Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400073048
CDS Infomation

pacid=37428795 polypeptide=PGSC0003DMP400049427 locus=PGSC0003DMG400028410 ID=PGSC0003DMT400073048.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAATATACACAACCAAATAAGCAAGACAACAACGGAGACTTATTCGATGATGCGGCG
GACGAATTCCCCTTCGATGATTGCAGCGACATATTTTCCGACGCCGAAACCGGCGGATCG
GAGGATGACGTAAACCACAATCAATCCGCGGAAAATTTCAATTTCCCGTCGTCTTCTCTC
CGGCACCGGCGACCTTTTTCTTTCAATGATTCTGGTAACGAGTCGACTAAATTTCAACCT
TCTATAAGTTCCGAGAGTTATTCGAATTCGAGAGAGCGAAAGATAAGGTTCTCAAGGAAA
TTGATGGCAGAAGATAAGGATAAGAACGGAAGTTTGGATAATATAGAAAGTTCAAACTCA
ATGCAGCTTGATTTGAGCACAAAAAGTCAAAAAGGTATAGGTGATGAACAAAATAAGGAG
ATTCCAACAGGTATGAATGCAAATAGTGTAATAATAGATAATTCGAATGAGGATTCTTCA
CTGGTGAAAGAGGATTCTGTAATTACGGATGTAAACAATGACCGAGTCAATAATTCGGAG
GAAGTTAATTCGCATTTGAGAGAAATTGATGATTCAAGTTCGAATATTTTGTTTGATTTA
GCAAATGTAGTAATAAAATCTGTTGGATTTCAAGTGAATATGTTGATAACTATTGTGAGT
TTGATGATAAAGTTGTTTACATTTCCTGTATGGATAATTTATAGCTCTTATATGTTTGTG
ATGGATCCATTTCAAATAATGAGGCGTGTGAAACGATATGTAATACACAGGTTTATGAGG
AGTTTTGGGTTTGTGTTTGAGAGTATGTTGAAATTTGTATCTGGATGGTTGAAGGAGCAG
AGTTCAGTATGGAGGTTGGGGCTACAATTTGGATGGGGATGTTTGTGGTCTGTGTATGTT
TGTTTTGTTTTGGTTGGATTGCTGGTATCAGCTTTTATAATGGGTGGCATCTTGATAAGA
ATTATGGTGGAAGAGCCAATCAGGATGAACGAGCCTTTGAATTTTGATTATACAGCAAAG
AGCCCAGTTGCATATGTGCCGATAATAAGGAGTCCAGGTGTGACCTGTGGTGTAGATAGT
CAAGTGGATGTTGGAATGGTTGATGGGGTGCGAGTTATCCCACCTAATCATAAGTTGCAG
GTTACTGTTTCACTAATGTTGCCCGAGTCAGATTACAACAGAAATTTGGGCATTTTTCAG
GTGCGGGTGGATTTCCTCAATTCTAATGGTAAAGTGCTATCTAGCGCCAGGCGACCCTGT
ATGTTGCAATTCAAAAGCAATCCTATACGCCTTTTTTCTACTTTCCTTAAAGCTGCCCCT
CTTGTCACTGGATATACATCAGAATCCCAAAAGTTAAAGGTAGACTTAAAGGGCTTCTCT
GAAGGTTTCATTCCAACTGCATGCTTGAGGGTGATCATTGAGCAACGAGCTGAATTCCAC
CCTGGAGGTGGAGTTCCCGAAATATATGCTGCCTCTTTAACACTGGAGTCTGAACTTCCT
TTTATGAAAAGAATGCTATGGTATTGGAAGACAACATTATTTGTGTGGGTTAGCATGACA
TTGTTTACAATGGAATTCCTTTTCGCTCTTCTTTGCTGCAAACCTCTTATCATTCCAAGA
TTACGATTGAGGCATGATCCGAACAGTCGTACAGGTTCACCGAACAATGCACCTATTGGA
AGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400049427
PEP Infomation

pacid=37428795 transcript=PGSC0003DMT400073048 locus=PGSC0003DMG400028410 ID=PGSC0003DMT400073048.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MEYTQPNKQDNNGDLFDDAADEFPFDDCSDIFSDAETGGSEDDVNHNQSAENFNFPSSSL
RHRRPFSFNDSGNESTKFQPSISSESYSNSRERKIRFSRKLMAEDKDKNGSLDNIESSNS
MQLDLSTKSQKGIGDEQNKEIPTGMNANSVIIDNSNEDSSLVKEDSVITDVNNDRVNNSE
EVNSHLREIDDSSSNILFDLANVVIKSVGFQVNMLITIVSLMIKLFTFPVWIIYSSYMFV
MDPFQIMRRVKRYVIHRFMRSFGFVFESMLKFVSGWLKEQSSVWRLGLQFGWGCLWSVYV
CFVLVGLLVSAFIMGGILIRIMVEEPIRMNEPLNFDYTAKSPVAYVPIIRSPGVTCGVDS
QVDVGMVDGVRVIPPNHKLQVTVSLMLPESDYNRNLGIFQVRVDFLNSNGKVLSSARRPC
MLQFKSNPIRLFSTFLKAAPLVTGYTSESQKLKVDLKGFSEGFIPTACLRVIIEQRAEFH
PGGGVPEIYAASLTLESELPFMKRMLWYWKTTLFVWVSMTLFTMEFLFALLCCKPLIIPR
LRLRHDPNSRTGSPNNAPIGR*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400073048
Transcript Infomation

pacid=37428795 locus=PGSC0003DMG400028410 ID=PGSC0003DMT400073048.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAATATACACAACCAAATAAGCAAGACAACAACGGAGACTTATTCGATGATGCGGCG
GACGAATTCCCCTTCGATGATTGCAGCGACATATTTTCCGACGCCGAAACCGGCGGATCG
GAGGATGACGTAAACCACAATCAATCCGCGGAAAATTTCAATTTCCCGTCGTCTTCTCTC
CGGCACCGGCGACCTTTTTCTTTCAATGATTCTGGTAACGAGTCGACTAAATTTCAACCT
TCTATAAGTTCCGAGAGTTATTCGAATTCGAGAGAGCGAAAGATAAGGTTCTCAAGGAAA
TTGATGGCAGAAGATAAGGATAAGAACGGAAGTTTGGATAATATAGAAAGTTCAAACTCA
ATGCAGCTTGATTTGAGCACAAAAAGTCAAAAAGGTATAGGTGATGAACAAAATAAGGAG
ATTCCAACAGGTATGAATGCAAATAGTGTAATAATAGATAATTCGAATGAGGATTCTTCA
CTGGTGAAAGAGGATTCTGTAATTACGGATGTAAACAATGACCGAGTCAATAATTCGGAG
GAAGTTAATTCGCATTTGAGAGAAATTGATGATTCAAGTTCGAATATTTTGTTTGATTTA
GCAAATGTAGTAATAAAATCTGTTGGATTTCAAGTGAATATGTTGATAACTATTGTGAGT
TTGATGATAAAGTTGTTTACATTTCCTGTATGGATAATTTATAGCTCTTATATGTTTGTG
ATGGATCCATTTCAAATAATGAGGCGTGTGAAACGATATGTAATACACAGGTTTATGAGG
AGTTTTGGGTTTGTGTTTGAGAGTATGTTGAAATTTGTATCTGGATGGTTGAAGGAGCAG
AGTTCAGTATGGAGGTTGGGGCTACAATTTGGATGGGGATGTTTGTGGTCTGTGTATGTT
TGTTTTGTTTTGGTTGGATTGCTGGTATCAGCTTTTATAATGGGTGGCATCTTGATAAGA
ATTATGGTGGAAGAGCCAATCAGGATGAACGAGCCTTTGAATTTTGATTATACAGCAAAG
AGCCCAGTTGCATATGTGCCGATAATAAGGAGTCCAGGTGTGACCTGTGGTGTAGATAGT
CAAGTGGATGTTGGAATGGTTGATGGGGTGCGAGTTATCCCACCTAATCATAAGTTGCAG
GTTACTGTTTCACTAATGTTGCCCGAGTCAGATTACAACAGAAATTTGGGCATTTTTCAG
GTGCGGGTGGATTTCCTCAATTCTAATGGTAAAGTGCTATCTAGCGCCAGGCGACCCTGT
ATGTTGCAATTCAAAAGCAATCCTATACGCCTTTTTTCTACTTTCCTTAAAGCTGCCCCT
CTTGTCACTGGATATACATCAGAATCCCAAAAGTTAAAGGTAGACTTAAAGGGCTTCTCT
GAAGGTTTCATTCCAACTGCATGCTTGAGGGTGATCATTGAGCAACGAGCTGAATTCCAC
CCTGGAGGTGGAGTTCCCGAAATATATGCTGCCTCTTTAACACTGGAGTCTGAACTTCCT
TTTATGAAAAGAATGCTATGGTATTGGAAGACAACATTATTTGTGTGGGTTAGCATGACA
TTGTTTACAATGGAATTCCTTTTCGCTCTTCTTTGCTGCAAACCTCTTATCATTCCAAGA
TTACGATTGAGGCATGATCCGAACAGTCGTACAGGTTCACCGAACAATGCACCTATTGGA
AGGTAG