Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400068308
CDS Infomation	pacid=37426093 polypeptide=PGSC0003DMP400046151 locus=PGSC0003DMG400026557 ID=PGSC0003DMT400068308.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGGAAGCAAAGGTCGAGGGCCACCTCCCAACATTAGGCGTCCACCTCCTGGACCCGGC ATGATGTATCCTGATTCTTTTGGTCCTCCTATGCACAACCCACCACCAGGTGATTTCCCT CCTTTTGACAGGCTACCTCCTCCAGAGATTTTGGAACATAAGATTGGCGCACAACATCTT GAGATGCAAAAACTTACTACAGAAAATCAGAGGCTTGCTGCCACCCATGTAACTTTGAGG CGAGATTTAGCTGCTGCACAACATGAGCTACAAATGTTGCATGTTCAGATAGAAGCAGTC AAGGCCAACAGGGAACAAGAGACTAAAGGCCTTAACGATAAAATTTCTAGGATAGAGGCT GAACTTCAAGCTACCGAATCTATCAAAAAAGAATTGCCGCAAGCACAAGGGGAAGCTCGC ACTTTGTTTGCAGCAAGGCAGGAACTTGTTGCTAAAATACAAATGCTGACTCAGGATCTT CAAAGGGCTCACACTGATGTGCTACATATTCCTCGTTTGCTGGCTGATTTGGAGAGCCTA AAAAAGGAGTATCAGCAGTGCCGGACTACCTATGAGTTTGAGAGGAAGTTATACAGTGAT CATCTTGAATCTCTTCAAGTGATGGAGAAGAACTACATGACTATGTCCAGAGAGGTGGAA AAGCTTAGGGCAGAGTTAACGAACACTTCCAACTCTGACAGACAAACAGGTGGACCTTAT GGTGGTTCAACTGGATACAATGAGAATGATGCCACTAATAATTATGCTACTGGGCAAAAC ATCTATGCAGATGGCTATGGAATTTATCAGGGTAGAGGCTCCGTACCAACAGGGACTAAT GTTGGAGGAGTTCCTGCTGTTACCTCTCCACAAGTTGGAGCTCAGTCTGTGCCTCCGTCA AACAGGCCTCCTTATGATGCATCAAATATACCTGGTTATGATGCACAAAGGGGAATTAGA GTCCCCGCTGGACATGGTTATGAAGCACAAATGGGATCAAGTGGTCCTGGCTATGATGCA CAAAGAGGATCTGGTTTAGCAGCTTATGAAGCTCAGAGGGGGCATGGTTATGATGCTCAG AGGACAGCGGGTTATGAAGCTTACAGAGGACCTGGCTATGATGCATATGGGGCACCTGTT TATGATGCTCAGAGAGGATCTGGTTATGACGTGCAAAGGGGAGCCAATTATGATCCTACC AAGGCCTCTAACTATGACGCATCATCCAAAGCCGGTGTTGCAACTCAAGGACAGGTAGCA GCTACAGGAAATGCTCCTCCTGGGGCAGCTCCCTCACCTGGTCATGTTGGTCCTGGATAT GATGCATCAGCACAAGGTGGAAATCCAGCACGTAGATGA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400046151
PEP Infomation	pacid=37426093 transcript=PGSC0003DMT400068308 locus=PGSC0003DMG400026557 ID=PGSC0003DMT400068308.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MGSKGRGPPPNIRRPPPGPGMMYPDSFGPPMHNPPPGDFPPFDRLPPPEILEHKIGAQHL EMQKLTTENQRLAATHVTLRRDLAAAQHELQMLHVQIEAVKANREQETKGLNDKISRIEA ELQATESIKKELPQAQGEARTLFAARQELVAKIQMLTQDLQRAHTDVLHIPRLLADLESL KKEYQQCRTTYEFERKLYSDHLESLQVMEKNYMTMSREVEKLRAELTNTSNSDRQTGGPY GGSTGYNENDATNNYATGQNIYADGYGIYQGRGSVPTGTNVGGVPAVTSPQVGAQSVPPS NRPPYDASNIPGYDAQRGIRVPAGHGYEAQMGSSGPGYDAQRGSGLAAYEAQRGHGYDAQ RTAGYEAYRGPGYDAYGAPVYDAQRGSGYDVQRGANYDPTKASNYDASSKAGVATQGQVA ATGNAPPGAAPSPGHVGPGYDASAQGGNPARR*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400068308
Transcript Infomation	pacid=37426093 locus=PGSC0003DMG400026557 ID=PGSC0003DMT400068308.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGGAAGCAAAGGTCGAGGGCCACCTCCCAACATTAGGCGTCCACCTCCTGGACCCGGC ATGATGTATCCTGATTCTTTTGGTCCTCCTATGCACAACCCACCACCAGGTGATTTCCCT CCTTTTGACAGGCTACCTCCTCCAGAGATTTTGGAACATAAGATTGGCGCACAACATCTT GAGATGCAAAAACTTACTACAGAAAATCAGAGGCTTGCTGCCACCCATGTAACTTTGAGG CGAGATTTAGCTGCTGCACAACATGAGCTACAAATGTTGCATGTTCAGATAGAAGCAGTC AAGGCCAACAGGGAACAAGAGACTAAAGGCCTTAACGATAAAATTTCTAGGATAGAGGCT GAACTTCAAGCTACCGAATCTATCAAAAAAGAATTGCCGCAAGCACAAGGGGAAGCTCGC ACTTTGTTTGCAGCAAGGCAGGAACTTGTTGCTAAAATACAAATGCTGACTCAGGATCTT CAAAGGGCTCACACTGATGTGCTACATATTCCTCGTTTGCTGGCTGATTTGGAGAGCCTA AAAAAGGAGTATCAGCAGTGCCGGACTACCTATGAGTTTGAGAGGAAGTTATACAGTGAT CATCTTGAATCTCTTCAAGTGATGGAGAAGAACTACATGACTATGTCCAGAGAGGTGGAA AAGCTTAGGGCAGAGTTAACGAACACTTCCAACTCTGACAGACAAACAGGTGGACCTTAT GGTGGTTCAACTGGATACAATGAGAATGATGCCACTAATAATTATGCTACTGGGCAAAAC ATCTATGCAGATGGCTATGGAATTTATCAGGGTAGAGGCTCCGTACCAACAGGGACTAAT GTTGGAGGAGTTCCTGCTGTTACCTCTCCACAAGTTGGAGCTCAGTCTGTGCCTCCGTCA AACAGGCCTCCTTATGATGCATCAAATATACCTGGTTATGATGCACAAAGGGGAATTAGA GTCCCCGCTGGACATGGTTATGAAGCACAAATGGGATCAAGTGGTCCTGGCTATGATGCA CAAAGAGGATCTGGTTTAGCAGCTTATGAAGCTCAGAGGGGGCATGGTTATGATGCTCAG AGGACAGCGGGTTATGAAGCTTACAGAGGACCTGGCTATGATGCATATGGGGCACCTGTT TATGATGCTCAGAGAGGATCTGGTTATGACGTGCAAAGGGGAGCCAATTATGATCCTACC AAGGCCTCTAACTATGACGCATCATCCAAAGCCGGTGTTGCAACTCAAGGACAGGTAGCA GCTACAGGAAATGCTCCTCCTGGGGCAGCTCCCTCACCTGGTCATGTTGGTCCTGGATAT GATGCATCAGCACAAGGTGGAAATCCAGCACGTAGATGA