Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400069483
CDS Infomation

pacid=37449775 polypeptide=PGSC0003DMP400046902 locus=PGSC0003DMG400027011 ID=PGSC0003DMT400069483.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATTCAGAAGATGATATGCACGATGCTAATGATATGGAGTCGGTAGATGAGGATTTC
TACAGTGACGGTGATGGTTATGGCGGCGATGCGGCAGATAGTGACGCTGATGTTGCTGAT
TATGATTTCATGGGTAATGAAACCGATGATTCCGATGAACAAGCTGTTAGTCGTACCCAG
AAAAATTATACTGTCTTGAAAGAAGAAGATATACGTCAGCGACAGGAGGAGGATATGACG
ACAATTTCTACTCTTCTCTCCATATCAAGAGAAGCTGCCTGTATATTACTTCGACGCTAT
AACTGGAGTGTGAACAAGGTGCATGAGGAGTGGTTTGCTGATGAAGAAAGAGTGCGCAAG
TCTGCCGGCTTGTTGGAGAAGCCTGCTGTCTCTCTTTCAAGAATTATAGATGTGGTGTGT
GGGATTTGCTTTGAGAACTTCCTTCCTGATGACATAACATCTGTTGGGTGTGGTCATCCT
TTTTGTACTACTTGCTGGAAAGCTTACATTACCACATCCATCAATGATGGCCCTGGATGC
TTGACGCTGCGATGTCCTGACCCATCATGCGATGTTGCCATTGGTCAAGATATGATTGAT
ACATTGACATCTGGTGAAGATAAGGAGAAGTACTATCGCTACCTTCTTAGATCCTATATT
GAGGACAGTAGAAAGACAAAATGGTGTCCTGCTCCAGGTTGTGATTCTGCAATAGAATAT
GATCTTGGAAGTGGAAGCTATGATGTTACTTGCTGTTGTTCCTTTAGTTTTTGTTGGAAT
TGTACAGAAGAGGCTCATCGGCCCGTGGATTGTGATACTGTGTCCAAGTGGGTTTTGAAA
AACAGTGCTGAGTCAGAGAACATGAATTGGATCTTGGCTAATTCCAAGCCCTGTCCAAAG
TGCAAGAGACCAATTGAGAAGAACCAAGGGTGTATGCACATGACTTGTACGCCACCATGT
AAATTTGAGTTTTGCTGGTTATGTCTTGGTGCATGGTCAGACCATGGTGAAAGGACTGGT
GGATTTTATGCGTGTAATCGCTATGAGTCAGCAAAGCAAGAGGGCGTGTATGATGAATCT
GAGAGGAGGAGGGAGATGGCCAAAAACTCTCTGGAAAGATACACACATTACTATGAGCGT
TGGGCAACCAATCAATCGTCGAGGCAAAAAGCCATGGCAGATCTGCATCAAATGCAAACT
GTTCATCTTGAAAAGCTTAGTGAAAAACAGTCCCAACCTGAGTCACAATTGAAATTCATT
ATAGATTCCTGGCAACAGATAGTTGAATGTAGGAGAGTGTTAAAATGGACTTATGCATAT
GGATACTACCTACCGGAACATGAGAAAGCGAAAAGGCAATTTTTTGAGTACGTACAAGGT
GAGGCAGAGGCTGGTTTAGAAAGACTTCATCAATGTGCTGAAAAGGAACTCCAAACTTAT
CTTAATGCTACAGGACCGTCCAAGGATTTCAATGATTTCCGTACAAAGCTCGCTGGTTTA
ACAAGTGTCACCCGAAACTACTTTGAAAATCTGGTTAGAGCACTGGAGAATGGTCTTGCT
GATGTGGATTCCCAAGGTGCTTGTAGTAAGGCACCCAGCTCAAAGAACGCAACTGGTAGC
AGCAAAGGCAAAGGAGGAGGTAGGGGAAAGAACTCTACTAAGACATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400046902
PEP Infomation

pacid=37449775 transcript=PGSC0003DMT400069483 locus=PGSC0003DMG400027011 ID=PGSC0003DMT400069483.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MDSEDDMHDANDMESVDEDFYSDGDGYGGDAADSDADVADYDFMGNETDDSDEQAVSRTQ
KNYTVLKEEDIRQRQEEDMTTISTLLSISREAACILLRRYNWSVNKVHEEWFADEERVRK
SAGLLEKPAVSLSRIIDVVCGICFENFLPDDITSVGCGHPFCTTCWKAYITTSINDGPGC
LTLRCPDPSCDVAIGQDMIDTLTSGEDKEKYYRYLLRSYIEDSRKTKWCPAPGCDSAIEY
DLGSGSYDVTCCCSFSFCWNCTEEAHRPVDCDTVSKWVLKNSAESENMNWILANSKPCPK
CKRPIEKNQGCMHMTCTPPCKFEFCWLCLGAWSDHGERTGGFYACNRYESAKQEGVYDES
ERRREMAKNSLERYTHYYERWATNQSSRQKAMADLHQMQTVHLEKLSEKQSQPESQLKFI
IDSWQQIVECRRVLKWTYAYGYYLPEHEKAKRQFFEYVQGEAEAGLERLHQCAEKELQTY
LNATGPSKDFNDFRTKLAGLTSVTRNYFENLVRALENGLADVDSQGACSKAPSSKNATGS
SKGKGGGRGKNSTKT*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400069483
Transcript Infomation

pacid=37449775 locus=PGSC0003DMG400027011 ID=PGSC0003DMT400069483.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATTCAGAAGATGATATGCACGATGCTAATGATATGGAGTCGGTAGATGAGGATTTC
TACAGTGACGGTGATGGTTATGGCGGCGATGCGGCAGATAGTGACGCTGATGTTGCTGAT
TATGATTTCATGGGTAATGAAACCGATGATTCCGATGAACAAGCTGTTAGTCGTACCCAG
AAAAATTATACTGTCTTGAAAGAAGAAGATATACGTCAGCGACAGGAGGAGGATATGACG
ACAATTTCTACTCTTCTCTCCATATCAAGAGAAGCTGCCTGTATATTACTTCGACGCTAT
AACTGGAGTGTGAACAAGGTGCATGAGGAGTGGTTTGCTGATGAAGAAAGAGTGCGCAAG
TCTGCCGGCTTGTTGGAGAAGCCTGCTGTCTCTCTTTCAAGAATTATAGATGTGGTGTGT
GGGATTTGCTTTGAGAACTTCCTTCCTGATGACATAACATCTGTTGGGTGTGGTCATCCT
TTTTGTACTACTTGCTGGAAAGCTTACATTACCACATCCATCAATGATGGCCCTGGATGC
TTGACGCTGCGATGTCCTGACCCATCATGCGATGTTGCCATTGGTCAAGATATGATTGAT
ACATTGACATCTGGTGAAGATAAGGAGAAGTACTATCGCTACCTTCTTAGATCCTATATT
GAGGACAGTAGAAAGACAAAATGGTGTCCTGCTCCAGGTTGTGATTCTGCAATAGAATAT
GATCTTGGAAGTGGAAGCTATGATGTTACTTGCTGTTGTTCCTTTAGTTTTTGTTGGAAT
TGTACAGAAGAGGCTCATCGGCCCGTGGATTGTGATACTGTGTCCAAGTGGGTTTTGAAA
AACAGTGCTGAGTCAGAGAACATGAATTGGATCTTGGCTAATTCCAAGCCCTGTCCAAAG
TGCAAGAGACCAATTGAGAAGAACCAAGGGTGTATGCACATGACTTGTACGCCACCATGT
AAATTTGAGTTTTGCTGGTTATGTCTTGGTGCATGGTCAGACCATGGTGAAAGGACTGGT
GGATTTTATGCGTGTAATCGCTATGAGTCAGCAAAGCAAGAGGGCGTGTATGATGAATCT
GAGAGGAGGAGGGAGATGGCCAAAAACTCTCTGGAAAGATACACACATTACTATGAGCGT
TGGGCAACCAATCAATCGTCGAGGCAAAAAGCCATGGCAGATCTGCATCAAATGCAAACT
GTTCATCTTGAAAAGCTTAGTGAAAAACAGTCCCAACCTGAGTCACAATTGAAATTCATT
ATAGATTCCTGGCAACAGATAGTTGAATGTAGGAGAGTGTTAAAATGGACTTATGCATAT
GGATACTACCTACCGGAACATGAGAAAGCGAAAAGGCAATTTTTTGAGTACGTACAAGGT
GAGGCAGAGGCTGGTTTAGAAAGACTTCATCAATGTGCTGAAAAGGAACTCCAAACTTAT
CTTAATGCTACAGGACCGTCCAAGGATTTCAATGATTTCCGTACAAAGCTCGCTGGTTTA
ACAAGTGTCACCCGAAACTACTTTGAAAATCTGGTTAGAGCACTGGAGAATGGTCTTGCT
GATGTGGATTCCCAAGGTGCTTGTAGTAAGGCACCCAGCTCAAAGAACGCAACTGGTAGC
AGCAAAGGCAAAGGAGGAGGTAGGGGAAAGAACTCTACTAAGACATGA