Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400070362
CDS Infomation

pacid=37464952 polypeptide=PGSC0003DMP400047569 locus=PGSC0003DMG400027356 ID=PGSC0003DMT400070362.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGTTCTCTTCCAATTGCGGTTTCTGGGTCCACCGTCAACAGTGGCGGTTGTAGGTGG
TGGGGGTGGTGCAACAAGAATAATAGTTCTGGCAAGAGTGGTAGTAATGGCAGTGGCAGC
AGTGATTCTTGTGCTAACTCATCAGCTTTTGTGTTCTTTTTGGTGTCTTTTGTTTGTCTT
GCTTCAATTGCTGGACTTTACTGTAGAGTTTTACTTCCCCCAAATGTACATACAATACTT
TCTTCTTTGGGGTGTAATGAGGATAATGAAGGTTCTTGGTCAATTGGGGTCTACTATGGT
GACTCTCCTTTTAATCTTAAACCCATTGAAGAGGCAAATGTTTGGAGGAACAAGACTGCA
GCGTGGCCAGTGGCAAATCCTGTTGTCACTTGTGCTTCAGCTTCTGGGGCTAGTTTTCCT
AGTAACTTTGTTGCTGACCCTTTTCTTTATGTTCAGGGAGACATCCTTTACCTGTTCTTT
GAAGCAAAGAATTCAATCACAATGCAAGGGGATATTGGAGTTGCAAGAAGTACCGATAAG
GGAGCAACGTGGGAGCAGTTGGGTGTTGCTTTGGATGAAGACTGGCATCTCTCCTATCCT
TACGTCTTTGACTACAATGGCAATATCTATATGATGCCTGAGGGAAGTGCTAAAGGGGAT
CTTCGTCTTTATCGAGCTGTAAAGTTTCCTACGGAATGGAAACTGGAAAAGGTCATAATG
AAAAAGCCGCTTGTTGATTCTTTTATCATTCAACATGATGGGAAGTACTGGCTTTTTGGT
TCAGATCACAGTGGAATTGGTGCCAAGAAGAACGGTCAGTTGGAGATTTGGTATAGTAGC
TCACCTCTGGGTCCTTGGAAACCGCATAAAAAGAATCCTATCTATAACACAGATAAGAGC
AAGGGAGCCCGAAATGGAGGTAGACCATTTTTATATGATGGCCATCTTCATCGTGCTGGT
CAAGACTGTGGTGAGACATATGGGCGGCGTTTACGTCTATTTAAAATAGAAGCTCTGACA
CCTACTGAATACAAAGAAGTTGAGGTTCCTCTGGGTCTTAAAGAGTCAATGAAGGGACGG
AATGCCTGGAATGGTGCCCGCAGTCATCAACTTGATGTGCAGCAACTAAGCTCCGGGGAG
TGGGTTGCAGTTATGGATGGGGACCGAGTTCCTTCAGGAGATGTAAATCGACGGTTTATT
TTAGGTTGTGCATCCGTTTTAGGTGTCGTAATGCTGGTTATAGTGTTTGGTATGCTACTA
GGAGCAGTGAAAGGATTAGTTCCCTTAAGTTGGTGCCCTCACAATGTTGGAAAGAGGAGT
GACGCTTCGTTCGATTGGGAAAGATCAAGCTTGTTATCTAATAGAATGAGACTATTTTGT
AGTCGGTTGAACAGAGCAAGCTCGTCTCTCCGTGCCAGAATAAAGCTAAAAACATGCAGT
GGAGGATTGGTTCTTGCTGTAATATTTATAGTCACTGTGGTGTTAATGTGCACTGGAGTG
AAATACATCTATGGAGGCAGCGGTGCAGAGGAAGCTTACCCGTTGAATGGTCAGTACTCT
CAGTTCACTTTATTAACAATGACCTACGATGCTCGGCTCTGGAACTTGAAAATGTACGTC
AAGCATTACTCAAGGTGTTCTTCAGTACGTGAGATTGTTGTAGTGTGGAATAAAGGCCAA
CCTCCAGAACTGAGTGAGCTCGATTCAGCAGTGCCAGTGAGGATAAGAGTAGAGGAACAG
AACTCACTAAACAATCGATTCAAAGTAGATCCTTTGATAAAGACACGAGCAGTTCTTGAA
CTTGATGATGACATTATGATGCCTTGTGATGATGTTGAACGGGGATTTAAGGTATGGCGT
GAGCACCCTGAACGCATCGTTGGGTTTTACCCCCGGCTTGCAGATGGAAACCCATTGAAA
TATCGAGCTGAGAATCATGCTCGCGAGCACAATGGATACAACATGATTCTGACAGGAGCT
GCCTTCATGGACAGCAAAATGGCTTTCGAAAAGTACTGGAGCAATGAAGCTGCAGCAGGC
AGGGCAGTGGTGGACAAGCTTTTTAACTGTGAGGATGTGTTGCTAAACTACTTGTATGCA
AACGCGAGCTCTTCCAGTACAGTTGAATACGTAAAACCAGCATGGGCAATTGATACTTCA
AAGTTTTCTGGCGTTGCAATTAGCCGGAATACACAGACTCACTATGGACTCAGAAGCAGT
TGCCTCCAAAAGTTCTCAGAAATGTATGGAAGTATATCAAGTAGAAAATCAGAATTTCAC
CATCGAAACGACGGGTGGGATGTATAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400047569
PEP Infomation

pacid=37464952 transcript=PGSC0003DMT400070362 locus=PGSC0003DMG400027356 ID=PGSC0003DMT400070362.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGSLPIAVSGSTVNSGGCRWWGWCNKNNSSGKSGSNGSGSSDSCANSSAFVFFLVSFVCL
ASIAGLYCRVLLPPNVHTILSSLGCNEDNEGSWSIGVYYGDSPFNLKPIEEANVWRNKTA
AWPVANPVVTCASASGASFPSNFVADPFLYVQGDILYLFFEAKNSITMQGDIGVARSTDK
GATWEQLGVALDEDWHLSYPYVFDYNGNIYMMPEGSAKGDLRLYRAVKFPTEWKLEKVIM
KKPLVDSFIIQHDGKYWLFGSDHSGIGAKKNGQLEIWYSSSPLGPWKPHKKNPIYNTDKS
KGARNGGRPFLYDGHLHRAGQDCGETYGRRLRLFKIEALTPTEYKEVEVPLGLKESMKGR
NAWNGARSHQLDVQQLSSGEWVAVMDGDRVPSGDVNRRFILGCASVLGVVMLVIVFGMLL
GAVKGLVPLSWCPHNVGKRSDASFDWERSSLLSNRMRLFCSRLNRASSSLRARIKLKTCS
GGLVLAVIFIVTVVLMCTGVKYIYGGSGAEEAYPLNGQYSQFTLLTMTYDARLWNLKMYV
KHYSRCSSVREIVVVWNKGQPPELSELDSAVPVRIRVEEQNSLNNRFKVDPLIKTRAVLE
LDDDIMMPCDDVERGFKVWREHPERIVGFYPRLADGNPLKYRAENHAREHNGYNMILTGA
AFMDSKMAFEKYWSNEAAAGRAVVDKLFNCEDVLLNYLYANASSSSTVEYVKPAWAIDTS
KFSGVAISRNTQTHYGLRSSCLQKFSEMYGSISSRKSEFHHRNDGWDV*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400070362
Transcript Infomation

pacid=37464952 locus=PGSC0003DMG400027356 ID=PGSC0003DMT400070362.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGTTCTCTTCCAATTGCGGTTTCTGGGTCCACCGTCAACAGTGGCGGTTGTAGGTGG
TGGGGGTGGTGCAACAAGAATAATAGTTCTGGCAAGAGTGGTAGTAATGGCAGTGGCAGC
AGTGATTCTTGTGCTAACTCATCAGCTTTTGTGTTCTTTTTGGTGTCTTTTGTTTGTCTT
GCTTCAATTGCTGGACTTTACTGTAGAGTTTTACTTCCCCCAAATGTACATACAATACTT
TCTTCTTTGGGGTGTAATGAGGATAATGAAGGTTCTTGGTCAATTGGGGTCTACTATGGT
GACTCTCCTTTTAATCTTAAACCCATTGAAGAGGCAAATGTTTGGAGGAACAAGACTGCA
GCGTGGCCAGTGGCAAATCCTGTTGTCACTTGTGCTTCAGCTTCTGGGGCTAGTTTTCCT
AGTAACTTTGTTGCTGACCCTTTTCTTTATGTTCAGGGAGACATCCTTTACCTGTTCTTT
GAAGCAAAGAATTCAATCACAATGCAAGGGGATATTGGAGTTGCAAGAAGTACCGATAAG
GGAGCAACGTGGGAGCAGTTGGGTGTTGCTTTGGATGAAGACTGGCATCTCTCCTATCCT
TACGTCTTTGACTACAATGGCAATATCTATATGATGCCTGAGGGAAGTGCTAAAGGGGAT
CTTCGTCTTTATCGAGCTGTAAAGTTTCCTACGGAATGGAAACTGGAAAAGGTCATAATG
AAAAAGCCGCTTGTTGATTCTTTTATCATTCAACATGATGGGAAGTACTGGCTTTTTGGT
TCAGATCACAGTGGAATTGGTGCCAAGAAGAACGGTCAGTTGGAGATTTGGTATAGTAGC
TCACCTCTGGGTCCTTGGAAACCGCATAAAAAGAATCCTATCTATAACACAGATAAGAGC
AAGGGAGCCCGAAATGGAGGTAGACCATTTTTATATGATGGCCATCTTCATCGTGCTGGT
CAAGACTGTGGTGAGACATATGGGCGGCGTTTACGTCTATTTAAAATAGAAGCTCTGACA
CCTACTGAATACAAAGAAGTTGAGGTTCCTCTGGGTCTTAAAGAGTCAATGAAGGGACGG
AATGCCTGGAATGGTGCCCGCAGTCATCAACTTGATGTGCAGCAACTAAGCTCCGGGGAG
TGGGTTGCAGTTATGGATGGGGACCGAGTTCCTTCAGGAGATGTAAATCGACGGTTTATT
TTAGGTTGTGCATCCGTTTTAGGTGTCGTAATGCTGGTTATAGTGTTTGGTATGCTACTA
GGAGCAGTGAAAGGATTAGTTCCCTTAAGTTGGTGCCCTCACAATGTTGGAAAGAGGAGT
GACGCTTCGTTCGATTGGGAAAGATCAAGCTTGTTATCTAATAGAATGAGACTATTTTGT
AGTCGGTTGAACAGAGCAAGCTCGTCTCTCCGTGCCAGAATAAAGCTAAAAACATGCAGT
GGAGGATTGGTTCTTGCTGTAATATTTATAGTCACTGTGGTGTTAATGTGCACTGGAGTG
AAATACATCTATGGAGGCAGCGGTGCAGAGGAAGCTTACCCGTTGAATGGTCAGTACTCT
CAGTTCACTTTATTAACAATGACCTACGATGCTCGGCTCTGGAACTTGAAAATGTACGTC
AAGCATTACTCAAGGTGTTCTTCAGTACGTGAGATTGTTGTAGTGTGGAATAAAGGCCAA
CCTCCAGAACTGAGTGAGCTCGATTCAGCAGTGCCAGTGAGGATAAGAGTAGAGGAACAG
AACTCACTAAACAATCGATTCAAAGTAGATCCTTTGATAAAGACACGAGCAGTTCTTGAA
CTTGATGATGACATTATGATGCCTTGTGATGATGTTGAACGGGGATTTAAGGTATGGCGT
GAGCACCCTGAACGCATCGTTGGGTTTTACCCCCGGCTTGCAGATGGAAACCCATTGAAA
TATCGAGCTGAGAATCATGCTCGCGAGCACAATGGATACAACATGATTCTGACAGGAGCT
GCCTTCATGGACAGCAAAATGGCTTTCGAAAAGTACTGGAGCAATGAAGCTGCAGCAGGC
AGGGCAGTGGTGGACAAGCTTTTTAACTGTGAGGATGTGTTGCTAAACTACTTGTATGCA
AACGCGAGCTCTTCCAGTACAGTTGAATACGTAAAACCAGCATGGGCAATTGATACTTCA
AAGTTTTCTGGCGTTGCAATTAGCCGGAATACACAGACTCACTATGGACTCAGAAGCAGT
TGCCTCCAAAAGTTCTCAGAAATGTATGGAAGTATATCAAGTAGAAAATCAGAATTTCAC
CATCGAAACGACGGGTGGGATGTATAG