Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400073726
CDS Infomation

pacid=37447603 polypeptide=PGSC0003DMP400049899 locus=PGSC0003DMG400028642 ID=PGSC0003DMT400073726.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGTTTCGGAAAGAAGATCAGGATAGGGCTCGATGGGTTTGGAAGAATTAATCGTTTC
ATCACGAGAGCAGCTCACAGAGACGAAAGCAAGCTTTCAAATGCCAGCAATGTGCTTAAG
ACTTCCACCTTTAAGCATGACTCAGATGGTTTTGGATCTGCTGGGTTAAAGTCTTTCAGA
GCATTTGCAGTGGTTGGTGCTGGAGTCTCTGGGCTACTTAGCTTTGCAGGAGTTGCTTAT
TCTGATGAGGCCGAACATGGCTTAGAGTGTCCGAGCTATCCTTGGCCTCACGAAGGCATT
CTCAGCTCTTATGATCATGCTTCGATACGTCGAGGTCATCAGGTTTACCAGCAAGTGTGT
GCATCCTGCCACTCAATGTCGCTAATTTCCTACCGTGATCTTGTTGGTGTTGCATACACT
GAAGAAGAAACTAAGGCCATGGCAGCAGAAATTGAGGTGGTTGATGGCCCTAATGATGAG
GGTGAGATGTTCACCCGCCCTGGGAAGTTGAGTGATCGTTTTCCACAGCCTTACGCAAAT
GAAGCAGCTGCAAGGTTTGCAAATGGTGGGGCTTATCCTCCTGATCTAAGTCTTATCACT
AAGGCCCGGCATAGTGGTCAAAACTATGTTTTCGCTCTTCTAACTGGCTACCGGGACCCT
CCTGCTGGTGTCTCAATTAGGGAAGGTCTTCACTATAACCCTTACTTCCCTGGTGGAGCT
ATAGCGATGCCTAAAATGCTTAATGATGGTGCTGTTGAGTATGAGGATGGTATACCCGCA
ACTGAGGCACAAATGGGAAAAGATGTTGTGTCCTTCCTGTCATGGGCTGCTGAACCAGAA
ATGGAAGAGAGAAAGCTGATGGGTTTCAAATGGATATTCGTCTTATCACTTGCACTTCTC
CAAGCAGCTTACTACCGTCGCCTGAGATGGTCTGTCCTGAAATCTCGGAAATTGGTCCTT
GATGTTGTCAACTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400049899
PEP Infomation

pacid=37447603 transcript=PGSC0003DMT400073726 locus=PGSC0003DMG400028642 ID=PGSC0003DMT400073726.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MSFGKKIRIGLDGFGRINRFITRAAHRDESKLSNASNVLKTSTFKHDSDGFGSAGLKSFR
AFAVVGAGVSGLLSFAGVAYSDEAEHGLECPSYPWPHEGILSSYDHASIRRGHQVYQQVC
ASCHSMSLISYRDLVGVAYTEEETKAMAAEIEVVDGPNDEGEMFTRPGKLSDRFPQPYAN
EAAARFANGGAYPPDLSLITKARHSGQNYVFALLTGYRDPPAGVSIREGLHYNPYFPGGA
IAMPKMLNDGAVEYEDGIPATEAQMGKDVVSFLSWAAEPEMEERKLMGFKWIFVLSLALL
QAAYYRRLRWSVLKSRKLVLDVVN*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400073726
Transcript Infomation

pacid=37447603 locus=PGSC0003DMG400028642 ID=PGSC0003DMT400073726.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGTTTCGGAAAGAAGATCAGGATAGGGCTCGATGGGTTTGGAAGAATTAATCGTTTC
ATCACGAGAGCAGCTCACAGAGACGAAAGCAAGCTTTCAAATGCCAGCAATGTGCTTAAG
ACTTCCACCTTTAAGCATGACTCAGATGGTTTTGGATCTGCTGGGTTAAAGTCTTTCAGA
GCATTTGCAGTGGTTGGTGCTGGAGTCTCTGGGCTACTTAGCTTTGCAGGAGTTGCTTAT
TCTGATGAGGCCGAACATGGCTTAGAGTGTCCGAGCTATCCTTGGCCTCACGAAGGCATT
CTCAGCTCTTATGATCATGCTTCGATACGTCGAGGTCATCAGGTTTACCAGCAAGTGTGT
GCATCCTGCCACTCAATGTCGCTAATTTCCTACCGTGATCTTGTTGGTGTTGCATACACT
GAAGAAGAAACTAAGGCCATGGCAGCAGAAATTGAGGTGGTTGATGGCCCTAATGATGAG
GGTGAGATGTTCACCCGCCCTGGGAAGTTGAGTGATCGTTTTCCACAGCCTTACGCAAAT
GAAGCAGCTGCAAGGTTTGCAAATGGTGGGGCTTATCCTCCTGATCTAAGTCTTATCACT
AAGGCCCGGCATAGTGGTCAAAACTATGTTTTCGCTCTTCTAACTGGCTACCGGGACCCT
CCTGCTGGTGTCTCAATTAGGGAAGGTCTTCACTATAACCCTTACTTCCCTGGTGGAGCT
ATAGCGATGCCTAAAATGCTTAATGATGGTGCTGTTGAGTATGAGGATGGTATACCCGCA
ACTGAGGCACAAATGGGAAAAGATGTTGTGTCCTTCCTGTCATGGGCTGCTGAACCAGAA
ATGGAAGAGAGAAAGCTGATGGGTTTCAAATGGATATTCGTCTTATCACTTGCACTTCTC
CAAGCAGCTTACTACCGTCGCCTGAGATGGTCTGTCCTGAAATCTCGGAAATTGGTCCTT
GATGTTGTCAACTGA