Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400077544
CDS Infomation

pacid=37469257 polypeptide=PGSC0003DMP400052522 locus=PGSC0003DMG400030154 ID=PGSC0003DMT400077544.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCAGATCCAGAGCCATTGATTGATGTTGGAAAATTAAATGAAAAAGTTCTATGTTAT
GCACAAACAATTTATAGATTTAATGGAGTTTGGGAAGGACCAGATCCTTTGACACCAATT
ATCCCTCTTTTCTTTATTCAAGTTTCATTAGCTATATTGATCACTCGTTTTGTCACCTTT
GTCTTAAAACCCACCAAGCAACCTCCTTTTGTTGCTGAGATTATTAGTGGCATACTTTTA
GGTCCTACAGCACTTGGAAGGATCATGAGGTTCAGGAGGCTGCTTTTCCCAAACTACAAC
TTCCATGTTATTGAGACAATGGCTCATGTAGCCCTTGTGTTCTATGGGTTTCTAGTGGGA
TTGCAGATGGATATGAAATCCGTTCTTCGAATTGGAATAAAGGCTAGAAATGTTGCTATT
ATCGGTATCATCATCCCTTTTGTCATGGGAACAATATTATATTTCTCACTTACTCGCGAT
GAAGAAGTTAGAGGCTTCATTTTCTATGGTGGTGCTCTTACTATAACAGGGTTCTCTGTC
CTGTCTAAGATACTTGATAAACAAAAGATCCTCCAAACTGACATAGGGAAAATGGCTATG
TCTTCAGCTGTAATCAATGATATTGGTGCATGGTTTATTCTTACACTAGGATATGTTGTC
ACAGGGAGTACAGCTAATATCCATTGGGCATTAATTTGCACGATTGCTTATGCCTTGTTC
TGTGTCTTTTATCTTCGTCGTGCCATTGGCTGGACCATTAGAAAAATGCCAGAAGGACAA
GGGTATAGTGAGTTCTTTATATGTTCAATCCTTGCTGGAATGGCTATTTCCGGAGTTATA
ACTGATGCTTTAGGGACACATCCTATTATTGGAGCTTTTCTCTTTGGACTTAGTATACCT
AATCAAGTGCTTCAAGCAGAAATTATCGATAAGCTTGATGACTTTGTGACGGGCATTTTT
ATGCCAACTTTCTTTGTTGTTTGTGGACTCAGAACCAATTTCGGACAAATGGGCAGCATT
TACGAAATTGTTGGCTACATACTTTTATTTGTTTCAGCCAAAATCTTGAGCTCAATAGCT
GCCACTTTCTTCTCTGAAATGACTATTAAGGAGGCCCTGGCTGTTGGAGTACTTAGCAAC
ACCAAGAGTATCATGGCCTTGATCATTATCGAAGCTGGTCAGGCACAACAGGTTTTGAGC
ACGCAATTGTACTCCCTTATGGTGGCTGGTATTTTGGTGATGACGGCGATAGTCACACCT
ATGACTATGCTCCACCGTCCCTCGCAGGAAATTGCTCCCCATAAACGAAGGACTATACAG
AAGGCAAGAATGGAGGAGGAGCTTCGGGTCCTTGCTTGCATCCATGGCACACATGACATC
CCTTCAGTCATCAACCTTCTTGGCTCGTCACATTCTACGCCAGCATCCCCAATAACTGTC
TTTGCTCTCCAAGTAGTAGAATTAGTCGGGCGTGGATCATCTATGCTAGAAGTACACAAC
TCAGGGAAACGAGGCTCGCGAAGTCTTGGACACGAGGAGACACAAACAAGACAGATCATC
ACTGCTTTCGACAACTATGAGCTACGATCAGATGGAGTGATGGTACAAGTACTCACAGCA
AGGTCTGCTTTGTCCACCATGGATGAAGATATGTGCAACATTGCCAAAGATAAGCGTGTA
GCTTTCATCATTCTACCTTTCCACAAACAACGAGGTATCGAGGGTGAAATGGAGGATGTC
AACCCTGAAATTCGGGCTGTCAACGAAGGTGTGCTAGCTAATGCCCCTTGTTCTGTGGGA
ATCCTCATCGATCGTGGCCTCTCTGAAACAAGTGACTATGCAAAAAATATCGTTGTCCTC
TTTTTCGGAGGTGCTGATGACAGGGAAGCTCTAGCTTATGCTTTGAGAATGGTTGATCGT
CCAGATACACGCCTAACTGTTGTAAAGTTCATTCCAGACGAAGGTGCTTCTGATATAGAG
CAAACGGAATTTGCTGATGAAAGTCATGTGAATGTCCAGATTGACAAAGAGAGTGAAAAG
TTGATGGACGACGAGTTCTTAAACAGGTTCAAGATCAGCACAGCCAATGACAAATCAGTA
ACATACATAGAACTGTTGCTGAATGATGTGGAAGAAGCTGTCAAGGCCATAAAACTAATG
GATCAGCATAACTATGATCTCTATATCGTAGGAAAAGGCCGAGGTGTGGTTTCACCACTA
ACAGCTGGCCTAGTCGATTGGTGTGACTGTCCTGAGCTCGGGGCTATTGGTGATCTTTTA
GTGACATCAGAATTCGACTCCACATTCTCCGTGCTGGTGATGCAACAGTATGTTAAGCCA
ATTGGAGATGGTTCAGTAAATTCTTATGGATCAATGAGTGAGAGGATAGCAGGCATTGGG
AATATGGACATGGACTTGGACATGCAACGCGCGGATAGTGAATCAGGGGACGTGTTCTCC
AGTTTTAGAAGGCGAACGGAACATATGCCACGAGTCTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400052522
PEP Infomation

pacid=37469257 transcript=PGSC0003DMT400077544 locus=PGSC0003DMG400030154 ID=PGSC0003DMT400077544.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MADPEPLIDVGKLNEKVLCYAQTIYRFNGVWEGPDPLTPIIPLFFIQVSLAILITRFVTF
VLKPTKQPPFVAEIISGILLGPTALGRIMRFRRLLFPNYNFHVIETMAHVALVFYGFLVG
LQMDMKSVLRIGIKARNVAIIGIIIPFVMGTILYFSLTRDEEVRGFIFYGGALTITGFSV
LSKILDKQKILQTDIGKMAMSSAVINDIGAWFILTLGYVVTGSTANIHWALICTIAYALF
CVFYLRRAIGWTIRKMPEGQGYSEFFICSILAGMAISGVITDALGTHPIIGAFLFGLSIP
NQVLQAEIIDKLDDFVTGIFMPTFFVVCGLRTNFGQMGSIYEIVGYILLFVSAKILSSIA
ATFFSEMTIKEALAVGVLSNTKSIMALIIIEAGQAQQVLSTQLYSLMVAGILVMTAIVTP
MTMLHRPSQEIAPHKRRTIQKARMEEELRVLACIHGTHDIPSVINLLGSSHSTPASPITV
FALQVVELVGRGSSMLEVHNSGKRGSRSLGHEETQTRQIITAFDNYELRSDGVMVQVLTA
RSALSTMDEDMCNIAKDKRVAFIILPFHKQRGIEGEMEDVNPEIRAVNEGVLANAPCSVG
ILIDRGLSETSDYAKNIVVLFFGGADDREALAYALRMVDRPDTRLTVVKFIPDEGASDIE
QTEFADESHVNVQIDKESEKLMDDEFLNRFKISTANDKSVTYIELLLNDVEEAVKAIKLM
DQHNYDLYIVGKGRGVVSPLTAGLVDWCDCPELGAIGDLLVTSEFDSTFSVLVMQQYVKP
IGDGSVNSYGSMSERIAGIGNMDMDLDMQRADSESGDVFSSFRRRTEHMPRV*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400077544
Transcript Infomation

pacid=37469257 locus=PGSC0003DMG400030154 ID=PGSC0003DMT400077544.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCAGATCCAGAGCCATTGATTGATGTTGGAAAATTAAATGAAAAAGTTCTATGTTAT
GCACAAACAATTTATAGATTTAATGGAGTTTGGGAAGGACCAGATCCTTTGACACCAATT
ATCCCTCTTTTCTTTATTCAAGTTTCATTAGCTATATTGATCACTCGTTTTGTCACCTTT
GTCTTAAAACCCACCAAGCAACCTCCTTTTGTTGCTGAGATTATTAGTGGCATACTTTTA
GGTCCTACAGCACTTGGAAGGATCATGAGGTTCAGGAGGCTGCTTTTCCCAAACTACAAC
TTCCATGTTATTGAGACAATGGCTCATGTAGCCCTTGTGTTCTATGGGTTTCTAGTGGGA
TTGCAGATGGATATGAAATCCGTTCTTCGAATTGGAATAAAGGCTAGAAATGTTGCTATT
ATCGGTATCATCATCCCTTTTGTCATGGGAACAATATTATATTTCTCACTTACTCGCGAT
GAAGAAGTTAGAGGCTTCATTTTCTATGGTGGTGCTCTTACTATAACAGGGTTCTCTGTC
CTGTCTAAGATACTTGATAAACAAAAGATCCTCCAAACTGACATAGGGAAAATGGCTATG
TCTTCAGCTGTAATCAATGATATTGGTGCATGGTTTATTCTTACACTAGGATATGTTGTC
ACAGGGAGTACAGCTAATATCCATTGGGCATTAATTTGCACGATTGCTTATGCCTTGTTC
TGTGTCTTTTATCTTCGTCGTGCCATTGGCTGGACCATTAGAAAAATGCCAGAAGGACAA
GGGTATAGTGAGTTCTTTATATGTTCAATCCTTGCTGGAATGGCTATTTCCGGAGTTATA
ACTGATGCTTTAGGGACACATCCTATTATTGGAGCTTTTCTCTTTGGACTTAGTATACCT
AATCAAGTGCTTCAAGCAGAAATTATCGATAAGCTTGATGACTTTGTGACGGGCATTTTT
ATGCCAACTTTCTTTGTTGTTTGTGGACTCAGAACCAATTTCGGACAAATGGGCAGCATT
TACGAAATTGTTGGCTACATACTTTTATTTGTTTCAGCCAAAATCTTGAGCTCAATAGCT
GCCACTTTCTTCTCTGAAATGACTATTAAGGAGGCCCTGGCTGTTGGAGTACTTAGCAAC
ACCAAGAGTATCATGGCCTTGATCATTATCGAAGCTGGTCAGGCACAACAGGTTTTGAGC
ACGCAATTGTACTCCCTTATGGTGGCTGGTATTTTGGTGATGACGGCGATAGTCACACCT
ATGACTATGCTCCACCGTCCCTCGCAGGAAATTGCTCCCCATAAACGAAGGACTATACAG
AAGGCAAGAATGGAGGAGGAGCTTCGGGTCCTTGCTTGCATCCATGGCACACATGACATC
CCTTCAGTCATCAACCTTCTTGGCTCGTCACATTCTACGCCAGCATCCCCAATAACTGTC
TTTGCTCTCCAAGTAGTAGAATTAGTCGGGCGTGGATCATCTATGCTAGAAGTACACAAC
TCAGGGAAACGAGGCTCGCGAAGTCTTGGACACGAGGAGACACAAACAAGACAGATCATC
ACTGCTTTCGACAACTATGAGCTACGATCAGATGGAGTGATGGTACAAGTACTCACAGCA
AGGTCTGCTTTGTCCACCATGGATGAAGATATGTGCAACATTGCCAAAGATAAGCGTGTA
GCTTTCATCATTCTACCTTTCCACAAACAACGAGGTATCGAGGGTGAAATGGAGGATGTC
AACCCTGAAATTCGGGCTGTCAACGAAGGTGTGCTAGCTAATGCCCCTTGTTCTGTGGGA
ATCCTCATCGATCGTGGCCTCTCTGAAACAAGTGACTATGCAAAAAATATCGTTGTCCTC
TTTTTCGGAGGTGCTGATGACAGGGAAGCTCTAGCTTATGCTTTGAGAATGGTTGATCGT
CCAGATACACGCCTAACTGTTGTAAAGTTCATTCCAGACGAAGGTGCTTCTGATATAGAG
CAAACGGAATTTGCTGATGAAAGTCATGTGAATGTCCAGATTGACAAAGAGAGTGAAAAG
TTGATGGACGACGAGTTCTTAAACAGGTTCAAGATCAGCACAGCCAATGACAAATCAGTA
ACATACATAGAACTGTTGCTGAATGATGTGGAAGAAGCTGTCAAGGCCATAAAACTAATG
GATCAGCATAACTATGATCTCTATATCGTAGGAAAAGGCCGAGGTGTGGTTTCACCACTA
ACAGCTGGCCTAGTCGATTGGTGTGACTGTCCTGAGCTCGGGGCTATTGGTGATCTTTTA
GTGACATCAGAATTCGACTCCACATTCTCCGTGCTGGTGATGCAACAGTATGTTAAGCCA
ATTGGAGATGGTTCAGTAAATTCTTATGGATCAATGAGTGAGAGGATAGCAGGCATTGGG
AATATGGACATGGACTTGGACATGCAACGCGCGGATAGTGAATCAGGGGACGTGTTCTCC
AGTTTTAGAAGGCGAACGGAACATATGCCACGAGTCTAA