Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400078332
CDS Infomation	pacid=37443639 polypeptide=PGSC0003DMP400053059 locus=PGSC0003DMG400030496 ID=PGSC0003DMT400078332.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGAGATTCGTGTATCGAAGATGATGAGCTCATGGATAGCTGAGCAATTCATAAAGGCA ACAAGCGATAAAAGGTTAGAAGTTGTGGCAGAGGAGTATGTGCAAGAGTTAATGGATAGG AGTCTAATTTTGGGTAAAACTCGAAAGCCTAATGGAAGATTCAAAACTTGCAAAATTCAT GATCTTCTTAGGCAGTTGTGCATAAGAGAAGCTCAAATTCAAAATGTTGTGCATTTCCCT TACAGTGATCATGTTTCTACTTACTCAGATGACATAAATGATCGTAGGCGTGTGATGATT CCTTTTCTGATTGAGGATTATTTTTGCGATCATCCAAGTCAAATGAGTGGTAAGATTACA ACCCGCAGCTTGATCTTTATGGGAGCTGGTAGATCTTATCTAGTACCTGAAATAAATCAC TGGCCTGATAGTATTTCAGATTTCAAGCTACTTAAGGTGTTGGATGCACGTGAAATTGGC TACGATTTCTCTCATATTATACCTCAACTTGTTCATTTGAGGTATGTTGATGCAAGAATT CAGGATCCTTCTTCACTAGCCAAGTTGTGCAATCTACAGACCATAATTATTTATTCAAGG ATAAATATTGTGCAGCTCCCGGTGGAGATTTGGACAATGTCAGAGATAAAACATGTGATT ATTGAACAAATGGATATGCCTAATCCTCTTAGTATTGAAGAGCAACAACCTTTGTTTCTG AATAACTTGCAAACACTTGCTCTCGATTCCTCGCCTTTTTTGGCAGAAATCCTAAAGAGA ACACCCAATGTAGATAAGCTGAAGATTAGAGCTGCTAATACACATAATGAGTGGTCTGAT TTTGTTGATTGTCTCATTAATCTACAGAGGCTGGAAAAGCTAAGTATAACAGCAACAGAA GACAACAGTCCGCGCATTCTGTCTAGTGCTTTTTGCGCGCCTAATCTAAAGCATTTGAGA TTAGCTGAAACTTCATTGCCTTGGGAAGATATGGCTGTGCTGGCTAATTTACCCAATCTT GAGGTGCTCAAAGCAGATCATGCATTCACGGGAACAGATTGGGATCTAAATGAAGATGTT GTGTTTCAAAAACTAAAATATCTACGAATTAAGAGGGCAGATGATCTGGAAATGTGGGAA GCAGCTAGTGATAGTTTCCCGATGCTTGAGCAACTAGTCCTTCAGCATCTCGAAGAACTA GAGGATATTCCACAAAGTTTTGGAGAAATAATGACACTAAAATTAGTCCAAGTGAAATAT TGCAGTCCTACAGTCGATGATAGTGCAAGGAATATTCTAGAAGATCAACAAAGCTGGGGA AATTATGAGCTTCAAATTATAATTGTACCATCTTTACAATACATGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400053059
PEP Infomation	pacid=37443639 transcript=PGSC0003DMT400078332 locus=PGSC0003DMG400030496 ID=PGSC0003DMT400078332.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MEIRVSKMMSSWIAEQFIKATSDKRLEVVAEEYVQELMDRSLILGKTRKPNGRFKTCKIH DLLRQLCIREAQIQNVVHFPYSDHVSTYSDDINDRRRVMIPFLIEDYFCDHPSQMSGKIT TRSLIFMGAGRSYLVPEINHWPDSISDFKLLKVLDAREIGYDFSHIIPQLVHLRYVDARI QDPSSLAKLCNLQTIIIYSRINIVQLPVEIWTMSEIKHVIIEQMDMPNPLSIEEQQPLFL NNLQTLALDSSPFLAEILKRTPNVDKLKIRAANTHNEWSDFVDCLINLQRLEKLSITATE DNSPRILSSAFCAPNLKHLRLAETSLPWEDMAVLANLPNLEVLKADHAFTGTDWDLNEDV VFQKLKYLRIKRADDLEMWEAASDSFPMLEQLVLQHLEELEDIPQSFGEIMTLKLVQVKY CSPTVDDSARNILEDQQSWGNYELQIIIVPSLQYM*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400078332
Transcript Infomation	pacid=37443639 locus=PGSC0003DMG400030496 ID=PGSC0003DMT400078332.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGAGATTCGTGTATCGAAGATGATGAGCTCATGGATAGCTGAGCAATTCATAAAGGCA ACAAGCGATAAAAGGTTAGAAGTTGTGGCAGAGGAGTATGTGCAAGAGTTAATGGATAGG AGTCTAATTTTGGGTAAAACTCGAAAGCCTAATGGAAGATTCAAAACTTGCAAAATTCAT GATCTTCTTAGGCAGTTGTGCATAAGAGAAGCTCAAATTCAAAATGTTGTGCATTTCCCT TACAGTGATCATGTTTCTACTTACTCAGATGACATAAATGATCGTAGGCGTGTGATGATT CCTTTTCTGATTGAGGATTATTTTTGCGATCATCCAAGTCAAATGAGTGGTAAGATTACA ACCCGCAGCTTGATCTTTATGGGAGCTGGTAGATCTTATCTAGTACCTGAAATAAATCAC TGGCCTGATAGTATTTCAGATTTCAAGCTACTTAAGGTGTTGGATGCACGTGAAATTGGC TACGATTTCTCTCATATTATACCTCAACTTGTTCATTTGAGGTATGTTGATGCAAGAATT CAGGATCCTTCTTCACTAGCCAAGTTGTGCAATCTACAGACCATAATTATTTATTCAAGG ATAAATATTGTGCAGCTCCCGGTGGAGATTTGGACAATGTCAGAGATAAAACATGTGATT ATTGAACAAATGGATATGCCTAATCCTCTTAGTATTGAAGAGCAACAACCTTTGTTTCTG AATAACTTGCAAACACTTGCTCTCGATTCCTCGCCTTTTTTGGCAGAAATCCTAAAGAGA ACACCCAATGTAGATAAGCTGAAGATTAGAGCTGCTAATACACATAATGAGTGGTCTGAT TTTGTTGATTGTCTCATTAATCTACAGAGGCTGGAAAAGCTAAGTATAACAGCAACAGAA GACAACAGTCCGCGCATTCTGTCTAGTGCTTTTTGCGCGCCTAATCTAAAGCATTTGAGA TTAGCTGAAACTTCATTGCCTTGGGAAGATATGGCTGTGCTGGCTAATTTACCCAATCTT GAGGTGCTCAAAGCAGATCATGCATTCACGGGAACAGATTGGGATCTAAATGAAGATGTT GTGTTTCAAAAACTAAAATATCTACGAATTAAGAGGGCAGATGATCTGGAAATGTGGGAA GCAGCTAGTGATAGTTTCCCGATGCTTGAGCAACTAGTCCTTCAGCATCTCGAAGAACTA GAGGATATTCCACAAAGTTTTGGAGAAATAATGACACTAAAATTAGTCCAAGTGAAATAT TGCAGTCCTACAGTCGATGATAGTGCAAGGAATATTCTAGAAGATCAACAAAGCTGGGGA AATTATGAGCTTCAAATTATAATTGTACCATCTTTACAATACATGTAA