Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400075342
CDS Infomation

pacid=37446880 polypeptide=PGSC0003DMP400051019 locus=PGSC0003DMG400029301 ID=PGSC0003DMT400075342.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGGAAGAAGCACAGTACGGAGCACCAGAAGCCGGTAACAACAAGAGGAAGTACGAT
GATCAAACGACACCGTCTCCTGGTCCACGTAGACCTACTGGATTTTCTGCTCCGATCGCT
TCCTTATCTCCTTCTGATGGTGCTGCTCCTCCTTCTTCTTACAACAATGTTCCGCCGCCC
ATGGATGATTTCCAGTTGGCTAAGCAGAAGGCTCAGGAGATCGCTGCTAGGTTGTTGAAT
AGTGCTGAAGCTAAGAAACCTAGAGTTGATAATAACGGCGGTGGTGCTGGTGCTGGTGGA
TATGATTCCTATGAACACAAGCCCATTGTTACTCCTTCAGTTACAAGTTCATATGGTTAT
CCGGGGCAAAGCAAGAAGATTGAAATACCAAATGGCAGAGTTGGTGTGATTATAGGAAAA
GGTGGGGAGACCATCAAGTATCTTCAACTCCAATCTGGAGCCAAAATTCAGGTTACTAGA
GACATGGATGCTGATCCTAATTCTACAAATAGAGCAGTTGAACTCATGGGTACTCCAGAC
CAAATAGCTAAGGCTGAACAGTTGATTACTGAGGTTCTTTCTGAGGCTGATTCAGGTGGT
TCTGGTCTAGTTTCCCGAAGATTACCTGGACAGCAATCTGGAGGAGAACAGTTTTCCTTG
AAAGTCCCCAACAACAAGGTTGGTCTTGTTATTGGAAAAGGAGGTGAGACTATAAAAAGT
ATGCAGGCAAGAACTGGAGCACGTATTCAGGTGATCCCTTTGCACTTGCCTCCAGGTGAT
ACATCACAGGAAAGAACAGTTCAAATTGATGGGTCAAGTGAACAGATTGAGGCTGCTAAG
CAGCTGGTGTATGAAGTAATTAGTGAGAATCGTGCTAGGAATCAAGGGATGTCCGGAGGA
TATCAACAACAAGGTTATCAGGCCCGGCCTCCTACAAGCTGGGCCCCTCCTGGTGCACCT
ATGCAACAATCTGGTTATGGCTATGGTCAGCCTGGTGCATACCCATCTCAACCATCTTAT
CCTGGCTACCCTCCTCAACCTGCCTCTGCTGGATATGCCTCTGGCTGGGATCAGAGTGCT
GCTCAAAATCAACAATCTCAGGCAGGTGGGTATGATTACTACAACCAACAGGCTCCACAA
CAACAGCAGCAAACTGCTGGAGGTTCAGCTGCTTCAACTGATACTAGTGCCTATGGTTAC
AACCAGCAATCTGCCTCTGGTTACAGCCAAGGACAAGCTTATGCCCAGGATGGCTATGGT
GGATATCATGCACCTGCCCCTCAATCTGGTGGTTATCAGGGTTCTGGTTATGAGCAGCAA
CAAGGTTATAGCTCTACTGCTGGCTATGGGAATGCCTCAAACCCAACATCAGATGGCCAG
AACTCGTCATATGGTACCCAAAGTGATGGCAGTCAAGCACCTCCACCAGCATCAGCCACG
GGTCAACAAGGATATCATTCTGGCCAGCAGCCCAGCCCTAATCCTAGTTACCCATCTCAA
GGCTCTGCTCAGGCTGGATATGGGGTGCCCCCAACTTCTCAAGGTGGGTATGGTACACAG
CCAGCTGGAGGCTATGCTGCTAGTTATGGGGCCCCTCAGGCTCAAAAGCCTCCTAGTCAG
GCAAGTTATGGTCAACCACAGCAGTCTCCTAGTGCACAAGCTGGTTATGCTCAGCCTCCC
ACTGCGCAACCCGGGTATCCTCAACCAGCTGCTCAATCAGGTTATACCCAGGCTGATCCC
AACGCTCAGCGACCTCCCTCTTCTGCCTATGGTGCTCCACCAGCTCAGCCAGGTTATGGT
GCCCAGTCTTATGGCGCTCCGCCAAGTTATGGCCAGCAGCCACCACCTTACAACAGTGCC
TATGGTGCTTACTCCCAGCCTCCAGCATATGCTTCTGAAGCAGCTCCAACCTCGCAGTCT
GTTCCACCTAGTGGTGGGGTTGCAAAAGCATCACCTCAGAGTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400051019
PEP Infomation

pacid=37446880 transcript=PGSC0003DMT400075342 locus=PGSC0003DMG400029301 ID=PGSC0003DMT400075342.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAEEAQYGAPEAGNNKRKYDDQTTPSPGPRRPTGFSAPIASLSPSDGAAPPSSYNNVPPP
MDDFQLAKQKAQEIAARLLNSAEAKKPRVDNNGGGAGAGGYDSYEHKPIVTPSVTSSYGY
PGQSKKIEIPNGRVGVIIGKGGETIKYLQLQSGAKIQVTRDMDADPNSTNRAVELMGTPD
QIAKAEQLITEVLSEADSGGSGLVSRRLPGQQSGGEQFSLKVPNNKVGLVIGKGGETIKS
MQARTGARIQVIPLHLPPGDTSQERTVQIDGSSEQIEAAKQLVYEVISENRARNQGMSGG
YQQQGYQARPPTSWAPPGAPMQQSGYGYGQPGAYPSQPSYPGYPPQPASAGYASGWDQSA
AQNQQSQAGGYDYYNQQAPQQQQQTAGGSAASTDTSAYGYNQQSASGYSQGQAYAQDGYG
GYHAPAPQSGGYQGSGYEQQQGYSSTAGYGNASNPTSDGQNSSYGTQSDGSQAPPPASAT
GQQGYHSGQQPSPNPSYPSQGSAQAGYGVPPTSQGGYGTQPAGGYAASYGAPQAQKPPSQ
ASYGQPQQSPSAQAGYAQPPTAQPGYPQPAAQSGYTQADPNAQRPPSSAYGAPPAQPGYG
AQSYGAPPSYGQQPPPYNSAYGAYSQPPAYASEAAPTSQSVPPSGGVAKASPQS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400075342
Transcript Infomation

pacid=37446880 locus=PGSC0003DMG400029301 ID=PGSC0003DMT400075342.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGGAAGAAGCACAGTACGGAGCACCAGAAGCCGGTAACAACAAGAGGAAGTACGAT
GATCAAACGACACCGTCTCCTGGTCCACGTAGACCTACTGGATTTTCTGCTCCGATCGCT
TCCTTATCTCCTTCTGATGGTGCTGCTCCTCCTTCTTCTTACAACAATGTTCCGCCGCCC
ATGGATGATTTCCAGTTGGCTAAGCAGAAGGCTCAGGAGATCGCTGCTAGGTTGTTGAAT
AGTGCTGAAGCTAAGAAACCTAGAGTTGATAATAACGGCGGTGGTGCTGGTGCTGGTGGA
TATGATTCCTATGAACACAAGCCCATTGTTACTCCTTCAGTTACAAGTTCATATGGTTAT
CCGGGGCAAAGCAAGAAGATTGAAATACCAAATGGCAGAGTTGGTGTGATTATAGGAAAA
GGTGGGGAGACCATCAAGTATCTTCAACTCCAATCTGGAGCCAAAATTCAGGTTACTAGA
GACATGGATGCTGATCCTAATTCTACAAATAGAGCAGTTGAACTCATGGGTACTCCAGAC
CAAATAGCTAAGGCTGAACAGTTGATTACTGAGGTTCTTTCTGAGGCTGATTCAGGTGGT
TCTGGTCTAGTTTCCCGAAGATTACCTGGACAGCAATCTGGAGGAGAACAGTTTTCCTTG
AAAGTCCCCAACAACAAGGTTGGTCTTGTTATTGGAAAAGGAGGTGAGACTATAAAAAGT
ATGCAGGCAAGAACTGGAGCACGTATTCAGGTGATCCCTTTGCACTTGCCTCCAGGTGAT
ACATCACAGGAAAGAACAGTTCAAATTGATGGGTCAAGTGAACAGATTGAGGCTGCTAAG
CAGCTGGTGTATGAAGTAATTAGTGAGAATCGTGCTAGGAATCAAGGGATGTCCGGAGGA
TATCAACAACAAGGTTATCAGGCCCGGCCTCCTACAAGCTGGGCCCCTCCTGGTGCACCT
ATGCAACAATCTGGTTATGGCTATGGTCAGCCTGGTGCATACCCATCTCAACCATCTTAT
CCTGGCTACCCTCCTCAACCTGCCTCTGCTGGATATGCCTCTGGCTGGGATCAGAGTGCT
GCTCAAAATCAACAATCTCAGGCAGGTGGGTATGATTACTACAACCAACAGGCTCCACAA
CAACAGCAGCAAACTGCTGGAGGTTCAGCTGCTTCAACTGATACTAGTGCCTATGGTTAC
AACCAGCAATCTGCCTCTGGTTACAGCCAAGGACAAGCTTATGCCCAGGATGGCTATGGT
GGATATCATGCACCTGCCCCTCAATCTGGTGGTTATCAGGGTTCTGGTTATGAGCAGCAA
CAAGGTTATAGCTCTACTGCTGGCTATGGGAATGCCTCAAACCCAACATCAGATGGCCAG
AACTCGTCATATGGTACCCAAAGTGATGGCAGTCAAGCACCTCCACCAGCATCAGCCACG
GGTCAACAAGGATATCATTCTGGCCAGCAGCCCAGCCCTAATCCTAGTTACCCATCTCAA
GGCTCTGCTCAGGCTGGATATGGGGTGCCCCCAACTTCTCAAGGTGGGTATGGTACACAG
CCAGCTGGAGGCTATGCTGCTAGTTATGGGGCCCCTCAGGCTCAAAAGCCTCCTAGTCAG
GCAAGTTATGGTCAACCACAGCAGTCTCCTAGTGCACAAGCTGGTTATGCTCAGCCTCCC
ACTGCGCAACCCGGGTATCCTCAACCAGCTGCTCAATCAGGTTATACCCAGGCTGATCCC
AACGCTCAGCGACCTCCCTCTTCTGCCTATGGTGCTCCACCAGCTCAGCCAGGTTATGGT
GCCCAGTCTTATGGCGCTCCGCCAAGTTATGGCCAGCAGCCACCACCTTACAACAGTGCC
TATGGTGCTTACTCCCAGCCTCCAGCATATGCTTCTGAAGCAGCTCCAACCTCGCAGTCT
GTTCCACCTAGTGGTGGGGTTGCAAAAGCATCACCTCAGAGTTAG