Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400068039
CDS Infomation

pacid=37446983 polypeptide=PGSC0003DMP400045957 locus=PGSC0003DMG400026460 ID=PGSC0003DMT400068039.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTCAATGTCCTGCAAGGATGGTAAATCAATTGAAGATAACGGAAAGTATGTCCGTTAT
ACACCTGAGCAGGTTGAAGCTCTTGAAAGGCTATATCATGAGTGTCCAAAGCCCAGTTCA
ATGCGTCGCCAGCAGCTTATTCGTGAATGCCCGATTCTATCCCATATAGAGCCTAGGCAA
ATCAAAGTTTGGTTTCAGAATAGAAGATGTAGGGAAAAACAGAGGAAAGAGTCATCAAGG
CTTCAGGGTGTGAATAGGAAGCTGTCAGCAATGAACAAGCTATTAATGGAAGAGAATGAT
AGATTGCAGAAGCAAGTTTCTCAACTGGTGTATGAAAATGGCTACTTTCGCAAGCAAACT
CAAACTACAAAGCTTGCTTCAAAAGACACCAGTTGTGAATCAGTGGTAACGAGTGGTCAA
CACCACTTGACACCTCAGCATCCTCCAAGAGATGCTAGTCCTGCAGGACTTTTGTCCATT
GCAGAAGAGACTTTAACAGAGTTTCTTTCAAAGGCTACTGGAACTGCTGTTGAGTGGGTC
CAAATGCCTGGAATGAAGCCTGGTCCGGATTCCATTGGAATCATTGCTATTTCTCATGGT
TGCACTGGCATGGCAGCAAGAGCTTGTGGCCTGGTTGGTTTAGATCCAACGAGGGTTGCT
GAGATCCTTAAGGATCGCCCTTCCTGGTATCGTGACTGCCGGGCTGTTGAAGTTCTAAAT
ATGCTGCCCACTGCCAATGGTGGAACCATTGAACTTCTTTACATGCAGCTTTATGCTCCA
ACAACTTTGGCGCCTCCTCGTGACTTCTGGCTGTTACGCTATACTACTGTTACGGATGAT
GGTAGCTTTGTGGTTTGTGAAAGGTCATTGGGAAATACTCTAAATGGTCCAAGTATGCCG
CAAGTTCAGAATTTTGTGAGAGCGGAAATGCTGCCTAGCGGATACCTGATTAGGCCTTGT
GAGGGAGGCGGCTCTATTGTCCATATTGTAGATCATATGAATTTAGAGGCATGGAGTGTG
CCAGAAGTGTTGCGTCCACTGTATGAGTCATCTGCAGTGCTTGCTCAGAAGACAACAATG
GCAGCACTACGCCAACTGAGGCAGTTAACTTTGGAAGTTTCACAGCCTAATGTCACTAAT
TGGGGCAGGAGACCAGCAGCTCTACGGGCATTAAGCAAGAGGCTGAACAGAGGGTTCAAT
GAGGCTCTCAATGGTTTCTCCAGTGAAGGCTGGTCTATGCTGGATAATGATGGAATGGAT
GATGTCACCATCCTTGTTAACTCATCCCCCGACAAATTGATGGGTTTAAACCTTTCTTTT
TCTGATGGATTTACATCTCTAAGCAATGCAATTTTGTGTGCAAAAGCATCTATGCTTCTA
CAGAGTGTGACTCCTGCGATACTTCTCAGGTTTTTGCGTGAGCATCGATCAGAATGGGTA
GACAACAATATTGATGCTTACTCGGCTGCAGCTGTTAAAGTTGGTCCTTGCAGCCTACCT
GGGGTTCGAGTCTCTAACTTTGGGGGTCAAGTGATACTTCCACTGGCACATACTGTTGAA
CATGAAGAGTTGCTGGAGGTCATTAAGTTGGAAGGAGTTTGCCATTCCCCGGAAGATGTT
ATAATGCCAAGAGATATGTTTCTATTGCAATTGTGCAGTGGAATGGATGAAAATGCTGTT
GGTACCTGTGCTGAACTCATTTTTGCTCCAATCGATGCCTCGTTTGCTGATGATGCACCA
CTCCTTCCTTCTGGGTTTCGCATTATTCCTTTAGACTCTGCTAAGGAAGCCTCCAGTCCA
AATCGCACCCTTGATCTTACTTCTGCTCTTGAAACTGGGCCAGTAGGAAGTAAGGTGGCT
AATGACCTCAAGTCAACTGGTGGCACATCAAAATCTATTATGACAATTGCTTTTCAGTTT
GCATTTGAAAGCCACATGCAAGAGAATGTTGCATCAATGGCTAGAAAGTATGTACGAAGC
TTCATTTCATCTGTTCAAAGGGTTGCATTGGCACTTTCTCCATCCAACTTCGGTTCTGTG
GGAGGCCTTCGTCTGCCGCTGGGGACTCCTGAAGCTCATACACTAGCTCGGTGGATCTGC
CAAAGTTACAGGTGTGGCATATACTTGCATGTCACTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400045957
PEP Infomation

pacid=37446983 transcript=PGSC0003DMT400068039 locus=PGSC0003DMG400026460 ID=PGSC0003DMT400068039.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MSMSCKDGKSIEDNGKYVRYTPEQVEALERLYHECPKPSSMRRQQLIRECPILSHIEPRQ
IKVWFQNRRCREKQRKESSRLQGVNRKLSAMNKLLMEENDRLQKQVSQLVYENGYFRKQT
QTTKLASKDTSCESVVTSGQHHLTPQHPPRDASPAGLLSIAEETLTEFLSKATGTAVEWV
QMPGMKPGPDSIGIIAISHGCTGMAARACGLVGLDPTRVAEILKDRPSWYRDCRAVEVLN
MLPTANGGTIELLYMQLYAPTTLAPPRDFWLLRYTTVTDDGSFVVCERSLGNTLNGPSMP
QVQNFVRAEMLPSGYLIRPCEGGGSIVHIVDHMNLEAWSVPEVLRPLYESSAVLAQKTTM
AALRQLRQLTLEVSQPNVTNWGRRPAALRALSKRLNRGFNEALNGFSSEGWSMLDNDGMD
DVTILVNSSPDKLMGLNLSFSDGFTSLSNAILCAKASMLLQSVTPAILLRFLREHRSEWV
DNNIDAYSAAAVKVGPCSLPGVRVSNFGGQVILPLAHTVEHEELLEVIKLEGVCHSPEDV
IMPRDMFLLQLCSGMDENAVGTCAELIFAPIDASFADDAPLLPSGFRIIPLDSAKEASSP
NRTLDLTSALETGPVGSKVANDLKSTGGTSKSIMTIAFQFAFESHMQENVASMARKYVRS
FISSVQRVALALSPSNFGSVGGLRLPLGTPEAHTLARWICQSYRCGIYLHVT*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400068039
Transcript Infomation

pacid=37446983 locus=PGSC0003DMG400026460 ID=PGSC0003DMT400068039.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTCAATGTCCTGCAAGGATGGTAAATCAATTGAAGATAACGGAAAGTATGTCCGTTAT
ACACCTGAGCAGGTTGAAGCTCTTGAAAGGCTATATCATGAGTGTCCAAAGCCCAGTTCA
ATGCGTCGCCAGCAGCTTATTCGTGAATGCCCGATTCTATCCCATATAGAGCCTAGGCAA
ATCAAAGTTTGGTTTCAGAATAGAAGATGTAGGGAAAAACAGAGGAAAGAGTCATCAAGG
CTTCAGGGTGTGAATAGGAAGCTGTCAGCAATGAACAAGCTATTAATGGAAGAGAATGAT
AGATTGCAGAAGCAAGTTTCTCAACTGGTGTATGAAAATGGCTACTTTCGCAAGCAAACT
CAAACTACAAAGCTTGCTTCAAAAGACACCAGTTGTGAATCAGTGGTAACGAGTGGTCAA
CACCACTTGACACCTCAGCATCCTCCAAGAGATGCTAGTCCTGCAGGACTTTTGTCCATT
GCAGAAGAGACTTTAACAGAGTTTCTTTCAAAGGCTACTGGAACTGCTGTTGAGTGGGTC
CAAATGCCTGGAATGAAGCCTGGTCCGGATTCCATTGGAATCATTGCTATTTCTCATGGT
TGCACTGGCATGGCAGCAAGAGCTTGTGGCCTGGTTGGTTTAGATCCAACGAGGGTTGCT
GAGATCCTTAAGGATCGCCCTTCCTGGTATCGTGACTGCCGGGCTGTTGAAGTTCTAAAT
ATGCTGCCCACTGCCAATGGTGGAACCATTGAACTTCTTTACATGCAGCTTTATGCTCCA
ACAACTTTGGCGCCTCCTCGTGACTTCTGGCTGTTACGCTATACTACTGTTACGGATGAT
GGTAGCTTTGTGGTTTGTGAAAGGTCATTGGGAAATACTCTAAATGGTCCAAGTATGCCG
CAAGTTCAGAATTTTGTGAGAGCGGAAATGCTGCCTAGCGGATACCTGATTAGGCCTTGT
GAGGGAGGCGGCTCTATTGTCCATATTGTAGATCATATGAATTTAGAGGCATGGAGTGTG
CCAGAAGTGTTGCGTCCACTGTATGAGTCATCTGCAGTGCTTGCTCAGAAGACAACAATG
GCAGCACTACGCCAACTGAGGCAGTTAACTTTGGAAGTTTCACAGCCTAATGTCACTAAT
TGGGGCAGGAGACCAGCAGCTCTACGGGCATTAAGCAAGAGGCTGAACAGAGGGTTCAAT
GAGGCTCTCAATGGTTTCTCCAGTGAAGGCTGGTCTATGCTGGATAATGATGGAATGGAT
GATGTCACCATCCTTGTTAACTCATCCCCCGACAAATTGATGGGTTTAAACCTTTCTTTT
TCTGATGGATTTACATCTCTAAGCAATGCAATTTTGTGTGCAAAAGCATCTATGCTTCTA
CAGAGTGTGACTCCTGCGATACTTCTCAGGTTTTTGCGTGAGCATCGATCAGAATGGGTA
GACAACAATATTGATGCTTACTCGGCTGCAGCTGTTAAAGTTGGTCCTTGCAGCCTACCT
GGGGTTCGAGTCTCTAACTTTGGGGGTCAAGTGATACTTCCACTGGCACATACTGTTGAA
CATGAAGAGTTGCTGGAGGTCATTAAGTTGGAAGGAGTTTGCCATTCCCCGGAAGATGTT
ATAATGCCAAGAGATATGTTTCTATTGCAATTGTGCAGTGGAATGGATGAAAATGCTGTT
GGTACCTGTGCTGAACTCATTTTTGCTCCAATCGATGCCTCGTTTGCTGATGATGCACCA
CTCCTTCCTTCTGGGTTTCGCATTATTCCTTTAGACTCTGCTAAGGAAGCCTCCAGTCCA
AATCGCACCCTTGATCTTACTTCTGCTCTTGAAACTGGGCCAGTAGGAAGTAAGGTGGCT
AATGACCTCAAGTCAACTGGTGGCACATCAAAATCTATTATGACAATTGCTTTTCAGTTT
GCATTTGAAAGCCACATGCAAGAGAATGTTGCATCAATGGCTAGAAAGTATGTACGAAGC
TTCATTTCATCTGTTCAAAGGGTTGCATTGGCACTTTCTCCATCCAACTTCGGTTCTGTG
GGAGGCCTTCGTCTGCCGCTGGGGACTCCTGAAGCTCATACACTAGCTCGGTGGATCTGC
CAAAGTTACAGGTGTGGCATATACTTGCATGTCACTTAA