Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400076713
CDS Infomation

pacid=37478281 polypeptide=PGSC0003DMP400051984 locus=PGSC0003DMG400029836 ID=PGSC0003DMT400076713.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCATGTTCTCTGTCTCTCAAGCAGCCATTCAGCTCTCTGCCTACCAACACAACCACC
CAGGGTAAATTGCCTGTAAACTTTCCTGTGACATTTGGGTGCATGAATGGGAAGGGAACT
CTAATAGAACAGAAATTCCAACTGAATTGCTCAAGAGACAAAGAGATGGATCTCACTGCA
TCAGCTTTGATTGATAGTGTTGCTGCCGAATGCATGGATGAGATGGGGACTATGGAACTA
CCTCCTCGAGTTGAGGCTAGGGAAGCAAAAGAGCCAAGTGTTTCAACAATGTTGATGAAC
TTCAGTAATGATTTTGATCCTTATGGTGCCTTAAGTACCCCCTTGTATCAAACATCTACT
TTTAAGCAACCTTCAGCAACCGAAAATGGGCAATATGATTATACACGGAGTGGAAATCCA
ACAAGGGATGCATTGGAAAAGCTTCTTGCAGAGCTTGAGAAAGCAGATCGAGCATTTTGC
TTTACCAGTGGAATGGCCGCCTTGGCAGCTGTAACTCGTCTCGTTAAAGCTGGTGAGGAG
ATTGTTGCCGGGGATGACATATATGGTGGTTCTGACCGGCTGCTCTCACAAGTTGTTCCA
AAAGCCGGGATCGTGGTCAAGCGAGTGGATACCACTAACTTAGATGAGGTTGCTTCTGTG
ATTAAACCATGGACAAAGCTTGTTTGGCTGGAAAGCCCAACCAACCCTCGTCAACAAATT
TGTGATATTCGTAAAATAGCCAAGATCGCTCATGCACATGGGGCTCTTGTGCTGGTAGAT
AACAGCATTATGTCCCCAGTACTGTCCCATCCTTTGGAGCTCGGAGCAGATATTGTGATG
CATTCAGCTACTAAGTTCATATCCGGTCATAGTGATCTCATGGCTGGTGTACTTGCCGTC
AGAGGAGAAAGCTTGGCGAAAGAGGTGTACTTCCTACAAAATGCTGAAGGTGCAGGGTTA
GCGCCATTCGATTGTTGGCTTTGTTTAAGAGGAATCAAAACAATGGCTCTTCGTGTTGAA
AAACAACAGGAAAATGCACAAAAAATTGCTGAATTTTTATCTTCCCATCCACGAGTGAAA
AAGGTCAACTATGCAGGTCTTCTTGACCATCCAGGGAGGTCTTTGCACTTCTCTCAGGCT
ACGGGTGCTGGATCGGTGCTGAGTTTCCTGACAGGTTCTTTGGCACTCTCTAAGCATGTT
GCTGAGGCTACCAAGTATTTCAGTATTACTGTCAGTTTTGGAAGTGTCAAGTCACTCATA
AGCTTGCCTTGCTTCATGTCCCATGCGAGCATACCTGTTGAAGTACGAGAGGCGAGAGGT
CTTACTGAGGACCTGGTTCGAATTTCTGTTGGGATTGAAGATGTCAACGACTTGATAGAT
GATTTAGACTATGCACTCAAGACTGGGCCTGCCTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400051984
PEP Infomation

pacid=37478281 transcript=PGSC0003DMT400076713 locus=PGSC0003DMG400029836 ID=PGSC0003DMT400076713.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MACSLSLKQPFSSLPTNTTTQGKLPVNFPVTFGCMNGKGTLIEQKFQLNCSRDKEMDLTA
SALIDSVAAECMDEMGTMELPPRVEAREAKEPSVSTMLMNFSNDFDPYGALSTPLYQTST
FKQPSATENGQYDYTRSGNPTRDALEKLLAELEKADRAFCFTSGMAALAAVTRLVKAGEE
IVAGDDIYGGSDRLLSQVVPKAGIVVKRVDTTNLDEVASVIKPWTKLVWLESPTNPRQQI
CDIRKIAKIAHAHGALVLVDNSIMSPVLSHPLELGADIVMHSATKFISGHSDLMAGVLAV
RGESLAKEVYFLQNAEGAGLAPFDCWLCLRGIKTMALRVEKQQENAQKIAEFLSSHPRVK
KVNYAGLLDHPGRSLHFSQATGAGSVLSFLTGSLALSKHVAEATKYFSITVSFGSVKSLI
SLPCFMSHASIPVEVREARGLTEDLVRISVGIEDVNDLIDDLDYALKTGPA*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400076713
Transcript Infomation

pacid=37478281 locus=PGSC0003DMG400029836 ID=PGSC0003DMT400076713.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCATGTTCTCTGTCTCTCAAGCAGCCATTCAGCTCTCTGCCTACCAACACAACCACC
CAGGGTAAATTGCCTGTAAACTTTCCTGTGACATTTGGGTGCATGAATGGGAAGGGAACT
CTAATAGAACAGAAATTCCAACTGAATTGCTCAAGAGACAAAGAGATGGATCTCACTGCA
TCAGCTTTGATTGATAGTGTTGCTGCCGAATGCATGGATGAGATGGGGACTATGGAACTA
CCTCCTCGAGTTGAGGCTAGGGAAGCAAAAGAGCCAAGTGTTTCAACAATGTTGATGAAC
TTCAGTAATGATTTTGATCCTTATGGTGCCTTAAGTACCCCCTTGTATCAAACATCTACT
TTTAAGCAACCTTCAGCAACCGAAAATGGGCAATATGATTATACACGGAGTGGAAATCCA
ACAAGGGATGCATTGGAAAAGCTTCTTGCAGAGCTTGAGAAAGCAGATCGAGCATTTTGC
TTTACCAGTGGAATGGCCGCCTTGGCAGCTGTAACTCGTCTCGTTAAAGCTGGTGAGGAG
ATTGTTGCCGGGGATGACATATATGGTGGTTCTGACCGGCTGCTCTCACAAGTTGTTCCA
AAAGCCGGGATCGTGGTCAAGCGAGTGGATACCACTAACTTAGATGAGGTTGCTTCTGTG
ATTAAACCATGGACAAAGCTTGTTTGGCTGGAAAGCCCAACCAACCCTCGTCAACAAATT
TGTGATATTCGTAAAATAGCCAAGATCGCTCATGCACATGGGGCTCTTGTGCTGGTAGAT
AACAGCATTATGTCCCCAGTACTGTCCCATCCTTTGGAGCTCGGAGCAGATATTGTGATG
CATTCAGCTACTAAGTTCATATCCGGTCATAGTGATCTCATGGCTGGTGTACTTGCCGTC
AGAGGAGAAAGCTTGGCGAAAGAGGTGTACTTCCTACAAAATGCTGAAGGTGCAGGGTTA
GCGCCATTCGATTGTTGGCTTTGTTTAAGAGGAATCAAAACAATGGCTCTTCGTGTTGAA
AAACAACAGGAAAATGCACAAAAAATTGCTGAATTTTTATCTTCCCATCCACGAGTGAAA
AAGGTCAACTATGCAGGTCTTCTTGACCATCCAGGGAGGTCTTTGCACTTCTCTCAGGCT
ACGGGTGCTGGATCGGTGCTGAGTTTCCTGACAGGTTCTTTGGCACTCTCTAAGCATGTT
GCTGAGGCTACCAAGTATTTCAGTATTACTGTCAGTTTTGGAAGTGTCAAGTCACTCATA
AGCTTGCCTTGCTTCATGTCCCATGCGAGCATACCTGTTGAAGTACGAGAGGCGAGAGGT
CTTACTGAGGACCTGGTTCGAATTTCTGTTGGGATTGAAGATGTCAACGACTTGATAGAT
GATTTAGACTATGCACTCAAGACTGGGCCTGCCTAG