Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400070156
CDS Infomation

pacid=37473221 polypeptide=PGSC0003DMP400047432 locus=PGSC0003DMG400027269 ID=PGSC0003DMT400070156.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCGTGAAACTGTGAAGAAACCTTGTGTTGCTGCTGCTACTGTTGTTGTTGCTGTTGCT
ACTACTATGACGAAGAAAACTAGTCCGGAAGAAGATGGGGACGTGATAATCATCCCTCCG
TTGTGTACATCAGCTAATCGGTCAAGATTACAAGCTGGGTCACGTCGCATTACGCCGACG
AATGATGATATGGCTGAGCTCCGGCAGCTGCCGAACGGAGATCTGTATACTGGGACATTT
TTGGGAAAAGTGCCGCATGGTAATGGGAAGTATTTATGGTCTGATGGGTGTATGTATGAA
GGTGAGTGGAGAAGAGGGAAGGCGAGTGGTAAAGGGAAGTTTTCGTGGCCTTCGGGGGCG
ACTTATGAAGGGGATTTTAAGGATGGGAGAATGGATGGGTATGGGACGTTTATCGGAGCT
GATGGGGATACGTATCGGGGTTGGTGGGCAGCAGATCGGAAACATGGGTTTGGAGAGAAG
TTATATGCTAATGGGGATTTGTATGTTGGTTCTTGGAAGTGGAATTTGCAAGAAGGGGAA
GGGAGGTATGTTTGGGGAAATGGGAATGAGTATATTGGAGAATGGAGAAAAGGGGTTATG
TTTGGTAAAGGGGTTTTGATTTGGGCAAATGGGAAAAGATATGAAGGGGATTGGGATAAT
GGGATGCCTAAAGGAAATGGTGTTTTAAGTTGGCCTGATGGTAGGACTTGTTATACTAGT
GGTTCATGGGGTGATAGTAATTCATCCAAACAAGAATTTAGTACTGGTGGTGGTAATGGT
GGTCAGGTTCTAAGGAGATCTTCTGTGACGATGAATGTGCGTGAAAGGAATGTTAATTTA
CCGAGGATTTGTATATGGGAATCTGATGGTGAAGCAGGAGATATTACTTGTGACATAGTT
GACAATAGGGAGGCTTCTTCTATGTTTGTTCCTAGGAATGATGATGAGGAGGATGAGGAT
GATGATGATGATGAAGAGAGTGAGAGTTCTGAAGGAGATGAAAGTGGGGATTTTCGGAAG
AGTCCTTGCCACTCTGAAGTTGTGGAAATGAAGAAGCCGGGGCAACCAATAACCAAGGGA
CATAAGAATTATGATTTGGTGGTTAGTCTTCAGCTAGGTATTAGGTATTCTACTCAGAAG
CACGCCTCAATTACCCGAGAACCAAAGAATGGGGATTTCGATCCTAATGAGAAGTTCTGG
ACAAGGTTTCCACCTGAGGGTTCCAAACTCACACCACCCCATCAGGTTGTGGACTTCAAA
TGGAAGGACTACTGTCCCGTAGTTTTCAAGAGTCTTAGGGAGTTGTTTGGAGTAGATCCA
GCTGAGTACATGCTAGCTATCTGTGGAAGTGATGCACTTAGGGAACTATCTTCCCCTGGG
AAAAGTGGCAGCAACTTCTATCTTACTCAAGATGACCGATTTATCATCAAAACTTTAAAA
AAGTCCGAAGTTAAGGTGTTCATTAGAATGCTTCAAAGTTATTATCGGCATGTTCGTCAG
TACCGAAGCTCCTTGGTGACAAAGTTTTTTGGTGTACATTGTGTTAAAATGGTTGGATGT
CAAAAGACACGTTTTGTTGTTATGGGGAACCTGTTCTACTCTGAACGTGTGATCCATAAG
CGCTTTGATTTAAAGGGATCCTCTTATGGCCGTACAACTGATAAGCCAGGAGGAGAGGCC
GATGAGACTACTACGCTTAAAGACCTCGATCTCAACTTTGTCTTTCAATTGCGACAATCT
TGGTATAAAGAGCTTATAAGACAAATTGATATAGATTGTCAGTTTCTGGAAGCTGAGAAT
ATCATGGATTACAGTCTTTTGATTGGTGTTCATATCTGCAATTATAGTAACAATGGCGAG
ATGAATTTGTCACCTTATGGCAAAGCTGAGGCTCAAGATTATTGCTTATGTGATGCAGAA
AGTCCTGATAAGGGACAGATCATTGACAAAAGGAATTCACCTATAAGTTCAGCTGCAAAT
GTGCCTGCAAGGGCGATGTGTGTGACAAGGAGTGGAAGTGAGTCAACTTCTGAACAGGGT
GGCTGTGAGGCTAATAATGCTATCCTTTGCCTGGGCATCATTGACATTCTTCAAGATTAT
GATATCAGCAAAAGACTAGAACATGCATACAAGTCATTTCAGGTGGATCCCACTTCAATA
TCTGCTGTTGATCCAAAGCTCTACTCTAAAAGATTTCGAGATTTTATAAGTAGAATCTTT
AAAGTAGACGAAGGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400047432
PEP Infomation

pacid=37473221 transcript=PGSC0003DMT400070156 locus=PGSC0003DMG400027269 ID=PGSC0003DMT400070156.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MRETVKKPCVAAATVVVAVATTMTKKTSPEEDGDVIIIPPLCTSANRSRLQAGSRRITPT
NDDMAELRQLPNGDLYTGTFLGKVPHGNGKYLWSDGCMYEGEWRRGKASGKGKFSWPSGA
TYEGDFKDGRMDGYGTFIGADGDTYRGWWAADRKHGFGEKLYANGDLYVGSWKWNLQEGE
GRYVWGNGNEYIGEWRKGVMFGKGVLIWANGKRYEGDWDNGMPKGNGVLSWPDGRTCYTS
GSWGDSNSSKQEFSTGGGNGGQVLRRSSVTMNVRERNVNLPRICIWESDGEAGDITCDIV
DNREASSMFVPRNDDEEDEDDDDDEESESSEGDESGDFRKSPCHSEVVEMKKPGQPITKG
HKNYDLVVSLQLGIRYSTQKHASITREPKNGDFDPNEKFWTRFPPEGSKLTPPHQVVDFK
WKDYCPVVFKSLRELFGVDPAEYMLAICGSDALRELSSPGKSGSNFYLTQDDRFIIKTLK
KSEVKVFIRMLQSYYRHVRQYRSSLVTKFFGVHCVKMVGCQKTRFVVMGNLFYSERVIHK
RFDLKGSSYGRTTDKPGGEADETTTLKDLDLNFVFQLRQSWYKELIRQIDIDCQFLEAEN
IMDYSLLIGVHICNYSNNGEMNLSPYGKAEAQDYCLCDAESPDKGQIIDKRNSPISSAAN
VPARAMCVTRSGSESTSEQGGCEANNAILCLGIIDILQDYDISKRLEHAYKSFQVDPTSI
SAVDPKLYSKRFRDFISRIFKVDEG*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400070156
Transcript Infomation

pacid=37473221 locus=PGSC0003DMG400027269 ID=PGSC0003DMT400070156.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCGTGAAACTGTGAAGAAACCTTGTGTTGCTGCTGCTACTGTTGTTGTTGCTGTTGCT
ACTACTATGACGAAGAAAACTAGTCCGGAAGAAGATGGGGACGTGATAATCATCCCTCCG
TTGTGTACATCAGCTAATCGGTCAAGATTACAAGCTGGGTCACGTCGCATTACGCCGACG
AATGATGATATGGCTGAGCTCCGGCAGCTGCCGAACGGAGATCTGTATACTGGGACATTT
TTGGGAAAAGTGCCGCATGGTAATGGGAAGTATTTATGGTCTGATGGGTGTATGTATGAA
GGTGAGTGGAGAAGAGGGAAGGCGAGTGGTAAAGGGAAGTTTTCGTGGCCTTCGGGGGCG
ACTTATGAAGGGGATTTTAAGGATGGGAGAATGGATGGGTATGGGACGTTTATCGGAGCT
GATGGGGATACGTATCGGGGTTGGTGGGCAGCAGATCGGAAACATGGGTTTGGAGAGAAG
TTATATGCTAATGGGGATTTGTATGTTGGTTCTTGGAAGTGGAATTTGCAAGAAGGGGAA
GGGAGGTATGTTTGGGGAAATGGGAATGAGTATATTGGAGAATGGAGAAAAGGGGTTATG
TTTGGTAAAGGGGTTTTGATTTGGGCAAATGGGAAAAGATATGAAGGGGATTGGGATAAT
GGGATGCCTAAAGGAAATGGTGTTTTAAGTTGGCCTGATGGTAGGACTTGTTATACTAGT
GGTTCATGGGGTGATAGTAATTCATCCAAACAAGAATTTAGTACTGGTGGTGGTAATGGT
GGTCAGGTTCTAAGGAGATCTTCTGTGACGATGAATGTGCGTGAAAGGAATGTTAATTTA
CCGAGGATTTGTATATGGGAATCTGATGGTGAAGCAGGAGATATTACTTGTGACATAGTT
GACAATAGGGAGGCTTCTTCTATGTTTGTTCCTAGGAATGATGATGAGGAGGATGAGGAT
GATGATGATGATGAAGAGAGTGAGAGTTCTGAAGGAGATGAAAGTGGGGATTTTCGGAAG
AGTCCTTGCCACTCTGAAGTTGTGGAAATGAAGAAGCCGGGGCAACCAATAACCAAGGGA
CATAAGAATTATGATTTGGTGGTTAGTCTTCAGCTAGGTATTAGGTATTCTACTCAGAAG
CACGCCTCAATTACCCGAGAACCAAAGAATGGGGATTTCGATCCTAATGAGAAGTTCTGG
ACAAGGTTTCCACCTGAGGGTTCCAAACTCACACCACCCCATCAGGTTGTGGACTTCAAA
TGGAAGGACTACTGTCCCGTAGTTTTCAAGAGTCTTAGGGAGTTGTTTGGAGTAGATCCA
GCTGAGTACATGCTAGCTATCTGTGGAAGTGATGCACTTAGGGAACTATCTTCCCCTGGG
AAAAGTGGCAGCAACTTCTATCTTACTCAAGATGACCGATTTATCATCAAAACTTTAAAA
AAGTCCGAAGTTAAGGTGTTCATTAGAATGCTTCAAAGTTATTATCGGCATGTTCGTCAG
TACCGAAGCTCCTTGGTGACAAAGTTTTTTGGTGTACATTGTGTTAAAATGGTTGGATGT
CAAAAGACACGTTTTGTTGTTATGGGGAACCTGTTCTACTCTGAACGTGTGATCCATAAG
CGCTTTGATTTAAAGGGATCCTCTTATGGCCGTACAACTGATAAGCCAGGAGGAGAGGCC
GATGAGACTACTACGCTTAAAGACCTCGATCTCAACTTTGTCTTTCAATTGCGACAATCT
TGGTATAAAGAGCTTATAAGACAAATTGATATAGATTGTCAGTTTCTGGAAGCTGAGAAT
ATCATGGATTACAGTCTTTTGATTGGTGTTCATATCTGCAATTATAGTAACAATGGCGAG
ATGAATTTGTCACCTTATGGCAAAGCTGAGGCTCAAGATTATTGCTTATGTGATGCAGAA
AGTCCTGATAAGGGACAGATCATTGACAAAAGGAATTCACCTATAAGTTCAGCTGCAAAT
GTGCCTGCAAGGGCGATGTGTGTGACAAGGAGTGGAAGTGAGTCAACTTCTGAACAGGGT
GGCTGTGAGGCTAATAATGCTATCCTTTGCCTGGGCATCATTGACATTCTTCAAGATTAT
GATATCAGCAAAAGACTAGAACATGCATACAAGTCATTTCAGGTGGATCCCACTTCAATA
TCTGCTGTTGATCCAAAGCTCTACTCTAAAAGATTTCGAGATTTTATAAGTAGAATCTTT
AAAGTAGACGAAGGGTAA