Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400078835
CDS Infomation

pacid=37431994 polypeptide=PGSC0003DMP400053435 locus=PGSC0003DMG400030682 ID=PGSC0003DMT400078835.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGTGTGACTATTTTAACAGATCTCGGAATGGAGATTTTGATTCCGATATGTGCCGTT
ATCGGCATCGCTTTCTCGCTCTTCCAGTGGCATCTCGTCTCCAAAGTTACGGTCGGTACT
GATAAGCCTCATTCCTCCGGAGACGATAAGAATGGATATGCTGAATCTCTCATTGAAGAA
GAAGAAGGCATCAATGACCATAACGTTGTTCAAAAATGCGCTGAAATTCAAAACGCTATT
TCTGAAGGAGCAACCTCATTTCTCTTTACAATGTACCAGTATGTTGGTGTTTTCATGGTT
GCTTTTGCAATTTTAATCTTCGTTTTCCTCGGCTCTGTTGAGGGATTCAGCACAAAGGAC
CAGCCTTGCACATATGACAGCACCAAAACTTGCAAGCCAGCTCTTGCAACTGCTGTCTTC
AGCACCATATCGTTTCTGCTTGGTGCTGTTACCTCTGTGGTGTCGGGGTTCCTTGGAATG
AAAATCGCCACATATGCAAATGCCAGAACTACCTTGGAGGCTAGAAAAGGTGTCGGGAAG
GCTTTTATTGTTGCATTCAGATCTGGTGCTGTGATGGGTTTCCTTCTTGCTGCAAACGGT
CTTTTGGTTTTATTCATAACAATCCTTCTATTTAAGATGTACTATGGTGATGACTGGGAA
GGTCTATTTGAGGCTATAACTGGTTATGGTCTTGGTGGATCTTCAATGGCCCTCTTTGGT
AGAGTTGGTGGAGGGATTTACACCAAAGCAGCAGATGTTGGAGCTGATCTTGTGGGCAAG
GTGGAGAGGAACATCCCTGAAGATGATCCTAGAAACCCAGCGGTGATTGCTGACAATGTT
GGAGACAATGTCGGAGATATTGCTGGTATGGGATCAGATCTGTTTGGATCTTATGCAGAG
TCATCTTGTGCGGCTCTTGTTGTTGCTTCAATCTCCTCCTTCGGTGTCAATCATGAGCTT
ACTGCCATGCTATATCCCCTTCTCATCAGCTCTGTCGGCATCCTTGTCTGTTTGCTTACC
ACCTTATTTGCAACTGATTTCTTTGAAGTCAAGGCTGTTAAGGAAATTGAGCCAGCATTG
AAGAAGCAACTCATTATCTCAACTGCTCTCATGACTATTGGGATTGCTTTTGTTAGTTGG
ATTGCCCTTCCATCGACCTTCACAATATTCAATTTCGGAGTTCAGAAAGAAGTAAAGAAC
TGGCAATTGTTCTTGTGTGTTGGAGTTGGTTTGTGGGCTGGACTCATTATTGGGTTTGTC
ACTGAGTACTATACCAGCAATGCTTACAGCCCCGTCCAAGACGTTGCTGATTCATGCCGC
ACTGGTGCTGCCACCAATGTCATCTTTGGCCTTGCCTTGGGTTACAAATCCGTCATCATT
CCCATTTTTGCCATTGCAATCAGTATATTTGTTAGCTTCAGCTTTGCTGCAATGTACGGC
ATTGCAGTTGCTGCCCTTGGAATGCTGAGCACTATAGCCACTGGTTTGGCAATTGATGCA
TATGGTCCCATTAGTGATAATGCAGGAGGTATTGCTGAGATGGCTGGAATGAGCCACAGA
ATCAGAGAGAGAACTGATGCACTTGATGCTGCAGGAAACACCACTGCTGCTATTGGAAAG
GGATTTGCTATTGGTTCTGCTGCACTCGTGTCTCTTGCCCTCTTTGGCGCGTTTGTCAGT
CGAGCAGCAATTTCCACTGTAGATGTCTTGACACCTAAAGTCTTCATTGGTTTGCTAGTC
GGTGCAATGCTTCCTTACTGGTTCTCCGCCATGACAATGAAGAGTGTTGGAAGCGCTGCT
CTTAAGATGGTTGAGGAAGTGCGCAGGCAATTCAACACCATCCCTGGTCTCATGGAAGGA
ACTGCCAAGCCTGACTATGCCACCTGTGTCAAGATCTCCACAGATGCATCAATCAAGGAG
ATGATTCCACCTGGTGCTCTTGTCATGCTCACTCCATTGATTGTTGGGATCTTGTTTGGT
GTCGAAACACTTTCTGGTGTTCTTGCAGGATCTCTCGTCTCTGGTGTACAGATTGCCATT
TCTGCATCCAACACTGGTGGTGCCTGGGACAACGCTAAGAAGTACATTGAGGCTGGAGCC
TCAGAACATGCAAGGACTCTTGGCCCCAAGGGATCTGATGCACACAAAGCTGCTGTAATT
GGTGACACTGTTGGTGACCCTCTCAAGGACACATCTGGACCATCATTGAACATTCTTATC
AAGCTGATGGCTGTGGAGTCCCTCGTGTTTGCTCCCTTCTTCGCCACCCATGGTGGTCTT
CTCTTCAAGTTGTTTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400053435
PEP Infomation

pacid=37431994 transcript=PGSC0003DMT400078835 locus=PGSC0003DMG400030682 ID=PGSC0003DMT400078835.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGVTILTDLGMEILIPICAVIGIAFSLFQWHLVSKVTVGTDKPHSSGDDKNGYAESLIEE
EEGINDHNVVQKCAEIQNAISEGATSFLFTMYQYVGVFMVAFAILIFVFLGSVEGFSTKD
QPCTYDSTKTCKPALATAVFSTISFLLGAVTSVVSGFLGMKIATYANARTTLEARKGVGK
AFIVAFRSGAVMGFLLAANGLLVLFITILLFKMYYGDDWEGLFEAITGYGLGGSSMALFG
RVGGGIYTKAADVGADLVGKVERNIPEDDPRNPAVIADNVGDNVGDIAGMGSDLFGSYAE
SSCAALVVASISSFGVNHELTAMLYPLLISSVGILVCLLTTLFATDFFEVKAVKEIEPAL
KKQLIISTALMTIGIAFVSWIALPSTFTIFNFGVQKEVKNWQLFLCVGVGLWAGLIIGFV
TEYYTSNAYSPVQDVADSCRTGAATNVIFGLALGYKSVIIPIFAIAISIFVSFSFAAMYG
IAVAALGMLSTIATGLAIDAYGPISDNAGGIAEMAGMSHRIRERTDALDAAGNTTAAIGK
GFAIGSAALVSLALFGAFVSRAAISTVDVLTPKVFIGLLVGAMLPYWFSAMTMKSVGSAA
LKMVEEVRRQFNTIPGLMEGTAKPDYATCVKISTDASIKEMIPPGALVMLTPLIVGILFG
VETLSGVLAGSLVSGVQIAISASNTGGAWDNAKKYIEAGASEHARTLGPKGSDAHKAAVI
GDTVGDPLKDTSGPSLNILIKLMAVESLVFAPFFATHGGLLFKLF*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400078835
Transcript Infomation

pacid=37431994 locus=PGSC0003DMG400030682 ID=PGSC0003DMT400078835.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGTGTGACTATTTTAACAGATCTCGGAATGGAGATTTTGATTCCGATATGTGCCGTT
ATCGGCATCGCTTTCTCGCTCTTCCAGTGGCATCTCGTCTCCAAAGTTACGGTCGGTACT
GATAAGCCTCATTCCTCCGGAGACGATAAGAATGGATATGCTGAATCTCTCATTGAAGAA
GAAGAAGGCATCAATGACCATAACGTTGTTCAAAAATGCGCTGAAATTCAAAACGCTATT
TCTGAAGGAGCAACCTCATTTCTCTTTACAATGTACCAGTATGTTGGTGTTTTCATGGTT
GCTTTTGCAATTTTAATCTTCGTTTTCCTCGGCTCTGTTGAGGGATTCAGCACAAAGGAC
CAGCCTTGCACATATGACAGCACCAAAACTTGCAAGCCAGCTCTTGCAACTGCTGTCTTC
AGCACCATATCGTTTCTGCTTGGTGCTGTTACCTCTGTGGTGTCGGGGTTCCTTGGAATG
AAAATCGCCACATATGCAAATGCCAGAACTACCTTGGAGGCTAGAAAAGGTGTCGGGAAG
GCTTTTATTGTTGCATTCAGATCTGGTGCTGTGATGGGTTTCCTTCTTGCTGCAAACGGT
CTTTTGGTTTTATTCATAACAATCCTTCTATTTAAGATGTACTATGGTGATGACTGGGAA
GGTCTATTTGAGGCTATAACTGGTTATGGTCTTGGTGGATCTTCAATGGCCCTCTTTGGT
AGAGTTGGTGGAGGGATTTACACCAAAGCAGCAGATGTTGGAGCTGATCTTGTGGGCAAG
GTGGAGAGGAACATCCCTGAAGATGATCCTAGAAACCCAGCGGTGATTGCTGACAATGTT
GGAGACAATGTCGGAGATATTGCTGGTATGGGATCAGATCTGTTTGGATCTTATGCAGAG
TCATCTTGTGCGGCTCTTGTTGTTGCTTCAATCTCCTCCTTCGGTGTCAATCATGAGCTT
ACTGCCATGCTATATCCCCTTCTCATCAGCTCTGTCGGCATCCTTGTCTGTTTGCTTACC
ACCTTATTTGCAACTGATTTCTTTGAAGTCAAGGCTGTTAAGGAAATTGAGCCAGCATTG
AAGAAGCAACTCATTATCTCAACTGCTCTCATGACTATTGGGATTGCTTTTGTTAGTTGG
ATTGCCCTTCCATCGACCTTCACAATATTCAATTTCGGAGTTCAGAAAGAAGTAAAGAAC
TGGCAATTGTTCTTGTGTGTTGGAGTTGGTTTGTGGGCTGGACTCATTATTGGGTTTGTC
ACTGAGTACTATACCAGCAATGCTTACAGCCCCGTCCAAGACGTTGCTGATTCATGCCGC
ACTGGTGCTGCCACCAATGTCATCTTTGGCCTTGCCTTGGGTTACAAATCCGTCATCATT
CCCATTTTTGCCATTGCAATCAGTATATTTGTTAGCTTCAGCTTTGCTGCAATGTACGGC
ATTGCAGTTGCTGCCCTTGGAATGCTGAGCACTATAGCCACTGGTTTGGCAATTGATGCA
TATGGTCCCATTAGTGATAATGCAGGAGGTATTGCTGAGATGGCTGGAATGAGCCACAGA
ATCAGAGAGAGAACTGATGCACTTGATGCTGCAGGAAACACCACTGCTGCTATTGGAAAG
GGATTTGCTATTGGTTCTGCTGCACTCGTGTCTCTTGCCCTCTTTGGCGCGTTTGTCAGT
CGAGCAGCAATTTCCACTGTAGATGTCTTGACACCTAAAGTCTTCATTGGTTTGCTAGTC
GGTGCAATGCTTCCTTACTGGTTCTCCGCCATGACAATGAAGAGTGTTGGAAGCGCTGCT
CTTAAGATGGTTGAGGAAGTGCGCAGGCAATTCAACACCATCCCTGGTCTCATGGAAGGA
ACTGCCAAGCCTGACTATGCCACCTGTGTCAAGATCTCCACAGATGCATCAATCAAGGAG
ATGATTCCACCTGGTGCTCTTGTCATGCTCACTCCATTGATTGTTGGGATCTTGTTTGGT
GTCGAAACACTTTCTGGTGTTCTTGCAGGATCTCTCGTCTCTGGTGTACAGATTGCCATT
TCTGCATCCAACACTGGTGGTGCCTGGGACAACGCTAAGAAGTACATTGAGGCTGGAGCC
TCAGAACATGCAAGGACTCTTGGCCCCAAGGGATCTGATGCACACAAAGCTGCTGTAATT
GGTGACACTGTTGGTGACCCTCTCAAGGACACATCTGGACCATCATTGAACATTCTTATC
AAGCTGATGGCTGTGGAGTCCCTCGTGTTTGCTCCCTTCTTCGCCACCCATGGTGGTCTT
CTCTTCAAGTTGTTTTAG