Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400075572
CDS Infomation

pacid=37446583 polypeptide=PGSC0003DMP400051182 locus=PGSC0003DMG400029390 ID=PGSC0003DMT400075572.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATTCACGTCGCCGGAGTTTTCATCCTCGTCGGAGTCGCCGTCCTTGCCGCCGTCGAA
GGACGTAATGTTTTGAAACTTCCGTCGGAAGCCTCCAGATTCTTCGATGTCGCAGATGAC
TCTGTTGGAACCAGATGGGCCGTCCTTCTTGCCGGATCAAATGGTTATTGGAATTATAGA
CATCAGGCTGATGTATGCCATGCATATCAGCTATTGAGAAAAGGTGGTCTCAAAGATGAA
AATATTATTGTCTTCATGTATGATGACATTGCTCACCATGAAGAGAACCCAAGACCAGGA
GTTATCATTAATAGTCCTGCTGGTGAGGATGTTTACGAAGGAGTTCCTAAGGATTACACG
GGAGATGATGTTAATGTGCACAACTTTTTAACTGTTCTCCTTGGTAACAAAACTGCACTT
ACTGGAGGTAGCGGAAAGGTGGTGAATAGTGGTCCAAATGATCATATTTTCATATTCTAT
AGTGATCATGGTGGCCCTGGGGTGCTTGGGATGCCTACCAATCCTTATCTATATGCAAAT
GATCTGATTGCTGTGTTGAAAAAGAAGCATGCCGCTGGGACATATAAAAGCTTGGTATTG
TACATTGAAGCTTGTGAGTCTGGAAGTATATTTGAAGGACTTCTTCCTAAGGGTCTAAAT
ATTTATGCCACAACAGCTTCAAATGCTGAAGAGAGCAGCTGGGGAACCTATTGTCCCGGA
GAATATCCTAGTCCTCCCCCTGAATATGAGACCTGTCTGGGTGATTTGTATGCTGTTTCC
TGGATGGAGGACAGTGAAATGCACAATTTGCGGACTGAAAATTTGAGGCAGCAGTATCAC
CTGGTCAAAAAGAGAACTGCTAATGGAAATACTGCCTATGGTTCCCATGTCATGCAATTT
GGTGATCTACAACTGAGTATGGAGTCTCTATTCAGGTTTATGGGTACAAATCCTGCAAAT
GATAACTACACTTATGTAGATGACAACTCCTTGTGGGCATCATCAAAGGCTGTCAACCAG
CGTGATGCAGATCTTTTACATTTCTGGGACAAGTTCCGCAAGGCTCCTGAAGGCTCTGCT
CGGAAAGTTGAAGCTCAGAAACAATTCACTGAAGCTATGTCACACAGAATGCACCTAGAT
GAGCGCATTGCCCTTGTTGGTAAGCTTCTGTTTGGAATTCAAAAAGGTCCTGAGGTGCTG
AAGCATGTTCGATCTGCTGGTCAGCCTCTTGTTGATGATTGGGCCTGCCTTAAATCTTTT
GTAAGAACATTTGAGTCACACTGTGGATCGTTATCCCAATATGGAATGAAACACATGCGT
TCCATTGCCAATATCTGTAATGCTGGAGTTCAGATGGAGCAGATGGTGGAGGCATCAGTA
CAAGCTTGTCCTAGCATCCCCTCCAATACTTGGAGTTCCCTCCACAGGGGCTTTAGTGCG
TAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400051182
PEP Infomation

pacid=37446583 transcript=PGSC0003DMT400075572 locus=PGSC0003DMG400029390 ID=PGSC0003DMT400075572.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MIHVAGVFILVGVAVLAAVEGRNVLKLPSEASRFFDVADDSVGTRWAVLLAGSNGYWNYR
HQADVCHAYQLLRKGGLKDENIIVFMYDDIAHHEENPRPGVIINSPAGEDVYEGVPKDYT
GDDVNVHNFLTVLLGNKTALTGGSGKVVNSGPNDHIFIFYSDHGGPGVLGMPTNPYLYAN
DLIAVLKKKHAAGTYKSLVLYIEACESGSIFEGLLPKGLNIYATTASNAEESSWGTYCPG
EYPSPPPEYETCLGDLYAVSWMEDSEMHNLRTENLRQQYHLVKKRTANGNTAYGSHVMQF
GDLQLSMESLFRFMGTNPANDNYTYVDDNSLWASSKAVNQRDADLLHFWDKFRKAPEGSA
RKVEAQKQFTEAMSHRMHLDERIALVGKLLFGIQKGPEVLKHVRSAGQPLVDDWACLKSF
VRTFESHCGSLSQYGMKHMRSIANICNAGVQMEQMVEASVQACPSIPSNTWSSLHRGFSA
*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400075572
Transcript Infomation

pacid=37446583 locus=PGSC0003DMG400029390 ID=PGSC0003DMT400075572.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATTCACGTCGCCGGAGTTTTCATCCTCGTCGGAGTCGCCGTCCTTGCCGCCGTCGAA
GGACGTAATGTTTTGAAACTTCCGTCGGAAGCCTCCAGATTCTTCGATGTCGCAGATGAC
TCTGTTGGAACCAGATGGGCCGTCCTTCTTGCCGGATCAAATGGTTATTGGAATTATAGA
CATCAGGCTGATGTATGCCATGCATATCAGCTATTGAGAAAAGGTGGTCTCAAAGATGAA
AATATTATTGTCTTCATGTATGATGACATTGCTCACCATGAAGAGAACCCAAGACCAGGA
GTTATCATTAATAGTCCTGCTGGTGAGGATGTTTACGAAGGAGTTCCTAAGGATTACACG
GGAGATGATGTTAATGTGCACAACTTTTTAACTGTTCTCCTTGGTAACAAAACTGCACTT
ACTGGAGGTAGCGGAAAGGTGGTGAATAGTGGTCCAAATGATCATATTTTCATATTCTAT
AGTGATCATGGTGGCCCTGGGGTGCTTGGGATGCCTACCAATCCTTATCTATATGCAAAT
GATCTGATTGCTGTGTTGAAAAAGAAGCATGCCGCTGGGACATATAAAAGCTTGGTATTG
TACATTGAAGCTTGTGAGTCTGGAAGTATATTTGAAGGACTTCTTCCTAAGGGTCTAAAT
ATTTATGCCACAACAGCTTCAAATGCTGAAGAGAGCAGCTGGGGAACCTATTGTCCCGGA
GAATATCCTAGTCCTCCCCCTGAATATGAGACCTGTCTGGGTGATTTGTATGCTGTTTCC
TGGATGGAGGACAGTGAAATGCACAATTTGCGGACTGAAAATTTGAGGCAGCAGTATCAC
CTGGTCAAAAAGAGAACTGCTAATGGAAATACTGCCTATGGTTCCCATGTCATGCAATTT
GGTGATCTACAACTGAGTATGGAGTCTCTATTCAGGTTTATGGGTACAAATCCTGCAAAT
GATAACTACACTTATGTAGATGACAACTCCTTGTGGGCATCATCAAAGGCTGTCAACCAG
CGTGATGCAGATCTTTTACATTTCTGGGACAAGTTCCGCAAGGCTCCTGAAGGCTCTGCT
CGGAAAGTTGAAGCTCAGAAACAATTCACTGAAGCTATGTCACACAGAATGCACCTAGAT
GAGCGCATTGCCCTTGTTGGTAAGCTTCTGTTTGGAATTCAAAAAGGTCCTGAGGTGCTG
AAGCATGTTCGATCTGCTGGTCAGCCTCTTGTTGATGATTGGGCCTGCCTTAAATCTTTT
GTAAGAACATTTGAGTCACACTGTGGATCGTTATCCCAATATGGAATGAAACACATGCGT
TCCATTGCCAATATCTGTAATGCTGGAGTTCAGATGGAGCAGATGGTGGAGGCATCAGTA
CAAGCTTGTCCTAGCATCCCCTCCAATACTTGGAGTTCCCTCCACAGGGGCTTTAGTGCG
TAA