Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400078915
CDS Infomation	pacid=37433312 polypeptide=PGSC0003DMP400053482 locus=PGSC0003DMG400030706 ID=PGSC0003DMT400078915.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGTGTTATGCCAGTGTCAGATGCATCCCCATCCGCGAGGGTTTGAATTGGGTTATGCG TTTTATCTGCCTGGAAGTTACCCTCATAAATATGGGGTTGGTGATTTGTTGAATGTTAAG GTGAATTCATTGACTTCAATTGACCCTGAGTTGCCTTATAGTTATTATAGTTTACCTTTT TGTCAACCACAAGAGGGTGTGAAGGATAGTGCTGAGAATCTTGGTGAGCTTCTTATGGGT GATAAAATTGAGAATTCTCCTTATAGGTTTAAGATGTATACTAATGAGACTGAGATTTTC ATGTGTCAAACTAAACCTTTGTCTGGTGAGGAGTTTAAGCTTTTGAAGAAGAGGATTGAT GAGATGTATCAAGTGAATTTGATTCTTGATAATTTGCCTGCTATTCGATATACGAGGAAG GCAGGTTATTTCTTGCGGTGGACTGGTTATCCGGTTGGGATCAAGGTTCAAGATGCGTAT TACGTGTTTAATCACTTGAAGTTTACGGTTCTTGTTCATAAGTATGAAGAGACCAATGTG GCTCGTGTTATGGGTACTGGGGATGGAGCTGAGGTGATATCAACAGTTGGAAAGGATGGA TCTGAGGAACCTGGTTACATGGTTGTTGGGTTTGAGGTTGTTCCTTGTAGTGTTCAACAT GCTCCTGATTCAGCAAAGAACTTGAAAATGTACAATAAGTACCCGACTCCAATTAAGTGC GACCCTACAACTGTTGCCATGGCTATTAAAGAAAATGAGCCTGTTTCGTTTACTTATGAG GTGAACTTTGTGGAAAGTGACATTAAGTGGCCATCAAGATGGGATGCTTATTTGAAGATG GAAGGTGCAAAGGTGCATTGGTTCTCTATCCTTAACTCCCTTATGGTGATCACTTTCTTG GCTGGAATTGTGCTTGTAATCTTCTTGAGGACTGTCAGGCGGGATCTGACAAGGTATGAG GAACTTGACAAAGAGGCTCAAGCTCAGATGAATGAGGAGTTATCCGGGTGGAAACTTGTG GTAAGTGATGTTTTCAGGGCTCCGAGTAATCCAGGACTTTTGTGTGCGATGGTTGGAGAT GGGGTTCAAATTCTAGGGATGGGTGTTGTGACTATCATGTTTGCTGCCCTCGGATTTATG TCCCCAGCTTCTCGTGGAACATTGATTACCGGCATGCTATTCTTCTATATGATTCTTGGT GTTGCAGCTGGTTATGTTGCTGTTCGTCTCTAG

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400053482
PEP Infomation	pacid=37433312 transcript=PGSC0003DMT400078915 locus=PGSC0003DMG400030706 ID=PGSC0003DMT400078915.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MVLCQCQMHPHPRGFELGYAFYLPGSYPHKYGVGDLLNVKVNSLTSIDPELPYSYYSLPF CQPQEGVKDSAENLGELLMGDKIENSPYRFKMYTNETEIFMCQTKPLSGEEFKLLKKRID EMYQVNLILDNLPAIRYTRKAGYFLRWTGYPVGIKVQDAYYVFNHLKFTVLVHKYEETNV ARVMGTGDGAEVISTVGKDGSEEPGYMVVGFEVVPCSVQHAPDSAKNLKMYNKYPTPIKC DPTTVAMAIKENEPVSFTYEVNFVESDIKWPSRWDAYLKMEGAKVHWFSILNSLMVITFL AGIVLVIFLRTVRRDLTRYEELDKEAQAQMNEELSGWKLVVSDVFRAPSNPGLLCAMVGD GVQILGMGVVTIMFAALGFMSPASRGTLITGMLFFYMILGVAAGYVAVRL*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400078915
Transcript Infomation	pacid=37433312 locus=PGSC0003DMG400030706 ID=PGSC0003DMT400078915.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGTGTTATGCCAGTGTCAGATGCATCCCCATCCGCGAGGGTTTGAATTGGGTTATGCG TTTTATCTGCCTGGAAGTTACCCTCATAAATATGGGGTTGGTGATTTGTTGAATGTTAAG GTGAATTCATTGACTTCAATTGACCCTGAGTTGCCTTATAGTTATTATAGTTTACCTTTT TGTCAACCACAAGAGGGTGTGAAGGATAGTGCTGAGAATCTTGGTGAGCTTCTTATGGGT GATAAAATTGAGAATTCTCCTTATAGGTTTAAGATGTATACTAATGAGACTGAGATTTTC ATGTGTCAAACTAAACCTTTGTCTGGTGAGGAGTTTAAGCTTTTGAAGAAGAGGATTGAT GAGATGTATCAAGTGAATTTGATTCTTGATAATTTGCCTGCTATTCGATATACGAGGAAG GCAGGTTATTTCTTGCGGTGGACTGGTTATCCGGTTGGGATCAAGGTTCAAGATGCGTAT TACGTGTTTAATCACTTGAAGTTTACGGTTCTTGTTCATAAGTATGAAGAGACCAATGTG GCTCGTGTTATGGGTACTGGGGATGGAGCTGAGGTGATATCAACAGTTGGAAAGGATGGA TCTGAGGAACCTGGTTACATGGTTGTTGGGTTTGAGGTTGTTCCTTGTAGTGTTCAACAT GCTCCTGATTCAGCAAAGAACTTGAAAATGTACAATAAGTACCCGACTCCAATTAAGTGC GACCCTACAACTGTTGCCATGGCTATTAAAGAAAATGAGCCTGTTTCGTTTACTTATGAG GTGAACTTTGTGGAAAGTGACATTAAGTGGCCATCAAGATGGGATGCTTATTTGAAGATG GAAGGTGCAAAGGTGCATTGGTTCTCTATCCTTAACTCCCTTATGGTGATCACTTTCTTG GCTGGAATTGTGCTTGTAATCTTCTTGAGGACTGTCAGGCGGGATCTGACAAGGTATGAG GAACTTGACAAAGAGGCTCAAGCTCAGATGAATGAGGAGTTATCCGGGTGGAAACTTGTG GTAAGTGATGTTTTCAGGGCTCCGAGTAATCCAGGACTTTTGTGTGCGATGGTTGGAGAT GGGGTTCAAATTCTAGGGATGGGTGTTGTGACTATCATGTTTGCTGCCCTCGGATTTATG TCCCCAGCTTCTCGTGGAACATTGATTACCGGCATGCTATTCTTCTATATGATTCTTGGT GTTGCAGCTGGTTATGTTGCTGTTCGTCTCTAG