Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400076954
CDS Infomation	pacid=37450429 polypeptide=PGSC0003DMP400052145 locus=PGSC0003DMG400029931 ID=PGSC0003DMT400076954.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGGAAGTGCACTGGAGACGCTGTGTGGACAGGCATATGGTGCAGGGCAAATTCACATG CTTGGTGTTTATATGCAACGCTCTATCATAATTCTATTTGCAACTTGTATCTTGCTCTTG CCAATATATCTATTTGCAACCCCAGTGCTTAAGCTGCTAGGCCAAGAATCTCACATTGCT GAGCTTGCGGGGGAATATGCCATACTAATCATCCCCCAATTGTTTTCACTTTCCATCAAT TTTCCGACCTCCAAATTCCTTCAAGCCCAAAGCAAAGTTGATGTGATTGCCTGGATTGGA TTTGTGACTTTGCTCATGCATGCTACACTCCTTTGGCTCTTTATTTACACATTCGGCTGG GGTACGACTGGTGCTGCCATAGCCTTTGACCTAACAAATTGGGTCTTGGCAATAGCTCAG TTTGCTTATGTTGTTGGATGGTGTAAGGATGGATGGAAGGGATTGTCCTGGGCAGCATTT AACGAAATGTGGTCCTTTGTGAGGCTCTCCATTGCCTCAGCCATTATGCTATGTCTTGAA ATTTGGTATATGATGAGTATTATCATCCTTGTTGGCCATCTTGACAATGCAGTTATTGCA GTTGGATCTATTTCTATTTGCATGAATGTCAATGGCTATGAAGGCATGTTGTTCATTGGA ATTAATGCTGCCATAAGTGTACGGGTCTCAAATGAGCTTGGCCTAGGACGTCCAAGGGCC ACTAAATACTCTGTCTATATCTCAGTGTTTCAGTCACTCCTAATTGGGCTACTCTGTATG GTTATTGTAATGGTAGCTAGAGAGCATTTGGCCGTTATTTTTACTAGCAGCAAAGATATG CAACAAGCTGTTGGTGATCTTTCTTACCTTCTCGGAATAACTATGGTTCTTAATAGTGTT CAGCCTGTTATATCAGGTGTTGCTGTGGGAGGTGGATGGCAAGCTTTAGTGGCTTATATT AATCTGGGATGTTATTACATTTTTGGACTCCCTCTAGGATTTATTCTTGGTTATGTGGCA AAGTTGGGAGCAAAGGGACTTTGGCTAGGAATGATAGCTGGGACATCTTTGCAGACTGTG CTACTATTGATTGTACTATATAAGACAAATTGGAACAAGGAGGTTGAGGAGACGAACGAG CGTATGCGGAAGTGGGGAGGTCAAGATTTTGAAATTGAGAAATCCCAGGCTGATCGCCTG ATGTCTGTTGAGAATGGTGTGTCGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400052145
PEP Infomation	pacid=37450429 transcript=PGSC0003DMT400076954 locus=PGSC0003DMG400029931 ID=PGSC0003DMT400076954.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MGSALETLCGQAYGAGQIHMLGVYMQRSIIILFATCILLLPIYLFATPVLKLLGQESHIA ELAGEYAILIIPQLFSLSINFPTSKFLQAQSKVDVIAWIGFVTLLMHATLLWLFIYTFGW GTTGAAIAFDLTNWVLAIAQFAYVVGWCKDGWKGLSWAAFNEMWSFVRLSIASAIMLCLE IWYMMSIIILVGHLDNAVIAVGSISICMNVNGYEGMLFIGINAAISVRVSNELGLGRPRA TKYSVYISVFQSLLIGLLCMVIVMVAREHLAVIFTSSKDMQQAVGDLSYLLGITMVLNSV QPVISGVAVGGGWQALVAYINLGCYYIFGLPLGFILGYVAKLGAKGLWLGMIAGTSLQTV LLLIVLYKTNWNKEVEETNERMRKWGGQDFEIEKSQADRLMSVENGVS*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400076954
Transcript Infomation	pacid=37450429 locus=PGSC0003DMG400029931 ID=PGSC0003DMT400076954.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGGAAGTGCACTGGAGACGCTGTGTGGACAGGCATATGGTGCAGGGCAAATTCACATG CTTGGTGTTTATATGCAACGCTCTATCATAATTCTATTTGCAACTTGTATCTTGCTCTTG CCAATATATCTATTTGCAACCCCAGTGCTTAAGCTGCTAGGCCAAGAATCTCACATTGCT GAGCTTGCGGGGGAATATGCCATACTAATCATCCCCCAATTGTTTTCACTTTCCATCAAT TTTCCGACCTCCAAATTCCTTCAAGCCCAAAGCAAAGTTGATGTGATTGCCTGGATTGGA TTTGTGACTTTGCTCATGCATGCTACACTCCTTTGGCTCTTTATTTACACATTCGGCTGG GGTACGACTGGTGCTGCCATAGCCTTTGACCTAACAAATTGGGTCTTGGCAATAGCTCAG TTTGCTTATGTTGTTGGATGGTGTAAGGATGGATGGAAGGGATTGTCCTGGGCAGCATTT AACGAAATGTGGTCCTTTGTGAGGCTCTCCATTGCCTCAGCCATTATGCTATGTCTTGAA ATTTGGTATATGATGAGTATTATCATCCTTGTTGGCCATCTTGACAATGCAGTTATTGCA GTTGGATCTATTTCTATTTGCATGAATGTCAATGGCTATGAAGGCATGTTGTTCATTGGA ATTAATGCTGCCATAAGTGTACGGGTCTCAAATGAGCTTGGCCTAGGACGTCCAAGGGCC ACTAAATACTCTGTCTATATCTCAGTGTTTCAGTCACTCCTAATTGGGCTACTCTGTATG GTTATTGTAATGGTAGCTAGAGAGCATTTGGCCGTTATTTTTACTAGCAGCAAAGATATG CAACAAGCTGTTGGTGATCTTTCTTACCTTCTCGGAATAACTATGGTTCTTAATAGTGTT CAGCCTGTTATATCAGGTGTTGCTGTGGGAGGTGGATGGCAAGCTTTAGTGGCTTATATT AATCTGGGATGTTATTACATTTTTGGACTCCCTCTAGGATTTATTCTTGGTTATGTGGCA AAGTTGGGAGCAAAGGGACTTTGGCTAGGAATGATAGCTGGGACATCTTTGCAGACTGTG CTACTATTGATTGTACTATATAAGACAAATTGGAACAAGGAGGTTGAGGAGACGAACGAG CGTATGCGGAAGTGGGGAGGTCAAGATTTTGAAATTGAGAAATCCCAGGCTGATCGCCTG ATGTCTGTTGAGAATGGTGTGTCGTAA