTGAAAAAGTATTCTGCGAGCACTTGCAGTGCCCGTGTT
GATGGAGGTACCACAAGCATCCATATGGAATTGGAAGATTGTGTGGCTAATTTTGTTGGC
AAGCCAGCTGCTATTGTCACAGGCATGGGTTACGTAACAAATTCAGCCATACTTCCTGTC
TTGATCGGAAAGGGAGGTTTGATTATTAGTGATTCTCTCAACCACAATTCTATTGTAAAT
GGTGCTCGAGGGTCTGGAGCTACTATTCGTGTTTTTCAACATAACACACCTTCTCACTTG
GAGAAGGTTTTGAGAGAACATATTGCTGAGGGACAACCCAGAACACACAGGCCGTGGAAG
AAGATAATTGTTATAGTGGAGGGCATATACAGCATGGAAGGGGAGCTATGTCAGCTTCCA
GAGATTGTCGCCATATGCAAGAAATACAAGGTATATGTTTATTTGGATGAGGCACACAGC
ATTGGAGCTGTTGGAAAATCAGGAAGGGGAGTCTGTGAGCTCTTGGGAGTTGACACAGCT
GATGTGGACATTATGATGGGAACTTTCACAAAATCATTTGGTTCATGCGGGGGTTATATT
GCTGGATCTAAAGAACTTATTGAATATTTGAAGTATTCTTGCCCAGCTCATCTGTATGCC
ACATCAATATCACCTCCAGCTGCCCAACAAATCATTTCTGCTATCAAGGTTATACTTGGT
GAAGATGGTACTAGTAGAGGAGCTCAGAAGCTGGCTCGAATTCGTGAAAATAGCAACTTT
TTCCGATCAGAACTACAGAAGATGGGTTTTGAGGTCCTTGGGGACAATGATTCTCCTGTG
ATGCCCATCATGATCTACAATCCTGGAAAAATACCTGCCTTTTCACGGGAGTGTCTCAAA
CGGAATGTACAATTTCTTGTCATTTCAGGCTCAGTTTTTAGTATATTGGCAATTGTTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400054098
PEP Infomation

pacid=37459321 transcript=PGSC0003DMT400079758 locus=PGSC0003DMG400031057 ID=PGSC0003DMT400079758.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MITIPYLTALTTYFSYGLLFAFGQFREFFRKIFDWWRGNNLQGYAPICLGLEDFYIRRLY
LRIQDCFGRPICSPPDAWFDVVERLSNDNNKTLKRTTKVSRCLNLGSYNYLGFAASDEYC
TPRVIESLKKYSASTCSARVDGGTTSIHMELEDCVANFVGKPAAIVTGMGYVTNSAILPV
LIGKGGLIISDSLNHNSIVNGARGSGATIRVFQHNTPSHLEKVLREHIAEGQPRTHRPWK
KIIVIVEGIYSMEGELCQLPEIVAICKKYKVYVYLDEAHSIGAVGKSGRGVCELLGVDTA
DVDIMMGTFTKSFGSCGGYIAGSKELIEYLKYSCPAHLYATSISPPAAQQIISAIKVILG
EDGTSRGAQKLARIRENSNFFRSELQKMGFEVLGDNDSPVMPIMIYNPGKIPAFSRECLK
RNVQFLVISGSVFSILAIV*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400079758
Transcript Infomation

pacid=37459321 locus=PGSC0003DMG400031057 ID=PGSC0003DMT400079758.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATCACCATTCCATACTTGACCGCCTTGACAACCTACTTCAGCTATGGATTGCTCTTC
GCATTCGGTCAATTCCGTGAGTTCTTCAGGAAGATCTTTGATTGGTGGCGTGGCAACAAT
CTTCAGGGATATGCTCCGATCTGCTTAGGACTTGAAGATTTCTATATCCGTCGGTTGTAT
CTTCGCATTCAGGATTGCTTTGGACGGCCAATATGTAGTCCTCCTGATGCTTGGTTTGAT
GTGGTGGAGCGTTTGTCCAATGATAATAACAAGACACTAAAGCGGACCACTAAAGTTTCA
AGGTGCCTAAACTTGGGTTCATATAATTACCTTGGTTTTGCTGCATCGGATGAATATTGT
ACACCTCGTGTCATTGAGTCTTTGAAAAAGTATTCTGCGAGCACTTGCAGTGCCCGTGTT
GATGGAGGTACCACAAGCATCCATATGGAATTGGAAGATTGTGTGGCTAATTTTGTTGGC
AAGCCAGCTGCTATTGTCACAGGCATGGGTTACGTAACAAATTCAGCCATACTTCCTGTC
TTGATCGGAAAGGGAGGTTTGATTATTAGTGATTCTCTCAACCACAATTCTATTGTAAAT
GGTGCTCGAGGGTCTGGAGCTACTATTCGTGTTTTTCAACATAACACACCTTCTCACTTG
GAGAAGGTTTTGAGAGAACATATTGCTGAGGGACAACCCAGAACACACAGGCCGTGGAAG
AAGATAATTGTTATAGTGGAGGGCATATACAGCATGGAAGGGGAGCTATGTCAGCTTCCA
GAGATTGTCGCCATATGCAAGAAATACAAGGTATATGTTTATTTGGATGAGGCACACAGC
ATTGGAGCTGTTGGAAAATCAGGAAGGGGAGTCTGTGAGCTCTTGGGAGTTGACACAGCT
GATGTGGACATTATGATGGGAACTTTCACAAAATCATTTGGTTCATGCGGGGGTTATATT
GCTGGATCTAAAGAACTTATTGAATATTTGAAGTATTCTTGCCCAGCTCATCTGTATGCC
ACATCAATATCACCTCCAGCTGCCCAACAAATCATTTCTGCTATCAAGGTTATACTTGGT
GAAGATGGTACTAGTAGAGGAGCTCAGAAGCTGGCTCGAATTCGTGAAAATAGCAACTTT
TTCCGATCAGAACTACAGAAGATGGGTTTTGAGGTCCTTGGGGACAATGATTCTCCTGTG
ATGCCCATCATGATCTACAATCCTGGAAAAATACCTGCCTTTTCACGGGAGTGTCTCAAA
CGGAATGTACAATTTCTTGTCATTTCAGGCTCAGTTTTTAGTATATTGGCAATTGTTTAA