Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400070470
CDS Infomation

pacid=37466353 polypeptide=PGSC0003DMP400047648 locus=PGSC0003DMG400027398 ID=PGSC0003DMT400070470.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAATTTGAATGCCAAAGAGGTACTAAGATTGGTTTGGAAGATTGTTCTATAGATTGT
GTAGACTACCCCTGCAGAGAAAAAGTTGATACTAGTTTTATTGAACCTTCAAAGAACCCA
AAGAGTTTCATATTTGACTCGGAGAAGCAAAACTCATTGTGGAGATTGGATGGGAAAGGT
GGTAGTTTGAGTTTGAAATGCAAAGAGTTGCTCGCTGTTAATGAGGTCCTGCCTGATTGT
CGGTCTATTACTGACCTCCCTCCGGCATTGATCTCAGAAATACTTAATTGCTTAGAACCA
AAGGAGCTTGGTGTTGTTTCGTGTGTGAATGCGTCATTGTATCGTCTTGCTTCAGAGCAC
CATGTGTGGAAGGAGTTCTATTGTGAAAGGTGGGGGCAGCCAATATTGTTGGCACCTCTG
GGCGCAGAGCATGCAGATGAGAAGTCGTGGAAGGAGCTTTTTGTGGAGAGGGAGTTCCGT
AGTAAAACATTCATGGGACGCTATAGTATTGATACATTGTATGGTCATACTGAGGCTGTT
AGAAGTGTTTCTGTTTTATCTTCAAAGAAACTTCTGTTTACTTCAGGGTATGATCAGATA
GTGCGAATGTGGGACTTGGAAGAAGGTTTGTCTATTGCATCATCTCGCCCTCTTGGCTGC
ACTATTCGTGCAGTTGCGGCTGATTCGAGGCTCTTAATAGCAGGGGGTACAGATGGATTC
ATACATGGTTGGAGAGCAGAGGATGGAAATCCACATCTCTTTGATCTTAGATCACCTCAG
AACCAGAACATGGAATTCAGAGTTTGGGAACATGAAGGACCAATAACATGTCTTGCATTG
GATTTGAATAAGATGTACAGTGGTTCTTGGGACATGAGTATTCGTGTTTGGGATCGATCT
TCTTTGAAATGTCTGAAAGTTCTAATGCACAATGACTGGGTTTGGAGCCTTGCTCCCCAT
GATACAACAGTAGCGAGCGCTGCAGGCTCAGATCTTTATGTCTGGGACACTAATATTGGG
TCAGAACTTGCTACCGTCAACAATGTTCATGCTGGAAATGCTTTTTCCTTGGCGCGAAGT
CACACAGGGAAGCTCCTATTCACTGGAGGGGAAGATGGAGCTATACGCATGTTCGAGATC
AGTAGAAATGATAAGTTTCATCTCAGGCGTGTGGCGACATGGATTCCTCACTCGGGTGCT
GTTTATTCTCTTGCATTTGAGTTCCCTTGGCTTGTTTCAGCTTCCAGTGATGGAAAACTC
TCACTTATTGATGTGAGAAAGCTGTTGAGGATGAATCGGAGTTATGTGATGGAGAAGCCT
TTGAAGGTTGACTATAGGGCTAAAAATGTAGAGCCACCTCAAAGAATGTTACATGGATTT
GGGAGCAATCTGTTTGCTGTGGATGTTGGTCTTGATCGTATTGTATGTGCTGGAGAAGAA
GGCATTGTTAGGATCTGGAACTTCTCAGAAGCTTTGGAGGTTGAGCAGAGAGTTCGAGCA
TTAAGAGGATTAAGGTTAGAGAACAGAATGAGGAGGCGTAAACTTCAGTCTGAAATGACT
GGTAAAGGCAGCCGTGCTGATCAGTGCTCAGTTGCTGCTAAGAAGAATCAATTGAATGGT
GATAGGAACAGCTGGCGCAACAAGCGTAGGGTGACTGGGAAGCTGAAGGCCTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400047648
PEP Infomation

pacid=37466353 transcript=PGSC0003DMT400070470 locus=PGSC0003DMG400027398 ID=PGSC0003DMT400070470.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MEFECQRGTKIGLEDCSIDCVDYPCREKVDTSFIEPSKNPKSFIFDSEKQNSLWRLDGKG
GSLSLKCKELLAVNEVLPDCRSITDLPPALISEILNCLEPKELGVVSCVNASLYRLASEH
HVWKEFYCERWGQPILLAPLGAEHADEKSWKELFVEREFRSKTFMGRYSIDTLYGHTEAV
RSVSVLSSKKLLFTSGYDQIVRMWDLEEGLSIASSRPLGCTIRAVAADSRLLIAGGTDGF
IHGWRAEDGNPHLFDLRSPQNQNMEFRVWEHEGPITCLALDLNKMYSGSWDMSIRVWDRS
SLKCLKVLMHNDWVWSLAPHDTTVASAAGSDLYVWDTNIGSELATVNNVHAGNAFSLARS
HTGKLLFTGGEDGAIRMFEISRNDKFHLRRVATWIPHSGAVYSLAFEFPWLVSASSDGKL
SLIDVRKLLRMNRSYVMEKPLKVDYRAKNVEPPQRMLHGFGSNLFAVDVGLDRIVCAGEE
GIVRIWNFSEALEVEQRVRALRGLRLENRMRRRKLQSEMTGKGSRADQCSVAAKKNQLNG
DRNSWRNKRRVTGKLKA*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400070470
Transcript Infomation

pacid=37466353 locus=PGSC0003DMG400027398 ID=PGSC0003DMT400070470.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAATTTGAATGCCAAAGAGGTACTAAGATTGGTTTGGAAGATTGTTCTATAGATTGT
GTAGACTACCCCTGCAGAGAAAAAGTTGATACTAGTTTTATTGAACCTTCAAAGAACCCA
AAGAGTTTCATATTTGACTCGGAGAAGCAAAACTCATTGTGGAGATTGGATGGGAAAGGT
GGTAGTTTGAGTTTGAAATGCAAAGAGTTGCTCGCTGTTAATGAGGTCCTGCCTGATTGT
CGGTCTATTACTGACCTCCCTCCGGCATTGATCTCAGAAATACTTAATTGCTTAGAACCA
AAGGAGCTTGGTGTTGTTTCGTGTGTGAATGCGTCATTGTATCGTCTTGCTTCAGAGCAC
CATGTGTGGAAGGAGTTCTATTGTGAAAGGTGGGGGCAGCCAATATTGTTGGCACCTCTG
GGCGCAGAGCATGCAGATGAGAAGTCGTGGAAGGAGCTTTTTGTGGAGAGGGAGTTCCGT
AGTAAAACATTCATGGGACGCTATAGTATTGATACATTGTATGGTCATACTGAGGCTGTT
AGAAGTGTTTCTGTTTTATCTTCAAAGAAACTTCTGTTTACTTCAGGGTATGATCAGATA
GTGCGAATGTGGGACTTGGAAGAAGGTTTGTCTATTGCATCATCTCGCCCTCTTGGCTGC
ACTATTCGTGCAGTTGCGGCTGATTCGAGGCTCTTAATAGCAGGGGGTACAGATGGATTC
ATACATGGTTGGAGAGCAGAGGATGGAAATCCACATCTCTTTGATCTTAGATCACCTCAG
AACCAGAACATGGAATTCAGAGTTTGGGAACATGAAGGACCAATAACATGTCTTGCATTG
GATTTGAATAAGATGTACAGTGGTTCTTGGGACATGAGTATTCGTGTTTGGGATCGATCT
TCTTTGAAATGTCTGAAAGTTCTAATGCACAATGACTGGGTTTGGAGCCTTGCTCCCCAT
GATACAACAGTAGCGAGCGCTGCAGGCTCAGATCTTTATGTCTGGGACACTAATATTGGG
TCAGAACTTGCTACCGTCAACAATGTTCATGCTGGAAATGCTTTTTCCTTGGCGCGAAGT
CACACAGGGAAGCTCCTATTCACTGGAGGGGAAGATGGAGCTATACGCATGTTCGAGATC
AGTAGAAATGATAAGTTTCATCTCAGGCGTGTGGCGACATGGATTCCTCACTCGGGTGCT
GTTTATTCTCTTGCATTTGAGTTCCCTTGGCTTGTTTCAGCTTCCAGTGATGGAAAACTC
TCACTTATTGATGTGAGAAAGCTGTTGAGGATGAATCGGAGTTATGTGATGGAGAAGCCT
TTGAAGGTTGACTATAGGGCTAAAAATGTAGAGCCACCTCAAAGAATGTTACATGGATTT
GGGAGCAATCTGTTTGCTGTGGATGTTGGTCTTGATCGTATTGTATGTGCTGGAGAAGAA
GGCATTGTTAGGATCTGGAACTTCTCAGAAGCTTTGGAGGTTGAGCAGAGAGTTCGAGCA
TTAAGAGGATTAAGGTTAGAGAACAGAATGAGGAGGCGTAAACTTCAGTCTGAAATGACT
GGTAAAGGCAGCCGTGCTGATCAGTGCTCAGTTGCTGCTAAGAAGAATCAATTGAATGGT
GATAGGAACAGCTGGCGCAACAAGCGTAGGGTGACTGGGAAGCTGAAGGCCTAG