Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400076216
CDS Infomation	pacid=37457825 polypeptide=PGSC0003DMP400051618 locus=PGSC0003DMG400029632 ID=PGSC0003DMT400076216.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGAAACTCAAAACCAATTAGCTGAAACAAAAATTCCTCAAGAATTGCTTCAATTTTCA CGTCTACCAGATGAAATCATCATTGAAATACTCTTGAGGTTACCAGTAAAATCTCTCTTG AAATTCAGGTGTGTTTCAAAATATTGGCTTTCTTTACTCTCAACTCCATATTTCATCAAT ACCCAGATCAAATTTTCTGTTAAAAAATCCAAAAATGTGAATCTTAGACTTGTTATAGTA GCTTCAGTATCTGGTTTAATGGGTAAAATGTGCTCTGTTTACTCTCTAGATTGTGAAAAT TCCTCTGTAAATGTTGATAAAATTGATTACCCATTAAAAACCCCTTTTAGATCTGCAAAA TTTTTGGGTTCTTGTAATGGGTTGATCTGTTTAACCCCAATGTCATTTAAACTTATGATA TGGAACCCTGTTACTGGAAAACACAAGGAATTTCAAGATTCATTTGTTCAATGTGCTGTA AATTGTTATATTAGATATGGGTTTGGTTATGATTATGTTCATGATGATTATAAGGTGGTT AAGATCTTTAGTTTTCCGCGAAATGAGGGGAAATATGAAAGTAAGGTTAAGATTTATAGC TTAAAGGATGATTCTTGGAAAATGGGTGAGGGGTTTGATAGTGGTTATGTTAATGCACAA TCCGGGATGTGTTTGAATGGATATCTTCATTGGGAGGTAAGCCATTGTCCCGATTCTGGT GGTGGTGGTGGTGGTTCTGGTGCTTGTTCGGAGATTATGACTTTGGATTTGGCTACGGAG ACGTATGGGGTAATGGCATTGCCTAATTGTGGAAATGGGAGTACTAGTTGGTCGTTGAGT GTTTTAAATGGATGTTTAGTTGCTTGTTGCAACTATGAGCCGGATAGGACGGATATGTGG GTGATGAAGGAGTATGGTGTGGAGGAGTCGTGGACTAAGTTGGTTTCTAATCTCACGGCT CCCCCTGGTCGTTTAGGTTATGTCTCGCCTTTGTCTGTGTCGGAGAATGGTGGTGAAGTT TTAGTGAGGCTTGGTACTAATATAAGTTTGTACAACGCGAGGAATGCTTCACATGAATCC TTGGACATTCATTCATTGGGTTATTGTCTTCAAGTACAAGCGATTACTTACTATGAGAGT CTAGCTTCGCCTAATGTTGGTGATATGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400051618
PEP Infomation	pacid=37457825 transcript=PGSC0003DMT400076216 locus=PGSC0003DMG400029632 ID=PGSC0003DMT400076216.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	METQNQLAETKIPQELLQFSRLPDEIIIEILLRLPVKSLLKFRCVSKYWLSLLSTPYFIN TQIKFSVKKSKNVNLRLVIVASVSGLMGKMCSVYSLDCENSSVNVDKIDYPLKTPFRSAK FLGSCNGLICLTPMSFKLMIWNPVTGKHKEFQDSFVQCAVNCYIRYGFGYDYVHDDYKVV KIFSFPRNEGKYESKVKIYSLKDDSWKMGEGFDSGYVNAQSGMCLNGYLHWEVSHCPDSG GGGGGSGACSEIMTLDLATETYGVMALPNCGNGSTSWSLSVLNGCLVACCNYEPDRTDMW VMKEYGVEESWTKLVSNLTAPPGRLGYVSPLSVSENGGEVLVRLGTNISLYNARNASHES LDIHSLGYCLQVQAITYYESLASPNVGDM*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400076216
Transcript Infomation	pacid=37457825 locus=PGSC0003DMG400029632 ID=PGSC0003DMT400076216.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGAAACTCAAAACCAATTAGCTGAAACAAAAATTCCTCAAGAATTGCTTCAATTTTCA CGTCTACCAGATGAAATCATCATTGAAATACTCTTGAGGTTACCAGTAAAATCTCTCTTG AAATTCAGGTGTGTTTCAAAATATTGGCTTTCTTTACTCTCAACTCCATATTTCATCAAT ACCCAGATCAAATTTTCTGTTAAAAAATCCAAAAATGTGAATCTTAGACTTGTTATAGTA GCTTCAGTATCTGGTTTAATGGGTAAAATGTGCTCTGTTTACTCTCTAGATTGTGAAAAT TCCTCTGTAAATGTTGATAAAATTGATTACCCATTAAAAACCCCTTTTAGATCTGCAAAA TTTTTGGGTTCTTGTAATGGGTTGATCTGTTTAACCCCAATGTCATTTAAACTTATGATA TGGAACCCTGTTACTGGAAAACACAAGGAATTTCAAGATTCATTTGTTCAATGTGCTGTA AATTGTTATATTAGATATGGGTTTGGTTATGATTATGTTCATGATGATTATAAGGTGGTT AAGATCTTTAGTTTTCCGCGAAATGAGGGGAAATATGAAAGTAAGGTTAAGATTTATAGC TTAAAGGATGATTCTTGGAAAATGGGTGAGGGGTTTGATAGTGGTTATGTTAATGCACAA TCCGGGATGTGTTTGAATGGATATCTTCATTGGGAGGTAAGCCATTGTCCCGATTCTGGT GGTGGTGGTGGTGGTTCTGGTGCTTGTTCGGAGATTATGACTTTGGATTTGGCTACGGAG ACGTATGGGGTAATGGCATTGCCTAATTGTGGAAATGGGAGTACTAGTTGGTCGTTGAGT GTTTTAAATGGATGTTTAGTTGCTTGTTGCAACTATGAGCCGGATAGGACGGATATGTGG GTGATGAAGGAGTATGGTGTGGAGGAGTCGTGGACTAAGTTGGTTTCTAATCTCACGGCT CCCCCTGGTCGTTTAGGTTATGTCTCGCCTTTGTCTGTGTCGGAGAATGGTGGTGAAGTT TTAGTGAGGCTTGGTACTAATATAAGTTTGTACAACGCGAGGAATGCTTCACATGAATCC TTGGACATTCATTCATTGGGTTATTGTCTTCAAGTACAAGCGATTACTTACTATGAGAGT CTAGCTTCGCCTAATGTTGGTGATATGTAA