Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400071807
CDS Infomation

pacid=37434836 polypeptide=PGSC0003DMP400048567 locus=PGSC0003DMG400027936 ID=PGSC0003DMT400071807.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGGGAAACGATTGGATTAACAGTTACTTAGAGGCAATACTGGATGTAGGACCAGGG
CTAGATGATAAGAAGTCATCGTTGTTGTTGAGAGAAAGAGGGAGGTTTAGTCCGACGAGG
TACTTTGTTGAGGAAGTTATTACTGGATTCGATGAGACTGATTTGCATCGTTCGTGGATC
CGAGCACAAGCTACTCGGAGTCCGCAGGAGAGGAATACTAGGCTGGAGAATATGTGCTGG
AGGATTTGGAATTTGGCTCGCCAGAAAAAGCAGCTTGAGGGAGAGCAAGCTCAGTGGATG
GCAAAACGCCGTCAAGAACGTGAGAGAGGTCGCAGAGAAGCAGTTGCTGATATGTCAGAG
GATCTATCTGAGGGAGAGAAAGGAGATATAGTCGCTGACATGTCATCTCATGGTGAAAGT
ACCAGAGGCCGATTGCCTAGAATCAGTTCTGTCGAGACAATGGAAGCATGGGTCAGTCAG
CAGAGAGGAAAGAAGCTTTATATCGTGCTTATAAGTTTACATGGTTTAATTCGGGGTGAG
AATATGGAGCTTGGACGGGATTCTGATACTGGTGGTCAGGTGAAGTATGTTGTTGAACTT
GCGAGGGCCTTAGGGTCGATGCCAGGTGTATATCGGGTTGACTTGCTTACTAGACAAGTA
TCTTCACCAGAAGTAGATTGGAGCTATGGTGAGCCGACAGAGATGCTGACACCAATAAGT
ACAGACGGCTTGATGACTGAGATGGGGGAGAGTAGTGGTGCTTATATTATTCGCATTCCT
TTTGGACCAAGAGAGAAATATATTCCAAAAGAACAGCTATGGCCCTATATTCCCGAATTT
GTTGATGGTGCACTTAACCATATTATTCAAATGTCCAAAGTTCTTGGTGAGCAAATTGGT
AGTGGCTATCCTGTGTGGCCTGTTGCCATACATGGACATTATGCTGATGCTGGCGACTCA
GCTGCTCTCCTGTCGGGTGCTTTAAATGTACCAATGCTTTTCACTGGTCACTCGCTTGGT
AGAGATAAGTTGGAGCAACTGTTGCGACAAGGTCGTTTGTCAAAGGATGAAATAAACTCA
ACGTACAAGATAATGCGGAGAATAGAGGCTGAAGAATTAACTCTTGATGCTTCCGAAATT
GTCATCACTAGTACAAGACAGGAGATTGACGAGCAATGGCGTTTGTATGATGGGTTTGAT
CCAATATTAGAGCGTAAGTTACGTGCAAGGATAAAGCGCAATGTCAGCTGTTATGGCAGG
TTTATGCCTCGTATGGCTGTAATTCCTCCTGGGATGGAGTTTCACCATATTGTGCCACAT
GAAGGTGACATGGATGGTGAAACAGAAGGAAGTGAAGATGGAAAGACCCCGGATCCACCT
ATTTGGGCAGAGATTATGCGCTTCTTTTCTAATCCAAGGAAGCCTATGATACTCGCACTT
GCTAGGCCTGATCCCAAGAAGAACCTCACTACTTTAGTGAAAGCATTTGGTGAATGTCGT
CCATTGAGAGAGCTTGCTAATCTTACTTTGATAATGGGTAATCGAGATAATATCGACGAA
ATGTCTAGCACCAATTCTGCACTTCTTCTTTCAATCTTGAAGATGATAGATAAGTATGAT
CTTTATGGTCAAGTAGCTTATCCTAAACACCACAAGCAGTCAGATGTTCCTGATATCTAC
CGTCTTGCTGCAAAGACTAAGGGTGTTTTTATTAATCCAGCTTTTATTGAGCCTTTTGGA
CTGACTTTGATTGAGGCAGCAGCTTATGGTCTCCCAATGGTAGCCACAAAAAATGGAGGA
CCTGTTGATATACATAGGGTTCTTGACAATGGTCTCTTAGTGGATCCCCATGATCAGCAG
GCAATTGCTGATGCTCTTTTGAAGTTGGTTGCTGATAAGCAACTGTGGGCTAAATGCAGG
GCAAATGGATTAAAAAATATCCACCTTTTCTCATGGCCCGAGCACTGTAAAACTTATCTA
TCCCGGATAGCTAGCTGCAAACCAAGGCAACCACGCTGGCTGAGATCCAATGATGATGAT
GATGAAAATTCAGAAACAGATTCACCTAGTGATTCCTTGAGAGATATTCATGATATATCT
CTGAATTTGAGATTTTCATTAGATGGGGAAAAGAATGACAATAAAGAAAATGCTGATAAT
ACATTAGACCCCGAAGTTCGAAGGAGCAAGTTAGAGAATGCTGTTTTGTCCTTATCTAAG
GGTGCACTGAAGAGCACATCAAAATCTTGGTCGTCAGACAAGGCAGACCAAAACCCTGGT
GCTGGTAAATTCCCAGCGATTAGGAGGAGGCGACATATTTTTGTTATTGCAGTGGATAGT
GATGCTAGCTCAGGACTCTCTGGAAGTGTGAAAAAGATATTTGAGGCTGTAGAGAAGGAA
AGGGCAGAAGGTTCCATTGGATTTATCCTGGCTACATCTTTCAATATATCAGAAGTACAG
TCTTTCCTGCTTTCAGAGGGCATGAATCCTACTGATTTTGATGCTTACATATGCAATAGT
GGTGGTGATCTTTATTATTCGTCCTTCCATTCTGAGCAAAATCCTTTTGTAGTTGACTTG
TACTATCACTCACATATTGAGTATCGTTGGGGGGGCGAAGGGTTGAGAAAGACTTTGGTG
CGTTGGGCCGCCTCTATCATTGATAAGAATGGTGAAAATGGAGATCACATTGTTGTTGAG
GATGAAGACAATTCAGCTGACTACTGCTATACTTTCAAAGTCTGCAAGCCTGGGACGGTT
CCTCCAGCTAAAGAGCTTAGAAAAGTAATGCGAATTCAGGCACTTCGTTGTCACGCTGTT
TATTGTCAAAATGGGAGTAGGATTAATGTGATCCCTGTACTGGCATCTCGGTCCCAAGCA
CTCAGGTACTTATATCTGCGATGGGGAATGGACTTGTCGAAGTTGGTGGTTTTCGTCGGA
GAAAGTGGTGATACTGATTATGAAGGATTGATCGGTGGTCTACGCAAGGCTGTCATAATG
AAAGGACTCTGCACTAATGCAAGCAGCTTAATTCACGGTAATAGGAATTACCCGCTATCT
GATGTTTTACCATTCGACAGCCCTAATGTCATCCAAGCGGACGAGGAATGTAGCAGCACC
GAAATCCGTAGCTTACTGGTGAAACTAGCGGTACTCAAAGGATAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400048567
PEP Infomation

pacid=37434836 transcript=PGSC0003DMT400071807 locus=PGSC0003DMG400027936 ID=PGSC0003DMT400071807.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAGNDWINSYLEAILDVGPGLDDKKSSLLLRERGRFSPTRYFVEEVITGFDETDLHRSWI
RAQATRSPQERNTRLENMCWRIWNLARQKKQLEGEQAQWMAKRRQERERGRREAVADMSE
DLSEGEKGDIVADMSSHGESTRGRLPRISSVETMEAWVSQQRGKKLYIVLISLHGLIRGE
NMELGRDSDTGGQVKYVVELARALGSMPGVYRVDLLTRQVSSPEVDWSYGEPTEMLTPIS
TDGLMTEMGESSGAYIIRIPFGPREKYIPKEQLWPYIPEFVDGALNHIIQMSKVLGEQIG
SGYPVWPVAIHGHYADAGDSAALLSGALNVPMLFTGHSLGRDKLEQLLRQGRLSKDEINS
TYKIMRRIEAEELTLDASEIVITSTRQEIDEQWRLYDGFDPILERKLRARIKRNVSCYGR
FMPRMAVIPPGMEFHHIVPHEGDMDGETEGSEDGKTPDPPIWAEIMRFFSNPRKPMILAL
ARPDPKKNLTTLVKAFGECRPLRELANLTLIMGNRDNIDEMSSTNSALLLSILKMIDKYD
LYGQVAYPKHHKQSDVPDIYRLAAKTKGVFINPAFIEPFGLTLIEAAAYGLPMVATKNGG
PVDIHRVLDNGLLVDPHDQQAIADALLKLVADKQLWAKCRANGLKNIHLFSWPEHCKTYL
SRIASCKPRQPRWLRSNDDDDENSETDSPSDSLRDIHDISLNLRFSLDGEKNDNKENADN
TLDPEVRRSKLENAVLSLSKGALKSTSKSWSSDKADQNPGAGKFPAIRRRRHIFVIAVDS
DASSGLSGSVKKIFEAVEKERAEGSIGFILATSFNISEVQSFLLSEGMNPTDFDAYICNS
GGDLYYSSFHSEQNPFVVDLYYHSHIEYRWGGEGLRKTLVRWAASIIDKNGENGDHIVVE
DEDNSADYCYTFKVCKPGTVPPAKELRKVMRIQALRCHAVYCQNGSRINVIPVLASRSQA
LRYLYLRWGMDLSKLVVFVGESGDTDYEGLIGGLRKAVIMKGLCTNASSLIHGNRNYPLS
DVLPFDSPNVIQADEECSSTEIRSLLVKLAVLKG*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400071807
Transcript Infomation

pacid=37434836 locus=PGSC0003DMG400027936 ID=PGSC0003DMT400071807.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGGGAAACGATTGGATTAACAGTTACTTAGAGGCAATACTGGATGTAGGACCAGGG
CTAGATGATAAGAAGTCATCGTTGTTGTTGAGAGAAAGAGGGAGGTTTAGTCCGACGAGG
TACTTTGTTGAGGAAGTTATTACTGGATTCGATGAGACTGATTTGCATCGTTCGTGGATC
CGAGCACAAGCTACTCGGAGTCCGCAGGAGAGGAATACTAGGCTGGAGAATATGTGCTGG
AGGATTTGGAATTTGGCTCGCCAGAAAAAGCAGCTTGAGGGAGAGCAAGCTCAGTGGATG
GCAAAACGCCGTCAAGAACGTGAGAGAGGTCGCAGAGAAGCAGTTGCTGATATGTCAGAG
GATCTATCTGAGGGAGAGAAAGGAGATATAGTCGCTGACATGTCATCTCATGGTGAAAGT
ACCAGAGGCCGATTGCCTAGAATCAGTTCTGTCGAGACAATGGAAGCATGGGTCAGTCAG
CAGAGAGGAAAGAAGCTTTATATCGTGCTTATAAGTTTACATGGTTTAATTCGGGGTGAG
AATATGGAGCTTGGACGGGATTCTGATACTGGTGGTCAGGTGAAGTATGTTGTTGAACTT
GCGAGGGCCTTAGGGTCGATGCCAGGTGTATATCGGGTTGACTTGCTTACTAGACAAGTA
TCTTCACCAGAAGTAGATTGGAGCTATGGTGAGCCGACAGAGATGCTGACACCAATAAGT
ACAGACGGCTTGATGACTGAGATGGGGGAGAGTAGTGGTGCTTATATTATTCGCATTCCT
TTTGGACCAAGAGAGAAATATATTCCAAAAGAACAGCTATGGCCCTATATTCCCGAATTT
GTTGATGGTGCACTTAACCATATTATTCAAATGTCCAAAGTTCTTGGTGAGCAAATTGGT
AGTGGCTATCCTGTGTGGCCTGTTGCCATACATGGACATTATGCTGATGCTGGCGACTCA
GCTGCTCTCCTGTCGGGTGCTTTAAATGTACCAATGCTTTTCACTGGTCACTCGCTTGGT
AGAGATAAGTTGGAGCAACTGTTGCGACAAGGTCGTTTGTCAAAGGATGAAATAAACTCA
ACGTACAAGATAATGCGGAGAATAGAGGCTGAAGAATTAACTCTTGATGCTTCCGAAATT
GTCATCACTAGTACAAGACAGGAGATTGACGAGCAATGGCGTTTGTATGATGGGTTTGAT
CCAATATTAGAGCGTAAGTTACGTGCAAGGATAAAGCGCAATGTCAGCTGTTATGGCAGG
TTTATGCCTCGTATGGCTGTAATTCCTCCTGGGATGGAGTTTCACCATATTGTGCCACAT
GAAGGTGACATGGATGGTGAAACAGAAGGAAGTGAAGATGGAAAGACCCCGGATCCACCT
ATTTGGGCAGAGATTATGCGCTTCTTTTCTAATCCAAGGAAGCCTATGATACTCGCACTT
GCTAGGCCTGATCCCAAGAAGAACCTCACTACTTTAGTGAAAGCATTTGGTGAATGTCGT
CCATTGAGAGAGCTTGCTAATCTTACTTTGATAATGGGTAATCGAGATAATATCGACGAA
ATGTCTAGCACCAATTCTGCACTTCTTCTTTCAATCTTGAAGATGATAGATAAGTATGAT
CTTTATGGTCAAGTAGCTTATCCTAAACACCACAAGCAGTCAGATGTTCCTGATATCTAC
CGTCTTGCTGCAAAGACTAAGGGTGTTTTTATTAATCCAGCTTTTATTGAGCCTTTTGGA
CTGACTTTGATTGAGGCAGCAGCTTATGGTCTCCCAATGGTAGCCACAAAAAATGGAGGA
CCTGTTGATATACATAGGGTTCTTGACAATGGTCTCTTAGTGGATCCCCATGATCAGCAG
GCAATTGCTGATGCTCTTTTGAAGTTGGTTGCTGATAAGCAACTGTGGGCTAAATGCAGG
GCAAATGGATTAAAAAATATCCACCTTTTCTCATGGCCCGAGCACTGTAAAACTTATCTA
TCCCGGATAGCTAGCTGCAAACCAAGGCAACCACGCTGGCTGAGATCCAATGATGATGAT
GATGAAAATTCAGAAACAGATTCACCTAGTGATTCCTTGAGAGATATTCATGATATATCT
CTGAATTTGAGATTTTCATTAGATGGGGAAAAGAATGACAATAAAGAAAATGCTGATAAT
ACATTAGACCCCGAAGTTCGAAGGAGCAAGTTAGAGAATGCTGTTTTGTCCTTATCTAAG
GGTGCACTGAAGAGCACATCAAAATCTTGGTCGTCAGACAAGGCAGACCAAAACCCTGGT
GCTGGTAAATTCCCAGCGATTAGGAGGAGGCGACATATTTTTGTTATTGCAGTGGATAGT
GATGCTAGCTCAGGACTCTCTGGAAGTGTGAAAAAGATATTTGAGGCTGTAGAGAAGGAA
AGGGCAGAAGGTTCCATTGGATTTATCCTGGCTACATCTTTCAATATATCAGAAGTACAG
TCTTTCCTGCTTTCAGAGGGCATGAATCCTACTGATTTTGATGCTTACATATGCAATAGT
GGTGGTGATCTTTATTATTCGTCCTTCCATTCTGAGCAAAATCCTTTTGTAGTTGACTTG
TACTATCACTCACATATTGAGTATCGTTGGGGGGGCGAAGGGTTGAGAAAGACTTTGGTG
CGTTGGGCCGCCTCTATCATTGATAAGAATGGTGAAAATGGAGATCACATTGTTGTTGAG
GATGAAGACAATTCAGCTGACTACTGCTATACTTTCAAAGTCTGCAAGCCTGGGACGGTT
CCTCCAGCTAAAGAGCTTAGAAAAGTAATGCGAATTCAGGCACTTCGTTGTCACGCTGTT
TATTGTCAAAATGGGAGTAGGATTAATGTGATCCCTGTACTGGCATCTCGGTCCCAAGCA
CTCAGGTACTTATATCTGCGATGGGGAATGGACTTGTCGAAGTTGGTGGTTTTCGTCGGA
GAAAGTGGTGATACTGATTATGAAGGATTGATCGGTGGTCTACGCAAGGCTGTCATAATG
AAAGGACTCTGCACTAATGCAAGCAGCTTAATTCACGGTAATAGGAATTACCCGCTATCT
GATGTTTTACCATTCGACAGCCCTAATGTCATCCAAGCGGACGAGGAATGTAGCAGCACC
GAAATCCGTAGCTTACTGGTGAAACTAGCGGTACTCAAAGGATAA