Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400074086
CDS Infomation

pacid=37453437 polypeptide=PGSC0003DMP400050153 locus=PGSC0003DMG400028792 ID=PGSC0003DMT400074086.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTCTGGAAATGAATCACCAGAATTAGGGCAGGCTGATGTTGATCGATCAGTTAGGCAA
GTTTGTGCAAATGGGATTTGCATGCAAACAAATGTTGTTGAAGCAAAGCTTGATGAGGGA
AACATTCAAGAGGCTGAATCTGCATTGCGTGAAGGTTTGTCCCTCAATTTTGAGGAAGCA
CGAGCTCTTCTTGGAAGATTGGAATATCAAAGAGGAAATGTGGAAGGTGCTCTTAGGGTG
TTTGATGGTATTGATCTTCAAGCAGCCATACAGAGGATGCAGCCTTCTGTTACTGAGAAA
CAACCTTCTAAAAAGGGCCGCACTAAAAGCATTGAGTCTGTGCCAGGTGTCTCACAGCAT
GCTGCTGGTCTGGTCCTTGAGGCCATATATTTGAAAGCGAAGTCCCTGCAAAAGCTTGGG
AGACTGACTGATGCTGCTCATGAATGTCTAAGTGTGCTTGATGCCGTAGAGAAGATATTC
GATAGTGGCATACCTGATGTACTGGTGGAGAATAAGCTGCAAGAAACTGTGAGCCATGCT
GTTGAGCTCCTTCCAGAGCTATGGAAGCAAGCTGGTTCCTATTCTGAAGCAATGTCTGCC
TATCGCCGTGCCCTCTTAAGCCAATGGAATCTCGATAATGACTGCTGTGCCAGGATTCAA
AAAGCTTTTGCTGTGTTTCTACTTTATAGTGGGGTTGAGGTTTGCCCACCAAGCTTAGCT
GTGCAAATTGACGGTTCTTATGTACCTAGGAACAATTTAGAAGAAGCAATACTGCTGTTA
ATGATTCTGATGAGAAAAGTTTACCTTGGTAAGATCAAATGGGACCCTTCAGTTTTAGAG
CACCTTACATTTGCTCTGTCTGTATGCGGCCAAACCTCTGTTTTAGCTAAGCAACTTGAA
GAAGTAATGCCAGGGGTACTTAACCGGATTGATCGTTGGCGATCTTTAGCACTTTGTTAT
TTTGCGGCTGGACAGAACAAAAATGCCTTAAGTCTGCTGCGGAAGTCTCTGCATAAACAT
GAAGAGCCAGATGACGTTCTCTCATTGGTGTTGGCTTCTAGAATTTGTTCTGAGGATGTC
TTTCTTGCAGCTGAGGGAGTGAAGTATGCACAGAGGGCGATAACTAATGCAGAGGGTTCA
AATGAACACTTGAAAGGTGTTGGTCTCCGCGTGTTAGGTCTTTGTTTGGGCAAGCAGGCG
AAAGTTGCAACCTCCGACTTTGAGAGATCACAACTTCAATCTGAGGCTTTAAAATCTTTA
GATGGTGCAATGGCTTTAGAGCATGAAAATTCAGATTTGATGTTTGAGTTAGGCGTTCAA
TATGCAGAGCACCGTAATCTGGATGCAGCTTTGCAATATGCGAGAAAGTATGTTGATGCA
ACGGGAGGATCTACTCTAAGAGGTTGGAGACTGCTTGCTTTAGTTCTTTCTGCTCAACAT
CGCTATTCGGAGGCTGAAGTAGTTACTGATGCGGCTTTTGATGAGACTACAAAGTGGGAT
CAAGGACCTTTGCTAAGAATGAAAGCTAAGCTTAAAACATCCCAGTCACGGTACATCGAC
GCCGTTGAACCTTATCGTCATCTCCTTTCATTGGTTCAAGCTCAAAGAAAATCTTTTGGA
CCATTCAGAAATGCGCCTCAGGTGGAGGAAGATAAGGTAAATGAATATGAAGTTTGGCAT
GGACTGGCAGACTTGTACTCTAGCCTTTCACATTTTAAGGATGCAGAGACATGTTTGGAG
AAAGCTAGAGGTCTTATCGAGTACTCAGCAGACACTTTGTATACAGAAGGAATGATGTTT
GAAAGACAGGGAGAAAATGACAAAGCGTTGTCAGCTTATATTAATGCACTATTAGTAGAG
CCTAATCATGTGCAGTGTAAGATCTTGCTTGGTTCTTTATTGACTAAAATGGACCCGGGG
ATGTTGCCATTGGCAAAAGCATTACTCTCAGATGCATTGAGGATTGAACCTACCAATCGT
GTAGCTTGGTACCACTTGGGATTGGTTCATAGAGACGATGGACGGGTAGCTGATGCTGCT
GATTGTTTCCAGGCAGCTTCCATGCTTGAAGAGTCTGATCCCATCGAAAAGTTTAGTTCC
ATCCTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400050153
PEP Infomation

pacid=37453437 transcript=PGSC0003DMT400074086 locus=PGSC0003DMG400028792 ID=PGSC0003DMT400074086.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MSGNESPELGQADVDRSVRQVCANGICMQTNVVEAKLDEGNIQEAESALREGLSLNFEEA
RALLGRLEYQRGNVEGALRVFDGIDLQAAIQRMQPSVTEKQPSKKGRTKSIESVPGVSQH
AAGLVLEAIYLKAKSLQKLGRLTDAAHECLSVLDAVEKIFDSGIPDVLVENKLQETVSHA
VELLPELWKQAGSYSEAMSAYRRALLSQWNLDNDCCARIQKAFAVFLLYSGVEVCPPSLA
VQIDGSYVPRNNLEEAILLLMILMRKVYLGKIKWDPSVLEHLTFALSVCGQTSVLAKQLE
EVMPGVLNRIDRWRSLALCYFAAGQNKNALSLLRKSLHKHEEPDDVLSLVLASRICSEDV
FLAAEGVKYAQRAITNAEGSNEHLKGVGLRVLGLCLGKQAKVATSDFERSQLQSEALKSL
DGAMALEHENSDLMFELGVQYAEHRNLDAALQYARKYVDATGGSTLRGWRLLALVLSAQH
RYSEAEVVTDAAFDETTKWDQGPLLRMKAKLKTSQSRYIDAVEPYRHLLSLVQAQRKSFG
PFRNAPQVEEDKVNEYEVWHGLADLYSSLSHFKDAETCLEKARGLIEYSADTLYTEGMMF
ERQGENDKALSAYINALLVEPNHVQCKILLGSLLTKMDPGMLPLAKALLSDALRIEPTNR
VAWYHLGLVHRDDGRVADAADCFQAASMLEESDPIEKFSSIL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400074086
Transcript Infomation

pacid=37453437 locus=PGSC0003DMG400028792 ID=PGSC0003DMT400074086.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTCTGGAAATGAATCACCAGAATTAGGGCAGGCTGATGTTGATCGATCAGTTAGGCAA
GTTTGTGCAAATGGGATTTGCATGCAAACAAATGTTGTTGAAGCAAAGCTTGATGAGGGA
AACATTCAAGAGGCTGAATCTGCATTGCGTGAAGGTTTGTCCCTCAATTTTGAGGAAGCA
CGAGCTCTTCTTGGAAGATTGGAATATCAAAGAGGAAATGTGGAAGGTGCTCTTAGGGTG
TTTGATGGTATTGATCTTCAAGCAGCCATACAGAGGATGCAGCCTTCTGTTACTGAGAAA
CAACCTTCTAAAAAGGGCCGCACTAAAAGCATTGAGTCTGTGCCAGGTGTCTCACAGCAT
GCTGCTGGTCTGGTCCTTGAGGCCATATATTTGAAAGCGAAGTCCCTGCAAAAGCTTGGG
AGACTGACTGATGCTGCTCATGAATGTCTAAGTGTGCTTGATGCCGTAGAGAAGATATTC
GATAGTGGCATACCTGATGTACTGGTGGAGAATAAGCTGCAAGAAACTGTGAGCCATGCT
GTTGAGCTCCTTCCAGAGCTATGGAAGCAAGCTGGTTCCTATTCTGAAGCAATGTCTGCC
TATCGCCGTGCCCTCTTAAGCCAATGGAATCTCGATAATGACTGCTGTGCCAGGATTCAA
AAAGCTTTTGCTGTGTTTCTACTTTATAGTGGGGTTGAGGTTTGCCCACCAAGCTTAGCT
GTGCAAATTGACGGTTCTTATGTACCTAGGAACAATTTAGAAGAAGCAATACTGCTGTTA
ATGATTCTGATGAGAAAAGTTTACCTTGGTAAGATCAAATGGGACCCTTCAGTTTTAGAG
CACCTTACATTTGCTCTGTCTGTATGCGGCCAAACCTCTGTTTTAGCTAAGCAACTTGAA
GAAGTAATGCCAGGGGTACTTAACCGGATTGATCGTTGGCGATCTTTAGCACTTTGTTAT
TTTGCGGCTGGACAGAACAAAAATGCCTTAAGTCTGCTGCGGAAGTCTCTGCATAAACAT
GAAGAGCCAGATGACGTTCTCTCATTGGTGTTGGCTTCTAGAATTTGTTCTGAGGATGTC
TTTCTTGCAGCTGAGGGAGTGAAGTATGCACAGAGGGCGATAACTAATGCAGAGGGTTCA
AATGAACACTTGAAAGGTGTTGGTCTCCGCGTGTTAGGTCTTTGTTTGGGCAAGCAGGCG
AAAGTTGCAACCTCCGACTTTGAGAGATCACAACTTCAATCTGAGGCTTTAAAATCTTTA
GATGGTGCAATGGCTTTAGAGCATGAAAATTCAGATTTGATGTTTGAGTTAGGCGTTCAA
TATGCAGAGCACCGTAATCTGGATGCAGCTTTGCAATATGCGAGAAAGTATGTTGATGCA
ACGGGAGGATCTACTCTAAGAGGTTGGAGACTGCTTGCTTTAGTTCTTTCTGCTCAACAT
CGCTATTCGGAGGCTGAAGTAGTTACTGATGCGGCTTTTGATGAGACTACAAAGTGGGAT
CAAGGACCTTTGCTAAGAATGAAAGCTAAGCTTAAAACATCCCAGTCACGGTACATCGAC
GCCGTTGAACCTTATCGTCATCTCCTTTCATTGGTTCAAGCTCAAAGAAAATCTTTTGGA
CCATTCAGAAATGCGCCTCAGGTGGAGGAAGATAAGGTAAATGAATATGAAGTTTGGCAT
GGACTGGCAGACTTGTACTCTAGCCTTTCACATTTTAAGGATGCAGAGACATGTTTGGAG
AAAGCTAGAGGTCTTATCGAGTACTCAGCAGACACTTTGTATACAGAAGGAATGATGTTT
GAAAGACAGGGAGAAAATGACAAAGCGTTGTCAGCTTATATTAATGCACTATTAGTAGAG
CCTAATCATGTGCAGTGTAAGATCTTGCTTGGTTCTTTATTGACTAAAATGGACCCGGGG
ATGTTGCCATTGGCAAAAGCATTACTCTCAGATGCATTGAGGATTGAACCTACCAATCGT
GTAGCTTGGTACCACTTGGGATTGGTTCATAGAGACGATGGACGGGTAGCTGATGCTGCT
GATTGTTTCCAGGCAGCTTCCATGCTTGAAGAGTCTGATCCCATCGAAAAGTTTAGTTCC
ATCCTTTGA