Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400073706
CDS Infomation

pacid=37449231 polypeptide=PGSC0003DMP400049883 locus=PGSC0003DMG400028630 ID=PGSC0003DMT400073706.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTGCTGGATTACGAGTTTTGTGATGAGTTAATAGACGAGTCTGAATCCAAATTCAGA
GAAGTAGTAGATGGGATTATGTTGCTGCATATGGGCAAGATTGTGAAGTTTGATCTTGAC
GTTAGAGTAGAAGATTTAGCTTCATATACAGCTATTGATAGATGGGTTCTTTATGTCACC
AGAAACAGTGTCAAGAAGCTACACCTTAGAATTTCTAATATTGGTGATCGTACCTATACA
CTGCCTCCTTGTATATTTCACTGTTCAACCCTGACACAGTTGAAACTTGCTAGATGTTCC
TTTAAACCACCTGGTTCTTTTCGTGGCTTTCCCAATCTTGTAACCCTTCGGTTGGCATCA
GTAACCTTTTCAGAGCATTGTGTTATCAAGGCCCCTCTTCTTGCTAATTTGACCTTGAAC
TGTTGTGATGGTATGCAATACCTAAACATTGTTTCACCAGTGTTGAAGTCCTTGTATGTT
TGTTACCCTCACTCCTATATCGCACTAAATTGCTTCATGAACTGCAAGAATTTGAGAGAT
TTAGGACTTGTGTTTTCCAAAGTGGTTGATAATCCAAATCATGATCATAGATCAACGTTG
GTGAAATTTCTTGGTAGCTTGCCTGCACTTGAGGTACTCCTGTTGGATTCACTTTTCATT
GACCTTTTGAGTGCAGACGTAGTTCTATCAAGTGGTCCTCCTTTTATGCTCAACTGCTTG
CGGAAGCTGTCCCTCTCTGTTGACTTTGGCAAATTGGGTCATATTTCTTGCGTTCTACAA
TTAATCGAGTGTTCGCCCAATTTGAATGAACTTGAGATTACGGTCAATGGTACCGATGAT
AATATTGAAGCATTTGTGAAATGTCTGAAGATGGCTGACTGCTTGCAGCTACCACTCAAC
AAGCTAGAGTATGTGAGTTTCTATGGTTTTGCAAGTCCAATCTGTGTAGAGGCTTTTGCT
ATGCTATTCATTATTCAGGCACGATCTTTGCTAAGGATCTTCATTGAACAACCGCTAGGA
ACTAAATCCAGTAAAGATTTGAGTGGTTTACCCAGAGCTTCTCCTAAGGCTGAGCTAGTT
ATAAGTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400049883
PEP Infomation

pacid=37449231 transcript=PGSC0003DMT400073706 locus=PGSC0003DMG400028630 ID=PGSC0003DMT400073706.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MVLDYEFCDELIDESESKFREVVDGIMLLHMGKIVKFDLDVRVEDLASYTAIDRWVLYVT
RNSVKKLHLRISNIGDRTYTLPPCIFHCSTLTQLKLARCSFKPPGSFRGFPNLVTLRLAS
VTFSEHCVIKAPLLANLTLNCCDGMQYLNIVSPVLKSLYVCYPHSYIALNCFMNCKNLRD
LGLVFSKVVDNPNHDHRSTLVKFLGSLPALEVLLLDSLFIDLLSADVVLSSGPPFMLNCL
RKLSLSVDFGKLGHISCVLQLIECSPNLNELEITVNGTDDNIEAFVKCLKMADCLQLPLN
KLEYVSFYGFASPICVEAFAMLFIIQARSLLRIFIEQPLGTKSSKDLSGLPRASPKAELV
IS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400073706
Transcript Infomation

pacid=37449231 locus=PGSC0003DMG400028630 ID=PGSC0003DMT400073706.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTGCTGGATTACGAGTTTTGTGATGAGTTAATAGACGAGTCTGAATCCAAATTCAGA
GAAGTAGTAGATGGGATTATGTTGCTGCATATGGGCAAGATTGTGAAGTTTGATCTTGAC
GTTAGAGTAGAAGATTTAGCTTCATATACAGCTATTGATAGATGGGTTCTTTATGTCACC
AGAAACAGTGTCAAGAAGCTACACCTTAGAATTTCTAATATTGGTGATCGTACCTATACA
CTGCCTCCTTGTATATTTCACTGTTCAACCCTGACACAGTTGAAACTTGCTAGATGTTCC
TTTAAACCACCTGGTTCTTTTCGTGGCTTTCCCAATCTTGTAACCCTTCGGTTGGCATCA
GTAACCTTTTCAGAGCATTGTGTTATCAAGGCCCCTCTTCTTGCTAATTTGACCTTGAAC
TGTTGTGATGGTATGCAATACCTAAACATTGTTTCACCAGTGTTGAAGTCCTTGTATGTT
TGTTACCCTCACTCCTATATCGCACTAAATTGCTTCATGAACTGCAAGAATTTGAGAGAT
TTAGGACTTGTGTTTTCCAAAGTGGTTGATAATCCAAATCATGATCATAGATCAACGTTG
GTGAAATTTCTTGGTAGCTTGCCTGCACTTGAGGTACTCCTGTTGGATTCACTTTTCATT
GACCTTTTGAGTGCAGACGTAGTTCTATCAAGTGGTCCTCCTTTTATGCTCAACTGCTTG
CGGAAGCTGTCCCTCTCTGTTGACTTTGGCAAATTGGGTCATATTTCTTGCGTTCTACAA
TTAATCGAGTGTTCGCCCAATTTGAATGAACTTGAGATTACGGTCAATGGTACCGATGAT
AATATTGAAGCATTTGTGAAATGTCTGAAGATGGCTGACTGCTTGCAGCTACCACTCAAC
AAGCTAGAGTATGTGAGTTTCTATGGTTTTGCAAGTCCAATCTGTGTAGAGGCTTTTGCT
ATGCTATTCATTATTCAGGCACGATCTTTGCTAAGGATCTTCATTGAACAACCGCTAGGA
ACTAAATCCAGTAAAGATTTGAGTGGTTTACCCAGAGCTTCTCCTAAGGCTGAGCTAGTT
ATAAGTTAA