Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400078102
CDS Infomation

pacid=37452440 polypeptide=PGSC0003DMP400052876 locus=PGSC0003DMG400030375 ID=PGSC0003DMT400078102.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGGCGATCAGGCTTTGGTCGGATCCGTGCGTATTCATCCTTAATATTTCGACCAGAA
GGCAGAATGGTACTACAGACAATCTCAGATGTTGGTTTCATGTTTCATGTTTTTGTTCTT
GGAGTTCAAGTAGATCCAACAATGCTGAGAAGAGCGGGGAGAAACGCGGTTCTAATAGGT
GTTTCATCTTTTGTTATGCCTTTTGCACTTGGAGGATTAGCCTGTTACGTATTACCTCAT
TTGACTGTCATAGATGACGCGACAGCGCATTTCCTGCCTTTGTTATCTGTAATTAACTCT
GCTTCATTCTTTCCTGTGATCACTAGCCTTCTTAGTGATCTTAAGATTCTAAATTCGGAA
ATTGGTCGAATAGCTACATTAGCCTCCTTGGTTAATGACGGTTGTATATATGCTGCTTCC
ATACTTTTAACAACAATAGATGCATCATCAAGTTATTCAAAGTGGAATGGAGTAATGGCC
ATTGCATGGATAGGCACATTCCTGATAGTAATCGTGTTTGCTGTAAGGCCATTGGTGAAA
CATATTGCTAGGACTATACCGGAAAGAGGGGCTATGAAGGAAAGCCATTTTCTAATGATA
GCTGTGCTAGCTCTCCTCTGTGGATTTGTGTCCCAGTCTATTGGACAGCCTCCTGCTGTT
GGTACTTTTATTTTGGGAGTAGTGGTGCCAGAGGGACCGCCTTTGGGCTCATCGATGGTC
TACAAGATCGATTCTTTATGTACTGGATTGCTGCTTCCTGCTAAGTTTGCTATCAGTGGG
TTGACATTGGACATATTCTCCCTAGGAAGAGGAAAGAGTCTTTTAGGGGTCGAAGCAGTG
ATCCTATTGGGTTATTTAGGTAAGTTTGCTGGCACTCTTGTTTCAGCTGTTCACTTTGCT
GTTTCCTTCCAAGATGCAGTACCTCTTGCTCTCATCATGTGCTGCAAAGGAATTATCGAG
GCATCCTTTTATATCGGCTTAAAGGATACTGGAGCAATAACAAGTGAAGCATATGCGCTT
TTGTTAATCACAATGTTGGTCATAACAGGAATTGTGAGACCTTTAATTTGGTACCTCTAT
GATCCATCAAGAAGGTACTTAGGCTACAGAACAAATAGTATACAACATTTGGATCCGACC
AGTGAGCTTCGGGTACAAGTGTGTATTCACAACGAAGATAATGTCCCAAGCTTAGTCAAT
CTTCTTGATGTGTCCAATCCATCTAGAAGGAGACCGATTGCAGTGTTTGTTCTTAATCTA
ATGGAGCTCAAAGGCAGCGCAGCTGCTTTACTGGTGCCAACTCATAATAGAAAAGGCAAA
CCGAAACTCAAGTCTCTGCCTAGCAGAACTGAACATATATCTAATGCATTCAACATTCTC
GCACATAGAAATCACGGTTCTATGGTTGTTCAACACTTCACCTCCATTGTTCCGTATGCC
ACTATGCACGATGACATATGTACAATCGCGGTGGACAAAGGTGTCAATATTGTGATCATC
CCATTCCACAAGCAGTGGGCTATTGATGGAACAGTAGGAGCCAATTTCCCTGCAATTAGG
ATGGTGAACCAACAGGTACTCCATAAAGCACCTTGCTCAGTCGGGATCCTAGTTGATCGG
GGACAATTAGCCGATAACACACAAATCTTGTTTGGCCATTCTCTTTTCCGCATCACAATG
CTTTACCTAGGTGGTCCTGATGATGATGAGGCACTTGCCTATTGCTGCAGGATGCTAGGG
CATCCCCACATCACCATGAGTCTCGTCTGGCTCAAACATTCGAGTGACAATATCGAGAAG
AGTATGGAGTCACATATGATACAATGGTTCAAGGCTAATAATGTGGATGCAGGGAGAGTG
AGTTACAAAGAAGAAGTGGTGAATGATGCAGTGGGGACAACTCAGGTTCTTCGTTCACTC
GAGGACAGTTGTGATCTTTGTATAGTTGGTAGAGACCACGAACAGTCCGAGTTAACACTA
GGGATCAATGAATGGATCGAGTGTCCAGAACTAGGATTTATTGGAGACATGTTAGCTACT
TCGGATTATAGTTTTTCATTGCTCGTTGTGCAACAAACACCACCCGGGACCGAGTTTATA
AACATCCAGCCACTGCAGCCTGTTGCTAGCAGTTTTTATTCTGGTTCAGGTAAATATAGT
CAGCATTCTGGTTCAGGTAAATATAGTCAGCATTCTGGTTATGGCCCTTTTGGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400052876
PEP Infomation

pacid=37452440 transcript=PGSC0003DMT400078102 locus=PGSC0003DMG400030375 ID=PGSC0003DMT400078102.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGRSGFGRIRAYSSLIFRPEGRMVLQTISDVGFMFHVFVLGVQVDPTMLRRAGRNAVLIG
VSSFVMPFALGGLACYVLPHLTVIDDATAHFLPLLSVINSASFFPVITSLLSDLKILNSE
IGRIATLASLVNDGCIYAASILLTTIDASSSYSKWNGVMAIAWIGTFLIVIVFAVRPLVK
HIARTIPERGAMKESHFLMIAVLALLCGFVSQSIGQPPAVGTFILGVVVPEGPPLGSSMV
YKIDSLCTGLLLPAKFAISGLTLDIFSLGRGKSLLGVEAVILLGYLGKFAGTLVSAVHFA
VSFQDAVPLALIMCCKGIIEASFYIGLKDTGAITSEAYALLLITMLVITGIVRPLIWYLY
DPSRRYLGYRTNSIQHLDPTSELRVQVCIHNEDNVPSLVNLLDVSNPSRRRPIAVFVLNL
MELKGSAAALLVPTHNRKGKPKLKSLPSRTEHISNAFNILAHRNHGSMVVQHFTSIVPYA
TMHDDICTIAVDKGVNIVIIPFHKQWAIDGTVGANFPAIRMVNQQVLHKAPCSVGILVDR
GQLADNTQILFGHSLFRITMLYLGGPDDDEALAYCCRMLGHPHITMSLVWLKHSSDNIEK
SMESHMIQWFKANNVDAGRVSYKEEVVNDAVGTTQVLRSLEDSCDLCIVGRDHEQSELTL
GINEWIECPELGFIGDMLATSDYSFSLLVVQQTPPGTEFINIQPLQPVASSFYSGSGKYS
QHSGSGKYSQHSGYGPFG*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400078102
Transcript Infomation

pacid=37452440 locus=PGSC0003DMG400030375 ID=PGSC0003DMT400078102.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGGCGATCAGGCTTTGGTCGGATCCGTGCGTATTCATCCTTAATATTTCGACCAGAA
GGCAGAATGGTACTACAGACAATCTCAGATGTTGGTTTCATGTTTCATGTTTTTGTTCTT
GGAGTTCAAGTAGATCCAACAATGCTGAGAAGAGCGGGGAGAAACGCGGTTCTAATAGGT
GTTTCATCTTTTGTTATGCCTTTTGCACTTGGAGGATTAGCCTGTTACGTATTACCTCAT
TTGACTGTCATAGATGACGCGACAGCGCATTTCCTGCCTTTGTTATCTGTAATTAACTCT
GCTTCATTCTTTCCTGTGATCACTAGCCTTCTTAGTGATCTTAAGATTCTAAATTCGGAA
ATTGGTCGAATAGCTACATTAGCCTCCTTGGTTAATGACGGTTGTATATATGCTGCTTCC
ATACTTTTAACAACAATAGATGCATCATCAAGTTATTCAAAGTGGAATGGAGTAATGGCC
ATTGCATGGATAGGCACATTCCTGATAGTAATCGTGTTTGCTGTAAGGCCATTGGTGAAA
CATATTGCTAGGACTATACCGGAAAGAGGGGCTATGAAGGAAAGCCATTTTCTAATGATA
GCTGTGCTAGCTCTCCTCTGTGGATTTGTGTCCCAGTCTATTGGACAGCCTCCTGCTGTT
GGTACTTTTATTTTGGGAGTAGTGGTGCCAGAGGGACCGCCTTTGGGCTCATCGATGGTC
TACAAGATCGATTCTTTATGTACTGGATTGCTGCTTCCTGCTAAGTTTGCTATCAGTGGG
TTGACATTGGACATATTCTCCCTAGGAAGAGGAAAGAGTCTTTTAGGGGTCGAAGCAGTG
ATCCTATTGGGTTATTTAGGTAAGTTTGCTGGCACTCTTGTTTCAGCTGTTCACTTTGCT
GTTTCCTTCCAAGATGCAGTACCTCTTGCTCTCATCATGTGCTGCAAAGGAATTATCGAG
GCATCCTTTTATATCGGCTTAAAGGATACTGGAGCAATAACAAGTGAAGCATATGCGCTT
TTGTTAATCACAATGTTGGTCATAACAGGAATTGTGAGACCTTTAATTTGGTACCTCTAT
GATCCATCAAGAAGGTACTTAGGCTACAGAACAAATAGTATACAACATTTGGATCCGACC
AGTGAGCTTCGGGTACAAGTGTGTATTCACAACGAAGATAATGTCCCAAGCTTAGTCAAT
CTTCTTGATGTGTCCAATCCATCTAGAAGGAGACCGATTGCAGTGTTTGTTCTTAATCTA
ATGGAGCTCAAAGGCAGCGCAGCTGCTTTACTGGTGCCAACTCATAATAGAAAAGGCAAA
CCGAAACTCAAGTCTCTGCCTAGCAGAACTGAACATATATCTAATGCATTCAACATTCTC
GCACATAGAAATCACGGTTCTATGGTTGTTCAACACTTCACCTCCATTGTTCCGTATGCC
ACTATGCACGATGACATATGTACAATCGCGGTGGACAAAGGTGTCAATATTGTGATCATC
CCATTCCACAAGCAGTGGGCTATTGATGGAACAGTAGGAGCCAATTTCCCTGCAATTAGG
ATGGTGAACCAACAGGTACTCCATAAAGCACCTTGCTCAGTCGGGATCCTAGTTGATCGG
GGACAATTAGCCGATAACACACAAATCTTGTTTGGCCATTCTCTTTTCCGCATCACAATG
CTTTACCTAGGTGGTCCTGATGATGATGAGGCACTTGCCTATTGCTGCAGGATGCTAGGG
CATCCCCACATCACCATGAGTCTCGTCTGGCTCAAACATTCGAGTGACAATATCGAGAAG
AGTATGGAGTCACATATGATACAATGGTTCAAGGCTAATAATGTGGATGCAGGGAGAGTG
AGTTACAAAGAAGAAGTGGTGAATGATGCAGTGGGGACAACTCAGGTTCTTCGTTCACTC
GAGGACAGTTGTGATCTTTGTATAGTTGGTAGAGACCACGAACAGTCCGAGTTAACACTA
GGGATCAATGAATGGATCGAGTGTCCAGAACTAGGATTTATTGGAGACATGTTAGCTACT
TCGGATTATAGTTTTTCATTGCTCGTTGTGCAACAAACACCACCCGGGACCGAGTTTATA
AACATCCAGCCACTGCAGCCTGTTGCTAGCAGTTTTTATTCTGGTTCAGGTAAATATAGT
CAGCATTCTGGTTCAGGTAAATATAGTCAGCATTCTGGTTATGGCCCTTTTGGGTAG