Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400078358
CDS Infomation

pacid=37443501 polypeptide=PGSC0003DMP400053078 locus=PGSC0003DMG400030509 ID=PGSC0003DMT400078358.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTGTTGCATACCCTCAATTTTTTGGTACAAAAAAAGTTGACACTTCATTGATGGTG
TCATCATCTTCCTCTGTTTCCCCTGTTATTCTATCTCAAGATGAGTTGAAAAAGGTAGCT
GCTTATAAAGCTGTGGAGTTTGTGGAGTCTGGTATGGTTGTTGGTCTAGGTACAGGTTCT
ACAGCAAAGCATGCTGTTGACAAAATAGCTGAGCTTTTACATAGTGGTAAGTTAAAGAAC
ATTGTAGGGATTCCCACTTCAAAGATTACTCATGAACAAGCTGTTTCACTTGGTATCCCT
TTATCAGATCTGAATAAACACCCTATTGTTGATTTAGCAATTGATGGGGCTGATGAAGTT
GACCCTCAAATGAATTTGGTTAAAGGGAGAGGAGGGTCATTGCTTAGGGAGAAAATGGTT
GAGGCAGCTACTAAGAAGTTTATTGTTATTGTTGATGAGTCAAAATTGGTGAATTATATA
GGTGGTAGTGGACTTGCTATGCCTGTTGAGATTGTGCCCTTTTGTTGGGAGTTTACATTG
AAGAGGCTTGAGATGTTGTTTATTGAAGCTGGATGTGTTGGGAAGTTGAGAACAGCAGGT
GGAAGTGGAGGTGAAGAGCCTTATGTTACTGATAATGGTAATTATATTATTGATTTGTAT
TTCAAGAAGGATATGGGTGATTTGAAAGATGCAAGTGATGCAATTTTGAGACTTGCTGGT
GTTGTTGAGCATGGCATGTTTATTGATATGGCTACTACTGTTATTGTTGCTGGAAAACTT
GGTGTCTCTGTTACTAATAAGTTATAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400053078
PEP Infomation

pacid=37443501 transcript=PGSC0003DMT400078358 locus=PGSC0003DMG400030509 ID=PGSC0003DMT400078358.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAVAYPQFFGTKKVDTSLMVSSSSSVSPVILSQDELKKVAAYKAVEFVESGMVVGLGTGS
TAKHAVDKIAELLHSGKLKNIVGIPTSKITHEQAVSLGIPLSDLNKHPIVDLAIDGADEV
DPQMNLVKGRGGSLLREKMVEAATKKFIVIVDESKLVNYIGGSGLAMPVEIVPFCWEFTL
KRLEMLFIEAGCVGKLRTAGGSGGEEPYVTDNGNYIIDLYFKKDMGDLKDASDAILRLAG
VVEHGMFIDMATTVIVAGKLGVSVTNKL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400078358
Transcript Infomation

pacid=37443501 locus=PGSC0003DMG400030509 ID=PGSC0003DMT400078358.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTGTTGCATACCCTCAATTTTTTGGTACAAAAAAAGTTGACACTTCATTGATGGTG
TCATCATCTTCCTCTGTTTCCCCTGTTATTCTATCTCAAGATGAGTTGAAAAAGGTAGCT
GCTTATAAAGCTGTGGAGTTTGTGGAGTCTGGTATGGTTGTTGGTCTAGGTACAGGTTCT
ACAGCAAAGCATGCTGTTGACAAAATAGCTGAGCTTTTACATAGTGGTAAGTTAAAGAAC
ATTGTAGGGATTCCCACTTCAAAGATTACTCATGAACAAGCTGTTTCACTTGGTATCCCT
TTATCAGATCTGAATAAACACCCTATTGTTGATTTAGCAATTGATGGGGCTGATGAAGTT
GACCCTCAAATGAATTTGGTTAAAGGGAGAGGAGGGTCATTGCTTAGGGAGAAAATGGTT
GAGGCAGCTACTAAGAAGTTTATTGTTATTGTTGATGAGTCAAAATTGGTGAATTATATA
GGTGGTAGTGGACTTGCTATGCCTGTTGAGATTGTGCCCTTTTGTTGGGAGTTTACATTG
AAGAGGCTTGAGATGTTGTTTATTGAAGCTGGATGTGTTGGGAAGTTGAGAACAGCAGGT
GGAAGTGGAGGTGAAGAGCCTTATGTTACTGATAATGGTAATTATATTATTGATTTGTAT
TTCAAGAAGGATATGGGTGATTTGAAAGATGCAAGTGATGCAATTTTGAGACTTGCTGGT
GTTGTTGAGCATGGCATGTTTATTGATATGGCTACTACTGTTATTGTTGCTGGAAAACTT
GGTGTCTCTGTTACTAATAAGTTATAG