Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400074489
CDS Infomation

pacid=37433303 polypeptide=PGSC0003DMP400050451 locus=PGSC0003DMG400028951 ID=PGSC0003DMT400074489.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTATAGTAATACAGCTCGCAAGTACTCTTCTTCTGCTGCTTCTTCATTATTGAGAGCA
TCTTCTTCTGTTACAAGGCCGCTTGCTTCAACTTCTAGTGCTGCTCACGCGCCTTGTCGT
GCTGGTGCTGGGGTTAATTCTGGTAATCAGCAGCGTTATTCATCAACGCTCCGGTCTCTA
CGTTGCTCTGTACCGAGGTGGAGTCACGGTGTTGATTGGAAGTCTCCGATCAGTCTTACT
GCTCAGATCAGGACTGCTGCCCCTGCTCTCAACGGGTTTCATCGGAAACTAGCTACCATG
GCTGCAGAGAACCCATTTAAGGGAATCCTCACTGGTCTTCCAAAGCCTGGAGGTGGTGAA
TTCGGAAAGTTCTATAGCTTACCTGCTCTCAATGATCCCAGGATTGACAAGCTACCATAT
TCTATTAGGATTCTTCTCGAATCAGCAATCCGTAATTGTGACAACTTTCAAGTGAAAAAG
GAAGATGTTGAAAAGATTATTGACTGGGAAAAATCTGCACCTAAGCTTGTGGAGATACCC
TTCAAGCCTGCCCGTGTCTTGCTGCAGGATTTTACTGGTGTACCAGCTGTGGTGGACCTT
GCTTGCATGCGTGATGCCATGAACAACCTTGGCAGTGATTCTGACAAGATTAATCCATTG
GTTCCTGTCGACCTAGTTATTGATCACTCAGTTCAAGTTGATGTAACAAGGTCAGAAAAT
GCAGTCCAGGCTAATATGGAGCTTGAATTCCAAAGGAACAAGGAGAGATTTGCCTTTCTT
AAGTGGGGATCCAATGCTTTCCAAAACATGCTTGTTGTACCACCTGGGTCTGGTATTGTG
CATCAGGTGAATCTTGAATATCTTGGAAGGGTTGTCTTTAATAGGGAAGGCTTGCTTTAC
CCAGATAGCGTGGTCGGAACAGATTCCCACACCACCATGATTGATGGGCTAGGAGTTGCT
GGATGGGGTGTCGGAGGTATTGAGGCAGAAGCTGCAATGCTTGGCCAGCCAATGAGCATG
GTGTTGCCTGGAGTTGTTGGGTTCAAGCTATCAGGGAATTTGCGAAATGGTGTAACTGCC
ACCGACTTGGTTCTGACTGTCACTCAAATGCTGAGGAAGCATGGTGTTGTTGGAAAGTTT
GTTGAATTCTATGGTGGTGGAATGAGTGGTCTTTCATTGGCTGACAGGGCCACCATTGCA
AACATGGCTCCTGAATATGGTGCAACAATGGGTTTCTTCCCTGTAGATCATGTTACTCTG
GAATACCTCAAGTTAACGGGGAGAAGTGATGAGATAGTTGGAATGGTAGAGGCATATCTC
CGTGCAAATAATATGTTTGTCGATTATAATGAGCCTCAACAAGAAAAAGTGTACTCTTCT
TATTTGAACCTAGACCTTGCCGATGTTGAACCATGTCTGTCAGGGCCAAAGAGACCTCAT
GACCGTGTGCCTTTGAAAGAAATGAAGTCTGACTGGCATGCTTGCCTAGATAACAAAGTT
GGATTCAAGGGATTTGCTGTGCCAAAAGAGGTGCAAGATAAAGTGGCCAAGTTTTCCTTC
CATGGGCAACCTGCAGAGCTCAAACATGGCAGTGTTGTGATTGCTGCTATCACAAGTTGC
ACAAATACATCCAATCCCAGTGTTATGCTAGGAGCAGCTCTGGTTGCCAAAAAGGCATCT
GAGCTGGGTCTACATGTTAAGCCATGGGTTAAAACAAGCCTTGCCCCAGGCTCTGGTGTT
GTTACAAAATATTTACTCAAGAGTGGTCTACAGAAGTATTTAAATCAACAAGGTTTCAAC
ATTGTTGGCTATGGCTGCACCACTTGTATCGGGAACTCAGGGGACTTGGATGAATCTGTT
GCTTCTGCCATATCAGAGAACGACATTGTTGCTGCTGCTGTACTCTCCGGAAATCGGAAC
TTTGAAGGGCGTGTTCATGCCTTGACAAGAGCAAACTATCTTGCTTCACCTCCCTTGGTG
GTTGCCTATGCTCTTGCTGGCACTGTTGATATAGACTTTGAGAAAGATCCAATTGGAGTG
GGAAAGGATGGTAAGGATGTGTACTTCAGGGATATATGGCCATCAACTGAAGAAATTGCT
GAGGTTGTTCAATCAAGTGTATTGCCAGACATGTTCAAGAGTACATATGAAGCTATTACA
AAGGGAAATACCATGTGGAATGAATTATCTGTGCCAACAACAAAGTTGTACCAATGGGAT
CCTAAATCTACATACATCCATGAGCCACCATATTTCAAGGGTATGACCATGGATCCTCCT
GGACCTCATGGAGTGAAGGATGCTTACTGCTTGCTGAACTTTGGCGACAGTATTACTACT
GATCACATTTCACCTGCCGGAAGCATTCATAAAGATAGCCCTGCTGCTAGGTACCTTATG
GAGCGGGGTGTCGATCGCAGGGACTTCAACTCATATGGTAGCCGTCGTGGTAATGATGAG
ATTATGGCTAGGGGTACTTTCGCCAATATCCGCCTTGTAAACAAGCTGTTAAATGGGGAG
GTTGGTCCAAAGACAGTCCACGTTCCTTCTGGAGAAAAGCTATCTGTGTTTGATGCTGCT
ATGAAATACAAATCCGCTGGACAAAGCACTATTATCTTGGCTGGAGCTGAATATGGAAGT
GGAAGCTCCCGAGATTGGGCTGCCAAGGGACCAATGTTGTTGGGAGTTAAAGCTGTAATT
GCGAAGAGCTTCGAGAGGATTCATCGTAGTAACTTGGTAGGAATGGGTATTGTGCCTCTA
TGCTTCAAGGCTGGGGAGGATGCAGATACACTTGGATTGACAGGTCAAGAGCGATATACC
ATTGATCTTCCTGAAAATATTAGTGAGATCCGCCCTGGGCAAGACGTTACTGTACAAACA
GATACTGGAAAATCCTTCACCTGCATAGTGCGTTTCGACACTGAGGTGGAGTTGGCTTAT
TTCAACCATGGAGGTATTCTTCAATATGTCATTCGTCAGTTGACACAGCGATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400050451
PEP Infomation

pacid=37433303 transcript=PGSC0003DMT400074489 locus=PGSC0003DMG400028951 ID=PGSC0003DMT400074489.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MYSNTARKYSSSAASSLLRASSSVTRPLASTSSAAHAPCRAGAGVNSGNQQRYSSTLRSL
RCSVPRWSHGVDWKSPISLTAQIRTAAPALNGFHRKLATMAAENPFKGILTGLPKPGGGE
FGKFYSLPALNDPRIDKLPYSIRILLESAIRNCDNFQVKKEDVEKIIDWEKSAPKLVEIP
FKPARVLLQDFTGVPAVVDLACMRDAMNNLGSDSDKINPLVPVDLVIDHSVQVDVTRSEN
AVQANMELEFQRNKERFAFLKWGSNAFQNMLVVPPGSGIVHQVNLEYLGRVVFNREGLLY
PDSVVGTDSHTTMIDGLGVAGWGVGGIEAEAAMLGQPMSMVLPGVVGFKLSGNLRNGVTA
TDLVLTVTQMLRKHGVVGKFVEFYGGGMSGLSLADRATIANMAPEYGATMGFFPVDHVTL
EYLKLTGRSDEIVGMVEAYLRANNMFVDYNEPQQEKVYSSYLNLDLADVEPCLSGPKRPH
DRVPLKEMKSDWHACLDNKVGFKGFAVPKEVQDKVAKFSFHGQPAELKHGSVVIAAITSC
TNTSNPSVMLGAALVAKKASELGLHVKPWVKTSLAPGSGVVTKYLLKSGLQKYLNQQGFN
IVGYGCTTCIGNSGDLDESVASAISENDIVAAAVLSGNRNFEGRVHALTRANYLASPPLV
VAYALAGTVDIDFEKDPIGVGKDGKDVYFRDIWPSTEEIAEVVQSSVLPDMFKSTYEAIT
KGNTMWNELSVPTTKLYQWDPKSTYIHEPPYFKGMTMDPPGPHGVKDAYCLLNFGDSITT
DHISPAGSIHKDSPAARYLMERGVDRRDFNSYGSRRGNDEIMARGTFANIRLVNKLLNGE
VGPKTVHVPSGEKLSVFDAAMKYKSAGQSTIILAGAEYGSGSSRDWAAKGPMLLGVKAVI
AKSFERIHRSNLVGMGIVPLCFKAGEDADTLGLTGQERYTIDLPENISEIRPGQDVTVQT
DTGKSFTCIVRFDTEVELAYFNHGGILQYVIRQLTQR*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400074489
Transcript Infomation

pacid=37433303 locus=PGSC0003DMG400028951 ID=PGSC0003DMT400074489.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTATAGTAATACAGCTCGCAAGTACTCTTCTTCTGCTGCTTCTTCATTATTGAGAGCA
TCTTCTTCTGTTACAAGGCCGCTTGCTTCAACTTCTAGTGCTGCTCACGCGCCTTGTCGT
GCTGGTGCTGGGGTTAATTCTGGTAATCAGCAGCGTTATTCATCAACGCTCCGGTCTCTA
CGTTGCTCTGTACCGAGGTGGAGTCACGGTGTTGATTGGAAGTCTCCGATCAGTCTTACT
GCTCAGATCAGGACTGCTGCCCCTGCTCTCAACGGGTTTCATCGGAAACTAGCTACCATG
GCTGCAGAGAACCCATTTAAGGGAATCCTCACTGGTCTTCCAAAGCCTGGAGGTGGTGAA
TTCGGAAAGTTCTATAGCTTACCTGCTCTCAATGATCCCAGGATTGACAAGCTACCATAT
TCTATTAGGATTCTTCTCGAATCAGCAATCCGTAATTGTGACAACTTTCAAGTGAAAAAG
GAAGATGTTGAAAAGATTATTGACTGGGAAAAATCTGCACCTAAGCTTGTGGAGATACCC
TTCAAGCCTGCCCGTGTCTTGCTGCAGGATTTTACTGGTGTACCAGCTGTGGTGGACCTT
GCTTGCATGCGTGATGCCATGAACAACCTTGGCAGTGATTCTGACAAGATTAATCCATTG
GTTCCTGTCGACCTAGTTATTGATCACTCAGTTCAAGTTGATGTAACAAGGTCAGAAAAT
GCAGTCCAGGCTAATATGGAGCTTGAATTCCAAAGGAACAAGGAGAGATTTGCCTTTCTT
AAGTGGGGATCCAATGCTTTCCAAAACATGCTTGTTGTACCACCTGGGTCTGGTATTGTG
CATCAGGTGAATCTTGAATATCTTGGAAGGGTTGTCTTTAATAGGGAAGGCTTGCTTTAC
CCAGATAGCGTGGTCGGAACAGATTCCCACACCACCATGATTGATGGGCTAGGAGTTGCT
GGATGGGGTGTCGGAGGTATTGAGGCAGAAGCTGCAATGCTTGGCCAGCCAATGAGCATG
GTGTTGCCTGGAGTTGTTGGGTTCAAGCTATCAGGGAATTTGCGAAATGGTGTAACTGCC
ACCGACTTGGTTCTGACTGTCACTCAAATGCTGAGGAAGCATGGTGTTGTTGGAAAGTTT
GTTGAATTCTATGGTGGTGGAATGAGTGGTCTTTCATTGGCTGACAGGGCCACCATTGCA
AACATGGCTCCTGAATATGGTGCAACAATGGGTTTCTTCCCTGTAGATCATGTTACTCTG
GAATACCTCAAGTTAACGGGGAGAAGTGATGAGATAGTTGGAATGGTAGAGGCATATCTC
CGTGCAAATAATATGTTTGTCGATTATAATGAGCCTCAACAAGAAAAAGTGTACTCTTCT
TATTTGAACCTAGACCTTGCCGATGTTGAACCATGTCTGTCAGGGCCAAAGAGACCTCAT
GACCGTGTGCCTTTGAAAGAAATGAAGTCTGACTGGCATGCTTGCCTAGATAACAAAGTT
GGATTCAAGGGATTTGCTGTGCCAAAAGAGGTGCAAGATAAAGTGGCCAAGTTTTCCTTC
CATGGGCAACCTGCAGAGCTCAAACATGGCAGTGTTGTGATTGCTGCTATCACAAGTTGC
ACAAATACATCCAATCCCAGTGTTATGCTAGGAGCAGCTCTGGTTGCCAAAAAGGCATCT
GAGCTGGGTCTACATGTTAAGCCATGGGTTAAAACAAGCCTTGCCCCAGGCTCTGGTGTT
GTTACAAAATATTTACTCAAGAGTGGTCTACAGAAGTATTTAAATCAACAAGGTTTCAAC
ATTGTTGGCTATGGCTGCACCACTTGTATCGGGAACTCAGGGGACTTGGATGAATCTGTT
GCTTCTGCCATATCAGAGAACGACATTGTTGCTGCTGCTGTACTCTCCGGAAATCGGAAC
TTTGAAGGGCGTGTTCATGCCTTGACAAGAGCAAACTATCTTGCTTCACCTCCCTTGGTG
GTTGCCTATGCTCTTGCTGGCACTGTTGATATAGACTTTGAGAAAGATCCAATTGGAGTG
GGAAAGGATGGTAAGGATGTGTACTTCAGGGATATATGGCCATCAACTGAAGAAATTGCT
GAGGTTGTTCAATCAAGTGTATTGCCAGACATGTTCAAGAGTACATATGAAGCTATTACA
AAGGGAAATACCATGTGGAATGAATTATCTGTGCCAACAACAAAGTTGTACCAATGGGAT
CCTAAATCTACATACATCCATGAGCCACCATATTTCAAGGGTATGACCATGGATCCTCCT
GGACCTCATGGAGTGAAGGATGCTTACTGCTTGCTGAACTTTGGCGACAGTATTACTACT
GATCACATTTCACCTGCCGGAAGCATTCATAAAGATAGCCCTGCTGCTAGGTACCTTATG
GAGCGGGGTGTCGATCGCAGGGACTTCAACTCATATGGTAGCCGTCGTGGTAATGATGAG
ATTATGGCTAGGGGTACTTTCGCCAATATCCGCCTTGTAAACAAGCTGTTAAATGGGGAG
GTTGGTCCAAAGACAGTCCACGTTCCTTCTGGAGAAAAGCTATCTGTGTTTGATGCTGCT
ATGAAATACAAATCCGCTGGACAAAGCACTATTATCTTGGCTGGAGCTGAATATGGAAGT
GGAAGCTCCCGAGATTGGGCTGCCAAGGGACCAATGTTGTTGGGAGTTAAAGCTGTAATT
GCGAAGAGCTTCGAGAGGATTCATCGTAGTAACTTGGTAGGAATGGGTATTGTGCCTCTA
TGCTTCAAGGCTGGGGAGGATGCAGATACACTTGGATTGACAGGTCAAGAGCGATATACC
ATTGATCTTCCTGAAAATATTAGTGAGATCCGCCCTGGGCAAGACGTTACTGTACAAACA
GATACTGGAAAATCCTTCACCTGCATAGTGCGTTTCGACACTGAGGTGGAGTTGGCTTAT
TTCAACCATGGAGGTATTCTTCAATATGTCATTCGTCAGTTGACACAGCGATGA