Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400072625

CDS Infomation

pacid=37479087 polypeptide=PGSC0003DMP400049124 locus=PGSC0003DMG400028257 ID=PGSC0003DMT400072625.v4.03 annot-version=v4.03

Sequence

ATGAATCGGATTCATTTCTTTGTCCGTTTATTTTCTGGTGGAAAAACCCTAGTTGTTCAA
GCCGATTCCACCAATAGAGTGGAAGTAATTCACCAGAAAATCAGTTTGATCACCGGAATT
CCCATATCTGTCCAGAGCTTAATCTACAGGGGCAAACAGCTTCAATCAGACCAAATGATA
TCGGATTGTGGAATTGAAATGGAATCCAACTTGCAACTCGTTGGCCGATTGAGGAGCACA
AAGCATTCTCGCGCTTGGAAGCTCATGAATGAATTGTCTTCAATAATTTGGGGATTCTGC
AAAACCGAATTCCGTTCGGTTCGGTATGACAAGGATCATATAGAAGATGTGCTTATAGAG
ATTTTGATTATGATTCCTCATGACATTGATGAAGCCTCTGAATACCTCGAAATATTTATT
TCATCCTCTGTTCCAGCAGCTCTGGTAATGCTTTATATGTCTTCACGTCTAGACAATAAA
ACTCTTGCTGATAAATGTATTCGTCAAATTATAAATTCATTTAAGAGTGAGTCCCTTACA
CCAATGTATAGTACATGTGCTATCATGTTAGAATTTTGTAAGATTTTGAGAGAGGCTGGG
ATTGAAGATGATTTGTATATCTTTTGTCGGAGTAGTTTCTGTGATATCATAGAGCTCGTA
GGAATTGCGAGGTGCAAGGCTGATATGAAGAAGTTCATATCATTGCAGGATGTTTTACCA
TTTGTTCGTGAGATAGTTGCTCAATTACACCATAACTTAAATTTGACTATGGAATCAACT
GATTTGTCATTACCGTGTAGCCTTGTGCATGATTTTGCTGCTTTTATGCTTCCAGTGCGG
AATGCCATATTGTTTCAAGTACCATTTGACTTTACAATAACTTTTCCGTTGATGGAGAAT
GACACCGGTGAAGCAGAGTATTACAGAGAGAGTATTGAATGTTTACATTGTTCTTTCCAT
GGTTTGCTAGAAGCAACGTTGTTGTCTTTAGGGCTTTTGGAAACCCAGTTGGGCTTGAAA
GAGGAAGTAGAAGATGCGCGAGTTGTACAATGGTGGTCTTTGTATCTTACAATTCTAAAG
GAGTTAAACAATATATCAAAAGTGTATACGGGCCTGGAGAAAGTGTTTTGGCAAAAGATG
AGGCAAGTAAAGGCTTCATTGTGCTTTCTGGTAGTTAAGTTTGCAACTAAATCAGAAGAT
TATGGGTGGCTTTTCGAGCACAAGGAGGTAATGAGTTTTGAGGTACGGAGACATTTGGCA
ATAATGATGCTTCCAGAAGTTGGAGACGGCGGGGGGCTGTACTGCATGTTCATTGACAGG
TCTCGATTGCTGGAAAATTCGTTTGAGTACATTGGTAATGCCACTCCTAAGAATCTGCAA
GGTTGTTTGTTTATTAAATTCAAACATGAAGAAGCTACTGGGCCTGGTGTGTTGAGGGAG
TGGTTTTTATTGGTATGCCAAGCGATGTTCAACCCTCAGAATGCTCTCTTTGTTGCTTGC
CCAAATGATCGTAGAAGGTTTTTTCCAAATTCAGCATCTAAGGTTAATCCATTACACCTT
AATTACTTCTGCTTCTCTGGTAGGATGATTGCATTGACTTTAATGCATAAAGTACAAATC
GGTGTTGTGTTTGATCGCACTTTCTTTTTGCAATTGGCTGGGAAAGACATAACATTGGAA
GATGTTAGGGATGCGGATCCACCCTTTTACAAGAGCTGTAAGGAAATACTAGAAATGGAT
CCAGAGATGGTGGATGGAGATAATCTAGGCTTGAGGTTCATTTGTGATGTTGAGTCGATG
GGCTCTAGGAAAGGGATCGAGCTTTGTCCCAATGGGAAAGATACGATCGTGGACAGTAAG
AATCGGGAGAAATATATTAATCTTCTTATAAAACATTACTTTGTAACATCAGTTGCAGAG
CAGGTTGCGTGTTTTGCCAAAGGTTTTGCTGATATTACAACCACTTCAAGGCACCAGCCC
TTATTCCGGTGTCTTAATCTTGAGGATCTCGACTTAATGCTTGATGGTAGTGGAAATGAT
ATTTCTGTTGAAGATTGGAAAGCACATACGGATTACTCTGGCTACAAGAAAAGTGATCGT
CAAATATCCTGGTTCTGGAAGGTACATGATTCTTGTCTCTACTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400049124

PEP Infomation

pacid=37479087 transcript=PGSC0003DMT400072625 locus=PGSC0003DMG400028257 ID=PGSC0003DMT400072625.v4.03 annot-version=v4.03

Sequence

MNRIHFFVRLFSGGKTLVVQADSTNRVEVIHQKISLITGIPISVQSLIYRGKQLQSDQMI
SDCGIEMESNLQLVGRLRSTKHSRAWKLMNELSSIIWGFCKTEFRSVRYDKDHIEDVLIE
ILIMIPHDIDEASEYLEIFISSSVPAALVMLYMSSRLDNKTLADKCIRQIINSFKSESLT
PMYSTCAIMLEFCKILREAGIEDDLYIFCRSSFCDIIELVGIARCKADMKKFISLQDVLP
FVREIVAQLHHNLNLTMESTDLSLPCSLVHDFAAFMLPVRNAILFQVPFDFTITFPLMEN
DTGEAEYYRESIECLHCSFHGLLEATLLSLGLLETQLGLKEEVEDARVVQWWSLYLTILK
ELNNISKVYTGLEKVFWQKMRQVKASLCFLVVKFATKSEDYGWLFEHKEVMSFEVRRHLA
IMMLPEVGDGGGLYCMFIDRSRLLENSFEYIGNATPKNLQGCLFIKFKHEEATGPGVLRE
WFLLVCQAMFNPQNALFVACPNDRRRFFPNSASKVNPLHLNYFCFSGRMIALTLMHKVQI
GVVFDRTFFLQLAGKDITLEDVRDADPPFYKSCKEILEMDPEMVDGDNLGLRFICDVESM
GSRKGIELCPNGKDTIVDSKNREKYINLLIKHYFVTSVAEQVACFAKGFADITTTSRHQP
LFRCLNLEDLDLMLDGSGNDISVEDWKAHTDYSGYKKSDRQISWFWKVHDSCLY*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400072625

Transcript Infomation

pacid=37479087 locus=PGSC0003DMG400028257 ID=PGSC0003DMT400072625.v4.03 annot-version=v4.03

Sequence

ATGAATCGGATTCATTTCTTTGTCCGTTTATTTTCTGGTGGAAAAACCCTAGTTGTTCAA
GCCGATTCCACCAATAGAGTGGAAGTAATTCACCAGAAAATCAGTTTGATCACCGGAATT
CCCATATCTGTCCAGAGCTTAATCTACAGGGGCAAACAGCTTCAATCAGACCAAATGATA
TCGGATTGTGGAATTGAAATGGAATCCAACTTGCAACTCGTTGGCCGATTGAGGAGCACA
AAGCATTCTCGCGCTTGGAAGCTCATGAATGAATTGTCTTCAATAATTTGGGGATTCTGC
AAAACCGAATTCCGTTCGGTTCGGTATGACAAGGATCATATAGAAGATGTGCTTATAGAG
ATTTTGATTATGATTCCTCATGACATTGATGAAGCCTCTGAATACCTCGAAATATTTATT
TCATCCTCTGTTCCAGCAGCTCTGGTAATGCTTTATATGTCTTCACGTCTAGACAATAAA
ACTCTTGCTGATAAATGTATTCGTCAAATTATAAATTCATTTAAGAGTGAGTCCCTTACA
CCAATGTATAGTACATGTGCTATCATGTTAGAATTTTGTAAGATTTTGAGAGAGGCTGGG
ATTGAAGATGATTTGTATATCTTTTGTCGGAGTAGTTTCTGTGATATCATAGAGCTCGTA
GGAATTGCGAGGTGCAAGGCTGATATGAAGAAGTTCATATCATTGCAGGATGTTTTACCA
TTTGTTCGTGAGATAGTTGCTCAATTACACCATAACTTAAATTTGACTATGGAATCAACT
GATTTGTCATTACCGTGTAGCCTTGTGCATGATTTTGCTGCTTTTATGCTTCCAGTGCGG
AATGCCATATTGTTTCAAGTACCATTTGACTTTACAATAACTTTTCCGTTGATGGAGAAT
GACACCGGTGAAGCAGAGTATTACAGAGAGAGTATTGAATGTTTACATTGTTCTTTCCAT
GGTTTGCTAGAAGCAACGTTGTTGTCTTTAGGGCTTTTGGAAACCCAGTTGGGCTTGAAA
GAGGAAGTAGAAGATGCGCGAGTTGTACAATGGTGGTCTTTGTATCTTACAATTCTAAAG
GAGTTAAACAATATATCAAAAGTGTATACGGGCCTGGAGAAAGTGTTTTGGCAAAAGATG
AGGCAAGTAAAGGCTTCATTGTGCTTTCTGGTAGTTAAGTTTGCAACTAAATCAGAAGAT
TATGGGTGGCTTTTCGAGCACAAGGAGGTAATGAGTTTTGAGGTACGGAGACATTTGGCA
ATAATGATGCTTCCAGAAGTTGGAGACGGCGGGGGGCTGTACTGCATGTTCATTGACAGG
TCTCGATTGCTGGAAAATTCGTTTGAGTACATTGGTAATGCCACTCCTAAGAATCTGCAA
GGTTGTTTGTTTATTAAATTCAAACATGAAGAAGCTACTGGGCCTGGTGTGTTGAGGGAG
TGGTTTTTATTGGTATGCCAAGCGATGTTCAACCCTCAGAATGCTCTCTTTGTTGCTTGC
CCAAATGATCGTAGAAGGTTTTTTCCAAATTCAGCATCTAAGGTTAATCCATTACACCTT
AATTACTTCTGCTTCTCTGGTAGGATGATTGCATTGACTTTAATGCATAAAGTACAAATC
GGTGTTGTGTTTGATCGCACTTTCTTTTTGCAATTGGCTGGGAAAGACATAACATTGGAA
GATGTTAGGGATGCGGATCCACCCTTTTACAAGAGCTGTAAGGAAATACTAGAAATGGAT
CCAGAGATGGTGGATGGAGATAATCTAGGCTTGAGGTTCATTTGTGATGTTGAGTCGATG
GGCTCTAGGAAAGGGATCGAGCTTTGTCCCAATGGGAAAGATACGATCGTGGACAGTAAG
AATCGGGAGAAATATATTAATCTTCTTATAAAACATTACTTTGTAACATCAGTTGCAGAG
CAGGTTGCGTGTTTTGCCAAAGGTTTTGCTGATATTACAACCACTTCAAGGCACCAGCCC
TTATTCCGGTGTCTTAATCTTGAGGATCTCGACTTAATGCTTGATGGTAGTGGAAATGAT
ATTTCTGTTGAAGATTGGAAAGCACATACGGATTACTCTGGCTACAAGAAAAGTGATCGT
CAAATATCCTGGTTCTGGAAGGTACATGATTCTTGTCTCTACTAA