Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400079498
CDS Infomation

pacid=37441517 polypeptide=PGSC0003DMP400053911 locus=PGSC0003DMG400030954 ID=PGSC0003DMT400079498.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTTATCAATACCAAATGGTTCTTGATATTTTTTGTGTTGATTTTTGGGTCCAAGATT
TGTTATTGTAGTGTTACTTATGATAAGAAGTCTCTCATTATCAATGGACAAAGAAAAATT
CTGTTTTCTGGTTCTGTTCATTACCCAAGAAGCACCCCTGATATGTGGGAGGGGATTATA
CAGAAGGCTAAAGATGGAGGATTGGATGTTATAGAAACCTATGTGTTTTGGAATCTTCAT
GAACCTTCACCTGGCAATTACAACTTTGAGGGGCGTAATGATTTAGTTCGATTCATAAAG
CTGATTCAGAAGGCAGGGCTTTATATGCATCTTCGAATTGGGCCTTATATTTGTGGAGAG
TGGAATTTTGGTGGTTTTCCTGTATGGTTGAAGTATGTTCCTGGAATCAGCTTTAGAACC
GATAATGAACCTTTCAAGAGGGAAATGCAAAGATTCACCACGAAAATTGTCCAAATGATG
AAGAATGAGAAGCTATTTCAGACCCAAGGTGGTCATATCATTCTGTCTCAGATCGAGAAC
GAGTATGGGTTAGAAATAAAACAATATGGTGCTCCAGGTCATGCGTACATGACTTGGGCG
GCTAAAATGGCTGTTGAAATGGGTACTGGGGTCCCATGGGTCATGTGCAAGGAGGATGAT
GCCCCTGATCCAGTGATAAACACCTGCAATGGTTTTTATTGTGATTATTTTTCCCCTAAC
AAGCCTAACAAGCCAACGATATGGACAGAGGCATGGAGTGGCTGGTTTGATGATTTTGGC
GGTCCAGTTCATCATCGACCAGTTGAAGATTTGGCCTTTGCAGTTGCTCGGTTCATTCAA
AAAGGTGGCTCTTTGGTGAATTATTATATGTATCATGGGGGAACCAACTTTGGAAGAACA
GCTGGAGGGCCTTTTATCACTACCAGCTATGACTATGATGCTCCTATTGATGAATATGGC
TTGATTAGGCAGCCAAAGTATGACCATTTGAAGGAGCTTCATAAGGCTGTCAAGTTATGT
GAACCAGCACTGATTTCTGCTGATCCTACCGTTACTGTCTTAGGGAACTATGAACAGGCA
CATGTATTTTCTTCCGGCTCTGGACATTGTGCTGCTTTTCTTGCAAATTACCATTTGAGT
TCAACTGCAAGGGTGACATTTAGGCACCAACATTACGATCTGCCACCTTGGTCAATAAGC
ATTCTTCCAGACTGTAAAAATGTTGTATATAATACTGCCAGGGTTGGAGTTAAGACATCC
ACTGCACAAATGCTGCCCACAAACGTACAACTGCGCACTTGGGAAACATTTAGCGAGGAT
GTATCCACCATTGATGTGGATTCAAAGCTCACTGTTGTTGGTCTCTTGGAGCAATTAAAT
GTTACCAGGGATATGAGTGACTACCTTTGGTACACCACTAGTGTTGAGATAAATTCAGCT
GAATCATTTCTACATCAAGGGCAACATCTGACTCTTACTGTGCAGTCAGCAGGCCATGCC
TTACATGTGTATATTAATGGACGGCTTTCAGGTTCAGTTTATGGAAACCGAGAAAACCGA
AGAGTTACATTTACAGGAGGTGTTAACCTGCATGCTGGAATAAACAGAATTTCCCTACTC
AGTGTAGCTGTTGGATTGCCGAACAACGGAGCACATTATGAGACATGGAGCGCAGGAGTC
CTTGGGCCAGTCGTTCTTCATGGGCTAGACAAGGGTCAAAGGGACTTATCATGGCAGAAA
TGGTCATATCAGGTGGGGTTGAGAGGCGAGACCATGAACTTGGCTTCAAATGCAATTTCT
GCTGCTGAATGGGTAGGAGGCTCTTTGATAGCAAGGCAGCAACAACCTCTTACGTGGTAC
AAGGTATATTTCAATGCACCAGGAGGAAGTGATCCATTAGCACTGGACATGGGTAGTATG
GGAAAAGGTCAAGTATGGGTCAATGGACAGAGCATTGGAAGATACTGGACCGCTTATGCC
ACTGGTAACTGCAGTCCTTGTACTTATGCAGCTACATACCGACAAGGAAAGTGCCAATCT
GGTTGTGGCCAGCCAACTCAAAGATGGTACCACGTTCCTCGATCTTGGTTAAAGCCAACT
GGGAACTTGCTGGTAGTTTTTGAGGAGATAGGTGGGGATGCATCAAAGATTTCTCTTGTC
AAAAGGTCAATTACATATGTATAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400053911
PEP Infomation

pacid=37441517 transcript=PGSC0003DMT400079498 locus=PGSC0003DMG400030954 ID=PGSC0003DMT400079498.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MVINTKWFLIFFVLIFGSKICYCSVTYDKKSLIINGQRKILFSGSVHYPRSTPDMWEGII
QKAKDGGLDVIETYVFWNLHEPSPGNYNFEGRNDLVRFIKLIQKAGLYMHLRIGPYICGE
WNFGGFPVWLKYVPGISFRTDNEPFKREMQRFTTKIVQMMKNEKLFQTQGGHIILSQIEN
EYGLEIKQYGAPGHAYMTWAAKMAVEMGTGVPWVMCKEDDAPDPVINTCNGFYCDYFSPN
KPNKPTIWTEAWSGWFDDFGGPVHHRPVEDLAFAVARFIQKGGSLVNYYMYHGGTNFGRT
AGGPFITTSYDYDAPIDEYGLIRQPKYDHLKELHKAVKLCEPALISADPTVTVLGNYEQA
HVFSSGSGHCAAFLANYHLSSTARVTFRHQHYDLPPWSISILPDCKNVVYNTARVGVKTS
TAQMLPTNVQLRTWETFSEDVSTIDVDSKLTVVGLLEQLNVTRDMSDYLWYTTSVEINSA
ESFLHQGQHLTLTVQSAGHALHVYINGRLSGSVYGNRENRRVTFTGGVNLHAGINRISLL
SVAVGLPNNGAHYETWSAGVLGPVVLHGLDKGQRDLSWQKWSYQVGLRGETMNLASNAIS
AAEWVGGSLIARQQQPLTWYKVYFNAPGGSDPLALDMGSMGKGQVWVNGQSIGRYWTAYA
TGNCSPCTYAATYRQGKCQSGCGQPTQRWYHVPRSWLKPTGNLLVVFEEIGGDASKISLV
KRSITYV*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400079498
Transcript Infomation

pacid=37441517 locus=PGSC0003DMG400030954 ID=PGSC0003DMT400079498.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTTATCAATACCAAATGGTTCTTGATATTTTTTGTGTTGATTTTTGGGTCCAAGATT
TGTTATTGTAGTGTTACTTATGATAAGAAGTCTCTCATTATCAATGGACAAAGAAAAATT
CTGTTTTCTGGTTCTGTTCATTACCCAAGAAGCACCCCTGATATGTGGGAGGGGATTATA
CAGAAGGCTAAAGATGGAGGATTGGATGTTATAGAAACCTATGTGTTTTGGAATCTTCAT
GAACCTTCACCTGGCAATTACAACTTTGAGGGGCGTAATGATTTAGTTCGATTCATAAAG
CTGATTCAGAAGGCAGGGCTTTATATGCATCTTCGAATTGGGCCTTATATTTGTGGAGAG
TGGAATTTTGGTGGTTTTCCTGTATGGTTGAAGTATGTTCCTGGAATCAGCTTTAGAACC
GATAATGAACCTTTCAAGAGGGAAATGCAAAGATTCACCACGAAAATTGTCCAAATGATG
AAGAATGAGAAGCTATTTCAGACCCAAGGTGGTCATATCATTCTGTCTCAGATCGAGAAC
GAGTATGGGTTAGAAATAAAACAATATGGTGCTCCAGGTCATGCGTACATGACTTGGGCG
GCTAAAATGGCTGTTGAAATGGGTACTGGGGTCCCATGGGTCATGTGCAAGGAGGATGAT
GCCCCTGATCCAGTGATAAACACCTGCAATGGTTTTTATTGTGATTATTTTTCCCCTAAC
AAGCCTAACAAGCCAACGATATGGACAGAGGCATGGAGTGGCTGGTTTGATGATTTTGGC
GGTCCAGTTCATCATCGACCAGTTGAAGATTTGGCCTTTGCAGTTGCTCGGTTCATTCAA
AAAGGTGGCTCTTTGGTGAATTATTATATGTATCATGGGGGAACCAACTTTGGAAGAACA
GCTGGAGGGCCTTTTATCACTACCAGCTATGACTATGATGCTCCTATTGATGAATATGGC
TTGATTAGGCAGCCAAAGTATGACCATTTGAAGGAGCTTCATAAGGCTGTCAAGTTATGT
GAACCAGCACTGATTTCTGCTGATCCTACCGTTACTGTCTTAGGGAACTATGAACAGGCA
CATGTATTTTCTTCCGGCTCTGGACATTGTGCTGCTTTTCTTGCAAATTACCATTTGAGT
TCAACTGCAAGGGTGACATTTAGGCACCAACATTACGATCTGCCACCTTGGTCAATAAGC
ATTCTTCCAGACTGTAAAAATGTTGTATATAATACTGCCAGGGTTGGAGTTAAGACATCC
ACTGCACAAATGCTGCCCACAAACGTACAACTGCGCACTTGGGAAACATTTAGCGAGGAT
GTATCCACCATTGATGTGGATTCAAAGCTCACTGTTGTTGGTCTCTTGGAGCAATTAAAT
GTTACCAGGGATATGAGTGACTACCTTTGGTACACCACTAGTGTTGAGATAAATTCAGCT
GAATCATTTCTACATCAAGGGCAACATCTGACTCTTACTGTGCAGTCAGCAGGCCATGCC
TTACATGTGTATATTAATGGACGGCTTTCAGGTTCAGTTTATGGAAACCGAGAAAACCGA
AGAGTTACATTTACAGGAGGTGTTAACCTGCATGCTGGAATAAACAGAATTTCCCTACTC
AGTGTAGCTGTTGGATTGCCGAACAACGGAGCACATTATGAGACATGGAGCGCAGGAGTC
CTTGGGCCAGTCGTTCTTCATGGGCTAGACAAGGGTCAAAGGGACTTATCATGGCAGAAA
TGGTCATATCAGGTGGGGTTGAGAGGCGAGACCATGAACTTGGCTTCAAATGCAATTTCT
GCTGCTGAATGGGTAGGAGGCTCTTTGATAGCAAGGCAGCAACAACCTCTTACGTGGTAC
AAGGTATATTTCAATGCACCAGGAGGAAGTGATCCATTAGCACTGGACATGGGTAGTATG
GGAAAAGGTCAAGTATGGGTCAATGGACAGAGCATTGGAAGATACTGGACCGCTTATGCC
ACTGGTAACTGCAGTCCTTGTACTTATGCAGCTACATACCGACAAGGAAAGTGCCAATCT
GGTTGTGGCCAGCCAACTCAAAGATGGTACCACGTTCCTCGATCTTGGTTAAAGCCAACT
GGGAACTTGCTGGTAGTTTTTGAGGAGATAGGTGGGGATGCATCAAAGATTTCTCTTGTC
AAAAGGTCAATTACATATGTATAG