Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400073059
CDS Infomation

pacid=37426745 polypeptide=PGSC0003DMP400049436 locus=PGSC0003DMG400028414 ID=PGSC0003DMT400073059.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGAATTCCATCTCCGAACTCCACCAAGCTCACGCTGTCATGCTCAAAACTGGTCTC
TTTCGTGACCCTTTTGCTGCTAGTCGCCTCTTGACTAAAGCCACTGTTCTTCCCATATCT
TCCCCTGAAACCCTTTCATATGCACTCTCTGTTTTCACTCACATTGAAGAACCCAACTCA
TATATCTACAACACAATCATCCGTGCTTATTCCACTAGCCCCTTTCCACAACTTGCACTC
ATTATCTTCCTCAAAATGTTAAACTCTGTAAATAAAGTTTTCCCAGATAGGTACACTTTT
ACATTCATTGTAAAAGCTTGTGCTACTATGGAAAATGCTAAACAAGGTGAACAAGTTCAT
GGGTTGGTGACAAAAATTGGACTTGAGGAAGATGTGTATATATACAACACTTTGGTTCAT
ATGTATGCGAAATGTGGGTGTTTTGGAATTTCGCGTGGTATGATTGATGGGTTGATTGAA
GATGATGTTATAGCGTGGAATGCATTGTTGAGTGTGTATGCGGAAAGGGGGTTGTTTGAA
TTGGCGCGTGAGTTGTTTGATGAAATGCCTGTGAAGAATGTGGAATCTTGGAATTTTATG
GTTTCTGGGTATGTGAATGTTGGGTTGGTGGATGAAGCAAGGAAGGTGTTTGATGAAATG
TTGGTGAAAGATGTTGTGTCTTGGAATGTTATGATTACTGGTTATACTAAGGCTGATAAG
TTTAATGAAGTTTTAACTCTTTTTGAGGATATGCTGAGAGCTAAAGTGAAGCCTGATGAT
TGTACACTTGTGAATGTGCTGTCTGCTTGTGCCGGTGTTGGATCTCTGAGCCAGGGAAAG
TGGGTTCATGCATTTATCGAGAGAAATGGGATTGAGGTTCACAATTTTCTTGCTACTGCT
CTTGTGGATATGTATTGCAAATGCGGATGTATTGAGAAAGGTTTAGAGGTGTTTAATGGT
ACTTTGAGAAAAGATATTAGTACTTGGAATGCAATGATTGCAGGGTTCAGCAACCATGGG
TATTTGGATGATGCATTAAAGACCTTCAATGAGCTCATTGCTGATGGTATCAAGCCAAAT
GAGGTTACTTTTGTAAGTGTTTTGTCTACTTGCAGTCAAGGGGGCTTATTAAGCGAGGGA
CGCAGGATGTTTGAACTCATGATTAATGAATATAGAATTCAGCCTACGCTTGTACATTAT
GGTTGTATGGTTGATTTACTTGGCCGGTTTGGATTATTAGAGGAGGCTGAAGAACTCGTA
AGCAAATTGCCTGTGAAAGAAGCTCCTGCTATTTGGGAGTCCCTCTTGAGTGCTTCCAGA
AGCCATAATGATGTCGAATTGGCAGAGCGCATCGCTACCAAACTTTTAGAGGTTGATCCT
CGCGACAGTGCTGGTTATGTTCAACTATCAAATGTCCTTGCATCTATGGGGAGATGGGAT
GATGTGAGGGAAGTGCGGAGAAAGATGAGGAGCGAGGGGATAACTAAAGAGCCCGGTTGT
AGTATGATTGAAGTTGATGGAGTTGTTCACGAGTTCTTGGCTGGTGAAGGGATAATACTG
TAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400049436
PEP Infomation

pacid=37426745 transcript=PGSC0003DMT400073059 locus=PGSC0003DMG400028414 ID=PGSC0003DMT400073059.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MANSISELHQAHAVMLKTGLFRDPFAASRLLTKATVLPISSPETLSYALSVFTHIEEPNS
YIYNTIIRAYSTSPFPQLALIIFLKMLNSVNKVFPDRYTFTFIVKACATMENAKQGEQVH
GLVTKIGLEEDVYIYNTLVHMYAKCGCFGISRGMIDGLIEDDVIAWNALLSVYAERGLFE
LARELFDEMPVKNVESWNFMVSGYVNVGLVDEARKVFDEMLVKDVVSWNVMITGYTKADK
FNEVLTLFEDMLRAKVKPDDCTLVNVLSACAGVGSLSQGKWVHAFIERNGIEVHNFLATA
LVDMYCKCGCIEKGLEVFNGTLRKDISTWNAMIAGFSNHGYLDDALKTFNELIADGIKPN
EVTFVSVLSTCSQGGLLSEGRRMFELMINEYRIQPTLVHYGCMVDLLGRFGLLEEAEELV
SKLPVKEAPAIWESLLSASRSHNDVELAERIATKLLEVDPRDSAGYVQLSNVLASMGRWD
DVREVRRKMRSEGITKEPGCSMIEVDGVVHEFLAGEGIIL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400073059
Transcript Infomation

pacid=37426745 locus=PGSC0003DMG400028414 ID=PGSC0003DMT400073059.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGAATTCCATCTCCGAACTCCACCAAGCTCACGCTGTCATGCTCAAAACTGGTCTC
TTTCGTGACCCTTTTGCTGCTAGTCGCCTCTTGACTAAAGCCACTGTTCTTCCCATATCT
TCCCCTGAAACCCTTTCATATGCACTCTCTGTTTTCACTCACATTGAAGAACCCAACTCA
TATATCTACAACACAATCATCCGTGCTTATTCCACTAGCCCCTTTCCACAACTTGCACTC
ATTATCTTCCTCAAAATGTTAAACTCTGTAAATAAAGTTTTCCCAGATAGGTACACTTTT
ACATTCATTGTAAAAGCTTGTGCTACTATGGAAAATGCTAAACAAGGTGAACAAGTTCAT
GGGTTGGTGACAAAAATTGGACTTGAGGAAGATGTGTATATATACAACACTTTGGTTCAT
ATGTATGCGAAATGTGGGTGTTTTGGAATTTCGCGTGGTATGATTGATGGGTTGATTGAA
GATGATGTTATAGCGTGGAATGCATTGTTGAGTGTGTATGCGGAAAGGGGGTTGTTTGAA
TTGGCGCGTGAGTTGTTTGATGAAATGCCTGTGAAGAATGTGGAATCTTGGAATTTTATG
GTTTCTGGGTATGTGAATGTTGGGTTGGTGGATGAAGCAAGGAAGGTGTTTGATGAAATG
TTGGTGAAAGATGTTGTGTCTTGGAATGTTATGATTACTGGTTATACTAAGGCTGATAAG
TTTAATGAAGTTTTAACTCTTTTTGAGGATATGCTGAGAGCTAAAGTGAAGCCTGATGAT
TGTACACTTGTGAATGTGCTGTCTGCTTGTGCCGGTGTTGGATCTCTGAGCCAGGGAAAG
TGGGTTCATGCATTTATCGAGAGAAATGGGATTGAGGTTCACAATTTTCTTGCTACTGCT
CTTGTGGATATGTATTGCAAATGCGGATGTATTGAGAAAGGTTTAGAGGTGTTTAATGGT
ACTTTGAGAAAAGATATTAGTACTTGGAATGCAATGATTGCAGGGTTCAGCAACCATGGG
TATTTGGATGATGCATTAAAGACCTTCAATGAGCTCATTGCTGATGGTATCAAGCCAAAT
GAGGTTACTTTTGTAAGTGTTTTGTCTACTTGCAGTCAAGGGGGCTTATTAAGCGAGGGA
CGCAGGATGTTTGAACTCATGATTAATGAATATAGAATTCAGCCTACGCTTGTACATTAT
GGTTGTATGGTTGATTTACTTGGCCGGTTTGGATTATTAGAGGAGGCTGAAGAACTCGTA
AGCAAATTGCCTGTGAAAGAAGCTCCTGCTATTTGGGAGTCCCTCTTGAGTGCTTCCAGA
AGCCATAATGATGTCGAATTGGCAGAGCGCATCGCTACCAAACTTTTAGAGGTTGATCCT
CGCGACAGTGCTGGTTATGTTCAACTATCAAATGTCCTTGCATCTATGGGGAGATGGGAT
GATGTGAGGGAAGTGCGGAGAAAGATGAGGAGCGAGGGGATAACTAAAGAGCCCGGTTGT
AGTATGATTGAAGTTGATGGAGTTGTTCACGAGTTCTTGGCTGGTGAAGGGATAATACTG
TAA