Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400074229
CDS Infomation

pacid=37446490 polypeptide=PGSC0003DMP400050259 locus=PGSC0003DMG400028845 ID=PGSC0003DMT400074229.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGGTTGTTGTTGCTACTGGCAGTAGTACTGTTGGTGGCCATTTTGGCGAATTTTTCA
AGCTTTGTTAATGGTGATACAGATCCATCTGATGCATCTGTTCTGAGAGTCCTGTATACC
ACCCTAAACTCACCAGGGCAGCTGACAAAATGGAATGCCAATGGCGGTGATCCTTGTGGA
GAGTCCTGGACAGGCATTACCTGCTCGGGCAATAAAGTTACTGAAATCAAGATGTCAGGT
CTTGGGCTCTCAGGTTCATTGGGGTCTCAGCTAGATAGTCTAAAATCTGTGACCAATTTT
GACATAAGCAATAACAATATGGGGAGCCAGTTACCTTACCAGCTTCCTCCAAATGTGCAA
AGATTAAACCTCGCTTCTAGTGGTTTTAGTGGTGGCCTCCCATATTCCATTTCACAGATG
ACCTCCCTCCAGTACTTAAATGTCAGTCATAATCAAATTCAAGGATCAGTGGTTGTCTCG
TTTGACTCGCTCTCTGCACTCAACACATTGGATTTCTCTTTCAATTCTATGACGGGTAAT
CTTCCTCAAAGCTTCCAGTCACTAACTAGTATGAACAAAATGTATTTGCAGAACAACCAG
TTTAGTGGAACTATTGACGTCCTGGCCAATCTTCCCCTCGGAAATCTGAATGTTGAAAAC
AACCAATTTACTGGCTGGATTCCAGATCAGCTTAAAGGGATAGTGCAATCAAATGGTAAT
TCATGGATCTCTGGACCTGCACCCCCACCTCCACCTGGCACACCTCCTGCAAACAATCCC
AATGGAGATCACAAATCCAGAGACAACAGCAGCAATTCGGGCAGTAGGAAATCAGGTATA
GGGGGTGGAGGTGTTGCAGGAATAGTGATATCTATTCTAGTTGTTGGAGCAATAGTAGCA
TTCTTTATTATCAAGAAAAGATCAAGAAGGTCGTCCACAGACATAGAAAAACTTGATAAG
CAGCCACTTGCTCCTCTTACTCCACAGAAAGTAGAAGAGTTGAAACCTTATCAAACCTTC
TCCACAGTAAGCATGGGCACATTTGAAACTCCCACTGCTGTAACTCTAAGACCTCCACCT
ATTAATCGCCTTAAGTCCTTTGATGAGGTTGACATGTCACCGAAACCCATTGTTCCTCCC
AAGAAAATTAATACAGCTCAAATCAGGGCTACACAGTTTTCAATTGCAGACCTACAGATT
GCTACTGATAGCTTCAATGTTGAAAACCTTATTGGCGAGGGATCAATTGGGCGTGTTTAT
TGCGCTCAGTTTGATGATGGCAAAGTTCTTGCTGTCAAGAAAATCAATTCTTCTGCCCTC
CAAAATCATGAAGATTTTCTCTATATAGTTTCTGAGATATCACAGTTGCACCATCCAAAT
ATAATTGAGCTTGTTGGTTATTGTTCAGAGCATGGACAGTACTTGCTAGTTCATGAATTC
CATAAAAATGGTTCTCTGCATGATTTCCTGCACCTGTCAGATGAAGACAGCAAGCCACTG
GCATGGAATAGCCGAGTCAAGATTGCACTTGGTGCAGCACGAGCACTAGAGTATCTGCAT
GAAGTTCATTCACCATCATTGGTTCATAAAAACATTAAATCGGCAAATATTTTACTTGAT
CTGGAACTCAATCCTCATCTATCAGATTCTGGATTAGCAAGCCTTATTAATGATGCAGAT
CAGGCACTAAACCATAATACAGGGTCTGGATATGGTGCACCTGAGGTAGCTATGTATGGG
CAATGCACCATAAAAAGTGATGTCTACAGCTTTGGAGTTGTTATGTTGGAACTTCTTACC
GGACGGACACCTTTTGATAGTGAGAGACCAAGATCTGAACAATCTTTAGTTAGATGGGCA
ACGCCACAACTCCATGATATTGATGCCTTAGCTAAGATGGTTGATCCAGCACTCAAAGGG
CTCTATCCTGTTAAATCCATTTCCCGCTTTGCTGATGTAATTGCTCTTTGTGTCCAGTCT
GAGCCTGAGTTCCGGCCACCTATGTCAGAAGTGGTTGAAGCCTTAGTTCGGCTAGTTCAA
CGAGCAAATATGAGCAAGAGGACATATAGTATTGATCGGGGTTCAAGGGGTGAAACAGAT
GCTCTAGACAACCAACCTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400050259
PEP Infomation

pacid=37446490 transcript=PGSC0003DMT400074229 locus=PGSC0003DMG400028845 ID=PGSC0003DMT400074229.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MRLLLLLAVVLLVAILANFSSFVNGDTDPSDASVLRVLYTTLNSPGQLTKWNANGGDPCG
ESWTGITCSGNKVTEIKMSGLGLSGSLGSQLDSLKSVTNFDISNNNMGSQLPYQLPPNVQ
RLNLASSGFSGGLPYSISQMTSLQYLNVSHNQIQGSVVVSFDSLSALNTLDFSFNSMTGN
LPQSFQSLTSMNKMYLQNNQFSGTIDVLANLPLGNLNVENNQFTGWIPDQLKGIVQSNGN
SWISGPAPPPPPGTPPANNPNGDHKSRDNSSNSGSRKSGIGGGGVAGIVISILVVGAIVA
FFIIKKRSRRSSTDIEKLDKQPLAPLTPQKVEELKPYQTFSTVSMGTFETPTAVTLRPPP
INRLKSFDEVDMSPKPIVPPKKINTAQIRATQFSIADLQIATDSFNVENLIGEGSIGRVY
CAQFDDGKVLAVKKINSSALQNHEDFLYIVSEISQLHHPNIIELVGYCSEHGQYLLVHEF
HKNGSLHDFLHLSDEDSKPLAWNSRVKIALGAARALEYLHEVHSPSLVHKNIKSANILLD
LELNPHLSDSGLASLINDADQALNHNTGSGYGAPEVAMYGQCTIKSDVYSFGVVMLELLT
GRTPFDSERPRSEQSLVRWATPQLHDIDALAKMVDPALKGLYPVKSISRFADVIALCVQS
EPEFRPPMSEVVEALVRLVQRANMSKRTYSIDRGSRGETDALDNQP*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400074229
Transcript Infomation

pacid=37446490 locus=PGSC0003DMG400028845 ID=PGSC0003DMT400074229.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGGTTGTTGTTGCTACTGGCAGTAGTACTGTTGGTGGCCATTTTGGCGAATTTTTCA
AGCTTTGTTAATGGTGATACAGATCCATCTGATGCATCTGTTCTGAGAGTCCTGTATACC
ACCCTAAACTCACCAGGGCAGCTGACAAAATGGAATGCCAATGGCGGTGATCCTTGTGGA
GAGTCCTGGACAGGCATTACCTGCTCGGGCAATAAAGTTACTGAAATCAAGATGTCAGGT
CTTGGGCTCTCAGGTTCATTGGGGTCTCAGCTAGATAGTCTAAAATCTGTGACCAATTTT
GACATAAGCAATAACAATATGGGGAGCCAGTTACCTTACCAGCTTCCTCCAAATGTGCAA
AGATTAAACCTCGCTTCTAGTGGTTTTAGTGGTGGCCTCCCATATTCCATTTCACAGATG
ACCTCCCTCCAGTACTTAAATGTCAGTCATAATCAAATTCAAGGATCAGTGGTTGTCTCG
TTTGACTCGCTCTCTGCACTCAACACATTGGATTTCTCTTTCAATTCTATGACGGGTAAT
CTTCCTCAAAGCTTCCAGTCACTAACTAGTATGAACAAAATGTATTTGCAGAACAACCAG
TTTAGTGGAACTATTGACGTCCTGGCCAATCTTCCCCTCGGAAATCTGAATGTTGAAAAC
AACCAATTTACTGGCTGGATTCCAGATCAGCTTAAAGGGATAGTGCAATCAAATGGTAAT
TCATGGATCTCTGGACCTGCACCCCCACCTCCACCTGGCACACCTCCTGCAAACAATCCC
AATGGAGATCACAAATCCAGAGACAACAGCAGCAATTCGGGCAGTAGGAAATCAGGTATA
GGGGGTGGAGGTGTTGCAGGAATAGTGATATCTATTCTAGTTGTTGGAGCAATAGTAGCA
TTCTTTATTATCAAGAAAAGATCAAGAAGGTCGTCCACAGACATAGAAAAACTTGATAAG
CAGCCACTTGCTCCTCTTACTCCACAGAAAGTAGAAGAGTTGAAACCTTATCAAACCTTC
TCCACAGTAAGCATGGGCACATTTGAAACTCCCACTGCTGTAACTCTAAGACCTCCACCT
ATTAATCGCCTTAAGTCCTTTGATGAGGTTGACATGTCACCGAAACCCATTGTTCCTCCC
AAGAAAATTAATACAGCTCAAATCAGGGCTACACAGTTTTCAATTGCAGACCTACAGATT
GCTACTGATAGCTTCAATGTTGAAAACCTTATTGGCGAGGGATCAATTGGGCGTGTTTAT
TGCGCTCAGTTTGATGATGGCAAAGTTCTTGCTGTCAAGAAAATCAATTCTTCTGCCCTC
CAAAATCATGAAGATTTTCTCTATATAGTTTCTGAGATATCACAGTTGCACCATCCAAAT
ATAATTGAGCTTGTTGGTTATTGTTCAGAGCATGGACAGTACTTGCTAGTTCATGAATTC
CATAAAAATGGTTCTCTGCATGATTTCCTGCACCTGTCAGATGAAGACAGCAAGCCACTG
GCATGGAATAGCCGAGTCAAGATTGCACTTGGTGCAGCACGAGCACTAGAGTATCTGCAT
GAAGTTCATTCACCATCATTGGTTCATAAAAACATTAAATCGGCAAATATTTTACTTGAT
CTGGAACTCAATCCTCATCTATCAGATTCTGGATTAGCAAGCCTTATTAATGATGCAGAT
CAGGCACTAAACCATAATACAGGGTCTGGATATGGTGCACCTGAGGTAGCTATGTATGGG
CAATGCACCATAAAAAGTGATGTCTACAGCTTTGGAGTTGTTATGTTGGAACTTCTTACC
GGACGGACACCTTTTGATAGTGAGAGACCAAGATCTGAACAATCTTTAGTTAGATGGGCA
ACGCCACAACTCCATGATATTGATGCCTTAGCTAAGATGGTTGATCCAGCACTCAAAGGG
CTCTATCCTGTTAAATCCATTTCCCGCTTTGCTGATGTAATTGCTCTTTGTGTCCAGTCT
GAGCCTGAGTTCCGGCCACCTATGTCAGAAGTGGTTGAAGCCTTAGTTCGGCTAGTTCAA
CGAGCAAATATGAGCAAGAGGACATATAGTATTGATCGGGGTTCAAGGGGTGAAACAGAT
GCTCTAGACAACCAACCTTAG