Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400075517
CDS Infomation

pacid=37448612 polypeptide=PGSC0003DMP400051143 locus=PGSC0003DMG400029364 ID=PGSC0003DMT400075517.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCAAGCAACTATTACCTCTGTTCTTCAAGTTATTCCTACTCCACAATCTCCATTGTCA
CACCAAACTAGCAACAATACCTTAAGGGGCTTAGAATCATGTTCATCAATGTCGCAACTC
AAACAATTCCATGCCCAAATTGTCAAGCATGGTCTCTCCTATGACAATGACGCAATGGGT
CGAGTTATTAAGTTCTGTGCAATATCCGAATCGGGCGATTTGAATTATGCCCTCCAAGTG
TTTGATAGATTGCCTGAACCAGATCCTTTTATATATAATACTGTTATTAGGGGTTTATTG
AAATCTCAAATGCTGAGAGATTCTTTGCTTTTTTACTTGTGTATGTTGGAACGTTCGGTT
TGGCCTAATAGTTTCACTTTTCCTCCTCTTATTAGAGTTTGTTGTATAGACAATGCTGTG
GAAGAAGGTAAACAGATTCATGGTCATGTGGTGAAGTTTGGGTTCGGGTTTGATCGATTT
TCGCAGAATAATTTGATTCATATGTATGTGAATTTTCGTTGTTTAGAGGAAGCGAAGAGG
GTGTTTGATAATATGTGTGAGAGAGATGATGTTTCTTGGACTACATTGATTAGTGGTTAT
GCTCAATTGGGGTATCTTGATGAAGCTTTTCAAGTGTTTGATTCGATTACGGAGAAAAGT
TCTGTTATTTGGAATGCTATGATATCAGCTTATGTGCAGAGTAATCGGTTTCATGAGGCG
TTTGCTTTGTTCGAAAGGATGGGGTCTGAGGGTGTTGTGGTTGATAAGTTTCTTGCTGCT
AGTATGTTGTCAGCTTGTACGCGACTTGGAGCGTTGAAGCAAGGTGAGTGGATAGTTGAA
CATGTCAAGAAGAGTGGGATTGAGTTAGACTCGAAATTGGGTGCTACGATTATTGATATG
TATTGCAAATGTGGCTGCTTAGATAAGGCTGTTGAGTTCTTTAAAGAGTTGCCACGAAAA
GGAATATCGTCGTGGAATTGTATGATTGGAGGGTTGGCGATGCATGGGAAAGGTGAGGCT
GCCATTGAGGTTTTGAAGGAAATGGAGAGTGAGAGGGTAGCTCCAGACTACATTACGTTC
GTGAATCTACTTAGTGCTTGTGCTCATTCAGGGTTGGTTGAAGAAGGAAAACACTATTTT
CGTTACATGAAGGAAACGTATGGCATTGAACCTGGCATGGAGCATTATGGATGTTTGGTT
GATTTGCTCGGAAGAGCTGGATTACTGGTGGAAGCAAGAAGGGTCATAAATGAGATGCCT
ATGAGTCCTGATGTAGGTGTATTGGGTGCTCTTCTTGGCGCATGTAGGATTCACAAGAAC
ATAGAGCTCGGAGAAAAGATAGGGAAGCAAGTGATCGAATTAGAACCTCAGAACAGTGGT
CGATACGTGTTGCTAGCTAACTTATATGCCTATGCAGGTAGATGGGAAGATGTTGCCAGT
ATAAGAAAGTTGATGAATGACAGGGGAGTGAAAAAGGTCCCTGGCTTCTCCATTGTTGAA
TTAGAAGGCGTTGTTAACGAGTTCATTGCAGGAGGAAGAACTCATCCTCAAGCCAAGGAG
ATATATGCAAAAGTAAACGAAATGCTGGACCGTATAAAATCTGCAGGCTATTTTCCAGAT
TCTGATGGAATGCAACATGATATTGATGAGGAAGAAACAGAGAATCCTTTGAACTATCAT
AGTGAGAAACTAGCTATTGCTTTCGGGTTATTGAAGAGCAAACCTGGGGAAATTCTTCGA
ATCACAAAGAATTTACGCGTTTGCAAGGACTGTCATCAAGCAAGTAAGTTCATCTCAAAG
GTTTATGATCGCGAAATCATCGTTAGAGATAGGAATAGGTTTCATCATTTTAAAGGTGGA
GAATGTTCTTGTAAAGACTACTGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400051143
PEP Infomation

pacid=37448612 transcript=PGSC0003DMT400075517 locus=PGSC0003DMG400029364 ID=PGSC0003DMT400075517.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MQATITSVLQVIPTPQSPLSHQTSNNTLRGLESCSSMSQLKQFHAQIVKHGLSYDNDAMG
RVIKFCAISESGDLNYALQVFDRLPEPDPFIYNTVIRGLLKSQMLRDSLLFYLCMLERSV
WPNSFTFPPLIRVCCIDNAVEEGKQIHGHVVKFGFGFDRFSQNNLIHMYVNFRCLEEAKR
VFDNMCERDDVSWTTLISGYAQLGYLDEAFQVFDSITEKSSVIWNAMISAYVQSNRFHEA
FALFERMGSEGVVVDKFLAASMLSACTRLGALKQGEWIVEHVKKSGIELDSKLGATIIDM
YCKCGCLDKAVEFFKELPRKGISSWNCMIGGLAMHGKGEAAIEVLKEMESERVAPDYITF
VNLLSACAHSGLVEEGKHYFRYMKETYGIEPGMEHYGCLVDLLGRAGLLVEARRVINEMP
MSPDVGVLGALLGACRIHKNIELGEKIGKQVIELEPQNSGRYVLLANLYAYAGRWEDVAS
IRKLMNDRGVKKVPGFSIVELEGVVNEFIAGGRTHPQAKEIYAKVNEMLDRIKSAGYFPD
SDGMQHDIDEEETENPLNYHSEKLAIAFGLLKSKPGEILRITKNLRVCKDCHQASKFISK
VYDREIIVRDRNRFHHFKGGECSCKDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400075517
Transcript Infomation

pacid=37448612 locus=PGSC0003DMG400029364 ID=PGSC0003DMT400075517.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCAAGCAACTATTACCTCTGTTCTTCAAGTTATTCCTACTCCACAATCTCCATTGTCA
CACCAAACTAGCAACAATACCTTAAGGGGCTTAGAATCATGTTCATCAATGTCGCAACTC
AAACAATTCCATGCCCAAATTGTCAAGCATGGTCTCTCCTATGACAATGACGCAATGGGT
CGAGTTATTAAGTTCTGTGCAATATCCGAATCGGGCGATTTGAATTATGCCCTCCAAGTG
TTTGATAGATTGCCTGAACCAGATCCTTTTATATATAATACTGTTATTAGGGGTTTATTG
AAATCTCAAATGCTGAGAGATTCTTTGCTTTTTTACTTGTGTATGTTGGAACGTTCGGTT
TGGCCTAATAGTTTCACTTTTCCTCCTCTTATTAGAGTTTGTTGTATAGACAATGCTGTG
GAAGAAGGTAAACAGATTCATGGTCATGTGGTGAAGTTTGGGTTCGGGTTTGATCGATTT
TCGCAGAATAATTTGATTCATATGTATGTGAATTTTCGTTGTTTAGAGGAAGCGAAGAGG
GTGTTTGATAATATGTGTGAGAGAGATGATGTTTCTTGGACTACATTGATTAGTGGTTAT
GCTCAATTGGGGTATCTTGATGAAGCTTTTCAAGTGTTTGATTCGATTACGGAGAAAAGT
TCTGTTATTTGGAATGCTATGATATCAGCTTATGTGCAGAGTAATCGGTTTCATGAGGCG
TTTGCTTTGTTCGAAAGGATGGGGTCTGAGGGTGTTGTGGTTGATAAGTTTCTTGCTGCT
AGTATGTTGTCAGCTTGTACGCGACTTGGAGCGTTGAAGCAAGGTGAGTGGATAGTTGAA
CATGTCAAGAAGAGTGGGATTGAGTTAGACTCGAAATTGGGTGCTACGATTATTGATATG
TATTGCAAATGTGGCTGCTTAGATAAGGCTGTTGAGTTCTTTAAAGAGTTGCCACGAAAA
GGAATATCGTCGTGGAATTGTATGATTGGAGGGTTGGCGATGCATGGGAAAGGTGAGGCT
GCCATTGAGGTTTTGAAGGAAATGGAGAGTGAGAGGGTAGCTCCAGACTACATTACGTTC
GTGAATCTACTTAGTGCTTGTGCTCATTCAGGGTTGGTTGAAGAAGGAAAACACTATTTT
CGTTACATGAAGGAAACGTATGGCATTGAACCTGGCATGGAGCATTATGGATGTTTGGTT
GATTTGCTCGGAAGAGCTGGATTACTGGTGGAAGCAAGAAGGGTCATAAATGAGATGCCT
ATGAGTCCTGATGTAGGTGTATTGGGTGCTCTTCTTGGCGCATGTAGGATTCACAAGAAC
ATAGAGCTCGGAGAAAAGATAGGGAAGCAAGTGATCGAATTAGAACCTCAGAACAGTGGT
CGATACGTGTTGCTAGCTAACTTATATGCCTATGCAGGTAGATGGGAAGATGTTGCCAGT
ATAAGAAAGTTGATGAATGACAGGGGAGTGAAAAAGGTCCCTGGCTTCTCCATTGTTGAA
TTAGAAGGCGTTGTTAACGAGTTCATTGCAGGAGGAAGAACTCATCCTCAAGCCAAGGAG
ATATATGCAAAAGTAAACGAAATGCTGGACCGTATAAAATCTGCAGGCTATTTTCCAGAT
TCTGATGGAATGCAACATGATATTGATGAGGAAGAAACAGAGAATCCTTTGAACTATCAT
AGTGAGAAACTAGCTATTGCTTTCGGGTTATTGAAGAGCAAACCTGGGGAAATTCTTCGA
ATCACAAAGAATTTACGCGTTTGCAAGGACTGTCATCAAGCAAGTAAGTTCATCTCAAAG
GTTTATGATCGCGAAATCATCGTTAGAGATAGGAATAGGTTTCATCATTTTAAAGGTGGA
GAATGTTCTTGTAAAGACTACTGGTAA