Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400077519
CDS Infomation

pacid=37430148 polypeptide=PGSC0003DMP400052506 locus=PGSC0003DMG400030144 ID=PGSC0003DMT400077519.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTTGTTTTTGTCTCTTTATCTTCTCTCAAATACTTGCTTCTTATCATAATTATCCCT
TTAGTCACTTCACTCTCCTTCAATTTTGATACTTTTACACCCAATGATCACAATGTAACC
TATGAGAGAGATGCTTCTCCAGAAAATGGTGCAATTCTACTCACCAAAAACCTCCTCAAT
CGCGATATTAATGCTAGTATAGGCCGAGCTATATATTCAAAACCACTGCATCTATGGGAC
AAGGCCTCTCGAAATCTCACTGATTTCACTACACATTTCTCCTTTAGCATTAATTCACAG
GGAATAACTAAATATGGTGATGGTTTTGCCTTCTTCCTTGCCCCTGCAGGTTCAACAATT
CCTTATAATACAACAAGAGGTGGAAGTCTTGGCCTTACAAGTAATAATGAGCGACTAAAT
TCATCGAGCAATCATTTTGTTGCTGTGGAGTTTGACACCTATCAGAACCCCTATGACCCA
AAGGGTGATCATGTAGGTGTCGATATTAACTCTATGCAATCTGTTGTTAATGTGACTTGG
TTTAGTAGCATTCCAAATGGTACGAAAACTGATGCCTGGATTAGTTATAATTCTAACTCA
AAAAATCTTACTGTTGTCTTCACTGGTTTTCAACTCCAAGGGAATAATATCACAGTCACT
GTCCTGCAGAACCTATCTTACAATCTTGATCTGAGGGAATATTTGCCAGAATGGGTCACT
TTTGGCTTCACTGGTGGAGCGGGAAGGAGATTTGCATTTCAAAGAATCTATTCTTGGAAA
TTTACTTCTTCTTTAGATAATATGACAGATACAGGGGTAACCTTATCAAACACCTTGCCA
AAGGATGCACCAACAAAAACTAAGTTAGGACTTGTGGTTGGATTGATTTCTGGTGGTTGT
GTTTTGGTTGCAGTATGTGCTTTGGTGTTATTTGCATTTTGGAGAAAGAGTAAGGTCAGA
GAAGATGATTATGTCTTTGATGGTTCCATGACTAATGAATTTCAAAAAAGTGCAGGACCA
AAGAAGTTCTTGTACAGTGAGTTGGCTAGATGTACAAATAACTTTTCACAGGAAGAGATG
CTTGGGCGGGGTGGATTCGGAGGTGTTTATAAAGGATATCTCAGTGAATCCAACTCTTAT
ATTGCTGTTAAGAGGGTTTCAAGGGAATCACAGCAAGGAATAAAAGAGTATGTATCAGAA
GTCAGGATCGTCAGCCGGTTAAGACATAAACATTTGGTGCAACTCATTGGTTGGTGCCAT
CAAAAAAGAGAACTTCTACTTGTCTATGAGTTTATGCCTAATGGAAGCTTAGATCACCAT
ATTTTTAGTGGAAAAAGCCATTTGGCATGGCCACTAAGATTCAAGATTGCTCAAGGCTTG
GCCTCGGCGTTGCTATATCTACACGAAGAATGGGAACAATGTGTGGTGCATAGGGATATA
AAGTCTAGCAATATTATGTTGGATTCTAATTTCAATGCCAAGCTTGGGGATTTTGGGTTA
GCTAGGCTAGTTGACCATGATAAGGGATCCCAAACAACAGTTTTGGCAGGCACAATGGGT
TACATGGCTCCTGAATGTGTCACCACTGGCAAAGCTAACAAGGAAACAGACGTCTATAGC
TTTGGTATTGTCGTGTTAGAAATAGGTTGTGGAAGGAAACCTATTGATCCTAAAGCAGAG
GAGCATCGAGTAAACATTGTCGATTGGGTTTGGAGACTTTATGGGATGAGAAGTATTCTT
GAAGCAGTTGATCCGAAACTATCATCAGAGTTCAATGAAGAGGAGATGGAGCATTTGCTA
GTTGTTGGCTTATGGTGTGCTCATCCAGATAATAATTGCAGGCCTTCTATTAGGCAAGCA
GTTCAGGTGCTTAATTTTGAAGCTCCATTACCCACGCTCCCTCGGAGCATGCCTGTGCCC
ACATATTGCAGCTTCTCACGCCATTTATCAACTATTTCAGTTTCATCAACACATGAAACC
AGCGGTACAGAGATCGCCCTTGCCCAAATCCAGCATTCAGTAAACGGAAACACCACTGAT
GCTTCAATAAAGAGAACATCTTCTTCAGCATCTTCATCTTCAACATCAGTTTTGTATCCA
AGTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400052506
PEP Infomation

pacid=37430148 transcript=PGSC0003DMT400077519 locus=PGSC0003DMG400030144 ID=PGSC0003DMT400077519.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MVVFVSLSSLKYLLLIIIIPLVTSLSFNFDTFTPNDHNVTYERDASPENGAILLTKNLLN
RDINASIGRAIYSKPLHLWDKASRNLTDFTTHFSFSINSQGITKYGDGFAFFLAPAGSTI
PYNTTRGGSLGLTSNNERLNSSSNHFVAVEFDTYQNPYDPKGDHVGVDINSMQSVVNVTW
FSSIPNGTKTDAWISYNSNSKNLTVVFTGFQLQGNNITVTVLQNLSYNLDLREYLPEWVT
FGFTGGAGRRFAFQRIYSWKFTSSLDNMTDTGVTLSNTLPKDAPTKTKLGLVVGLISGGC
VLVAVCALVLFAFWRKSKVREDDYVFDGSMTNEFQKSAGPKKFLYSELARCTNNFSQEEM
LGRGGFGGVYKGYLSESNSYIAVKRVSRESQQGIKEYVSEVRIVSRLRHKHLVQLIGWCH
QKRELLLVYEFMPNGSLDHHIFSGKSHLAWPLRFKIAQGLASALLYLHEEWEQCVVHRDI
KSSNIMLDSNFNAKLGDFGLARLVDHDKGSQTTVLAGTMGYMAPECVTTGKANKETDVYS
FGIVVLEIGCGRKPIDPKAEEHRVNIVDWVWRLYGMRSILEAVDPKLSSEFNEEEMEHLL
VVGLWCAHPDNNCRPSIRQAVQVLNFEAPLPTLPRSMPVPTYCSFSRHLSTISVSSTHET
SGTEIALAQIQHSVNGNTTDASIKRTSSSASSSSTSVLYPS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400077519
Transcript Infomation

pacid=37430148 locus=PGSC0003DMG400030144 ID=PGSC0003DMT400077519.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTTGTTTTTGTCTCTTTATCTTCTCTCAAATACTTGCTTCTTATCATAATTATCCCT
TTAGTCACTTCACTCTCCTTCAATTTTGATACTTTTACACCCAATGATCACAATGTAACC
TATGAGAGAGATGCTTCTCCAGAAAATGGTGCAATTCTACTCACCAAAAACCTCCTCAAT
CGCGATATTAATGCTAGTATAGGCCGAGCTATATATTCAAAACCACTGCATCTATGGGAC
AAGGCCTCTCGAAATCTCACTGATTTCACTACACATTTCTCCTTTAGCATTAATTCACAG
GGAATAACTAAATATGGTGATGGTTTTGCCTTCTTCCTTGCCCCTGCAGGTTCAACAATT
CCTTATAATACAACAAGAGGTGGAAGTCTTGGCCTTACAAGTAATAATGAGCGACTAAAT
TCATCGAGCAATCATTTTGTTGCTGTGGAGTTTGACACCTATCAGAACCCCTATGACCCA
AAGGGTGATCATGTAGGTGTCGATATTAACTCTATGCAATCTGTTGTTAATGTGACTTGG
TTTAGTAGCATTCCAAATGGTACGAAAACTGATGCCTGGATTAGTTATAATTCTAACTCA
AAAAATCTTACTGTTGTCTTCACTGGTTTTCAACTCCAAGGGAATAATATCACAGTCACT
GTCCTGCAGAACCTATCTTACAATCTTGATCTGAGGGAATATTTGCCAGAATGGGTCACT
TTTGGCTTCACTGGTGGAGCGGGAAGGAGATTTGCATTTCAAAGAATCTATTCTTGGAAA
TTTACTTCTTCTTTAGATAATATGACAGATACAGGGGTAACCTTATCAAACACCTTGCCA
AAGGATGCACCAACAAAAACTAAGTTAGGACTTGTGGTTGGATTGATTTCTGGTGGTTGT
GTTTTGGTTGCAGTATGTGCTTTGGTGTTATTTGCATTTTGGAGAAAGAGTAAGGTCAGA
GAAGATGATTATGTCTTTGATGGTTCCATGACTAATGAATTTCAAAAAAGTGCAGGACCA
AAGAAGTTCTTGTACAGTGAGTTGGCTAGATGTACAAATAACTTTTCACAGGAAGAGATG
CTTGGGCGGGGTGGATTCGGAGGTGTTTATAAAGGATATCTCAGTGAATCCAACTCTTAT
ATTGCTGTTAAGAGGGTTTCAAGGGAATCACAGCAAGGAATAAAAGAGTATGTATCAGAA
GTCAGGATCGTCAGCCGGTTAAGACATAAACATTTGGTGCAACTCATTGGTTGGTGCCAT
CAAAAAAGAGAACTTCTACTTGTCTATGAGTTTATGCCTAATGGAAGCTTAGATCACCAT
ATTTTTAGTGGAAAAAGCCATTTGGCATGGCCACTAAGATTCAAGATTGCTCAAGGCTTG
GCCTCGGCGTTGCTATATCTACACGAAGAATGGGAACAATGTGTGGTGCATAGGGATATA
AAGTCTAGCAATATTATGTTGGATTCTAATTTCAATGCCAAGCTTGGGGATTTTGGGTTA
GCTAGGCTAGTTGACCATGATAAGGGATCCCAAACAACAGTTTTGGCAGGCACAATGGGT
TACATGGCTCCTGAATGTGTCACCACTGGCAAAGCTAACAAGGAAACAGACGTCTATAGC
TTTGGTATTGTCGTGTTAGAAATAGGTTGTGGAAGGAAACCTATTGATCCTAAAGCAGAG
GAGCATCGAGTAAACATTGTCGATTGGGTTTGGAGACTTTATGGGATGAGAAGTATTCTT
GAAGCAGTTGATCCGAAACTATCATCAGAGTTCAATGAAGAGGAGATGGAGCATTTGCTA
GTTGTTGGCTTATGGTGTGCTCATCCAGATAATAATTGCAGGCCTTCTATTAGGCAAGCA
GTTCAGGTGCTTAATTTTGAAGCTCCATTACCCACGCTCCCTCGGAGCATGCCTGTGCCC
ACATATTGCAGCTTCTCACGCCATTTATCAACTATTTCAGTTTCATCAACACATGAAACC
AGCGGTACAGAGATCGCCCTTGCCCAAATCCAGCATTCAGTAAACGGAAACACCACTGAT
GCTTCAATAAAGAGAACATCTTCTTCAGCATCTTCATCTTCAACATCAGTTTTGTATCCA
AGTTAA