Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400069632
CDS Infomation

pacid=37451153 polypeptide=PGSC0003DMP400047017 locus=PGSC0003DMG400027070 ID=PGSC0003DMT400069632.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCCACCTCCTCTCTTTCTCTCATTTTCCTTTTGTCCTCTCTTCTCTTAATTCCTTCA
CTCCTTGCCTCTTCTCCCTTACAAAATCATCAATATGTTGTTGATCAAGTACATAGGAGC
ATAAATGTGTCAAGGAGGAACTTAGGGTATTTGTCTTGTGAGACAGGAAACCCTATAGAT
GACTGTTGGCGTTGTGATCCAAACTGGGAGAAAAACCGTCAAAGACTAGCTAATTGTGCT
ATTGGCTTTGGAAAAAATGCCGTTGGTGGTAGAGACGGAAAAATTTACGTCGTTACCAAC
TCTGGTAACGACGATCCTGTTAACCCTAAACCGGGGACTCTCCGGTATGGGGTTATTCAA
GATGAGCCATTATGGATTATTTTTGCTAGGGATATGGTGATTCAACTGAAAGAAGAACTT
ATTATGAACTCTTTCAAGACTATTGATGGAAGAGGAGCTACCGTTCACATTGCAGGTGGA
CCATGCATAACCATACAGTATGTGACCAATGTTATCATCCATGGAATTCACATACATGAT
TGTAAGCAAGGTGGGAATGCTATGGTGAGGAGCACCCCACATCACTATGGGTGGAGAACT
ATATCAGATGGTGATGGAGTATCCATTTTTGGTGGGAGTCATATTTGGATAGATCATTGT
TCCTTGTCTAATTGTGTTGATGGTTTGATTGATGCTATAATGGGGTCCACAGCAATTACC
ATATCTAACAATTACATGACTAAACATGATAAAGTGATGTTATTGGGACATAGTGATTCC
CATGTCCAAGACAAGAACATGCAAGTAACCATTGCTTTCAATCACTTTGGAGAAGGCCTT
GTCCAAAGAATCCCAAGATGTAGACATGGTTATTTCCATGTGGTGAACAATGACTATACT
CACTGGGAAATGTATGCAATTGGTGGTAGTGCAAATCCCACCATCAATAGCCAGGGCAAT
AGATTCCTTGCTTCTGATATTAGATTCAGCAAAGAGGTGACGAAGCATGAAATTTCACCA
GAAAGTGAATGGAAGAATTGGAATTGGAGGAGTGATGGTGACTTAATGTTAAATGGTGCA
TTTTTTGTAAAATCAGGAGCTGGAGCCTCTTCAAATTATGCTAAGGCTTCAAGTTTGAGT
GCTAAGTCTTCTTCACTAATAAGTTCCCTTGTGTCCGGGGCCGGTGCCCTAAGTTGTCGG
GAAGGGTCTCGTTGCTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400047017
PEP Infomation

pacid=37451153 transcript=PGSC0003DMT400069632 locus=PGSC0003DMG400027070 ID=PGSC0003DMT400069632.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MATSSLSLIFLLSSLLLIPSLLASSPLQNHQYVVDQVHRSINVSRRNLGYLSCETGNPID
DCWRCDPNWEKNRQRLANCAIGFGKNAVGGRDGKIYVVTNSGNDDPVNPKPGTLRYGVIQ
DEPLWIIFARDMVIQLKEELIMNSFKTIDGRGATVHIAGGPCITIQYVTNVIIHGIHIHD
CKQGGNAMVRSTPHHYGWRTISDGDGVSIFGGSHIWIDHCSLSNCVDGLIDAIMGSTAIT
ISNNYMTKHDKVMLLGHSDSHVQDKNMQVTIAFNHFGEGLVQRIPRCRHGYFHVVNNDYT
HWEMYAIGGSANPTINSQGNRFLASDIRFSKEVTKHEISPESEWKNWNWRSDGDLMLNGA
FFVKSGAGASSNYAKASSLSAKSSSLISSLVSGAGALSCREGSRC*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400069632
Transcript Infomation

pacid=37451153 locus=PGSC0003DMG400027070 ID=PGSC0003DMT400069632.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCCACCTCCTCTCTTTCTCTCATTTTCCTTTTGTCCTCTCTTCTCTTAATTCCTTCA
CTCCTTGCCTCTTCTCCCTTACAAAATCATCAATATGTTGTTGATCAAGTACATAGGAGC
ATAAATGTGTCAAGGAGGAACTTAGGGTATTTGTCTTGTGAGACAGGAAACCCTATAGAT
GACTGTTGGCGTTGTGATCCAAACTGGGAGAAAAACCGTCAAAGACTAGCTAATTGTGCT
ATTGGCTTTGGAAAAAATGCCGTTGGTGGTAGAGACGGAAAAATTTACGTCGTTACCAAC
TCTGGTAACGACGATCCTGTTAACCCTAAACCGGGGACTCTCCGGTATGGGGTTATTCAA
GATGAGCCATTATGGATTATTTTTGCTAGGGATATGGTGATTCAACTGAAAGAAGAACTT
ATTATGAACTCTTTCAAGACTATTGATGGAAGAGGAGCTACCGTTCACATTGCAGGTGGA
CCATGCATAACCATACAGTATGTGACCAATGTTATCATCCATGGAATTCACATACATGAT
TGTAAGCAAGGTGGGAATGCTATGGTGAGGAGCACCCCACATCACTATGGGTGGAGAACT
ATATCAGATGGTGATGGAGTATCCATTTTTGGTGGGAGTCATATTTGGATAGATCATTGT
TCCTTGTCTAATTGTGTTGATGGTTTGATTGATGCTATAATGGGGTCCACAGCAATTACC
ATATCTAACAATTACATGACTAAACATGATAAAGTGATGTTATTGGGACATAGTGATTCC
CATGTCCAAGACAAGAACATGCAAGTAACCATTGCTTTCAATCACTTTGGAGAAGGCCTT
GTCCAAAGAATCCCAAGATGTAGACATGGTTATTTCCATGTGGTGAACAATGACTATACT
CACTGGGAAATGTATGCAATTGGTGGTAGTGCAAATCCCACCATCAATAGCCAGGGCAAT
AGATTCCTTGCTTCTGATATTAGATTCAGCAAAGAGGTGACGAAGCATGAAATTTCACCA
GAAAGTGAATGGAAGAATTGGAATTGGAGGAGTGATGGTGACTTAATGTTAAATGGTGCA
TTTTTTGTAAAATCAGGAGCTGGAGCCTCTTCAAATTATGCTAAGGCTTCAAGTTTGAGT
GCTAAGTCTTCTTCACTAATAAGTTCCCTTGTGTCCGGGGCCGGTGCCCTAAGTTGTCGG
GAAGGGTCTCGTTGCTAG