Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400069799
CDS Infomation

pacid=37442514 polypeptide=PGSC0003DMP400047162 locus=PGSC0003DMG400027143 ID=PGSC0003DMT400069799.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCATTCATCATCTGTTTTATCTCCTCCAAATTGCTCACTACTGAAGAGATCACACAGA
AATCAAATCGAGAAATTGTCTTTAGCGCCATTGAAGAATCTTCCGTTCTGTGGACTGAGA
AATGAGATTTTAGCGTTTGAGTTTTCGAAGCTTAATCGATGTGAGGCTCAGAGAGTGAGG
AATTTTCTAAGGAATAAAATAGTATCAGCTTCGGTGGCTGAAAATGGTAATGCTCCGACG
TCGTTTGATTATGATTTAGTAATAATTGGTGCTGGTGTTGGTGGCCATGGTGCTGCATTA
CATGCTGTGGAGAAGGGTCTTAAAACAGCTATCATTGAAGGAGATGTAATCGGCGGAACT
TGTGTAAACAGAGGTTGTGTTCCTTCTAAAGCACTTCTTGCAGTTAGCGGTAGGATGCGG
GAACTTAAGAATGAGCATCACTTGAAAGCTTTGGGTATACAGGTTTCTGGTGCCGGCTAT
GACAGGCAAGCAGTTGCTGATCATGCTAATAATCTTGCCTCGAAAATTCGTAATAACTTG
ACAAACTCTCTAAAGGCACTTGGTGTGGACATTTTGACAGGAGTGGGTACTATAACGGGT
CCTCAAAGGGTGAAGTATGGAAAAGTTGGTTTTTCTGGCAGTGAAGTTACCGCAAGGGAT
ATAATTATCGCTACCGGTTCTGTCCCTTTTGTTCCTAGAGGCATTGAAGTTGATGGGAAG
ACTGTGATTACCAGCGACCATGCTCTCAAACTGGAGTTTGTACCTGAATGGATAGCTATA
GTAGGAAGTGGTTATATTGGACTTGAATTTAGTGATGTGTATACCGCACTTGGTAGTGAG
GTTACTTTTATTGAAGCTCTAGATCAACTTATGCCTGGATTTGATCCAGAGATTAGTAAG
TTAGCTCAAAGGATTCTGGTAAATCCAAGGAAAATTGATTATCACACTGGAGTGTTTGCA
ACGAAGATCACCCCGGCAAAGGATGGGAGACCAGTTGTTATTGAGCTAACTGACGCCAAG
ACTAAAGAAGTAAAGGACACTTTGGAGGTTGATGCAGCTCTAATTGCAACTGGCAGAGCG
CCCTTCACGAATGGTCTAGGCCTGGAGAATATTAACGTGTTGACGCAACGAGGTTTTATT
CCTGTTGATGAGCGTATGCGAGTTGTTGATGCTGATGGAAATTTGGTACCTCACCTTTAT
TGCATTGGTGATGCAAATGGTAAAATGATGCTTGCTCATGCAGCCAGTGCTCAGGGAATA
TCTGTTGTCGAACAAGTCTCGGGAAGAGACCACGTGCTTAACCATTTGAGCATTCCAGCT
GCTTGTTTTACTCATCCTGAAATTAGCATGGTTGGGTTGACAGAGCCGCAAGCTCGAGAG
AAAGCTGAAAAAGAGGGGTTTGAGATAAGCATTGCAAAAACAAGCTTTAAGGCAAACACA
AAGGCACTGGCAGAAAATGAAGGGGAAGGACTTGCAAAGTTGATATACCGACCAGACAAT
GGGGAAATTCTCGGAGTTCATATCTTTGGTATGCATGCTGCTGACCTCATTCATGAAGCG
TCCAACGCCATAGCATTGGGAACGTCCATTCAGGATATAAAGTTTGCAGTGCACGCACAT
CCAACATTGTCTGAAGTCCTTGATGAACTGTTCAAATCTGCTAAGGTAACTAGTCACGAC
CATCGCCCACTTAGTGAATCAGTTGCTGTCTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400047162
PEP Infomation

pacid=37442514 transcript=PGSC0003DMT400069799 locus=PGSC0003DMG400027143 ID=PGSC0003DMT400069799.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MHSSSVLSPPNCSLLKRSHRNQIEKLSLAPLKNLPFCGLRNEILAFEFSKLNRCEAQRVR
NFLRNKIVSASVAENGNAPTSFDYDLVIIGAGVGGHGAALHAVEKGLKTAIIEGDVIGGT
CVNRGCVPSKALLAVSGRMRELKNEHHLKALGIQVSGAGYDRQAVADHANNLASKIRNNL
TNSLKALGVDILTGVGTITGPQRVKYGKVGFSGSEVTARDIIIATGSVPFVPRGIEVDGK
TVITSDHALKLEFVPEWIAIVGSGYIGLEFSDVYTALGSEVTFIEALDQLMPGFDPEISK
LAQRILVNPRKIDYHTGVFATKITPAKDGRPVVIELTDAKTKEVKDTLEVDAALIATGRA
PFTNGLGLENINVLTQRGFIPVDERMRVVDADGNLVPHLYCIGDANGKMMLAHAASAQGI
SVVEQVSGRDHVLNHLSIPAACFTHPEISMVGLTEPQAREKAEKEGFEISIAKTSFKANT
KALAENEGEGLAKLIYRPDNGEILGVHIFGMHAADLIHEASNAIALGTSIQDIKFAVHAH
PTLSEVLDELFKSAKVTSHDHRPLSESVAV*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400069799
Transcript Infomation

pacid=37442514 locus=PGSC0003DMG400027143 ID=PGSC0003DMT400069799.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCATTCATCATCTGTTTTATCTCCTCCAAATTGCTCACTACTGAAGAGATCACACAGA
AATCAAATCGAGAAATTGTCTTTAGCGCCATTGAAGAATCTTCCGTTCTGTGGACTGAGA
AATGAGATTTTAGCGTTTGAGTTTTCGAAGCTTAATCGATGTGAGGCTCAGAGAGTGAGG
AATTTTCTAAGGAATAAAATAGTATCAGCTTCGGTGGCTGAAAATGGTAATGCTCCGACG
TCGTTTGATTATGATTTAGTAATAATTGGTGCTGGTGTTGGTGGCCATGGTGCTGCATTA
CATGCTGTGGAGAAGGGTCTTAAAACAGCTATCATTGAAGGAGATGTAATCGGCGGAACT
TGTGTAAACAGAGGTTGTGTTCCTTCTAAAGCACTTCTTGCAGTTAGCGGTAGGATGCGG
GAACTTAAGAATGAGCATCACTTGAAAGCTTTGGGTATACAGGTTTCTGGTGCCGGCTAT
GACAGGCAAGCAGTTGCTGATCATGCTAATAATCTTGCCTCGAAAATTCGTAATAACTTG
ACAAACTCTCTAAAGGCACTTGGTGTGGACATTTTGACAGGAGTGGGTACTATAACGGGT
CCTCAAAGGGTGAAGTATGGAAAAGTTGGTTTTTCTGGCAGTGAAGTTACCGCAAGGGAT
ATAATTATCGCTACCGGTTCTGTCCCTTTTGTTCCTAGAGGCATTGAAGTTGATGGGAAG
ACTGTGATTACCAGCGACCATGCTCTCAAACTGGAGTTTGTACCTGAATGGATAGCTATA
GTAGGAAGTGGTTATATTGGACTTGAATTTAGTGATGTGTATACCGCACTTGGTAGTGAG
GTTACTTTTATTGAAGCTCTAGATCAACTTATGCCTGGATTTGATCCAGAGATTAGTAAG
TTAGCTCAAAGGATTCTGGTAAATCCAAGGAAAATTGATTATCACACTGGAGTGTTTGCA
ACGAAGATCACCCCGGCAAAGGATGGGAGACCAGTTGTTATTGAGCTAACTGACGCCAAG
ACTAAAGAAGTAAAGGACACTTTGGAGGTTGATGCAGCTCTAATTGCAACTGGCAGAGCG
CCCTTCACGAATGGTCTAGGCCTGGAGAATATTAACGTGTTGACGCAACGAGGTTTTATT
CCTGTTGATGAGCGTATGCGAGTTGTTGATGCTGATGGAAATTTGGTACCTCACCTTTAT
TGCATTGGTGATGCAAATGGTAAAATGATGCTTGCTCATGCAGCCAGTGCTCAGGGAATA
TCTGTTGTCGAACAAGTCTCGGGAAGAGACCACGTGCTTAACCATTTGAGCATTCCAGCT
GCTTGTTTTACTCATCCTGAAATTAGCATGGTTGGGTTGACAGAGCCGCAAGCTCGAGAG
AAAGCTGAAAAAGAGGGGTTTGAGATAAGCATTGCAAAAACAAGCTTTAAGGCAAACACA
AAGGCACTGGCAGAAAATGAAGGGGAAGGACTTGCAAAGTTGATATACCGACCAGACAAT
GGGGAAATTCTCGGAGTTCATATCTTTGGTATGCATGCTGCTGACCTCATTCATGAAGCG
TCCAACGCCATAGCATTGGGAACGTCCATTCAGGATATAAAGTTTGCAGTGCACGCACAT
CCAACATTGTCTGAAGTCCTTGATGAACTGTTCAAATCTGCTAAGGTAACTAGTCACGAC
CATCGCCCACTTAGTGAATCAGTTGCTGTCTGA