Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400076253
CDS Infomation

pacid=37456229 polypeptide=PGSC0003DMP400051650 locus=PGSC0003DMG400029646 ID=PGSC0003DMT400076253.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATGTTGGAGGAAACTCCTTAGCATCTGGTGCAGATGGAAAGAAGAGAAAAGTAAGT
TATTTCTATGATCCTGAAGTTGGCAATTACTATTATGGACAAGGCCACCCAATGAAGCCA
CATCGAATGCGGATGACACATGCTCTTCTTGCCCACTATGGTCTATTACAACATATGCAT
GTTCTGAAGCCAAACCCTGCTAGAGATAAGGATCTCTGCAGGTTTCATGCTGATGATTAT
ATTGCTTTCTTGAGAAGCGTAACCCCAGAAACACAGCAAGATCAGCTGAGGCAGCTGAAG
AGATTCAACGTTGGGGAGGACTGTCCAGTTTTTGATGGTCTTTATTCCTTCTGCCAAACC
TATGCTGGAGGTTCTGTTGGTGGGGCAGTGAAGTTGAACCATGGACACTGTGATATCGCT
GTAAATTGGGCTGGTGGATTGCATCATGCCAAGAAATGTGAAGCATCTGGTTTCTGCTAT
GTGAACGATATCGTGTTGGCTATTCTGGAGCTACTCAAAGTTCATGAGAGAGTGTTGTAT
GTGGATATTGATATCCATCATGGTGATGGCGTGGAAGAGGCCTTCTATACCACAGATAGG
GTCATGACAGTTTCCTTTCATAAATTTGGAGATTACTTTCCTGGTACAGGGGATGTACGT
GATATTGGTTATGGAAGTGGAAAATACTACTCTCTAAATGTTCCACTAGATGATGGAATT
GATGATGAGAGCTATCAGTCCCTCTTTAAGCCAATTATGGGCAAAGTGATGGAAGTTTTT
AAGCCTGGTGCTGTGGTCTTACAATGTGGAGCAGATTCCTTGTCTGGTGATAGGCTAGGC
TGCTTTAATCTCTCTATTAAAGGTCATGCAGAATGTGTCAAGTACATGAGGTCTTTCAAT
GTGCCACTGTTGTTGCTTGGTGGAGGTGGCTACACAATACGTAATGTTGCTCGTTGCTGG
TGTTATGAAACAGGAGTTGCATTAGGAATAGAGCTTGAAGATAAGATGCCGCAACATGAA
TATTATGAATACTTTGGTCCAGATTATACCTTGCATGTTGCTCCAAGTAACATGGAGAAC
AAAAATTCTCGTCAGATTTTAGAAGATATAAGATCAAAGCTGCTTGAGAATCTTTCAAAG
CTTCAGCATGCCCCAAGTGTACAGTTCCAGGAGCGACCACCGGATACTGAATTGCCCGAG
GCTGATGAAGATCTAGAGGATGCAGATTCAAGATGGGATGCTGATTCTGACACGAATGGC
GAAGAACGTAAGCCCATTCCTAGCAGAGTGAGGAGGGAACATGTTGAACCTGAAGGAAAA
GGCATGGACGATATGAAAACAGAGGAGCACCTAAGAGAAGTAGAATCGACATTCGCAGAG
TCAACAAGTTTGAAGGGTGGCAATTCAGGTTCTACACTGATAGATGGAGGTCAGATTAAA
CTGGAACAAGGAAACTCTAACAAGCCTTTTGATCAACCAACTGATATTATTTCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400051650
PEP Infomation

pacid=37456229 transcript=PGSC0003DMT400076253 locus=PGSC0003DMG400029646 ID=PGSC0003DMT400076253.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MDVGGNSLASGADGKKRKVSYFYDPEVGNYYYGQGHPMKPHRMRMTHALLAHYGLLQHMH
VLKPNPARDKDLCRFHADDYIAFLRSVTPETQQDQLRQLKRFNVGEDCPVFDGLYSFCQT
YAGGSVGGAVKLNHGHCDIAVNWAGGLHHAKKCEASGFCYVNDIVLAILELLKVHERVLY
VDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKFGDYFPGTGDVRDIGYGSGKYYSLNVPLDDGI
DDESYQSLFKPIMGKVMEVFKPGAVVLQCGADSLSGDRLGCFNLSIKGHAECVKYMRSFN
VPLLLLGGGGYTIRNVARCWCYETGVALGIELEDKMPQHEYYEYFGPDYTLHVAPSNMEN
KNSRQILEDIRSKLLENLSKLQHAPSVQFQERPPDTELPEADEDLEDADSRWDADSDTNG
EERKPIPSRVRREHVEPEGKGMDDMKTEEHLREVESTFAESTSLKGGNSGSTLIDGGQIK
LEQGNSNKPFDQPTDIIS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400076253
Transcript Infomation

pacid=37456229 locus=PGSC0003DMG400029646 ID=PGSC0003DMT400076253.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATGTTGGAGGAAACTCCTTAGCATCTGGTGCAGATGGAAAGAAGAGAAAAGTAAGT
TATTTCTATGATCCTGAAGTTGGCAATTACTATTATGGACAAGGCCACCCAATGAAGCCA
CATCGAATGCGGATGACACATGCTCTTCTTGCCCACTATGGTCTATTACAACATATGCAT
GTTCTGAAGCCAAACCCTGCTAGAGATAAGGATCTCTGCAGGTTTCATGCTGATGATTAT
ATTGCTTTCTTGAGAAGCGTAACCCCAGAAACACAGCAAGATCAGCTGAGGCAGCTGAAG
AGATTCAACGTTGGGGAGGACTGTCCAGTTTTTGATGGTCTTTATTCCTTCTGCCAAACC
TATGCTGGAGGTTCTGTTGGTGGGGCAGTGAAGTTGAACCATGGACACTGTGATATCGCT
GTAAATTGGGCTGGTGGATTGCATCATGCCAAGAAATGTGAAGCATCTGGTTTCTGCTAT
GTGAACGATATCGTGTTGGCTATTCTGGAGCTACTCAAAGTTCATGAGAGAGTGTTGTAT
GTGGATATTGATATCCATCATGGTGATGGCGTGGAAGAGGCCTTCTATACCACAGATAGG
GTCATGACAGTTTCCTTTCATAAATTTGGAGATTACTTTCCTGGTACAGGGGATGTACGT
GATATTGGTTATGGAAGTGGAAAATACTACTCTCTAAATGTTCCACTAGATGATGGAATT
GATGATGAGAGCTATCAGTCCCTCTTTAAGCCAATTATGGGCAAAGTGATGGAAGTTTTT
AAGCCTGGTGCTGTGGTCTTACAATGTGGAGCAGATTCCTTGTCTGGTGATAGGCTAGGC
TGCTTTAATCTCTCTATTAAAGGTCATGCAGAATGTGTCAAGTACATGAGGTCTTTCAAT
GTGCCACTGTTGTTGCTTGGTGGAGGTGGCTACACAATACGTAATGTTGCTCGTTGCTGG
TGTTATGAAACAGGAGTTGCATTAGGAATAGAGCTTGAAGATAAGATGCCGCAACATGAA
TATTATGAATACTTTGGTCCAGATTATACCTTGCATGTTGCTCCAAGTAACATGGAGAAC
AAAAATTCTCGTCAGATTTTAGAAGATATAAGATCAAAGCTGCTTGAGAATCTTTCAAAG
CTTCAGCATGCCCCAAGTGTACAGTTCCAGGAGCGACCACCGGATACTGAATTGCCCGAG
GCTGATGAAGATCTAGAGGATGCAGATTCAAGATGGGATGCTGATTCTGACACGAATGGC
GAAGAACGTAAGCCCATTCCTAGCAGAGTGAGGAGGGAACATGTTGAACCTGAAGGAAAA
GGCATGGACGATATGAAAACAGAGGAGCACCTAAGAGAAGTAGAATCGACATTCGCAGAG
TCAACAAGTTTGAAGGGTGGCAATTCAGGTTCTACACTGATAGATGGAGGTCAGATTAAA
CTGGAACAAGGAAACTCTAACAAGCCTTTTGATCAACCAACTGATATTATTTCTTGA