Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400071681
CDS Infomation

pacid=37431306 polypeptide=PGSC0003DMP400048490 locus=PGSC0003DMG400027885 ID=PGSC0003DMT400071681.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAAACACAGAATCGGTTTTACTGTCGAAAACGGTCCAGGTGTCGTGGAATTTTCAAT
GGGCTCTGTTTGTCTGTATTGGTTGTTTTCTTTTTCCGTCGAGAAGATGTTGTTCAAAGT
CCACTTTCTAAGAAACTTTTCAAAATTAGTGCTGTTAGAAAGGAAACGAGTTTGAGTTAT
CATCATTTGGGTGAAAGCAGCAGGGATATCAAGCTCTGTGCAGGGTTGTATAAACATCAA
GGTTACAGTACAAAATGTGACTACTTGAAGGCAAATCCTCAATGTAATTCAGGGGGTTTC
TTCAATTATCTTTTCTTCTTTTACTGTAACTGTGAAGGTTTTAGTATTTTTGGATATGTG
ACTCTTGCTATTTGGTTGATTTCTTTGTTCTATCTGTTGGGGAATACGGCTGCTGATTAC
TTCTGTTGTTGTCTTGAAAAGCTATCCAATTTGTTGAAATTGCCCCCAACTGTAGCAGGA
GTTACTCTGCTTCCTTTAGGGAATGGGGCGCCTGATGTGTTTGCTAGTATTGCTGCTTTT
ATGGGCAGTGATTCTGGGGAGGTGGGGTTGAATAGTGTTCTTGGTGGTGCTGTTTTTGTT
ACATGTGTTGTAGTTGGTACTGTTTCCTTGTGTGTTGCAGAACAATGTATACAGATTGAT
AAGAAGTGCTTTATTAGGGATGTGTGTTTCTTTATTATAGTTCTCGTTTCACTTCTTACT
CTTTTGAGTCTAGGCAAGGTGGCGGTTTTAGGTGCTGTTGCCTTTATCTCTATTTATTTG
GTGTATGCTGGTTTTGTTGCTGCAAATGAGATGCTTAGGGATCGCAATTGTAGTTTGAAG
TTGGATTTAATTGCTCCGTTGTTACCAGTTACATCGAGTAGCATAGATGGAGAGAGTGAT
TCTTCTTTAGGTGGGTTGGAATCAGCTGATGGATTGCTGCAGCTACAAGCTCAGCTGCCA
CATTGGATGTGGTCTTCAAATGTGGCAATCTTCTCTGATGAAGTTGTGAAGGATAATTCC
GTAGAAAGTAGTCCAATGGATTTGTGGGGTTGGAATGAACAGGATGATGTCGATGACCAG
TCTTCTTCCCTATCCTGTTCTAAGTTGTTTGCACTGCTAGAAATACCATTGACACTCCCA
AGAAGGTTAACGATCCCCATTGTTGATGAGGACAGATGGTCAAAACTGTATGCTGTTTCT
AGTGCTTCTTTGGCGCCCTTGCTTTTAGCATTCCTTTGGAACACTCAGGACAATTTGAGT
TGCCCTGCTACCACTGCATATGTTGTTGGTGCTGTAGTTGGTGGTATATTTGGAGGTGTT
GCATTTGTCTATACCTCAGCCGATCACCCACCGAAAAGATTCTTGTTTCCATGGCTCTTG
GGAGGCTTCTTTATGAGTATCATTTGGTTTTATATCGTGGCAAACGAGCTAGTGGCTCTG
CTAGTGGCATTTGGTGTGATCTTTGGTGTCAATCCATCAATTCTTGCGTTAACCGTCTTG
GCATGGGGAAACTCTATGGGTGACTTAATGTCAAATGTTGCAATAGCAAGTAATAGTGCA
GATGGTGTGCAGATTGCCATGTCAGGATGTTATGCAGGTCCTATGTTCAACACCCTTGCT
GGTTTAGGCATCTCCATGCTCCTTGGAGCCTTGTCGAGTAGGCCAGAATCTTATATCCTT
CCAAGAGATAATAGCTTGTATTACACAATGGGATTTCTAATGTTAGCCCTGGTTTGGGCA
CTCATTGTACTACCTCGGAATGATATGCGGCCTAGCAAGTCGTTGGGATTGGGACTTATG
ACCATATATGTAGTTTTTCTATCAAGCAGGGCAATGCTTGCCATGGGAGATGGTTCACTT
CATGGTATGAGCTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400048490
PEP Infomation

pacid=37431306 transcript=PGSC0003DMT400071681 locus=PGSC0003DMG400027885 ID=PGSC0003DMT400071681.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

METQNRFYCRKRSRCRGIFNGLCLSVLVVFFFRREDVVQSPLSKKLFKISAVRKETSLSY
HHLGESSRDIKLCAGLYKHQGYSTKCDYLKANPQCNSGGFFNYLFFFYCNCEGFSIFGYV
TLAIWLISLFYLLGNTAADYFCCCLEKLSNLLKLPPTVAGVTLLPLGNGAPDVFASIAAF
MGSDSGEVGLNSVLGGAVFVTCVVVGTVSLCVAEQCIQIDKKCFIRDVCFFIIVLVSLLT
LLSLGKVAVLGAVAFISIYLVYAGFVAANEMLRDRNCSLKLDLIAPLLPVTSSSIDGESD
SSLGGLESADGLLQLQAQLPHWMWSSNVAIFSDEVVKDNSVESSPMDLWGWNEQDDVDDQ
SSSLSCSKLFALLEIPLTLPRRLTIPIVDEDRWSKLYAVSSASLAPLLLAFLWNTQDNLS
CPATTAYVVGAVVGGIFGGVAFVYTSADHPPKRFLFPWLLGGFFMSIIWFYIVANELVAL
LVAFGVIFGVNPSILALTVLAWGNSMGDLMSNVAIASNSADGVQIAMSGCYAGPMFNTLA
GLGISMLLGALSSRPESYILPRDNSLYYTMGFLMLALVWALIVLPRNDMRPSKSLGLGLM
TIYVVFLSSRAMLAMGDGSLHGMS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400071681
Transcript Infomation

pacid=37431306 locus=PGSC0003DMG400027885 ID=PGSC0003DMT400071681.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAAACACAGAATCGGTTTTACTGTCGAAAACGGTCCAGGTGTCGTGGAATTTTCAAT
GGGCTCTGTTTGTCTGTATTGGTTGTTTTCTTTTTCCGTCGAGAAGATGTTGTTCAAAGT
CCACTTTCTAAGAAACTTTTCAAAATTAGTGCTGTTAGAAAGGAAACGAGTTTGAGTTAT
CATCATTTGGGTGAAAGCAGCAGGGATATCAAGCTCTGTGCAGGGTTGTATAAACATCAA
GGTTACAGTACAAAATGTGACTACTTGAAGGCAAATCCTCAATGTAATTCAGGGGGTTTC
TTCAATTATCTTTTCTTCTTTTACTGTAACTGTGAAGGTTTTAGTATTTTTGGATATGTG
ACTCTTGCTATTTGGTTGATTTCTTTGTTCTATCTGTTGGGGAATACGGCTGCTGATTAC
TTCTGTTGTTGTCTTGAAAAGCTATCCAATTTGTTGAAATTGCCCCCAACTGTAGCAGGA
GTTACTCTGCTTCCTTTAGGGAATGGGGCGCCTGATGTGTTTGCTAGTATTGCTGCTTTT
ATGGGCAGTGATTCTGGGGAGGTGGGGTTGAATAGTGTTCTTGGTGGTGCTGTTTTTGTT
ACATGTGTTGTAGTTGGTACTGTTTCCTTGTGTGTTGCAGAACAATGTATACAGATTGAT
AAGAAGTGCTTTATTAGGGATGTGTGTTTCTTTATTATAGTTCTCGTTTCACTTCTTACT
CTTTTGAGTCTAGGCAAGGTGGCGGTTTTAGGTGCTGTTGCCTTTATCTCTATTTATTTG
GTGTATGCTGGTTTTGTTGCTGCAAATGAGATGCTTAGGGATCGCAATTGTAGTTTGAAG
TTGGATTTAATTGCTCCGTTGTTACCAGTTACATCGAGTAGCATAGATGGAGAGAGTGAT
TCTTCTTTAGGTGGGTTGGAATCAGCTGATGGATTGCTGCAGCTACAAGCTCAGCTGCCA
CATTGGATGTGGTCTTCAAATGTGGCAATCTTCTCTGATGAAGTTGTGAAGGATAATTCC
GTAGAAAGTAGTCCAATGGATTTGTGGGGTTGGAATGAACAGGATGATGTCGATGACCAG
TCTTCTTCCCTATCCTGTTCTAAGTTGTTTGCACTGCTAGAAATACCATTGACACTCCCA
AGAAGGTTAACGATCCCCATTGTTGATGAGGACAGATGGTCAAAACTGTATGCTGTTTCT
AGTGCTTCTTTGGCGCCCTTGCTTTTAGCATTCCTTTGGAACACTCAGGACAATTTGAGT
TGCCCTGCTACCACTGCATATGTTGTTGGTGCTGTAGTTGGTGGTATATTTGGAGGTGTT
GCATTTGTCTATACCTCAGCCGATCACCCACCGAAAAGATTCTTGTTTCCATGGCTCTTG
GGAGGCTTCTTTATGAGTATCATTTGGTTTTATATCGTGGCAAACGAGCTAGTGGCTCTG
CTAGTGGCATTTGGTGTGATCTTTGGTGTCAATCCATCAATTCTTGCGTTAACCGTCTTG
GCATGGGGAAACTCTATGGGTGACTTAATGTCAAATGTTGCAATAGCAAGTAATAGTGCA
GATGGTGTGCAGATTGCCATGTCAGGATGTTATGCAGGTCCTATGTTCAACACCCTTGCT
GGTTTAGGCATCTCCATGCTCCTTGGAGCCTTGTCGAGTAGGCCAGAATCTTATATCCTT
CCAAGAGATAATAGCTTGTATTACACAATGGGATTTCTAATGTTAGCCCTGGTTTGGGCA
CTCATTGTACTACCTCGGAATGATATGCGGCCTAGCAAGTCGTTGGGATTGGGACTTATG
ACCATATATGTAGTTTTTCTATCAAGCAGGGCAATGCTTGCCATGGGAGATGGTTCACTT
CATGGTATGAGCTAA