Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400072250
CDS Infomation

pacid=37480063 polypeptide=PGSC0003DMP400048847 locus=PGSC0003DMG400028117 ID=PGSC0003DMT400072250.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATAACAGTGTGCAAGAGAGGCTACTTGATTCACAAATAGAAAAAGTTGATGAAAAC
TTAAAAGAGAGGATCTACGACGAGACTAAGAAGATATGGAGAGTTGCATTACCCGGAATA
CTGTCAAGAGTAGCTTCATTTGGAAGTATAGTGGTCACACAATCATTCATCGGACACATT
AGTGAATTAGATCTCGCTGCTTATGCACTTGTACAAACTCTCACTGTGCGATTCGTCAAT
GGTATACTGATTGGAATGTCAAGCGCCACTGAAACTCTTTGTGGGCAATCATATGGAGCA
GGACAGTATCATATGATGGGAATCTACTTGCAAAGATCATGGATTGTTGGTTTGATTACA
TTGACAGTATTGCTTCCGTTTTTCGTCTTAGCCACTCCAATCTTTAAGCTACTCGGTGAG
AATGGATCAATCGCGGATGCTGCTGGATACGTTTCCTACTGGTTCATTCCCTTCATCTAC
AACTTTGTATTTAGCTTGACGATCCAGATGTACCTTCAAGCACAACAAAAGAACATGATT
ATAGCATGGCTATCTGTAATACAATTTGTGATCCACATTCCGTTGTCTTGGCTACTGGTT
ATCCAGCTAAATTATGGAGTTCCTGGTGCCATGATAGCGTTGAGCATATCCTCCTGGTTC
GTAGTAGTCGGGGAGTTTGTATACATCTTAGGAGGTTGGTGTCCTAACACATGGAATGGA
TTCTCCTTAGCAGCACTGAAAGATGTACTACCCGTCATGAAGCTCTCAATATCCTCTGGT
GTCATGGTTTGCTTAGAGCTATGGTACAATGCTGTTCTAGTCCTGCTGGCAGGATATATG
AAGAATGCAGAGGTTGCTATATCTGCCTTCTCTATTTGCCTCAATATCAATGGATGGGAG
TTTATGATAAGTCTCGGCTTCCTTGGAGCTGCTTGTGTCCGGATTGCAAATGAACTCGGG
AAAGGAGATGCTAAGGCTGTAAAATTCTCCATTAAAGTCTTAGTGAGCACTTCACTTATT
ATCGGACTGTTCTTCTGGGCTGTGTGCTTGATCTTTGGCAGAAATCTCGGATACTTATTC
AGTGATGAGAAGGCGGTCACTGACAGCGTGGCTGACCTTTCTACTTTACTCGCTTTCTCG
ATTTTGCTCAATAGCATTTACCCTGTACTCTCAGGTGTGGCTGTAGGAGCTGGTTTACAA
AGCACAGTTGCAATTATAAATTTGTGTTGCTTCTATTTGATTGGAGTACCAATTGGAGCT
TTGCTTGGATATGTAGCTCATCTTCAAGTGAAGGGTATATGGATTGGAATGATATGTGGA
ATTGTTACTCAATCAGCTGCATTATGCTACATGACATGGAAAACAGATTGGGATGGAGAG
GTATCAAAAGCCAAACAAAGACTTAATCGATGGTACTTGAAATCTTCTGAAGAGTCTAAT
CAAAATGATCAAGCTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400048847
PEP Infomation

pacid=37480063 transcript=PGSC0003DMT400072250 locus=PGSC0003DMG400028117 ID=PGSC0003DMT400072250.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MDNSVQERLLDSQIEKVDENLKERIYDETKKIWRVALPGILSRVASFGSIVVTQSFIGHI
SELDLAAYALVQTLTVRFVNGILIGMSSATETLCGQSYGAGQYHMMGIYLQRSWIVGLIT
LTVLLPFFVLATPIFKLLGENGSIADAAGYVSYWFIPFIYNFVFSLTIQMYLQAQQKNMI
IAWLSVIQFVIHIPLSWLLVIQLNYGVPGAMIALSISSWFVVVGEFVYILGGWCPNTWNG
FSLAALKDVLPVMKLSISSGVMVCLELWYNAVLVLLAGYMKNAEVAISAFSICLNINGWE
FMISLGFLGAACVRIANELGKGDAKAVKFSIKVLVSTSLIIGLFFWAVCLIFGRNLGYLF
SDEKAVTDSVADLSTLLAFSILLNSIYPVLSGVAVGAGLQSTVAIINLCCFYLIGVPIGA
LLGYVAHLQVKGIWIGMICGIVTQSAALCYMTWKTDWDGEVSKAKQRLNRWYLKSSEESN
QNDQA*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400072250
Transcript Infomation

pacid=37480063 locus=PGSC0003DMG400028117 ID=PGSC0003DMT400072250.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATAACAGTGTGCAAGAGAGGCTACTTGATTCACAAATAGAAAAAGTTGATGAAAAC
TTAAAAGAGAGGATCTACGACGAGACTAAGAAGATATGGAGAGTTGCATTACCCGGAATA
CTGTCAAGAGTAGCTTCATTTGGAAGTATAGTGGTCACACAATCATTCATCGGACACATT
AGTGAATTAGATCTCGCTGCTTATGCACTTGTACAAACTCTCACTGTGCGATTCGTCAAT
GGTATACTGATTGGAATGTCAAGCGCCACTGAAACTCTTTGTGGGCAATCATATGGAGCA
GGACAGTATCATATGATGGGAATCTACTTGCAAAGATCATGGATTGTTGGTTTGATTACA
TTGACAGTATTGCTTCCGTTTTTCGTCTTAGCCACTCCAATCTTTAAGCTACTCGGTGAG
AATGGATCAATCGCGGATGCTGCTGGATACGTTTCCTACTGGTTCATTCCCTTCATCTAC
AACTTTGTATTTAGCTTGACGATCCAGATGTACCTTCAAGCACAACAAAAGAACATGATT
ATAGCATGGCTATCTGTAATACAATTTGTGATCCACATTCCGTTGTCTTGGCTACTGGTT
ATCCAGCTAAATTATGGAGTTCCTGGTGCCATGATAGCGTTGAGCATATCCTCCTGGTTC
GTAGTAGTCGGGGAGTTTGTATACATCTTAGGAGGTTGGTGTCCTAACACATGGAATGGA
TTCTCCTTAGCAGCACTGAAAGATGTACTACCCGTCATGAAGCTCTCAATATCCTCTGGT
GTCATGGTTTGCTTAGAGCTATGGTACAATGCTGTTCTAGTCCTGCTGGCAGGATATATG
AAGAATGCAGAGGTTGCTATATCTGCCTTCTCTATTTGCCTCAATATCAATGGATGGGAG
TTTATGATAAGTCTCGGCTTCCTTGGAGCTGCTTGTGTCCGGATTGCAAATGAACTCGGG
AAAGGAGATGCTAAGGCTGTAAAATTCTCCATTAAAGTCTTAGTGAGCACTTCACTTATT
ATCGGACTGTTCTTCTGGGCTGTGTGCTTGATCTTTGGCAGAAATCTCGGATACTTATTC
AGTGATGAGAAGGCGGTCACTGACAGCGTGGCTGACCTTTCTACTTTACTCGCTTTCTCG
ATTTTGCTCAATAGCATTTACCCTGTACTCTCAGGTGTGGCTGTAGGAGCTGGTTTACAA
AGCACAGTTGCAATTATAAATTTGTGTTGCTTCTATTTGATTGGAGTACCAATTGGAGCT
TTGCTTGGATATGTAGCTCATCTTCAAGTGAAGGGTATATGGATTGGAATGATATGTGGA
ATTGTTACTCAATCAGCTGCATTATGCTACATGACATGGAAAACAGATTGGGATGGAGAG
GTATCAAAAGCCAAACAAAGACTTAATCGATGGTACTTGAAATCTTCTGAAGAGTCTAAT
CAAAATGATCAAGCTTAA