Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400073978
CDS Infomation

pacid=37432284 polypeptide=PGSC0003DMP400050078 locus=PGSC0003DMG400028748 ID=PGSC0003DMT400073978.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTACCAGAAATTCTTGGTTCACTATTGCATCATTGTTCTAAGACCAAGGCATTCCAT
TATGGACTCTCTCTTCATGCAGCTGCAATCAAGTCAGGCTTACCAGGTGATGTTCTTATA
TCTAATCACATCCTCAACATGTATGCCAAGTGTGGAAATATTAACTTTGCCAGTCAGATT
TTTAATGAGATGTCCAAAAGAAATCTCGTTACCTGGTCAGCCATGATCGCTGGTTATGAT
CAAGATGGGAAACACCTCATGGCTATCAGCCTCTACTCCCAAATGCCACTAGAGCCCAAT
GAATTTGTCCTTGCTAGTGCTCTTAGTTCATGTGCTAACCTCTTGGCCTTGAAACTTGGT
AGGCAAATACATTCCCAGTCTATCAAATTAGGCTGTTCATCCATTTCGTTTGTGTCCAAC
TCTCTGATCTCAATGTACATGAAAAATGGTCAATGTAGTGACGCTCTATCAGTTTTTGCA
TTGACACCCACTCTTACTGATGTCTCCTACAACACAATCATAATGGGTTTGGTAGAAAGT
AATCAAAGAGAGAAAGCATTTGAAGTCTACAAAAGTATGTGCCAACAAGGGTTGGTTCCG
GACCGCTTTACCTTTGTTGGCTTATTAGGAACCTGCGATACTGCACATGATTTGGGGAAA
GGAATGCAATTGCATAGCCAAACAATCAAGCTCAAACTTGATGGGACCGCCTTTATAGGC
AATATAATAATGACAATGTACTCAAATTTGAACTTGTTAAATGAAGCTGACAAAATTTTC
AGATCAATCAAAGAGAAAGATGTCATTTCATGGAATACTCTCATTGCTGCTTGTTCTCGT
TGTGATGATCATTCTAAGGCCTTGGTTGTTTTTAGAGAGATGGTCGAATATTTTGATGGA
GGGCCTGATGAGTTTACTTATGCTAGTCTGCTTTCTGCATGTGCTGGCATGGGTTCGATG
CAATTTGGGCAGCAAATACATGCTCATCTTATTAGAAAAAGCTCAAGTGTAGATATTGGT
GTTGTCAATGCCCTTGTGAACATGTATGCTAAATGTGGCTGTATCCAGTATGCATATACA
ACTTTTAGGCTAATGATTTCTCGTAACCTTGTCTCATGGAATAGTGTCATTGCTGGATTT
GCTAACCATGGCCACGGAAAAAAAGTTATAAAATTATTCGAGGAGATGAAGAGTGTTGGT
TTAAAGCCTGATTCTGTCACATTTCTCGGACTTCTAGTCGCTTGCAATCATGCAGGGCTT
GTAGATGAGGGCCTATATTACTTCAATACCATGAACGAGATTTATGGGGTTACTCCCGAC
ATTGAACATTTCTCTTGCCTCATTGATTTACTAGGACGAGCTGGGAGACTGAAAGATGCT
GAAGAATACATGCAAAGGTACCCCTTTGGGCATGATTCAGTTGTTTTAGGTTGCTTACTT
TCAGCTTGTCGGCTGCATGGTGATGTTGTAATTGGGGAAAGAATGGCTAAGAAGCTCCTA
CAGCTTCAGCCAGTTTCTACTTCGCCTTATGTTTTGTTATCAAACTTATATGCTTCAGAC
GAGAAGTGGAATAGTGTAGCAGAGGCAAGAAAAATGCTGAAGAGTTGTGGTTTAAAGAAG
GAGGCGGGTCATAGTCTCATTGAAGTGAAGGGATCTGTTGAGAAGTTCACAATTGGCAAT
TTTGCGAACTCAAGGATTGAGGAAATCGTGAATGTGCTTGGAACTTTAGGCTGTGGATGG
GATGAAGAAATTATCCTCCTTGATTCAGCATAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400050078
PEP Infomation

pacid=37432284 transcript=PGSC0003DMT400073978 locus=PGSC0003DMG400028748 ID=PGSC0003DMT400073978.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MVPEILGSLLHHCSKTKAFHYGLSLHAAAIKSGLPGDVLISNHILNMYAKCGNINFASQI
FNEMSKRNLVTWSAMIAGYDQDGKHLMAISLYSQMPLEPNEFVLASALSSCANLLALKLG
RQIHSQSIKLGCSSISFVSNSLISMYMKNGQCSDALSVFALTPTLTDVSYNTIIMGLVES
NQREKAFEVYKSMCQQGLVPDRFTFVGLLGTCDTAHDLGKGMQLHSQTIKLKLDGTAFIG
NIIMTMYSNLNLLNEADKIFRSIKEKDVISWNTLIAACSRCDDHSKALVVFREMVEYFDG
GPDEFTYASLLSACAGMGSMQFGQQIHAHLIRKSSSVDIGVVNALVNMYAKCGCIQYAYT
TFRLMISRNLVSWNSVIAGFANHGHGKKVIKLFEEMKSVGLKPDSVTFLGLLVACNHAGL
VDEGLYYFNTMNEIYGVTPDIEHFSCLIDLLGRAGRLKDAEEYMQRYPFGHDSVVLGCLL
SACRLHGDVVIGERMAKKLLQLQPVSTSPYVLLSNLYASDEKWNSVAEARKMLKSCGLKK
EAGHSLIEVKGSVEKFTIGNFANSRIEEIVNVLGTLGCGWDEEIILLDSA*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400073978
Transcript Infomation

pacid=37432284 locus=PGSC0003DMG400028748 ID=PGSC0003DMT400073978.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTACCAGAAATTCTTGGTTCACTATTGCATCATTGTTCTAAGACCAAGGCATTCCAT
TATGGACTCTCTCTTCATGCAGCTGCAATCAAGTCAGGCTTACCAGGTGATGTTCTTATA
TCTAATCACATCCTCAACATGTATGCCAAGTGTGGAAATATTAACTTTGCCAGTCAGATT
TTTAATGAGATGTCCAAAAGAAATCTCGTTACCTGGTCAGCCATGATCGCTGGTTATGAT
CAAGATGGGAAACACCTCATGGCTATCAGCCTCTACTCCCAAATGCCACTAGAGCCCAAT
GAATTTGTCCTTGCTAGTGCTCTTAGTTCATGTGCTAACCTCTTGGCCTTGAAACTTGGT
AGGCAAATACATTCCCAGTCTATCAAATTAGGCTGTTCATCCATTTCGTTTGTGTCCAAC
TCTCTGATCTCAATGTACATGAAAAATGGTCAATGTAGTGACGCTCTATCAGTTTTTGCA
TTGACACCCACTCTTACTGATGTCTCCTACAACACAATCATAATGGGTTTGGTAGAAAGT
AATCAAAGAGAGAAAGCATTTGAAGTCTACAAAAGTATGTGCCAACAAGGGTTGGTTCCG
GACCGCTTTACCTTTGTTGGCTTATTAGGAACCTGCGATACTGCACATGATTTGGGGAAA
GGAATGCAATTGCATAGCCAAACAATCAAGCTCAAACTTGATGGGACCGCCTTTATAGGC
AATATAATAATGACAATGTACTCAAATTTGAACTTGTTAAATGAAGCTGACAAAATTTTC
AGATCAATCAAAGAGAAAGATGTCATTTCATGGAATACTCTCATTGCTGCTTGTTCTCGT
TGTGATGATCATTCTAAGGCCTTGGTTGTTTTTAGAGAGATGGTCGAATATTTTGATGGA
GGGCCTGATGAGTTTACTTATGCTAGTCTGCTTTCTGCATGTGCTGGCATGGGTTCGATG
CAATTTGGGCAGCAAATACATGCTCATCTTATTAGAAAAAGCTCAAGTGTAGATATTGGT
GTTGTCAATGCCCTTGTGAACATGTATGCTAAATGTGGCTGTATCCAGTATGCATATACA
ACTTTTAGGCTAATGATTTCTCGTAACCTTGTCTCATGGAATAGTGTCATTGCTGGATTT
GCTAACCATGGCCACGGAAAAAAAGTTATAAAATTATTCGAGGAGATGAAGAGTGTTGGT
TTAAAGCCTGATTCTGTCACATTTCTCGGACTTCTAGTCGCTTGCAATCATGCAGGGCTT
GTAGATGAGGGCCTATATTACTTCAATACCATGAACGAGATTTATGGGGTTACTCCCGAC
ATTGAACATTTCTCTTGCCTCATTGATTTACTAGGACGAGCTGGGAGACTGAAAGATGCT
GAAGAATACATGCAAAGGTACCCCTTTGGGCATGATTCAGTTGTTTTAGGTTGCTTACTT
TCAGCTTGTCGGCTGCATGGTGATGTTGTAATTGGGGAAAGAATGGCTAAGAAGCTCCTA
CAGCTTCAGCCAGTTTCTACTTCGCCTTATGTTTTGTTATCAAACTTATATGCTTCAGAC
GAGAAGTGGAATAGTGTAGCAGAGGCAAGAAAAATGCTGAAGAGTTGTGGTTTAAAGAAG
GAGGCGGGTCATAGTCTCATTGAAGTGAAGGGATCTGTTGAGAAGTTCACAATTGGCAAT
TTTGCGAACTCAAGGATTGAGGAAATCGTGAATGTGCTTGGAACTTTAGGCTGTGGATGG
GATGAAGAAATTATCCTCCTTGATTCAGCATAG